PDB-4ghk: X-ray Crystal Structure of Gamma-glutamyl phosphate reductase fro...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4ghk

タイトル

X-ray Crystal Structure of Gamma-glutamyl phosphate reductase from Burkholderia thailandensis

要素

Gamma-glutamyl phosphate reductase

キーワード

OXIDOREDUCTASE / Structural Genomics / NIAID / National Institute of Allergy and Infectious Diseases / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease / SSGCID / Gamma-glutamyl phosphate reductase

機能・相同性

機能・相同性情報

glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase / glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase activity / L-proline biosynthetic process / NADP binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Burkholderia thailandensis (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.25 Å

データ登録者

Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID)

引用

ジャーナル: Plos One / 年: 2013
タイトル: Combining functional and structural genomics to sample the essential Burkholderia structome.
著者: Baugh, L. / Gallagher, L.A. / Patrapuvich, R. / Clifton, M.C. / Gardberg, A.S. / Edwards, T.E. / Armour, B. / Begley, D.W. / Dieterich, S.H. / Dranow, D.M. / Abendroth, J. / Fairman, J.W. / ...

履歴

登録	2012年8月7日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2012年12月26日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2013年10月30日	Group: Database references
改定 1.2	2023年9月13日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4ghk.cif.gz	596.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4ghk.ent.gz	494.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4ghk.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4ghk_validation.pdf.gz	458.2 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4ghk_full_validation.pdf.gz	466 KB	表示
XML形式データ	4ghk_validation.xml.gz	58.7 KB	表示
CIF形式データ	4ghk_validation.cif.gz	84.3 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gh/4ghk ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gh/4ghk	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	3d63C 3dahC 3eizC 3ej2C 3ek2C 3ezoC 3f0fC 3ftpC 3gk0C 3gk3C 3gvfC 3gwaC 3gweC 3imlC 3sz8C 3t4cC 3tmlC 3tmqC 3txyC 3u7jC 3ue9C 3uk1C 3uk2C 3undC 3uptC 3urrC 3uw1C 3uw2C 3uw3C 3v2iC 3v7nC 3v8hC 3v9oC 3v9pC 3vavC 4ddoC 4dfeC 4dheC 4dhkC 4dutC 4dz4C 4e4tC 4efiC 4eg0C 4egjC 4ek2C 4eqyC 4ewgC 4exqC 4f2gC 4f32C 4f3nC 4f3yC 4f4hC 4f7dC 4fk8C 4fryC 4g1kC 4g67C 4h3yC 4h3zC 4h4gC 1olaS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	1o20-2 6qib-d 6eo1-d 5l6s-2 1rzm-1 6qd2-d 5l6s-1 4kqe-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: ButhA.01417.a

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#127 - 2010年7月クリスタリン (Crystallins) 類似性 (5) #89 - 2007年5月アコニターゼと鉄調節タンパク質１ (Aconitase and Iron Regulatory Protein 1) 類似性 (5)

登録構造単位

A: Gamma-glutamyl phosphate reductase

B: Gamma-glutamyl phosphate reductase

C: Gamma-glutamyl phosphate reductase

D: Gamma-glutamyl phosphate reductase

191 kDa, 4 ポリマー
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1

登録構造と同一
ソフトウェアが定義した集合体

2

A: Gamma-glutamyl phosphate reductase

B: Gamma-glutamyl phosphate reductase

ソフトウェアが定義した集合体
95.3 kDa, 2 ポリマー
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3

C: Gamma-glutamyl phosphate reductase

D: Gamma-glutamyl phosphate reductase

ソフトウェアが定義した集合体
95.3 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	85.410, 142.460, 154.760
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Gamma-glutamyl phosphate reductase / GPR / Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase / Glutamyl-gamma-semialdehyde dehydrogenase / GSA dehydrogenase 分子量: 47659.180 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Burkholderia thailandensis (バクテリア) 株: E264 / 遺伝子: proA, BTH_I1214 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) 参照: UniProt: Q2SZ88, glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase
#2: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 658 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

#1: タンパク質

Gamma-glutamyl phosphate reductase / GPR / Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase / Glutamyl-gamma-semialdehyde dehydrogenase / GSA dehydrogenase

分子量: 47659.180 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Burkholderia thailandensis (バクテリア)
株: E264 / 遺伝子: proA, BTH_I1214 / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌)
参照: UniProt: Q2SZ88, glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase

