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検索結果

検索 (著者・登録者: castano & diez & d)の結果全40件を表示しています

EMDB-15413:
Architecture of the ESCPE-1 membrane coat
手法: サブトモグラム平均 / : Lopez-Robles C, Scaramuzza S, Astorga-Simon E, Ishida M, Williamsom CD, Banos-Mateos S, Gil-Carton D, Romero M, Vidaurrazaga A, Fernandez-Recio J, Rojas AL, Bonifacino JS, Castano-Diez D, Hierro A

PDB-8afz:
Architecture of the ESCPE-1 membrane coat
手法: サブトモグラム平均 / : Lopez-Robles C, Scaramuzza S, Astorga-Simon E, Ishida M, Williamsom CD, Banos-Mateos S, Gil-Carton D, Romero M, Vidaurrazaga A, Fernandez-Recio J, Rojas AL, Bonifacino JS, Castano-Diez D, Hierro A

EMDB-29607:
HIV-2 Gag Capsid from Immature Virus-like Particles
手法: 単粒子 / : Talledge N, Zhang W, Mansky LM

EMDB-29606:
CryoET of HIV-2 Immature Particles
手法: トモグラフィー / : Talledge N, Zhang W, Mansky ML

EMDB-16183:
In situ structure of the Caulobacter crescentus S-layer
手法: サブトモグラム平均 / : von Kuegelgen A, Bharat T

EMDB-16207:
HIV-1 CA-SP1 subtomogram average with Relion4 from EMPIAR-10164 dataset, 3.2 A from 5 tomograms
手法: サブトモグラム平均 / : Ke Z, Briggs JAG, Scheres SHW

EMDB-16209:
HIV-1 CA-SP1 subtomogram average with Relion4 from EMPIAR-10164 dataset, 3.0 A from the full dataset
手法: サブトモグラム平均 / : Ke Z, Briggs JAG, Scheres SHW

EMDB-15949:
COPII inner coat reprocessed with relion4.0
手法: サブトモグラム平均 / : Zanetti G, Pyle E

EMDB-11376:
Subtomogram averaging of the OSBP construct NPHFFAT.
手法: サブトモグラム平均 / : de la Mora E, Dezi M, diCicco A, Bigay J, Gautier R, Manzi J, Polidori J, Castano-Diez D, Mesmin B, Antonny B, Levy D

EMDB-11399:
VAP-A engaged in in vitro membrane contact sites.
手法: サブトモグラム平均 / : de la Mora E, diCicco A, Dezi M, Levy D

EMDB-11402:
VAP-A engaged in in vitro membrane contact sites with the OSBP construct N-PH-FFAT at 19.6 A resolution
手法: サブトモグラム平均 / : de la Mora E, diCicco A, Dezi M, Levy D

EMDB-11427:
Representative tomogram of in vitro membrane contact sites between VAP-A and N-PH-FFAT
手法: トモグラフィー / : de la Mora E, diCicco A, Dezi M, Levy D

EMDB-11438:
Representative tomogram of in vitro membrane contact sites between VAP-A and N-PH-FFAT. Example of VAP-A reconstituted at high concentration.
手法: トモグラフィー / : de la Mora E, diCicco A, Dezi M, Levy D

EMDB-11455:
Representative tomogram of in vitro membrane contact sites between VAP-A and OSBP.
手法: トモグラフィー / : de la Mora E, Dezi M, diCicco A, Bigay J, Gautier R, Manzi J, Polidori J, Castano-Diez D, Mesmin B, Antonny B, Levy D

PDB-5ojq:
The modeled structure of of wild type extended type VI secretion system sheath/tube complex in vibrio cholerae based on cryo-EM reconstruction of the non-contractile sheath/tube complex
手法: らせん対称 / : Wang J, Brackmann M, Castano-Diez D, Kudryashev M, Goldie K, Maier T, Stahlberg H, Basler M

EMDB-3563:
Subtomogram average of type VI secretion system (T6SS) extended sheath
手法: サブトモグラム平均 / : Wang J, Castano-Diez D, Kudryashev M, Basler M

EMDB-3564:
Subtomogram average of type VI secretion system (T6SS) contracted sheath
手法: サブトモグラム平均 / : Wang J, Basler M

EMDB-3566:
VipA-N3, non-contractile sheath of the type VI secretion system
手法: らせん対称 / : Wang J, Brackmann M, Castano-Diez D, Kudryashev M, Goldie G, Maier T, Stahlberg H, Basler M

EMDB-3567:
VipA-N2/VipB contracted sheath of type VI secretion system
手法: らせん対称 / : Wang J, Brackmann M, Castano-Diez D, Kudryashev M, Goldie K, Maier T, Stahlberg H, Basler M

PDB-5mxn:
Atomic model of the VipA/VipB/Hcp, the type six secretion system non-contractile sheath-tube of Vibrio cholerae from cryo-EM
手法: らせん対称 / : Wang J, Brackmann M, Castano-Diez D, Kudryashev M, Goldie K, Maier T, Stahlberg H, Basler M

PDB-5myu:
VipA-N2/VipB contracted sheath of type VI secretion system
手法: らせん対称 / : Wang J, Brackmann B, Castano-Diez D, Kudryashev M, Goldie D, Maier T, Stahlberg H, Basler M

EMDB-3108:
Structure of the mouse serotonin receptor 5-HT3 in lipid vesicles
手法: サブトモグラム平均 / : Kudryashev M, Castano-Diez D, Deluz C, Hassaine G, Graf-Meyer A, Vogel H, Stahlberg H

EMDB-3109:
Insight into the assembly of viruses with vertical single beta-barrel major capsid proteins
手法: 単粒子 / : Gil-Carton D, Jaakkola ST, Charro D, Peralta B, Castano-Diez D, Oksanen HM, Bamford DH, Abrescia NG

