[日本語] English
EMN検索
- 3次元電子顕微鏡データ検索 -

-
検索条件


キーワード
データベース /
Q: EM Navigatorの情報源は?
データエントリ / 週前
Q: データの更新はいつですか?
著者・登録者
解析手法
表示モード
並び順
エントリ数 / 1ページ
登録情報
文献
試料
実験
解析
データの最大数全データの場合は0
ファイル形式
  • CSV形式 (コンマ区切り, Excelなどに)
  • TSV形式 (タブ区切り)
  • JSON形式

万見検索

-
検索結果

検索 (著者・登録者: kimura & t)の結果85件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-39119:
Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence
手法: 単粒子 / : Kimura T, Hirai S, Kujirai T, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-39120:
Cryo-EM structure of the human nucleosome containing the H3.1 E97K mutant
手法: 単粒子 / : Kimura T, Hirai S, Kujirai T, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8ybj:
Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence
手法: 単粒子 / : Kimura T, Hirai S, Kujirai T, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8ybk:
Cryo-EM structure of the human nucleosome containing the H3.1 E97K mutant
手法: 単粒子 / : Kimura T, Hirai S, Kujirai T, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-36907:
Cryo-EM structure of the RC-LH core comples from Halorhodospira halochloris
手法: 単粒子 / : Wang GL, Qi CH, Yu LJ

PDB-8k5o:
Cryo-EM structure of the RC-LH core comples from Halorhodospira halochloris
手法: 単粒子 / : Wang GL, Qi CH, Yu LJ

EMDB-36223:
Cryo-EM structure of the GI.4 Chiba VLP complexed with the CV-1A1 Fv-clasp
手法: 単粒子 / : Hosaka T, Katsura K, Kimura-Someya T, Someya Y, Shirouzu M

PDB-8jg5:
Cryo-EM structure of the GI.4 Chiba VLP complexed with the CV-1A1 Fv-clasp
手法: 単粒子 / : Hosaka T, Katsura K, Kimura-Someya T, Someya Y, Shirouzu M

EMDB-37465:
Photosynthetic LH1-RC complex from the purple sulfur bacterium Allochromatium vinosum purified by sucrose density
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Harada A, Kobayashi A, Minamino A, Nakamura N, Ji XC, Purba ER, Hall M, Yu LJ, Madigan MT, Mizoguchi A, Iwasaki K, Humbel BM, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

EMDB-37466:
Photosynthetic LH1-RC complex from the purple sulfur bacterium Allochromatium vinosum purified by Ca2+-DEAE
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Harada A, Kobayashi A, Minamino A, Nakamura N, Ji XC, Purba ER, Hall M, Yu LJ, Madigan MT, Mizoguchi A, Iwasaki K, Humbel BM, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

PDB-8wdu:
Photosynthetic LH1-RC complex from the purple sulfur bacterium Allochromatium vinosum purified by sucrose density
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Harada A, Kobayashi A, Minamino A, Nakamura N, Ji XC, Purba ER, Hall M, Yu LJ, Madigan MT, Mizoguchi A, Iwasaki K, Humbel BM, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

PDB-8wdv:
Photosynthetic LH1-RC complex from the purple sulfur bacterium Allochromatium vinosum purified by Ca2+-DEAE
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Harada A, Kobayashi A, Minamino A, Nakamura N, Ji XC, Purba ER, Hall M, Yu LJ, Madigan MT, Mizoguchi A, Iwasaki K, Humbel BM, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

EMDB-36724:
Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 1)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-36726:
Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 2)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-36727:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-36728:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-36729:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike RBD in complex with ACE2
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8jyk:
Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 1)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8jym:
Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 2)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8jyn:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8jyo:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8jyp:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike RBD in complex with ACE2
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-35029:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2, no ACE2 binding.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35030:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2. 1 ACE2 bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35031:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2. 2 ACE2 bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35032:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2. 3 ACE2 bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35036:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy.no ACE2 decoy binding
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35037:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy. 1 ACE2 decoy bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35038:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy. 1 ACE2 decoy bound and 2 RBD up form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35039:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy. 2 ACE2 decoy bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35040:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy. 3 ACE2 decoy bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-36345:
RBD of SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

