PDB: 20503 件ウェブページステータス検索Chemie searchBIRD

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7OMK	The NMR structure of the Zf-GRF domains from the mouse Endonuclease VIII-LIKE 3 (mNEIL3) 分子名称: Endonuclease 8-like 3 著者 Dinesh, D.C, Huskova, A, Srb, P, Veverka, V, Silhan, J. 登録日 2021-05-24 公開日 2022-06-01 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Model of abasic site DNA cross-link repair; from the architecture of NEIL3 DNA binding domains to the X-structure model. Nucleic Acids Res., 50, 2022
7JS6	Solution NMR structure of des-citrulassin F 分子名称: des-citrulassin F 著者 Harris, L.A, Mitchell, D.A. 登録日 2020-08-13 公開日 2020-12-16 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Reactivity-Based Screening for Citrulline-Containing Natural Products Reveals a Family of Bacterial Peptidyl Arginine Deiminases. Acs Chem.Biol., 15, 2020
7UBF	Solution NMR structure of 8-residue Rosetta-designed cyclic peptide D8.21 in 50% d6-DMSO and 50% water with cis/trans switching (CC conformation, 50%) 分子名称: Cyclic peptide D8.21 DVA-MLE-DPR-LEU-DVA-MLE-DPR-LEU 著者 Ramelot, T.A, Tejero, R, Montelione, G.T. 登録日 2022-03-14 公開日 2022-09-14 最終更新日 2022-09-28 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Accurate de novo design of membrane-traversing macrocycles. Cell, 185, 2022
7UBD	Solution NMR structure of 8-residue Rosetta-designed cyclic peptide D8.31 in d6-DMSO with cis/trans switching (A-CC conformation) 分子名称: Cyclic peptide D8.31 DAL-DPR-MLU-DVA-DAL-DPR-MLU-DVA 著者 Ramelot, T.A, Tejero, R, Montelione, G.T. 登録日 2022-03-14 公開日 2022-09-14 最終更新日 2022-09-28 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Accurate de novo design of membrane-traversing macrocycles. Cell, 185, 2022
7UBI	Solution NMR structure of 8-residue Rosetta-designed cyclic peptide D8.21 in CDCl3 with cis/trans switching (TT conformation, 47%) 分子名称: Cyclic peptide D8.21 DVA-MLE-DPR-LEU-DVA-MLE-DPR-LEU 著者 Ramelot, T.A, Tejero, R, Montelione, G.T. 登録日 2022-03-14 公開日 2022-09-14 最終更新日 2022-09-28 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Accurate de novo design of membrane-traversing macrocycles. Cell, 185, 2022
7UBG	Solution NMR structure of 9-residue Rosetta-designed cyclic peptide D9.16 in CDCl3 with cis/trans switching (A-TT conformation) 分子名称: Cyclic peptide D9.16 DPR-MAA-ALA-DVA-MLE-LEU-LEU-PRO-DLE 著者 Ramelot, T.A, Tejero, R, Montelione, G.T. 登録日 2022-03-14 公開日 2022-09-14 最終更新日 2022-09-28 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Accurate de novo design of membrane-traversing macrocycles. Cell, 185, 2022
8XZ2	The structural model of a homodimeric D-Ala-D-Ala metallopeptidase, VanX, from vancomycin-resistant bacteria 分子名称: D-alanyl-D-alanine dipeptidase 著者 Konuma, T, Takai, T, Tsuchiya, C, Nishida, M, Hashiba, M, Yamada, Y, Shirai, H, Motoda, Y, Nagadoi, A, Chikaishi, E, Akagi, K, Akashi, S, Yamazaki, T, Akutsu, H, Oe, A, Ikegami, T. 登録日 2024-01-20 公開日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Analysis of the homodimeric structure of a D-Ala-D-Ala metallopeptidase, VanX, from vancomycin-resistant bacteria. Protein Sci., 33, 2024
6K8Q	Solution structure of the intermembrane space domain of the mitochondrial import protein Tim21 from S. cerevisiae 分子名称: Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM21 著者 Bala, S, Shinya, S, Srivastava, A, Shimada, A, Kobayashi, N, Kojima, C, Tama, F, Miyashita, O, Kohda, D. 登録日 2019-06-13 公開日 2019-09-11 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Crystal contact-free conformation of an intrinsically flexible loop in protein crystal: Tim21 as the case study. Biochim Biophys Acta Gen Subj, 1864, 2020
