PDB: 669 件ウェブページステータス検索Chemie searchBIRD

---

2KQH	A G-rich sequence within the c-kit oncogene promoter forms a parallel G-quadruplex having asymmetric G-tetrad dynamics 分子名称: 5'-D(*CP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*CP*GP*CP*GP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*T)-3', POTASSIUM ION 著者 Hsu, S.-T.D, Varnai, P, Bugaut, A, Reszka, A.P, Neidle, S, Balasubramanian, S. 登録日 2009-11-05 公開日 2009-11-24 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 A G-rich sequence within the c-kit oncogene promoter forms a parallel G-quadruplex having asymmetric G-tetrad dynamics J.Am.Chem.Soc., 131, 2009
2N2D	Structure of DNA G-quadruplex adopted by ALS and FTD related GGGGCC repeat with G21 to Br-G21 substitution 分子名称: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*GP*CP*CP*GP*GP*GP*GP*CP*CP*GP*GP*GP*GP*CP*CP*GP*GP*(BGM)P*G)-3') 著者 Brcic, J, Plavec, J. 登録日 2015-05-06 公開日 2015-09-23 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of a DNA quadruplex containing ALS and FTD related GGGGCC repeat stabilized by 8-bromodeoxyguanosine substitution. Nucleic Acids Res., 43, 2015
2LPW	human CEB25 minisatellite G-quadruplex 分子名称: DNA (26-MER) 著者 Amrane, S, Adrian, M, Heddi, B, Serero, A, Nicolas, A, Mergny, J.L, Phan, A.T. 登録日 2012-02-20 公開日 2012-03-07 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Formation of Pearl-Necklace Monomorphic G-Quadruplexes in the Human CEB25 Minisatellite. J.Am.Chem.Soc., 134, 2012
2N9Q	Photoswitchable G-quadruplex 分子名称: DNA (5'-D(*GP*GP*(AZW)P*GP*G)-3'), POTASSIUM ION 著者 Thevarpadam, J, Bessi, I, Binas, O, Goncalves, D.P.N, Slavov, C, Jonker, H.R.A, Richter, C, Wachtveitl, J, Schwalbe, H, Heckel, A. 登録日 2015-12-02 公開日 2016-02-17 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Photoresponsive Formation of an Intermolecular Minimal G-Quadruplex Motif. Angew.Chem.Int.Ed.Engl., 55, 2016
2LK7	Monomer-dimer equilibrium for 5'-5' stacking of propeller-type parallel-stranded G-quadruplexes: NMR structural study 分子名称: DNA (5'-D(*TP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*GP*GP*T)-3') 著者 Do, N.Q, Phan, A.T. 登録日 2011-10-07 公開日 2012-10-10 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Monomer-Dimer Equilibrium for the 5'-5' Stacking of Propeller-Type Parallel-Stranded G-Quadruplexes: NMR Structural Study Chemistry, 2012
2MGN	Solution structure of a G-quadruplex bound to the bisquinolinium compound Phen-DC3 分子名称: 5'-D(*TP*GP*AP*GP*GP*GP*TP*GP*GP*TP*GP*AP*GP*GP*GP*TP*GP*GP*GP*GP*AP*AP*GP*G)-3', N2,N9-bis(1-methylquinolin-3-yl)-1,10-phenanthroline-2,9-dicarboxamide 著者 Chung, W.J, Heddi, B, Hamon, F, Teulade-Fichou, M.P, Phan, A.T. 登録日 2013-11-01 公開日 2014-01-22 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution Structure of a G-quadruplex Bound to the Bisquinolinium Compound Phen-DC3. Angew.Chem.Int.Ed.Engl., 53, 2014
2KAZ	Folding topology of a bimolecular DNA quadruplex containing a stable mini-hairpin motif within the connecting loop 分子名称: 5'-D(*DGP*DGP*DGP*DAP*DCP*DGP*DTP*DAP*DGP*DTP*DGP*DGP*DG)-3', POTASSIUM ION 著者 Balkwill, G.D, Garner, T.P, Williams, H.E.L, Searle, M.S. 登録日 2008-11-18 公開日 2008-12-16 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Folding topology of a bimolecular DNA quadruplex containing a stable mini-hairpin motif within the diagonal loop J.Mol.Biol., 385, 2009
2M1G	Parallel human telomeric quadruplex containing 2'F-ANA substitutions 分子名称: 5'-D(*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*(GFL)P*GP*GP*T)-3' 著者 Martin-Pintado, N, Yahyaee-Anzahaee, M, Deleavey, G.F, Portella, G, Orozco, M, Damha, M.J, Gonzalez, C. 登録日 2012-11-27 公開日 2013-05-08 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Dramatic effect of furanose c2' substitution on structure and stability: directing the folding of the human telomeric quadruplex with a single fluorine atom. J.Am.Chem.Soc., 135, 2013