PDB-8jje:
RBD of SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-33931:
Structure of photosynthetic LH1-RC super-complex of Rhodobacter capsulatus
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Ji XC, Satoh I, Kobayashi Y, Nagashima KVP, Hall M, Yu LJ, Kimura Y, Mizoguchi A, Humbel BM, Madigan MT, Wang-Otomo ZY

PDB-7yml:
Structure of photosynthetic LH1-RC super-complex of Rhodobacter capsulatus
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Ji XC, Satoh I, Kobayashi Y, Nagashima KVP, Hall M, Yu LJ, Kimura Y, Mizoguchi A, Humbel BM, Madigan MT, Wang-Otomo ZY

EMDB-33501:
Structure of photosynthetic LH1-RC super-complex of Rhodopila globiformis
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Kurosawa K, Takaichi S, Nagashima KVP, Hall M, Yu LJ, Kimura Y, Madigan MT, Mizoguchi A, Humbel BM, Wang-Otomo ZY

PDB-7xxf:
Structure of photosynthetic LH1-RC super-complex of Rhodopila globiformis
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Kurosawa K, Takaichi S, Nagashima KVP, Hall M, Yu LJ, Kimura Y, Madigan MT, Mizoguchi A, Humbel BM, Wang-Otomo ZY

EMDB-34221:
SARS-CoV-2 BA.2.75 spike glycoprotein (closed state 1)
手法: 単粒子 / : Anraku Y, Tabata-Sasaki K, Kita S, Fukuhara H, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-34222:
SARS-CoV-2 BA.2.75 spike glycoprotein (closed state 2)
手法: 単粒子 / : Anraku Y, Tabata-Sasaki K, Kita S, Fukuhara H, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-34223:
SARS-CoV-2 BA.2.75 spike glycoprotein (1-up state)
手法: 単粒子 / : Anraku Y, Tabata-Sasaki K, Kita S, Fukuhara H, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-34224:
SARS-CoV-2 BA.2.75 spike glycoprotein in complex with ACE2
手法: 単粒子 / : Anraku Y, Tabata-Sasaki K, Kita S, Fukuhara H, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8gs6:
Structure of the SARS-CoV-2 BA.2.75 spike glycoprotein (closed state 1)
手法: 単粒子 / : Anraku Y, Tabata-Sasaki K, Kita S, Fukuhara H, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-12554:
Bacilladnavirus capsid structure
手法: 単粒子 / : Munke A, Okamoto K

PDB-7ns0:
Bacilladnavirus capsid structure
手法: 単粒子 / : Munke A, Okamoto K

EMDB-12555:
Genome of an algal ssDNA virus - outer layer
手法: 単粒子 / : Munke A, Okamoto K

EMDB-25399:
Molecular mechanism of the the wake-promoting agent TAK-925
手法: 単粒子 / : Yin J, Chapman K, Lian P, De Brabander JK, Rosenbaum DM

PDB-7sr8:
Molecular mechanism of the the wake-promoting agent TAK-925
手法: 単粒子 / : Yin J, Chapman K, Lian P, De Brabander JK, Rosenbaum DM

EMDB-25389:
Structure of the orexin-2 receptor(OX2R) bound to TAK-925, Gi and scFv16
手法: 単粒子 / : McGrath AP, Kang Y, Flinspach M

PDB-7sqo:
Structure of the orexin-2 receptor(OX2R) bound to TAK-925, Gi and scFv16
手法: 単粒子 / : McGrath AP, Kang Y, Flinspach M

EMDB-31837:
Cryo-EM structure of human NTCP complexed with YN69202Fab
手法: 単粒子 / : Asami J, Shimizu T, Ohto U

ページ:

+
EMN検索について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

+
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

-
EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は? / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

他の情報も見る