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6IA0	Human telomeric G-quadruplex with 8-oxo-G substitution in the central G-quartet 分子名称: hTel-oxoG10 著者 Bielskute, S, Plavec, J, Podbevsek, P. 登録日 2018-11-26 公開日 2019-01-30 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Impact of Oxidative Lesions on the Human Telomeric G-Quadruplex. J. Am. Chem. Soc., 141, 2019
6IA4	Human telomeric G-quadruplex with 8-oxo-G substitution in the outer G-quartet 分子名称: hTel-oxoG21 著者 Bielskute, S, Plavec, J, Podbevsek, P. 登録日 2018-11-26 公開日 2019-01-30 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Impact of Oxidative Lesions on the Human Telomeric G-Quadruplex. J. Am. Chem. Soc., 141, 2019
6JCE	NMR solution and X-ray crystal structures of a DNA containing both right-and left-handed parallel-stranded G-quadruplexes 分子名称: 29-mer DNA 著者 Winnerdy, F.R, Bakalar, B, Maity, A, Vandana, J.J, Mechulam, Y, Schmitt, E, Phan, A.T. 登録日 2019-01-28 公開日 2019-07-10 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 NMR solution and X-ray crystal structures of a DNA molecule containing both right- and left-handed parallel-stranded G-quadruplexes. Nucleic Acids Res., 47, 2019
8JIH	human telomere two-quartet G-quadruplex at pH 5.0 分子名称: DNA (5'-D(*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*G)-3') 著者 Wang, B, Galer, P, Plavec, J. 登録日 2023-05-26 公開日 2024-04-03 最終更新日 2024-05-08 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Unveiling the structural mechanism of a G-quadruplex pH-Driven switch. Biochimie, 214, 2023
8JIC	human telomere two-quartet G-quadruplex at pH 7.0 分子名称: DNA (5'-D(*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*G)-3') 著者 Wang, B, Galer, P, Plavec, J. 登録日 2023-05-26 公開日 2024-04-03 最終更新日 2024-05-08 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Unveiling the structural mechanism of a G-quadruplex pH-Driven switch. Biochimie, 214, 2023
5J6U	DIY G-Quadruplexes: Solution Structure of d(GGGGTTTGGGGTTTTGGGGAAGGGG) in sodium 分子名称: DNA (25-MER) 著者 Dvorkin, S.A, Karsisiotis, A.I, Webba da Silva, M. 登録日 2016-04-05 公開日 2017-05-10 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Encoding canonical DNA quadruplex structure. Sci Adv, 4, 2018
8X1V	NMR structure of a bimolecular parallel G-quadruplex formed by AAGGG repeats from pathogenic RFC1 gene 分子名称: DNA (5'-D(*AP*AP*GP*GP*GP*AP*AP*GP*GP*GP*AP*A)-3') 著者 Wang, Y, Guo, P, Han, D. 登録日 2023-11-08 公開日 2024-01-17 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structural investigation of pathogenic RFC1 AAGGG pentanucleotide repeats reveals a role of G-quadruplex in dysregulated gene expression in CANVAS. Nucleic Acids Res., 52, 2024
6CRM	Crystal Structure of RecQ catalytic core from C. sakazakii bound to an unfolded G-quadruplex 分子名称: DNA (5'-D(P*GP*GP*GP*TP*CP*GP*GP*TP*GP*CP*CP*TP*TP*A)-3'), RecQ, ZINC ION 著者 Voter, A.F, Keck, J.L. 登録日 2018-03-19 公開日 2018-10-17 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.19286251 Å) 主引用文献 A guanine-flipping and sequestration mechanism for G-quadruplex unwinding by RecQ helicases. Nat Commun, 9, 2018
5J05	DIY G-Quadruplexes: Solution structure of d(GGGTTTGGGTTTTGGGAGGG) in sodium 分子名称: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*TP*TP*TP*GP*GP*GP*TP*TP*TP*TP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*G)-3') 著者 Dvorkin, S.A, Karsisiotis, A.I, Webba da Silva, M. 登録日 2016-03-27 公開日 2017-04-05 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Encoding canonical DNA quadruplex structure. Sci Adv, 4, 2018
