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検索結果

検索 (著者・登録者: fujii & k)の結果83件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-63297:
Cryo-EM map of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica bound to C-terminal region of collagen model peptide (Pro-Hyp-Gly)10
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-63331:
Consensus map of apo collagenase H from Hathewaya histolytica
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-63332:
Cryo-EM map of apo collagenase H from Hathewaya histolytica - focused map of the Peptidase-Helper-PKD1 domains
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-63333:
Cryo-EM map of apo collagenase H from Hathewaya histolytica - focused map of the ARM domain
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-63334:
Consensus map of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica in complex with collagen model peptide (Pro-Hyp-Gly)10
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-63335:
Cryo-EM map of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica in complex with collagen model peptide (Pro-Hyp-Gly)10 - focused map of ColH bound to the C-terminal region of collagen model peptide
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-63336:
Cryo-EM map of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica in complex with collagen model peptide (Pro-Hyp-Gly)10 - focused map of ColH bound to the N-terminal region of collagen model peptide
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-63337:
Composite map of apo collagenase H from Hathewaya histolytica
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-63339:
Composite map of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica in complex with collagen model peptide (Pro-Hyp-Gly)10
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-63508:
Consensus map of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica in complex with collagen model peptide (Pro-Hyp-Gly)12
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-63509:
Cryo-EM map of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica in complex with collagen model peptide (Pro-Hyp-Gly)12 - focused map of the ARM domain
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-63510:
Cryo-EM map of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica in complex with collagen model peptide (Pro-Hyp-Gly)12 - focused map of the Peptidase-Helper-PKD1 domains
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-63511:
Composite map of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica in complex with collagen model peptide (Pro-Hyp-Gly)12
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-65889:
Cryo-EM structure of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica bound to C-terminal region of the collagen-binding protein ColH (Pro-Pro-Gly)10
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

PDB-9lqj:
Cryo-EM structure of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica bound to C-terminal region of collagen model peptide (Pro-Hyp-Gly)10
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

PDB-9lrk:
Cryo-EM structure of apo collagenase H from Hathewaya histolytica
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

PDB-9lrm:
Cryo-EM structure of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica in complex with collagen model peptide (Pro-Hyp-Gly)10
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

PDB-9lyi:
Cryo-EM structure of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica in complex with collagen model peptide (Pro-Hyp-Gly)12
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

PDB-9wdc:
Cryo-EM structure of collagenase H (E416Q mutant) from Hathewaya histolytica bound to C-terminal region of the collagen-binding protein ColH (Pro-Pro-Gly)10
手法: 単粒子 / : Oki H, Kawahara K

EMDB-64036:
Cryo-EM structure of the Lhcp trimer from Ostreococcus tauri at 1.94 angstrom resolution
手法: 単粒子 / : Seki S, Kubota M, Ishii A, Kim E, Tanaka H, Miyata T, Namba K, Kurisu G, Minagawa J, Fujii R

PDB-9uc6:
Cryo-EM structure of the Lhcp trimer from Ostreococcus tauri at 1.94 angstrom resolution
手法: 単粒子 / : Seki S, Kubota M, Ishii A, Kim E, Tanaka H, Miyata T, Namba K, Kurisu G, Minagawa J, Fujii R

EMDB-63799:
Cryo-EM structure of violaxanthin-chlorophyll-a-binding protein with red shifted Chl a (rVCP) from Trachydiscus minutus at 2.4 angstrom
手法: 単粒子 / : Seki S, Litvin R, Bina D, Tanaka H, Miyata T, Namba K, Kurisu G, Polivka T, Fujii R

PDB-9mcc:
Cryo-EM structure of violaxanthin-chlorophyll-a-binding protein with red shifted Chl a (rVCP) from Trachydiscus minutus at 2.4 angstrom
手法: 単粒子 / : Seki S, Litvin R, Bina D, Tanaka H, Miyata T, Namba K, Kurisu G, Polivka T, Fujii R

EMDB-62399:
CryoEM structure of Pleurocybella porrigens lectin (PPL) in complex with GalNAc
手法: 単粒子 / : Ishimoto N, Adachi D, Kawabata H, Park SY, Tame JRH, Kamata K

PDB-9kl3:
CryoEM structure of Pleurocybella porrigens lectin (PPL) in complex with GalNAc
手法: 単粒子 / : Ishimoto N, Adachi D, Kawabata H, Park SY, Tame JRH, Kamata K

