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検索結果

検索 (著者・登録者: kimura & y)の結果147件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-66181:
Cryo-EM structure of LH1-RC from Rhodovulum sulfidophilum
手法: 単粒子 / : Yue XY, Wang GL, Yu LJ

PDB-9wqv:
Cryo-EM structure of LH1-RC from Rhodovulum sulfidophilum
手法: 単粒子 / : Yue XY, Wang GL, Yu LJ

EMDB-68389:
P301L/S320F human tau filaments from mouse brain
手法: 単粒子 / : Yanagisawa H, Kano M, Kimura T, Kikkawa M, Tomita T

PDB-22jy:
P301L/S320F human tau filaments from mouse brain
手法: 単粒子 / : Yanagisawa H, Kano M, Kimura T, Kikkawa M, Tomita T

EMDB-60059:
Structure of the Bacterial Ribosome without hypoxia-induced rRNA modifications
手法: 単粒子 / : Ishiguro K, Yokoyama T, Shirouzu M, Ito T, Suzuki T

EMDB-60060:
Structure of the Bacterial Ribosome with hypoxia-induced rRNA modifications
手法: 単粒子 / : Ishiguro K, Yokoyama T, Shirouzu M, Ito T, Suzuki T

EMDB-63714:
Structure of photosynthetic LH1-RC complex the Halophilic Nonsulfur Purple Bacterium, Rhodothalassium salexigens
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Inami M, Ooya T, Matsushita R, Minamino A, Takenaka S, Takaichi S, Purba ER, Hall M, Mochizuki T, Yu LJ, Mizoguchi A, Humbel BM, Madigan MT, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

EMDB-64946:
Map including micelle density from the photosynthetic LH1-RC complex of the halophilic nonsulfur purple bacterium Rhodothalassium salexigens
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Inami M, Ooya T, Matsushita R, Inada K, Takenaka S, Takaichi S, Purba ER, Hall M, Mochizuki T, Yu LJ, Mizoguchi A, Humbel BM, Madigan MT, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

PDB-9m8m:
Structure of photosynthetic LH1-RC complex the Halophilic Nonsulfur Purple Bacterium, Rhodothalassium salexigens
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Inami M, Ooya T, Matsushita R, Minamino A, Takenaka S, Takaichi S, Purba ER, Hall M, Mochizuki T, Yu LJ, Mizoguchi A, Humbel BM, Madigan MT, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

EMDB-61076:
KU13-bond Mycobacterium tuberculosis 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Nishihara D, Fujino M, Tanaka Y, Yokoyama T

PDB-9j1m:
KU13-bond Mycobacterium tuberculosis 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Nishihara D, Fujino M, Tanaka Y, Yokoyama T

EMDB-37121:
Structure of nucleosome complexed with one DEK molecule
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-37149:
Structure of H1.2 bound to the nucleosome
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8kd1:
Structure of nucleosome complexed with one DEK molecule
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8ke0:
Structure of H1.2 bound to the nucleosome
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-37115:
Structure of nucleosome complexed with two DEK molecules
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38443:
193 bp Widom601L nucleosome (closed)
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38444:
193 bp Widom601L nucleosome (middle)
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38445:
193 bp Widom601L nucleosome (open)
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8kcy:
Structure of nucleosome complexed with two DEK molecules
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-39835:
Photosynthetic LH2-LH1 complex from the purple bacterium Halorhodospira halophila
手法: 単粒子 / : Tani K, Nagashima KVP, Kanno R, Hiwatashi N, Kawakami M, Nakata K, Nagashima S, Inoue K, Takaichi S, Purba ER, Hall M, Yu LJ, Madigan MT, Mizoguchi A, Humbel BM, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

PDB-8z81:
Photosynthetic LH2-LH1 complex from the purple bacterium Halorhodospira halophila
手法: 単粒子 / : Tani K, Nagashima KVP, Kanno R, Hiwatashi N, Kawakami M, Nakata K, Nagashima S, Inoue K, Takaichi S, Purba ER, Hall M, Yu LJ, Madigan MT, Mizoguchi A, Humbel BM, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

EMDB-39836:
Photosynthetic LH1-RC-HiPIP complex from the purple bacterium Halorhodospira halophila
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Nagashima KVP, Hiwatashi N, Kawakami M, Nakata K, Nagashima S, Inoue K, Takaichi S, Purba ER, Hall M, Yu LJ, Madigan MT, Mizoguchi A, Humbel BM, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

EMDB-39837:
Photosynthetic LH1-RC complex from the purple bacterium Halorhodospira halophila
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Nagashima KVP, Hiwatashi N, Kawakami M, Nakata K, Nagashima S, Inoue K, Takaichi S, Purba ER, Hall M, Yu LJ, Madigan MT, Mizoguchi A, Humbel BM, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

PDB-8z82:
Photosynthetic LH1-RC-HiPIP complex from the purple bacterium Halorhodospira halophila
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Nagashima KVP, Hiwatashi N, Kawakami M, Nakata K, Nagashima S, Inoue K, Takaichi S, Purba ER, Hall M, Yu LJ, Madigan MT, Mizoguchi A, Humbel BM, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

