+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1.0E+38 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | PORCINE PANCREATIC ELASTASE COMPLEXED WITH (3S, 4S)N-PARA-NITROBENZENESULPHONYL -3-ETHYL-4-(CARBOXYLIC ACID)PYRROLIDIN-2-ONE SOAKED IN PH 9 BUFFER FOR 2 MINUTES | ||||||
![]() | ELASTASE | ||||||
![]() | SERINE PROTEASE / HYDROLASE / SERINE PROTEINASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() pancreatic elastase / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / extracellular space / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Wright, P.A. / Wilmouth, R.C. / Clifton, I.J. / Schofield, C.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: 'Ph-Jump' Crystallographic Analyses of Gamma-Lactam-Porcine Pancreatic Elastase Complexes 著者: Wright, P.A. / Wilmouth, R.C. / Clifton, I.J. / Schofield, C.J. #1: ![]() タイトル: Mechanistic Insights Into the Inhibition of Serine Proteases by Monocyclic Lactams 著者: Wilmouth, R.C. / Kassamally, S. / Westwood, N.J. / Sheppard, R.J. / Claridge, T.D.W. / Aplin, R.T. / Wright, P.A. / Pritchard, G.J. / Schofield, C.J. #2: ![]() タイトル: Inhibition of Elastase by N-Sulfonylaryl Beta-Lactams: Anatomy of a Stable Acyl-Enzyme Complex 著者: Wilmouth, R.C. / Westwood, N.J. / Anderson, K. / Brownlee, W. / Claridge, T.D.W. / Clifton, I.J. / Pritchard, G.J. / Aplin, R.T. / Schofield, C.J. #3: ![]() タイトル: Structure of a Specific Acyl-Enzyme Complex Formed between Beta-Casomorphin-7 and Porcine Pancreatic Elastase 著者: Wilmouth, R.C. / Clifton, I.J. / Robinson, C.V. / Roach, P.L. / Aplin, R.T. / Westwood, N.J. / Hajdu, J. / Schofield, C.J. #4: ![]() タイトル: Structure of Native Porcine Pancreatic Elastase at 1.65 A Resolution 著者: Meyer, E. / Cole, G. / Radhakrishnan, R. / Epp, O. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 65.4 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 46.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 25928.031 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
---|---|
#2: 化合物 | ChemComp-CA / |
#3: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#4: 化合物 | ChemComp-TPY / ( |
#5: 水 | ChemComp-HOH / |
配列の詳細 | THE SEQUENCE USED FOR THIS STRUCTURE IS THE SAME AS THAT OF NATIVE PORCINE PANCREATIC |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.05 Å3/Da / 溶媒含有率: 30.1 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶化 | pH: 9 詳細: 25MM SODIUM SULPHATE, 25MM SODIUM ACETATE, PH 5.0; THEN SOAKED IN 25 MM SODIUM SULPHATE, 50MM SODIUM ACETATE, 20 MG/ML GAMMA-LACTAM, 10% (V/V) DMSO, PH 5.0 FOR 24 HOURS | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 5 / 手法: unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
|
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
---|---|
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1998年7月15日 |
放射 | モノクロメーター: SI(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.826 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.7→18.3 Å / Num. obs: 24440 / % possible obs: 98.5 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 7.7 % / Biso Wilson estimate: 18.2 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.037 / Net I/σ(I): 12.7 |
反射 シェル | 解像度: 1.7→1.73 Å / 冗長度: 3 % / Rmerge(I) obs: 0.249 / Mean I/σ(I) obs: 5.74 / % possible all: 95.4 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 95.4 % |
-
解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 3EST 解像度: 1.7→18.3 Å / SU B: 2.02 / SU ML: 0.069 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.118 / ESU R Free: 0.114 / 詳細: SHELX ALSO USED
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 18.75 Å2
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→18.3 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
|