EMDB-66460:
Cryo-EM Structure of human complement C1s CUB domain in complex with RAY121
手法: 単粒子 / : Kawauchi H, Adrian H, Gupta G, Koga H, Fujii T, Fukumura T, Ishino S, Irie M, Torizawa T

PDB-9x1h:
Cryo-EM Structure of human complement C1s CUB domain in complex with RAY121
手法: 単粒子 / : Kawauchi H, Adrian H, Gupta G, Koga H, Fujii T, Fukumura T, Ishino S, Irie M, Torizawa T

EMDB-38604:
RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38607:
RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38624:
RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38717:
RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xrj:
RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xrm:
RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xso:
RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xvs:
RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38825:
Cryo-EM structure of Light-harvesting complex from Spinacia oleracea
手法: 単粒子 / : Seki S, Miyata T, Tanaka H, Namba K, Kurisu G, Fujii R

EMDB-39192:
Cryo-EM structure of in vitro reconstituted Light-harvesting complex II trimer
手法: 単粒子 / : Seki S, Miyata T, Tanaka H, Namba K, Kurisu G, Fujii R

EMDB-39304:
Cryo-EM structure of light-harvesting complex II with C1 symmetry
手法: 単粒子 / : Seki S, Miyata T, Tanaka H, Namba K, Kurisu G, Fujii R

EMDB-39305:
Cryo-EM structure of in vitro reconstituted LHCII with C1 symmetry
手法: 単粒子 / : Seki S, Miyata T, Tanaka H, Namba K, Kurisu G, Fujii R

PDB-8y15:
Cryo-EM structure of Light-harvesting complex from Spinacia oleracea
手法: 単粒子 / : Seki S, Miyata T, Tanaka H, Namba K, Kurisu G, Fujii R

PDB-8yee:
Cryo-EM structure of in vitro reconstituted Light-harvesting complex II trimer
手法: 単粒子 / : Seki S, Miyata T, Tanaka H, Namba K, Kurisu G, Fujii R

EMDB-35448:
Overlapping tri-nucleosome
手法: 単粒子 / : Nishimura M, Fujii T, Tanaka H, Maehara K, Nozawa K, Takizawa Y, Ohkawa Y, Kurumizaka H

PDB-8ihl:
Overlapping tri-nucleosome
手法: 単粒子 / : Nishimura M, Fujii T, Tanaka H, Maehara K, Nozawa K, Takizawa Y, Ohkawa Y, Kurumizaka H

EMDB-32588:
The Cryo-EM structure of siphonaxanthin chlorophyll a/b type light-harvesting complex II
手法: 単粒子 / : Seki S, Nakaniwa T, Castro-Hartmann P, Sader K, Kawamoto A, Tanaka H, Qian P, Kurisu G, Fujii R

PDB-7wlm:
The Cryo-EM structure of siphonaxanthin chlorophyll a/b type light-harvesting complex II
手法: 単粒子 / : Seki S, Nakaniwa T, Castro-Hartmann P, Sader K, Kawamoto A, Tanaka H, Qian P, Kurisu G, Fujii R

EMDB-32381:
Trichodesmium erythraeum cyanophycin synthetase 1 (TeCphA1)
手法: 単粒子 / : Kawasaki M, Miyakawa T

EMDB-32382:
Trichodesmium erythraeum cyanophycin synthetase 1 (TeCphA1) with ATPgammaS
手法: 単粒子 / : Kawasaki M, Miyakawa T

EMDB-32383:
Trichodesmium erythraeum cyanophycin synthetase 1 (TeCphA1) with ATPgammaS, 4x(beta-Asp-Arg), and aspartate
手法: 単粒子 / : Miyakawa T, Yang J

EMDB-32384:
Trichodesmium erythraeum cyanophycin synthetase 1 (TeCphA1) with ATPgammaS and 4x(beta-Asp-Arg)
手法: 単粒子 / : Miyakawa T, Yang J

PDB-7wac:
Trichodesmium erythraeum cyanophycin synthetase 1 (TeCphA1)
手法: 単粒子 / : Kawasaki M, Miyakawa T, Yang J, Adachi N, Fujii A, Miyauchi Y, Muramatsu T, Moriya T, Senda T, Tanokura M

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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