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検索結果

検索 (著者・登録者: orlova & a)の結果199件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-52659:
A subunit of alpha-1 antitrypsin polymers isolated from ZZ explant liver tissue and decorated with conformationally nonselective Fab 9C5
手法: 単粒子 / : Aldobiyan IF, Irving JA, Orlova EV, Lomas DA

EMDB-50186:
Interface between baseplate cup and extended tail tube/sheath of Klebsiella phage KP1 variant vB_Kpn_Lilla1
手法: 単粒子 / : Orlova EV, Isupov MN

EMDB-50187:
Pre-assembled baseplate cup of Klebsiella phage KP1 variant vB_Kpn_Lilla1
手法: 単粒子 / : Orlova EV, Isupov MN

PDB-9f4a:
Interface between baseplate cup and extended tail tube/sheath of Klebsiella phage KP1 variant vB_Kpn_Lilla1
手法: 単粒子 / : Orlova EV, Isupov MN

PDB-9f4b:
Pre-assembled baseplate cup of Klebsiella phage KP1 variant vB_Kpn_Lilla1
手法: 単粒子 / : Orlova EV, Isupov MN

EMDB-19992:
Tail tube and extended tail sheath tube of Klebsiella phage KP1 variant vB_Kpn_Lilla1
手法: らせん対称 / : Orlova EV, Isupov MN

PDB-9ev2:
Tail tube and extended tail sheath tube of Klebsiella phage KP1 variant vB_Kpn_Lilla1
手法: らせん対称 / : Orlova EV, Isupov MN

EMDB-14342:
Six DNA Helix Bundle nanopore - State 1
手法: 単粒子 / : Javed A, Ahmad K

EMDB-14343:
Six DNA duplex bundle nanopore - State 2
手法: 単粒子 / : Javed A, Ahmad K

EMDB-14344:
Six DNA Helix Bundle nanopore - State 3
手法: 単粒子 / : Javed A, Ahmad K

EMDB-14345:
Six DNA Helix Bundle nanopore - State 4
手法: 単粒子 / : Javed A, Ahmad K

EMDB-14346:
Six DNA Helix Bundle nanopore - State 5
手法: 単粒子 / : Javed A, Ahmad K

PDB-7ywh:
Six DNA Helix Bundle nanopore - State 1
手法: 単粒子 / : Javed A, Ahmad K, Lanphere C, Coveney P, Howorka S, Orlova EV

PDB-7ywi:
Six DNA duplex bundle nanopore - State 2
手法: 単粒子 / : Javed A, Ahmad K, Lanphere C, Coveney P, Howorka S, Orlova EV

PDB-7ywl:
Six DNA Helix Bundle nanopore - State 3
手法: 単粒子 / : Javed A, Ahmad K, Lanphere C, Coveney P, Howorka S, Orlova EV

PDB-7ywn:
Six DNA Helix Bundle nanopore - State 4
手法: 単粒子 / : Javed A, Ahmad K, Lanphere C, Orlova EV, Coveney P, Howorka S

PDB-7ywo:
Six DNA Helix Bundle nanopore - State 5
手法: 単粒子 / : Javed A, Ahmad K, Lanphere C, Coveney P, Howorka S, Orlova EV

EMDB-14509:
gp6/gp15/gp16 connector complex of bacteriophage SPP1
手法: 単粒子 / : Orlov I, Roche S, Tavares P, Orlova EV

PDB-7z4w:
gp6/gp15/gp16 connector complex of bacteriophage SPP1
手法: 単粒子 / : Orlov I, Roche S, Tavares P, Orlova EV

EMDB-13664:
GA1 bacteriophage portal protein
手法: 単粒子 / : Javed A, Villanueva H

EMDB-13665:
PhiCPV4 bacteriophage Portal Protein
手法: 単粒子 / : Javed A, Villanueva H

PDB-7pv2:
GA1 bacteriophage portal protein
手法: 単粒子 / : Javed A, Villanueva H, Orlova EV, Savva R

PDB-7pv4:
PhiCPV4 bacteriophage Portal Protein
手法: 単粒子 / : Javed A, Villanueva H, Orlova EV, Savva R

EMDB-12707:
O-Layer C14 at 2.58A - Local refinement with C14 symmetry of the O-layer of the outer membrane core complex from the fully-assembled R388 type IV secretion system.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK

EMDB-12708:
I-Layer C16 at 3.08A - Local refinement with C16 symmetry of I-layer of the outer membrane core complex from the fully-assembled R388 type IV secretion system.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK

EMDB-12709:
Stalk C1 at 3.71A - Local refinement without symmetry of the Stalk complex from the fully-assembled R388 type IV secretion system.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK

EMDB-12715:
IMC-Arches C6 at 8.33A - Refinement with C6 symmetry of the Inner Membrane Complex (IMC) with the Arches from the fully-assembled R388 type IV secretion system.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK

EMDB-12716:
Trimer of dimers TrwK/VirB4unbound C1 at 4.14A - Refinement without symmetry of TrwK/VirB4unbound trimer of dimers complex (with Hcp1) from the R388 type IV secretion system.
手法: 単粒子 / : Vadakkepat AK, Mace K