EMDB-3110:
Insight into the assembly of viruses with vertical single beta-barrel major capsid proteins
手法: サブトモグラム平均 / : Gil-Carton D, Jaakkola ST, Charro D, Peralta B, Castano-Diez D, Oksanen HM, Bamford DH, Abrescia NG

EMDB-3111:
Insight into the assembly of viruses with vertical single beta-barrel major capsid proteins
手法: サブトモグラム平均 / : Gil-Carton D, Jaakkola ST, Charro D, Peralta B, Castano-Diez D, Oksanen HM, Bamford DH, Abrescia NG

EMDB-5720:
Structure of the Yersinia enterocolitica secretin YscC
手法: 単粒子 / : Kowal J, Chami M, Ringler P, Muller AS, Kudryashev M, Castano-Diez D, Amstutz M, Cornelis GR, Stahlberg H, Engel A

EMDB-5721:
Structure of the flexible N-terminal region of Yersinia enterocolitica secretin YscC
手法: 単粒子 / : Kowal J, Chami M, Ringler P, Muller AS, Kudryashev M, Castano-Diez D, Amstutz M, Cornelis GR, Stahlberg H, Engel A

EMDB-5722:
Structure of the trypsin-resistant core of secretin YscC
手法: 単粒子 / : Kowal J, Chami M, Ringler P, Muller AS, Kudryashev M, Castano-Diez D, Amstutz M, Cornelis GR, Stahlberg H, Engel A

EMDB-2437:
Mechanism of Membranous Tunnelling Nanotube Formation in Viral Genome Delivery
手法: サブトモグラム平均 / : Peralta B, Gil-Carton D, Castano-Diez D, Bertin A, Boulogne C, Oksanen HM, Bamford DH, Abrescia NGA

EMDB-2438:
Mechanism of Membranous Tunnelling Nanotube Formation in Viral Genome Delivery
手法: サブトモグラム平均 / : Peralta B, Gil-Carton D, Castano-Diez D, Bertin A, Boulogne C, Oksanen HM, Bamford DH, Abrescia NGA

EMDB-2439:
Mechanism of Membranous Tunnelling Nanotube Formation in Viral Genome Delivery
手法: サブトモグラム平均 / : Peralta B, Gil-Carton D, Castano-Diez D, Bertin A, Boulogne C, Oksanen HM, Bamford DH, Abrescia NGA

EMDB-2440:
Mechanism of Membranous Tunnelling Nanotube Formation in Viral Genome Delivery
手法: サブトモグラム平均 / : Peralta B, Gil-Carton D, Castano-Diez D, Bertin A, Boulogne C, Oksanen HM, Bamford DH, Abrescia NGA

EMDB-5694:
Type III secretion system (Injectisome) of Yersinia enterocolitica in situ
手法: サブトモグラム平均 / : Kudryashev M, Stenta M, Schmelz S, Amstutz M, Wiesand U, Castano-Diez D, Degiacomi M, Muennich S, Bleck CKE, Kowal J, Diepold A, Heinz DW, Dal Peraro M, Cornelis GR, Stahlberg H

EMDB-2103:
Heritable yeast prions have a highly organized 3-dimensional architecture with inter-fiber structures
手法: サブトモグラム平均 / : Frangakis A, Saibil HR

EMDB-2104:
Heritable yeast prions have a highly organized 3-dimensional architecture with inter-fiber structures
手法: サブトモグラム平均 / : Frangakis A, Saibil HR

EMDB-1703:
Intracellular part of the desmosome
手法: サブトモグラム平均 / : Al-Amoudi A, Frangakis AS

EMDB-1637:
Proteome organization in a genome-reduced bacterium -Topoisomerase of Mycoplasma pneumoniae -
手法: 単粒子 / : Kuhner S, vanNoort V, Betts MJ, Leo-Macias A, Batisse C, Rode M, Yamada T, Maier T, Bader S, Beltran-Alvarez P, Castano-Diez D, Chen WH, Devos D, Guell Cargol M, Norambuena T, Racke I, Rybin V, Schmidt A, Yus E, Aebersold R, Herrmann R, Bottcher B, Frangakis AS, Russell RB, Serrano L, Bork P, Gavin AC

EMDB-1638:
Proteome organization in a genome-reduced bacterium -Gyrase of Mycoplasma pneumoniae -
手法: 単粒子 / : Kuhner S, vanNoort V, Betts MJ, Leo-Macias A, Batisse C, Rode M, Yamada T, Maier T, Bader S, Beltran-Alvarez P, Castano-Diez D, Chen WH, Devos D, Guell Cargol M, Norambuena T, Racke I, Rybin V, Schmidt A, Yus E, Aebersold R, Herrmann R, Bottcher B, Frangakis AS, Russell RB, Serrano L, Bork P, Gavin AC

EMDB-1639:
Proteome organization in a genome-reduced bacterium -RNA-polymeraseof Mycoplasma pneumoniae -
手法: 単粒子 / : Kuhner S, vanNoort V, Betts MJ, Leo-Macias A, Batisse C, Rode M, Yamada T, Maier T, Bader S, Beltran-Alvarez P, Castano-Diez D, Chen WH, Devos D, Guell Cargol M, Norambuena T, Racke I, Rybin V, Schmidt A, Yus E, Aebersold R, Herrmann R, Bottcher B, Frangakis AS, Russell RB, Serrano L, Bork P, Gavin AC

EMDB-1374:
The molecular architecture of cadherins in native epidermal desmosomes.
手法: サブトモグラム平均 / : Al-Amoudi A, Castano Diez D, Frangakis AS

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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