PDB-8z83:
Photosynthetic LH1-RC complex from the purple bacterium Halorhodospira halophila
手法: 単粒子 / : Tani K, Kanno R, Nagashima KVP, Hiwatashi N, Kawakami M, Nakata K, Nagashima S, Inoue K, Takaichi S, Purba ER, Hall M, Yu LJ, Madigan MT, Mizoguchi A, Humbel BM, Kimura Y, Wang-Otomo ZY

EMDB-60158:
Cryo-EM structure of photosynthetic LH1' complex of Roseospirillum parvum
手法: 単粒子 / : Wang GL, Wang XP, Yu LJ

EMDB-60165:
Cryo-EM structure of photosynthetic LH1-RC core complex of Roseospirillum parvum
手法: 単粒子 / : Wang GL, Wang XP, Yu LJ

PDB-8zjw:
Cryo-EM structure of photosynthetic LH1' complex of Roseospirillum parvum
手法: 単粒子 / : Wang GL, Wang XP, Yu LJ

PDB-8zk2:
Cryo-EM structure of photosynthetic LH1-RC core complex of Roseospirillum parvum
手法: 単粒子 / : Wang GL, Wang XP, Yu LJ

EMDB-61095:
Structure of photosynthetic LH1-RC complex from the purple bacterium Blastochloris tepida
手法: 単粒子 / : Kimura Y, Kanno R, Mori K, Matsuda Y, Seto R, Takenaka S, Mino H, Ohkubo T, Honda M, Sasaki YC, Kishikawa J, Mitsuoka K, Mio K, Hall M, Purba ER, Mochizuki T, Mizoguchi A, Humbel BM, Madigan MT, Wang-Otomo ZY, Tani K

PDB-9j2f:
Structure of photosynthetic LH1-RC complex from the purple bacterium Blastochloris tepida
手法: 単粒子 / : Kimura Y, Kanno R, Mori K, Matsuda Y, Seto R, Takenaka S, Mino H, Ohkubo T, Honda M, Sasaki YC, Kishikawa J, Mitsuoka K, Mio K, Hall M, Purba ER, Mochizuki T, Mizoguchi A, Humbel BM, Madigan MT, Wang-Otomo ZY, Tani K

EMDB-60274:
SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein trimer in complex with antigen-binding fragments (Fabs)
手法: 単粒子 / : Sugita Y, Kimura K, Noda T, Hashiguchi T

EMDB-39577:
E. coli 70S ribosome complexed with P. putida tRNAIle2 at the A-site and P-site
手法: 単粒子 / : Akiyama N, Ishiguro K, Shirouzu M, Suzuki T

EMDB-39578:
E. coli 70S ribosome complexed with P. putida tRNAIle2 and A4 mRNA
手法: 単粒子 / : Akiyama N, Ishiguro K, Shirouzu M, Suzuki T

EMDB-39579:
E. coli 70S ribosome complexed with P. putida tRNAIle2 and dA4 mRNA
手法: 単粒子 / : Akiyama N, Ishiguro K, Shirouzu M, Suzuki T

EMDB-39580:
E. coli 70S ribosome complexed with P. putida tRNAIle2 and Am4 mRNA
手法: 単粒子 / : Akiyama N, Ishiguro K, Shirouzu M, Suzuki T

EMDB-39581:
E. coli 70S ribosome complexed with P.putida tRNAIle2 and A(F)4 mRNA
手法: 単粒子 / : Akiyama N, Ishiguro K, Shirouzu M, Suzuki T

PDB-8yuo:
E. coli 70S ribosome complexed with P. putida tRNAIle2 at the A-site and P-site
手法: 単粒子 / : Akiyama N, Ishiguro K, Shirouzu M, Suzuki T

PDB-8yup:
E. coli 70S ribosome complexed with P. putida tRNAIle2 and A4 mRNA
手法: 単粒子 / : Akiyama N, Ishiguro K, Shirouzu M, Suzuki T

PDB-8yuq:
E. coli 70S ribosome complexed with P. putida tRNAIle2 and dA4 mRNA
手法: 単粒子 / : Akiyama N, Ishiguro K, Shirouzu M, Suzuki T

PDB-8yur:
E. coli 70S ribosome complexed with P. putida tRNAIle2 and Am4 mRNA
手法: 単粒子 / : Akiyama N, Ishiguro K, Shirouzu M, Suzuki T

PDB-8yus:
E. coli 70S ribosome complexed with P.putida tRNAIle2 and A(F)4 mRNA
手法: 単粒子 / : Akiyama N, Ishiguro K, Shirouzu M, Suzuki T

EMDB-37910:
Structure of the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein (closed state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38459:
Structure of the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike protein (1-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38686:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38687:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up and 1-down state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38688:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike RBD in complex with ACE2 (up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38689:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike RBD in complex with ACE2 (down state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38690:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (3-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

ページ:

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

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関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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