5MVB	Solution structure of a human G-Quadruplex hybrid-2 form in complex with a Gold-ligand. 分子名称: DNA (26-MER), POTASSIUM ION, bis(m2-Oxo)-bis(2-methyl-2,2'-bipyridine)-di-gold(iii) 著者 Wirmer-Bartoschek, J, Jonker, H.R.A, Bendel, L.E, Gruen, T, Bazzicalupi, C, Messori, L, Gratteri, P, Schwalbe, H. 登録日 2017-01-16 公開日 2017-05-31 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution NMR Structure of a Ligand/Hybrid-2-G-Quadruplex Complex Reveals Rearrangements that Affect Ligand Binding. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 56, 2017
6T51	NMR structure of KRAS22RT G-quadruplex forming within KRAS promoter region at physological temperature 分子名称: KRAS22RT, POTASSIUM ION 著者 Marquevielle, J, Salgado, G. 登録日 2019-10-15 公開日 2019-10-30 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 1H,13C, and15N chemical shift assignments of a G-quadruplex forming sequence within the KRAS proto-oncogene promoter region. Biomol.Nmr Assign., 12, 2018
7NTU	X-ray structure of the complex between human alpha thrombin and two duplex/quadruplex aptamers: NU172 and HD22_27mer 分子名称: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide, HD22_27mer, ... 著者 Troisi, R, Santamaria, A, Sica, F. 登録日 2021-03-10 公開日 2021-04-28 最終更新日 2024-10-16 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.1 Å) 主引用文献 Structural and functional analysis of the simultaneous binding of two duplex/quadruplex aptamers to human alpha-thrombin. Int.J.Biol.Macromol., 181, 2021
1MF5	GCATGCT Quadruplex 分子名称: 5'-D(*GP*CP*AP*TP*GP*CP*T)-3', COBALT HEXAMMINE(III) 著者 Thorpe, J.H, Teixeira, S.C.M, Gale, B.C, Cardin, C.J. 登録日 2002-08-09 公開日 2003-02-11 最終更新日 2024-04-03 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.1 Å) 主引用文献 Crystal structure of the complementary quadruplex formed by d(GCATGCT) at atomic resolution Nucleic Acids Res., 31, 2003
7Z9L	Phen-DC3 intercalation causes hybrid-to-antiparallel transformation of human telomeric DNA G-quadruplex 分子名称: DNA (5'-D(*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*G)-3'), N2,N9-bis(1-methylquinolin-3-yl)-1,10-phenanthroline-2,9-dicarboxamide 著者 Ghosh, A, Trajkovski, M, Teulade-Fichou, M.P, Gabelica, V, Plavec, J. 登録日 2022-03-21 公開日 2022-08-31 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Phen-DC 3 Induces Refolding of Human Telomeric DNA into a Chair-Type Antiparallel G-Quadruplex through Ligand Intercalation. Angew.Chem.Int.Ed.Engl., 61, 2022
7V6V	trimolecular G-quadruplexes consists of a hairpin motif and two short chains 分子名称: DNA (5'-D(*CP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*GP*GP*GP*A)-3') 著者 Zhang, N, Jing, H.T, Hu, W.X. 登録日 2021-08-20 公開日 2023-02-08 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLID-STATE NMR 主引用文献 Conversion to Trimolecular G-Quadruplex by Spontaneous Hoogsteen Pairing-Based Strand Displacement Reaction between Bimolecular G-Quadruplex and Double G-Rich Probes. J.Am.Chem.Soc., 2023
7QVQ	Human telomeric DNA G-quadruplex of a gold(III) complex containing the 2,4,6-tris (2-pyrimidyl)-1,3,5-triazine ligand 分子名称: 2,4,6-tris (2-pyrimidyl)-1,3,5-triazine gold(III) complex, POTASSIUM ION, human telomeric DNA 著者 Bazzicalupi, C, Ryde, U, Gratteri, P, Bergmann, J. 登録日 2022-01-23 公開日 2022-12-28 最終更新日 2024-02-07 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å) 主引用文献 Probing the Efficiency of 13-Pyridylalkyl Berberine Derivatives to Human Telomeric G-Quadruplexes Binding: Spectroscopic, Solid State and In Silico Analysis. Int J Mol Sci, 23, 2022
8EBO	Homopurine parallel G-quadruplex from human chromosome 7 stabilized by K+ ions 分子名称: COBALT (III) ION, DNA (5'-D(*GP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*AP*AP*AP*AP*GP*GP*GP*GP*A)-3'), N-METHYLMESOPORPHYRIN, ... 著者 Chen, E.V, Yatsunyk, L.A. 登録日 2022-08-31 公開日 2022-12-28 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.98 Å) 主引用文献 Homopurine guanine-rich sequences in complex with N-methyl mesoporphyrin IX form parallel G-quadruplex dimers and display a unique symmetry tetrad. Bioorg.Med.Chem., 77, 2022