EMDB-12717:
Dimer TrwK/VirB4unbound C1 at 3.49A - Local refinement without symmetry of the TrwK/VirB4unbound dimer complex from the R388 type IV secretion system.
手法: 単粒子 / : Vadakkepat AK, Mace K

EMDB-12933:
IMC protomer C1 at 3.75A - Local refinement without symmetry of the inner membrane complex (IMC) protomer from the fully-assembled R388 type IV secretion system.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK

EMDB-13765:
OMCC C1 at 3.28A - Refinement without symmetry of the outer membrane core complex (O- and I-layer) from the fully-assembled R388 type IV secretion system.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK, Waksman G, Lukoyanova N

EMDB-13766:
Ab Initio model for IMC-Arches-Stalk from the fully-assembled R388 type IV secretion system determined by cryo-EM.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK, Waksman G, Lukoyanova N

EMDB-13767:
IMC-Arches-Stalk C1 at 6.18A - Refinement of the IMC, Arches and Stalk complex without symmetry from the fully-assembled R388 type IV secretion system.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK

EMDB-13768:
Stalk C5 at 3.28A - Local refinement with C5 symmetry of the Stalk complex from the fully-assembled R388 type IV secretion system.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK, Waksman G, Lukoyanova N

PDB-7o3j:
O-layer structure (TrwH/VirB7, TrwF/VirB9CTD, TrwE/VirB10CTD) of the outer membrane core complex from the fully-assembled R388 type IV secretion system determined by cryo-EM.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK, Lukoyanova N, Waksman G

PDB-7o3t:
I-layer structure (TrwF/VirB9NTD, TrwE/VirB10NTD) of the outer membrane core complex from the fully-assembled R388 type IV secretion system determined by cryo-EM.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK, Lukoyanova N, Waksman G

PDB-7o3v:
Stalk complex structure (TrwJ/VirB5-TrwI/VirB6) from the fully-assembled R388 type IV secretion system determined by cryo-EM.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK, Lukoyanova N, Waksman G

PDB-7o41:
Hexameric composite model of the Inner Membrane Complex (IMC) with the Arches from the fully-assembled R388 type IV secretion system determined by cryo-EM.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK, Lukoyanova N, Waksman G

PDB-7o42:
TrwK/VirB4unbound trimer of dimers complex (with Hcp1) from the R388 type IV secretion system determined by cryo-EM.
手法: 単粒子 / : Vadakkepat AK, Mace K, Lukoyanova N, Waksman G

PDB-7o43:
TrwK/VirB4unbound dimer complex from R388 type IV secretion system determined by cryo-EM.
手法: 単粒子 / : Vadakkepat AK, Mace K, Lukoyanova N, Waksman G

PDB-7oiu:
Inner Membrane Complex (IMC) protomer structure (TrwM/VirB3, TrwK/VirB4, TrwG/VirB8tails) from the fully-assembled R388 type IV secretion system determined by cryo-EM.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK, Lukoyanova N, Waksman G

PDB-7q1v:
Arches protomer (trimer of TrwG/VirB8peri) structure from the fully-assembled R388 type IV secretion system determined by cryo-EM.
手法: 単粒子 / : Mace K, Vadakkepat AK, Lukoyanova N, Waksman G

EMDB-11852:
Bovine Papillomavirus E1 DNA helicase-replication fork complex
手法: 単粒子 / : Javed A, Major B

PDB-7apd:
Bovine Papillomavirus E1 DNA helicase-replication fork complex
手法: 単粒子 / : Javed A, Major B, Stead J, Sanders CM, Orlova EV

EMDB-4620:
A dimer component of alpha-1 antitrypsin heat-induced polymers generated from wild-type M plasma protein and decorated with Fab 4B12
手法: 単粒子 / : Elliston ELK, Redzej A, Orlova EV, Lomas DA, Irving JA

EMDB-4631:
A dimer component of alpha-1 antitrypsin polymers isolated from ZZ explant liver tissue and decorated with Fab 4B12 (component B with ~90 degree rotation around the dimer axis)
手法: 単粒子 / : Faull SV, Elliston ELK, Orlova EV, Gooptu B, Lomas DA, Irving JA

EMDB-4632:
A dimer component of alpha-1 antitrypsin polymers isolated from ZZ explant liver tissue and decorated with Fab 4B12 (component A with ~60 degree rotation around the dimer axis)
手法: 単粒子 / : Elliston ELK, Faull SV, Orlova EV, Gooptu B, Lomas DA, Irving JA

EMDB-10002:
BACTERIOPHAGE SPP1 PROCAPSID-II PROTEIN
手法: 単粒子 / : Ignatiou A, Brasiles S

EMDB-4716:
BACTERIOPHAGE SPP1 MATURE CAPSID PROTEIN
手法: 単粒子 / : Ignatiou A, El Sadek Fadel M

EMDB-4717:
BACTERIOPHAGE SPP1 PROCAPSID-I PROTEIN
手法: 単粒子 / : Ignatiou A, Brasiles S

ページ:

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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