8H0G	AQEE-30 in a HFIP solution 分子名称: AQEE-30 著者 Park, O.-S, Jeon, Y.H, Cheong, C. 登録日 2022-09-28 公開日 2022-12-14 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure of AQEE-30 of VGF Neuropeptide in Membrane-Mimicking Environments. Int J Mol Sci, 23, 2022
8H0U	AQEE-30 in a DPC solution 分子名称: AQEE-30 著者 Park, O.-S, Jeon, Y.H, Cheong, C. 登録日 2022-09-30 公開日 2022-12-14 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure of AQEE-30 of VGF Neuropeptide in Membrane-Mimicking Environments. Int J Mol Sci, 23, 2022
8HEQ	Solution structure of the periplasmic domain of the anti-sigma factor RsgI2 from Clostridium thermocellum 分子名称: Anti-sigma-I factor RsgI2 著者 Chen, C, Feng, Y. 登録日 2022-11-08 公開日 2023-05-24 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Essential autoproteolysis of bacterial anti-sigma factor RsgI for transmembrane signal transduction. Sci Adv, 9, 2023
7NN6	periplasmic domain of Vibrio cholerae ToxR 分子名称: ToxR 著者 Gubensaek, N, Wagner, G.E, Zangger, K. 登録日 2021-02-24 公開日 2021-04-07 最終更新日 2021-06-30 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 The periplasmic domains of Vibriocholerae ToxR and ToxS are forming a strong heterodimeric complex independent on the redox state of ToxR cysteines. Mol.Microbiol., 115, 2021
7NM2	Solution structure of MLKL executioner domain in complex with a fragment 分子名称: 2-[(~{S})-methoxy-(4-propan-2-ylphenyl)methyl]-3~{H}-benzimidazole-5-carboxylic acid, Mixed lineage kinase domain-like protein 著者 Ruebbelke, M, Bauer, M, Hamilton, J, Binder, F, Nar, H, Zeeb, M. 登録日 2021-02-23 公開日 2021-09-22 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Discovery and Structure-Based Optimization of Fragments Binding the Mixed Lineage Kinase Domain-like Protein Executioner Domain. J.Med.Chem., 64, 2021
7NM5	Solution structure of MLKL executioner domain in complex with a fragment 分子名称: 2-[(~{S})-methoxy-(4-phenylphenyl)methyl]-3~{H}-benzimidazole-5-carboxylic acid, Mixed lineage kinase domain-like protein 著者 Ruebbelke, M, Bauer, M, Hamilton, J, Binder, F, Nar, H, Zeeb, M. 登録日 2021-02-23 公開日 2021-09-22 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Discovery and Structure-Based Optimization of Fragments Binding the Mixed Lineage Kinase Domain-like Protein Executioner Domain. J.Med.Chem., 64, 2021
7NM4	Solution structure of MLKL executioner domain in complex with a fragment 分子名称: (~{S})-1~{H}-benzimidazol-2-yl-(4-propan-2-ylphenyl)methanol, Mixed lineage kinase domain-like protein 著者 Ruebbelke, M, Bauer, M, Hamilton, J, Binder, F, Nar, H, Zeeb, M. 登録日 2021-02-23 公開日 2021-09-22 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Discovery and Structure-Based Optimization of Fragments Binding the Mixed Lineage Kinase Domain-like Protein Executioner Domain. J.Med.Chem., 64, 2021
8JIC	human telomere two-quartet G-quadruplex at pH 7.0 分子名称: DNA (5'-D(*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*G)-3') 著者 Wang, B, Galer, P, Plavec, J. 登録日 2023-05-26 公開日 2024-04-03 最終更新日 2024-05-08 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Unveiling the structural mechanism of a G-quadruplex pH-Driven switch. Biochimie, 214, 2023
