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構造論文のリスト

全データ112,015件中、1から20件目までを表示しています

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Structural identification and comprehension of human ALDH1L1-Gossypol complex.

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Structure of Aquifex aeolicus lumazine synthase by cryo-electron microscopy to 1.42 Å resolution.

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About bacteriophage tail terminator and tail completion proteins: structure of the proximal extremity of siphophage T5 tail

To Be Published,
Linares R / Breyton C
手法: EM (単粒子)

51232
EMDBエントリ 画像なし

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Advanced glycation end-product (AGE) crosslinking activates a type 6 secretion system phospholipase effector protein

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The New Crystal Form of hSOD1

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Cryo-EM filament structure in FTLD-synuclein from typical multiple system atrophy brain

To Be Published,
Yang Y / Scheres HWS / Goedert M
手法: EM (らせん対称)

45979
EMDBエントリ 画像なし

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Crystal structure of outer membrane lipoprotein carrier protein (LolA) from Francisella philomiragia (monoclinic P Form)

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NRIP1_133 / RIP140 SxxLxxLL motif coregulator peptide with agonist GW1929 and PPARg LBD

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The WDR11 complex is a receptor for acidic-cluster-containing cargo proteins.

Cell, Vol. 187, Issue 16, Page 4272-4288.e20, Year 2024
Huaqing Deng / Guowen Jia / Ping Li / Yingying Tang / Lin Zhao / Qin Yang / Jia Zhao / Jinrui Wang / Yingfeng Tu / Xin Yong ...Huaqing Deng / Guowen Jia / Ping Li / Yingying Tang / Lin Zhao / Qin Yang / Jia Zhao / Jinrui Wang / Yingfeng Tu / Xin Yong / Sitao Zhang / Xianming Mo / Daniel D Billadeau / Zhaoming Su / Da Jia
手法: EM (単粒子)

38300
EMDBエントリ 画像なし

39863
EMDBエントリ 画像なし

39943
EMDBエントリ 画像なし

39947
EMDBエントリ 画像なし

39949
EMDBエントリ 画像なし

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Elucidating the Unconventional Binding Mode of a DNA-Encoded Library Hit Provides a Blueprint for Sirtuin 6 Inhibitor Development.

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Staphylococcus aureus MazF in complex with Nanobody 11

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Salmonella enterica serovar Typhimurium FliC(G426A)delta(204-292) forming the L-type straight filament

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Secondary amino-acid substitutions contribute to the emergence of HIV protease inhibitor resistance as directly as primary amino-acid substitutions.

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NMR structures of small molecules bound to a model of a CUG RNA repeat expansion.

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Crystal structure of Streptococcus pyogenes TglA

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Structural insights into the human NuA4/TIP60 acetyltransferase and chromatin remodeling complex.

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Structural switch in acetylcholine receptors in developing muscle.

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Propofol rescues voltage-dependent gating of HCN1 channel epilepsy mutants.

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Transport and inhibition mechanisms of the human noradrenaline transporter.

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Molecular mechanism of ligand gating and opening of NMDA receptor.

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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