2KKA	Human telomere DNA two-tetrad quadruplex structure in K+ solution 分子名称: 5'-D(*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*IP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*T)-3' 著者 Zhang, Z, Dai, J, Yang, D. 登録日 2009-06-16 公開日 2009-12-15 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure of a two-G-tetrad intramolecular G-quadruplex formed by a variant human telomeric sequence in K+ solution: insights into the interconversion of human telomeric G-quadruplex structures. Nucleic Acids Res., 38, 2010
2MBJ	Structure of an antiparallel (2+2) G-quadruplex formed by human telomeric repeats in Na+ solution (with G22-to-BrG substitution) 分子名称: DNA_(27-MER) 著者 Lim, K.W, Ng, V.C.M, Martin-Pintado, N, Heddi, B, Phan, A.T. 登録日 2013-08-02 公開日 2013-09-18 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure of the human telomere in Na+ solution: an antiparallel (2+2) G-quadruplex scaffold reveals additional diversity. Nucleic Acids Res., 41, 2013
2N4Y	Structure and possible function of a G-quadruplex in the long terminal repeat of the proviral HIV-1 genome 分子名称: DNA_(5'-D(*CP*TP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*AP*CP*TP*GP*GP*GP*GP*AP*GP*TP*GP*GP*T)-3') 著者 DeNicola, B, Lech, C.J, Heddi, B, Regmi, S, Frasson, I, Perrone, R, Richter, S.N, Phan, A.T. 登録日 2015-07-02 公開日 2016-06-29 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure and possible function of a G-quadruplex in the long terminal repeat of the proviral HIV-1 genome. Nucleic Acids Res., 44, 2016
2L88	Solution structure of all parallel G-quadruplex formed by the oncogene RET promoter sequence 分子名称: 5'-D(*GP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*GP*T)-3' 著者 Tong, X, Cao, C. 登録日 2011-01-06 公開日 2011-05-25 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of all parallel G-quadruplex formed by the oncogene RET promoter sequence Nucleic Acids Res., 39, 2011
2KM3	Structure of an intramolecular G-quadruplex containing a G.C.G.C tetrad formed by human telomeric variant CTAGGG repeats 分子名称: DNA (5'-D(*AP*GP*GP*GP*CP*TP*AP*GP*GP*GP*CP*TP*AP*GP*GP*GP*CP*TP*AP*GP*GP*G)-3') 著者 Lim, K.W, Alberti, P, Guedin, A, Lacroix, L, Riou, J.F, Royle, N.J, Mergny, J.L, Phan, A.T. 登録日 2009-07-17 公開日 2009-11-03 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Sequence variant (CTAGGG)n in the human telomere favors a G-quadruplex structure containing a G.C.G.C tetrad Nucleic Acids Res., 37, 2009
2M6V	Solution NMR structure of the d(GGGTTGGGTTTTGGGTGGG) quadruplex in sodium conditions 分子名称: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*TP*TP*GP*GP*GP*TP*TP*TP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*GP*G)-3') 著者 Karsisiotis, A.I, Webba da Silva, M. 登録日 2013-04-10 公開日 2014-07-16 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Encoding canonical DNA quadruplex structure. Sci Adv, 4, 2018
2M6W	Solution NMR structure of the d(GGGGTTGGGGTTTTGGGGAAGGGG) quadruplex in sodium conditions 分子名称: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*GP*TP*TP*GP*GP*GP*GP*TP*TP*TP*TP*GP*GP*GP*GP*AP*AP*GP*GP*GP*G)-3') 著者 Karsisiotis, A.I, Webba da Silva, M. 登録日 2013-04-19 公開日 2014-07-23 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Encoding canonical DNA quadruplex structure. Sci Adv, 4, 2018