8JIH	human telomere two-quartet G-quadruplex at pH 5.0 分子名称: DNA (5'-D(*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*G)-3') 著者 Wang, B, Galer, P, Plavec, J. 登録日 2023-05-26 公開日 2024-04-03 最終更新日 2024-05-08 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Unveiling the structural mechanism of a G-quadruplex pH-Driven switch. Biochimie, 214, 2023
8CWA	Solution NMR structure of 8-residue Rosetta-designed cyclic peptide D8.21 in CDCl3 with cis/trans switching (TC conformation, 53%) 分子名称: Cyclic peptide D8.21 DVA-MLE-DPR-LEU-DVA-MLE-DPR-LEU 著者 Ramelot, T.A, Tejero, R, Montelione, G.T. 登録日 2022-05-18 公開日 2022-09-14 最終更新日 2022-09-28 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Accurate de novo design of membrane-traversing macrocycles. Cell, 185, 2022
7DVM	DgkA structure in E.coli lipid bilayer 分子名称: Diacylglycerol kinase 著者 Li, J, Yang, J. 登録日 2021-01-13 公開日 2022-04-13 最終更新日 2023-09-27 実験手法 SOLID-STATE NMR 主引用文献 Structure of membrane diacylglycerol kinase in lipid bilayers. Commun Biol, 4, 2021
6W0O	Amyloid-beta(1-40) fibril derived from Alzheimer's disease cortical tissue 分子名称: Amyloid-beta precursor protein 著者 Ghosh, U, Thurber, K.R, Tycko, R. 登録日 2020-03-02 公開日 2021-01-13 最終更新日 2024-05-15 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (2.77 Å), SOLID-STATE NMR 主引用文献 Molecular structure of a prevalent amyloid-beta fibril polymorph from Alzheimer's disease brain tissue. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
8Q7J	Conformations of macrocyclic peptides sampled by exact NOEs: models for cell-permeability 分子名称: CYCLOSPORIN A 著者 Ruedisser, S.H, Matabaro, E, Sonderegger, L, Guentert, P, Kuenzler, M, Gossert, A.D. 登録日 2023-08-16 公開日 2023-12-06 最終更新日 2024-01-03 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Conformations of Macrocyclic Peptides Sampled by Nuclear Magnetic Resonance: Models for Cell-Permeability. J.Am.Chem.Soc., 145, 2023
8E2O	Leveraging the Structure of DNAJA1 to Discover Novel Pancreatic Cancer Therapies 分子名称: Isoform 2 of DnaJ homolog subfamily A member 1 著者 Roth, H.E, Powers, R. 登録日 2022-08-15 公開日 2022-11-09 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Leveraging the Structure of DNAJA1 to Discover Novel Potential Pancreatic Cancer Therapies. Biomolecules, 12, 2022
6GCJ	Solution structure of the RodA hydrophobin from Aspergillus fumigatus 分子名称: Hydrophobin 著者 Pille, A, Kwan, A, Aimanianda, V, Latge, J.-P, Sunde, M, Guijarro, J.I. 登録日 2018-04-18 公開日 2019-03-27 最終更新日 2019-09-04 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Assembly and disassembly of Aspergillus fumigatus conidial rodlets Cell Surf, 2019
7RNO	Model of the Ac-6-FP/hpMR1/bB2m/TAPBPR complex from integrated docking, NMR and restrained MD 分子名称: Beta-2-microglobulin, Major histocompatibility complex class I-related gene protein, N-(6-formyl-4-oxo-3,4-dihydropteridin-2-yl)acetamide, ... 著者 McShan, A.C, Sgourakis, N.G. 登録日 2021-07-29 公開日 2022-05-11 最終更新日 2022-08-10 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 TAPBPR employs a ligand-independent docking mechanism to chaperone MR1 molecules. Nat.Chem.Biol., 18, 2022
2FNF	C1 domain of Nore1 分子名称: ZINC ION, putative Ras Effector Nore1 著者 Harjes, E, Harjes, S, Wohlgemuth, S, Krieger, E, Herrmann, C, Muller, K.H, Bayer, P. 登録日 2006-01-11 公開日 2006-02-07 最終更新日 2024-05-29 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 GTP-Ras disrupts the intramolecular complex of C1 and RA domains of Nore1. Structure, 14, 2006

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