#2: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 658 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

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実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.47 Å³/Da / 溶媒含有率: 50.19 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 40% PEG 300, 200 mM Calcium Acetate, 100 mM sodium cacodylate pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 21-ID-F / 波長: 0.97872 Å

検出器

タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2012年7月20日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.97872 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.25→50 Å / Num. all: 90232 / Num. obs: 90052 / % possible obs: 99.8 % / Observed criterion σ(F): -3 / Observed criterion σ(I): -3 / B_iso Wilson estimate: 36.944 Å² / R_merge(I) obs: 0.093 / Net I/σ(I): 13.59

反射シェル

解像度 (Å)	最高解像度 (Å)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Diffraction-ID	% possible all
2.25-2.31		0.551	2.65	1	99.9
2.31-2.37		0.482	3.07	1	99.9
2.37-2.44		0.41	3.59	1	99.9
2.44-2.52		0.356	4.17	1	99.9
2.52-2.6		0.303	4.99	1	99.9
2.6-2.69		0.255	5.93	1	99.9
2.69-2.79		0.22	6.89	1	99.9
2.79-2.9		0.184	8.19	1	100
2.9-3.03		0.143	10.45	1	99.9
3.03-3.18		0.113	12.82	1	99.9
3.18-3.35		0.087	16.13	1	99.8
3.35-3.56		0.071	19.41	1	99.8
3.56-3.8		0.056	23.16	1	99.9
3.8-4.11		0.047	27.47	1	99.8
4.11-4.5		0.04	31.55	1	99.9
4.5-5.03		0.037	32.99	1	99.8
5.03-5.81		0.041	30.53	1	99.9
5.81-7.12		0.04	30.39	1	99.8
7.12-10.06		0.026	42.5	1	99.4
	10.06	0.023	45.03	1	96

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XSCALE		データスケーリング
PHASER		位相決定
PHENIX	1.8.1_1168	精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
XDS		データ削減

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 1OLA

1ola

解像度: 2.25→45.398 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.32 / SU ML: 0.22 / σ(F): 1.36 / 位相誤差: 22.5 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2245	4512	5.01 %
R_work	0.1805	-	-
obs	0.1828	90030	99.82 %
all	-	90232	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 39.9917 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.25→45.398 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	11552	0	0	658	12210

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	11693
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.039	15884
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	12.753	4158
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.063	1942
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	2083

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.2499-2.2755	0.2787	128	0.2159	2810	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2755-2.3023	0.2991	156	0.2168	2842	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3023-2.3304	0.2418	170	0.2179	2776	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3304-2.3599	0.2734	155	0.217	2813	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3599-2.3909	0.2656	188	0.2121	2786	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3909-2.4237	0.2352	121	0.2063	2841	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4237-2.4583	0.2806	162	0.2047	2802	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4583-2.495	0.2712	144	0.2056	2844	X-RAY DIFFRACTION	100
2.495-2.534	0.2588	144	0.1972	2820	X-RAY DIFFRACTION	100
2.534-2.5755	0.2671	152	0.195	2808	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5755-2.6199	0.2452	128	0.1904	2867	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6199-2.6675	0.2817	156	0.1896	2840	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6675-2.7188	0.2345	148	0.1936	2824	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7188-2.7743	0.27	139	0.1905	2850	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7743-2.8346	0.2289	155	0.1922	2802	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8346-2.9006	0.2915	143	0.1894	2843	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9006-2.9731	0.2157	164	0.1922	2840	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9731-3.0535	0.2174	142	0.1896	2867	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0535-3.1433	0.263	159	0.194	2804	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1433-3.2447	0.2575	145	0.193	2868	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2447-3.3607	0.2441	149	0.1843	2824	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3607-3.4952	0.2464	170	0.1827	2864	X-RAY DIFFRACTION	100
3.4952-3.6542	0.2377	136	0.1759	2865	X-RAY DIFFRACTION	100
3.6542-3.8467	0.206	126	0.1659	2905	X-RAY DIFFRACTION	100
3.8467-4.0876	0.2066	141	0.1564	2876	X-RAY DIFFRACTION	100
4.0876-4.403	0.153	145	0.1445	2878	X-RAY DIFFRACTION	100
4.403-4.8456	0.1752	151	0.1419	2894	X-RAY DIFFRACTION	100
4.8456-5.5457	0.1846	169	0.1635	2918	X-RAY DIFFRACTION	100
5.5457-6.9829	0.2095	161	0.1933	2924	X-RAY DIFFRACTION	100
6.9829-45.4068	0.1828	165	0.1761	3023	X-RAY DIFFRACTION	98

