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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1unz | ||||||
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タイトル | Structure Based Engineering of Internal Molecular Surfaces Of Four Helix Bundles | ||||||
![]() | GENERAL CONTROL PROTEIN GCN4 | ||||||
![]() | FOUR HELIX BUNDLE / CAVITY | ||||||
機能・相同性 | ![]() protein localization to nuclear periphery / FCERI mediated MAPK activation / Activation of the AP-1 family of transcription factors / response to amino acid starvation / mediator complex binding / negative regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II / positive regulation of cellular response to amino acid starvation / nitrogen catabolite activation of transcription from RNA polymerase II promoter / Oxidative Stress Induced Senescence / TFIID-class transcription factor complex binding ...protein localization to nuclear periphery / FCERI mediated MAPK activation / Activation of the AP-1 family of transcription factors / response to amino acid starvation / mediator complex binding / negative regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II / positive regulation of cellular response to amino acid starvation / nitrogen catabolite activation of transcription from RNA polymerase II promoter / Oxidative Stress Induced Senescence / TFIID-class transcription factor complex binding / positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II / positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly / amino acid biosynthetic process / cellular response to amino acid starvation / RNA polymerase II transcription regulator complex / : / DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific / RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding / transcription regulator complex / sequence-specific DNA binding / DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific / regulation of cell cycle / intracellular signal transduction / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / DNA-binding transcription factor activity / chromatin binding / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / identical protein binding / nucleus 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Yadav, M.K. / Redman, J.E. / Alvarez-Gutierrez, J.M. / Zhang, Y. / Stout, C.D. / Ghadiri, M.R. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure-Based Engineering of Internal Cavities in Coiled-Coil Peptides 著者: Yadav, M.K. / Redman, J.E. / Leman, L.J. / Alvarez-Gutierrez, J.M. / Zhang, Y. / Stout, C.D. / Ghadiri, M.R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 23 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 16.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 416.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 420.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 3.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 4.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1untC ![]() 1unuC ![]() 1unvC ![]() 1unwC ![]() 1unxC ![]() 1unyC ![]() 1uo0C ![]() 1uo1C ![]() 1uo2C ![]() 1uo3C ![]() 1uo4C ![]() 1uo5C ![]() 1w5gC ![]() 1w5iC ![]() 2bniC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4046.757 Da / 分子数: 2 / 変異: YES / 由来タイプ: 合成 詳細: BASED ON SEQUENCE FROM SACCHAROMYCES CEREVISIAE (BAKER'S YEAST) 由来: (合成) ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | 構成要素の詳細 | ENGINEERED | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.5 Å3/Da / 溶媒含有率: 50 % |
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結晶化 | pH: 7 / 詳細: 2.5 M NACL, 100 MM NAAC, 200 MM LI2SO4, PH 4.5 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 114 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | 日付: 2002年10月15日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.8→22 Å / Num. obs: 8233 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 10.4 % / Rmerge(I) obs: 0.066 / Net I/σ(I): 7.1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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原子変位パラメータ | Biso mean: 35.918 Å2 | ||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→55.9 Å
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