8EDP	Crystal structure of a three-tetrad, parallel, and K+ stabilized homopurine G-quadruplex from human chromosome 7 分子名称: COBALT HEXAMMINE(III), DNA (5'-D(*AP*GP*GP*GP*AP*AP*AP*AP*GP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*AP*AP*AP*AP*GP*GP*GP*G)-3'), N-METHYLMESOPORPHYRIN, ... 著者 Ye, M, Yatsunyk, L.A. 登録日 2022-09-05 公開日 2022-12-28 最終更新日 2024-05-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.01 Å) 主引用文献 Homopurine guanine-rich sequences in complex with N-methyl mesoporphyrin IX form parallel G-quadruplex dimers and display a unique symmetry tetrad. Bioorg.Med.Chem., 77, 2022
4RJ1	Structural variations and solvent structure of UGGGGU quadruplexes stabilized by Sr2+ ions 分子名称: CALCIUM ION, RNA (5'-R(*UP*GP*GP*GP*GP*U)-3'), SODIUM ION, ... 著者 Fyfe, A.C, Dunten, P.W, Scott, W.G. 登録日 2014-10-08 公開日 2014-11-12 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.92 Å) 主引用文献 Structural Variations and Solvent Structure of r(UGGGGU) Quadruplexes Stabilized by Sr(2+) Ions. J.Mol.Biol., 427, 2015
4RNE	Structural variations and solvent structure of UGGGGU quadruplexes stabilized by Sr2+ ions 分子名称: CALCIUM ION, RNA (5'-R(*UP*GP*GP*GP*GP*U)-3'), SODIUM ION, ... 著者 Fyfe, A.C, Dunten, P.W, Scott, W.G. 登録日 2014-10-24 公開日 2014-11-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.01 Å) 主引用文献 Structural Variations and Solvent Structure of r(UGGGGU) Quadruplexes Stabilized by Sr(2+) Ions. J.Mol.Biol., 427, 2015
8JFQ	Structure of the Major G-Quadruplex in the Human EGFR Oncogene Promoter Adopts a Unique Folding Topology with a Distinctive Snap-back Loop 分子名称: 26mer-DNA 著者 Liu, Y, Li, J, Zhang, Y, Wang, Y, Chen, J, Bian, Y, Xia, Y, Yang, M.H, Zheng, K, Wang, K.B, Kong, L.Y. 登録日 2023-05-18 公開日 2023-08-02 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure of the Major G-Quadruplex in the Human EGFR Oncogene Promoter Adopts a Unique Folding Topology with a Distinctive Snap-Back Loop. J.Am.Chem.Soc., 145, 2023
5NYS	M2 G-quadruplex dilute solution 分子名称: DNA (5'-D(*TP*AP*GP*GP*GP*AP*CP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*CP*AP*GP*GP*GP*T)-3') 著者 Trajkovski, M, Plavec, J, Endoh, T, Tateishi-Karimata, H, Sugimoto, N. 登録日 2017-05-11 公開日 2018-04-11 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Pursuing origins of (poly)ethylene glycol-induced G-quadruplex structural modulations. Nucleic Acids Res., 46, 2018
5NYU	M2 G-quadruplex 10 wt% PEG8000 分子名称: DNA (5'-D(*TP*AP*GP*GP*GP*AP*CP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*CP*AP*GP*GP*GP*T)-3') 著者 Trajkovski, M, Plavec, J, Endoh, T, Tateishi-Karimata, H, Sugimoto, N. 登録日 2017-05-11 公開日 2018-04-11 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Pursuing origins of (poly)ethylene glycol-induced G-quadruplex structural modulations. Nucleic Acids Res., 46, 2018
5NYT	M2 G-quadruplex 20 wt% ethylene glycol 分子名称: DNA (5'-D(*TP*AP*GP*GP*GP*AP*CP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*CP*AP*GP*GP*GP*T)-3') 著者 Trajkovski, M, Plavec, J, Endoh, T, Tateishi-Karimata, H, Sugimoto, N. 登録日 2017-05-11 公開日 2018-04-11 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Pursuing origins of (poly)ethylene glycol-induced G-quadruplex structural modulations. Nucleic Acids Res., 46, 2018
4RKV	Structural variations and solvent structure of UGGGGU quadruplexes stabilized by Sr2+ ions 分子名称: CALCIUM ION, RNA (5'-R(*UP*GP*GP*GP*GP*U)-3'), SODIUM ION, ... 著者 Fyfe, A.C, Dunten, P.W, Scott, W.G. 登録日 2014-10-14 公開日 2014-11-19 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.88 Å) 主引用文献 Structural Variations and Solvent Structure of r(UGGGGU) Quadruplexes Stabilized by Sr(2+) Ions. J.Mol.Biol., 427, 2015

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