2LOD	Solution-state structure of an intramolecular G-quadruplex with propeller, diagonal and edgewise loops 分子名称: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*CP*AP*CP*AP*GP*GP*GP*GP*AP*CP*GP*GP*G)-3') 著者 Marusic, M, Sket, P, Bauer, L, Viglasky, V, Plavec, J. 登録日 2012-01-23 公開日 2012-05-30 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution-state structure of an intramolecular G-quadruplex with propeller, diagonal and edgewise loops. Nucleic Acids Res., 40, 2012
7PNE	Parallel Q-D hybrid with 3' duplex stem-loop as a lateral snapback loop 分子名称: TTAMycdup-3sbl 著者 Vianney, Y.M, Weisz, K. 登録日 2021-09-06 公開日 2021-12-29 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Indoloquinoline Ligands Favor Intercalation at Quadruplex-Duplex Interfaces. Chemistry, 28, 2022
5MTG	G-quadruplex formed within promoters of Plasmodium falciparum B var genes - form I 分子名称: UpsB-Q-1 DNA (34-MER) 著者 Juribasic Kulcsar, M, Plavec, J. 登録日 2017-01-09 公開日 2018-02-28 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Stabilizing interactions in long-loop G-quadruplex formed within promoters of Plasmodium falciparum B var genes To Be Published
5MTA	G-quadruplex formed within promoters of Plasmodium falciparum B var genes 分子名称: UpsB-Q-1, DNA (34-MER) 著者 Juribasic Kulcsar, M, Plavec, J. 登録日 2017-01-09 公開日 2018-02-28 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Stabilizing interactions in long-loop G-quadruplex formed within promoters of Plasmodium falciparum B var genes To Be Published
8XAK	Structure of Pif1-G4 complex 分子名称: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE, ATP-dependent DNA helicase PIF1, DNA (34-MER), ... 著者 Hong, Z, Song, H. 登録日 2023-12-04 公開日 2024-07-31 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.5 Å) 主引用文献 Eukaryotic Pif1 helicase unwinds G-quadruplex and dsDNA using a conserved wedge. Nat Commun, 15, 2024
2LYG	Fuc_TBA 分子名称: 2-hydroxyethyl 6-deoxy-beta-L-galactopyranoside, DNA (5'-D(P*GP*GP*TP*TP*GP*GP*TP*GP*TP*GP*GP*TP*TP*GP*G)-3') 著者 Gomez-Pinto, I, Vengut-Climent, E, Lucas, R, Avio, A, Eritja, R, Gonzalez-Ibaez, C, Morales, J. 登録日 2012-09-18 公開日 2014-01-29 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Carbohydrate-DNA interactions at G-quadruplexes: folding and stability changes by attaching sugars at the 5'-end. Chemistry, 19, 2013
1KF1	Structure and Packing of Human Telomeric DNA 分子名称: 5'-D(*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*G)-3, POTASSIUM ION 著者 Parkinson, G.N, Lee, M.P.H, Neidle, S. 登録日 2001-11-19 公開日 2002-05-31 最終更新日 2023-08-16 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Crystal structure of parallel quadruplexes from human telomeric DNA. Nature, 417, 2002
1V3O	Crystal structure of d(GCGAGAGC): the DNA quadruplex structure split from the octaplex 分子名称: 5'-D(*GP*(C38)P*GP*AP*GP*AP*GP*C)-3', POTASSIUM ION 著者 Kondo, J, Umeda, S, Sunami, T, Takenaka, A. 登録日 2003-11-03 公開日 2004-06-08 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) 主引用文献 Crystal structures of a DNA octaplex with I-motif of G-quartets and its splitting into two quadruplexes suggest a folding mechanism of eight tandem repeats Nucleic Acids Res., 32, 2004
7YS5	RET G-quadruplex in 10mM Na+ 分子名称: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*GP*GP*T)-3') 著者 Yin, S, Cao, C. 登録日 2022-08-11 公開日 2023-09-06 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 RET G-quadruplex in 10mM Na+ To Be Published
4WO3	THE SECOND C-KIT DNA QUADRUPLEX CRYSTAL STRUCTURE 分子名称: DNA (5'-D(*AP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*GP*CP*GP*CP*TP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*AP*GP*GP*G)-3'), POTASSIUM ION 著者 Wei, D, Neidle, S. 登録日 2014-10-15 公開日 2014-10-29 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.73 Å) 主引用文献 THE SECOND C-KIT1 DNA QUADRUPLEX CRYSTAL STRUCTURE TO BE PUBLISHED

<6789101112131415161718192021>