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	8.1125	-0.5944	0.7282	1.3129	-0.7055	1.4749	0.0885	-0.5852	-0.9056	-0.1158	0.1705	0.57	0.1592	-0.246	-0.189	0.2597	-0.0779	-0.0823	0.1896	0.0709	0.482	22.1014	23.9522	38.3906
2	2.2615	-0.5481	0.5065	1.8631	-0.1023	1.7045	0.2276	0.6249	-0.4671	-0.5211	-0.1459	0.3502	0.2105	0.0043	-0.0802	0.3373	0.0502	-0.0928	0.3261	-0.0549	0.3076	25.612	27.2739	28.8296
3	4.9568	-1.7381	1.2363	6.6717	-1.4058	7.4999	-0.053	0.5917	0.5015	-0.5821	0.2664	0.4949	-0.1921	-0.5897	-0.2077	0.2726	-0.0525	-0.0874	0.3205	0.0495	0.3868	15.9536	39.975	30.7558
4	5.8867	-0.3561	-0.791	1.334	-0.0033	5.5591	-0.1284	0.2852	-0.234	-0.361	0.0517	0.2326	0.1924	-0.3586	0.0806	0.265	-0.01	-0.0492	0.2445	-0.0083	0.1763	32.7476	59.3409	9.3428
5	4.8547	0.3728	0.1409	6.4704	1.6286	4.0185	-0.0247	0.1655	-0.0208	-0.3615	-0.0593	0.6097	0.3255	-0.9236	0.1126	0.2981	-0.0561	-0.0985	0.4631	0.02	0.2675	22.877	59.3347	1.9435
6	0.1695	0.1224	-0.235	1.488	-1.4032	2.0786	-0.0093	0.0688	0.0043	-0.0296	0.0588	0.1594	-0.0622	-0.1444	-0.0714	0.1743	0.0111	-0.0181	0.217	-0.035	0.2286	32.4264	52.7637	26.4336
7	4.3217	-0.1211	-1.1304	2.6144	0.2532	2.7855	0.2566	0.0827	0.6359	0.0696	-0.1353	0.3789	-0.2662	-0.0672	-0.0863	0.2503	0.0133	0.0836	0.1172	0.0166	0.3548	23.3558	70.7646	42.5909
8	1.8996	-0.6998	-1.1265	1.5517	1.5046	2.9622	0.0009	-0.4189	0.1314	0.3313	-0.1007	0.2231	0.0665	-0.1563	0.0856	0.2664	-0.076	0.0493	0.2841	-0.0208	0.2461	25.1315	63.305	48.9387
9	6.0793	1.4322	-0.2432	3.7801	0.8461	2.6542	0.3492	-0.5151	0.0205	0.4024	-0.3819	0.6908	0.1302	-0.4227	-0.0032	0.2478	-0.0447	0.0609	0.3146	-0.0138	0.3199	15.1856	59.3811	42.9916
10	6.701	0.3213	-0.4298	1.0916	1.2791	4.0377	-0.0372	-0.2416	0.2814	0.5083	-0.0453	0.1337	-0.2679	-0.2123	0.1145	0.3865	-0.0286	0.0318	0.2314	0.0362	0.181	29.3058	32.6435	67.5553
11	3.379	-0.7348	0.7696	2.8239	0.276	6.5625	0.0039	-0.1103	0.3291	0.0081	0.1859	0.5234	-0.7562	-0.6338	-0.1458	0.4215	0.0551	0.1199	0.3522	0.0294	0.3905	17.8756	32.352	73.0077
12	0.2005	0.027	-0.0699	1.6801	-1.2836	1.5146	-0.0168	-0.0266	0.0229	0.2447	0.0856	0.1253	-0.0076	-0.16	-0.0796	0.2308	-0.0376	0.0037	0.2133	-0.0196	0.2225	30.6532	39.6635	50.5959
13	4.4724	-0.9169	1.0447	2.7536	-0.6136	2.4071	0.1155	0.3795	0.1436	-0.3286	-0.2161	-0.3592	0.1958	0.5101	0.0303	0.2493	0.0734	0.0581	0.4199	0.0614	0.1792	66.6649	41.2321	16.8558
14	0.8459	-0.3317	-0.2253	1.8111	0.8392	1.499	0.0198	0.1396	-0.1573	0.112	0.0354	-0.3867	0.3383	0.2922	-0.0517	0.2489	0.0699	-0.0289	0.2883	0.0112	0.2785	66.543	35.1142	22.7183
15	7.409	-1.7074	0.8077	8.4372	-1.2	8.228	0.1399	-0.4213	-0.6602	0.5056	-0.1267	-0.6847	0.5287	0.9265	-0.0079	0.2582	0.0384	-0.0784	0.3648	0.0187	0.3661	74.7854	38.9312	35.2071
16	5.229	-0.2809	0.0153	4.813	-0.9118	1.3329	-0.0271	0.181	-0.1814	-0.2586	-0.168	-0.841	0.0866	0.2818	0.2006	0.3004	-0.0377	-0.0248	0.1984	0.044	0.3661	60.3234	14.1648	56.3091
17	1.6414	0.4426	-0.4749	3.8607	-1.0268	2.1163	-0.1231	-0.143	-0.3105	0.335	-0.1239	-0.9508	-0.0111	0.529	0.2218	0.2723	-0.0076	-0.1297	0.2866	0.0561	0.4763	65.9492	22.6426	57.8345
18	0.2408	-0.0655	0.1158	1.3571	-1.101	1.2913	0.004	-0.0156	-0.0271	0.1736	-0.1112	-0.229	-0.004	0.101	0.1298	0.1562	-0.0184	-0.058	0.2034	-0.0029	0.1882	55.6569	37.0996	43.8701
19	1.4694	0.0728	0.4908	2.1745	0.0557	2.2773	-0.1817	-0.1276	0.3563	0.3514	-0.0418	-0.3191	-0.9531	0.3001	0.1253	0.5898	-0.1243	-0.136	0.2804	0.0527	0.2937	61.9469	55.2994	57.8471
20	3.2186	0.6465	0.9388	5.1369	-0.8752	0.6965	-0.6154	-0.3147	0.4188	0.4091	0.5885	-0.3413	-1.2885	0.3494	-0.153	0.8801	-0.2594	-0.2927	0.4032	-0.0014	0.378	68.197	57.3829	65.5517
21	5.4751	0.2947	1.7713	2.5581	1.3105	3.2671	0.115	0.0162	0.4796	0.4065	-0.3481	-0.6798	-0.812	1.096	0.2886	0.4097	-0.1862	-0.0542	0.5247	0.0628	0.4656	75.9843	53.1603	49.1415
22	5.4356	0.142	0.2569	6.5985	-1.0212	0.4553	-0.0343	-0.4397	0.312	0.3462	0.0263	-0.4242	-0.1685	0.1857	0.0225	0.2081	-0.0181	0.0233	0.2169	-0.0014	0.2249	60.0388	75.9835	24.6651
23	3.1801	-0.5993	-0.2524	6.5191	-0.4637	6.5468	0.0902	-0.1737	0.2523	0.2769	-0.3836	-1.9813	0.3223	0.7079	0.2251	0.2436	-0.0225	-0.0142	0.3039	0.0517	0.6198	71.3051	80.9071	22.8469
24	0.2159	0.3056	-0.0994	2.5313	-1.575	1.5991	-0.0085	-0.0359	-0.0623	-0.0148	-0.136	-0.3828	-0.0624	0.1835	0.1779	0.1481	0.0058	-0.0029	0.2208	0.0019	0.228	58.6025	57.6321	32.4311

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(chain A and resid 2:34)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(chain A and resid 35:194)
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(chain A and resid 195:225)
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(chain A and resid 226:278)
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(chain A and resid 279:323)
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(chain A and resid 324:422)
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(chain B and resid 2:48)
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(chain B and resid 49:169)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(chain B and resid 170:226)
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(chain B and resid 227:278)
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(chain B and resid 279:322)
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(chain B and resid 323:422)
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(chain C and resid 3:43)
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(chain C and resid 44:195)
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(chain C and resid 196:225)
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(chain C and resid 228:304)
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(chain C and resid 305:346)
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(chain C and resid 347:422)
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(chain D and resid 3:147)
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(chain D and resid 148:181)
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(chain D and resid 182:226)
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(chain D and resid 227:284)
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(chain D and resid 285:323)
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(chain D and resid 324:422)

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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