PDB: 289 件ウェブページステータス検索Chemie searchBIRD

---

3MFH	DNA Polymerase Eta in Complex With Undamaged DNA 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, 5'-D(*GP*TP*CP*CP*TP*CP*CP*CP*CP*TP*(DOC))-3', 5'-D(*TP*AP*AP*TP*TP*GP*AP*GP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*AP*C)-3', ... 著者 Silverstein, T.D, Johnson, R.E, Jain, R, Prakash, L, Prakash, S, Aggarwal, A.K. 登録日 2010-04-02 公開日 2010-06-23 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 Structural basis for the suppression of skin cancers by DNA polymerase eta. Nature, 465, 2010
3MFI	DNA Polymerase Eta in Complex With a cis-syn Thymidine Dimer 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, 5'-D(*GP*TP*CP*CP*TP*CP*CP*CP*CP*TP*(DOC))-3', 5'-D(*TP*AP*AP*(TTD)P*GP*AP*GP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*AP*C)-3', ... 著者 Silverstein, T.D, Johnson, R.E, Jain, R, Prakash, L, Prakash, S, Aggarwal, A.K. 登録日 2010-04-02 公開日 2010-06-23 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.76 Å) 主引用文献 Structural basis for the suppression of skin cancers by DNA polymerase eta. Nature, 465, 2010
5F9L	CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING dAMPNPP ACROSS A DNA TEMPLATE CONTAINING 1,N2-ETHENODEOXYGUANOSINE LESION 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(GNE)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Patra, A, Egli, M. 登録日 2015-12-09 公開日 2016-12-21 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.592 Å) 主引用文献 Bypass of the 1, N2-Ethenodeoxyguanosine Lesion by Human DNA Polymerase Eta To Be Published
6PLC	Structure of human DNA polymerase eta complexed with 8OA in the template base paired with incoming non-hydrolyzable GTP 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(A38)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Koag, M.C, Lee, S. 登録日 2019-06-30 公開日 2020-04-22 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Mutagenesis mechanism of the major oxidative adenine lesion 7,8-dihydro-8-oxoadenine. Nucleic Acids Res., 48, 2020
5F9N	CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTING dCMPNPP ACROSS A DNA TEMPLATE CONTAINING 1,N2-ETHENODEOXYGUANOSINE LESION 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(GNE)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Patra, A, Egli, M. 登録日 2015-12-09 公開日 2016-12-21 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.23 Å) 主引用文献 Bypass of the 1, N2-Ethenodeoxyguanosine Lesion by Human DNA Polymerase Eta To Be Published
7L69	Crystal structure of human polymerase eta complexed with syn N7-benzylguanine 分子名称: DNA (5'-D(*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(7BG)P*CP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), DNA polymerase eta 著者 Jung, H, Lee, S. 登録日 2020-12-23 公開日 2022-01-05 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.91 Å) 主引用文献 Crystal structure of human polymerase eta complexed with syn N7-benzylguanine To Be Published
4DL7	Human DNA polymerase eta fails to extend primer 2 nucleotide after cisplatin crosslink (Pt-GG4). 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, Cisplatin, DNA (5'-D(*TP*AP*CP*TP*CP*GP*GP*TP*CP*AP*CP*T)-3'), ... 著者 Zhao, Y, Biertumpfel, C, Gregory, M, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. 登録日 2012-02-05 公開日 2012-05-09 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.97 Å) 主引用文献 Structural Basis for Chemoresistance to Cisplatin Mediated by DNA Polymerase eta Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 109, 2012
2I5O	Solution Structure of the Ubiquitin-Binding Zinc Finger (UBZ) Domain of the Human DNA Y-Polymerase Eta 分子名称: DNA polymerase eta, ZINC ION 著者 Zhou, P, Bomar, M.G. 登録日 2006-08-25 公開日 2007-03-13 最終更新日 2024-05-29 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure of the ubiquitin-binding zinc finger domain of human DNA Y-polymerase eta. Embo Rep., 8, 2007
6MQ8	Binary structure of DNA polymerase eta in complex with templating hypoxanthine 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*IP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Hawkins, M.A, Jung, H, Lee, S. 登録日 2018-10-09 公開日 2019-10-23 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.969 Å) 主引用文献 Structural insights into the bypass of the major deaminated purines by translesion synthesis DNA polymerase. Biochem.J., 2020
6D0Z	Polymerase Eta cytarabine (AraC) extension ternary complex 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*GP*CP*AP*GP*TP*GP*CP*T)-3'), DNA polymerase eta, ... 著者 Rechkoblit, O, Aggarwal, A.K. 登録日 2018-04-11 公開日 2018-09-05 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.75 Å) 主引用文献 Structural basis for polymerase eta-promoted resistance to the anticancer nucleoside analog cytarabine. Sci Rep, 8, 2018
6PL8	Structure of human DNA polymerase eta complexed with 8OA in the template base paired with incoming non-hydrolyzable TTP 分子名称: 5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]thymidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(A38)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Koag, M.C, Lee, S. 登録日 2019-06-30 公開日 2020-07-01 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.17 Å) 主引用文献 Structure of human DNA polymerase eta complexed with 8OA in the template base paired with incoming non-hydrolyzable TTP To Be Published
6D0M	Polymerase Eta post-insertion binary complex with cytarabine (AraC) 分子名称: DNA (5'-D(*CP*AP*TP*GP*AP*CP*AP*GP*TP*GP*CP*T)-3'), DNA polymerase eta, DNA/RNA (5'-D(*AP*GP*CP*AP*CP*TP*GP*T)-R(P*(CAR))-3'), ... 著者 Rechkoblit, O, Aggarwal, A.K. 登録日 2018-04-10 公開日 2018-09-05 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.832 Å) 主引用文献 Structural basis for polymerase eta-promoted resistance to the anticancer nucleoside analog cytarabine. Sci Rep, 8, 2018
6PL7	Structure of human DNA polymerase eta complexed with A in the template base paired with incoming non-hydrolyzable TTP 分子名称: 5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]thymidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*AP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Koag, M.C, Lee, S. 登録日 2019-06-30 公開日 2020-07-01 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Structure of human DNA polymerase eta complexed with A in the template base paired with incoming non-hydrolyzable TTP To Be Published
6W5X	Crystal structure of human polymerase eta complexed with N7-benzylguanine and dCTP* 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(DRG)P*CP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), ... 著者 Jung, H, Lee, S. 登録日 2020-03-14 公開日 2021-03-17 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.59 Å) 主引用文献 Crystal structure of human polymerase eta complexed with N7-benzylguanine and dCTP* To Be Published
6Q02	Polymerase Eta-catalyzed insertion of the mismatched A opposite template cytarabine (AraC) residue 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA Primer Strand, DNA polymerase eta, ... 著者 Rechkoblit, O, Aggarwal, A.K. 登録日 2019-08-01 公開日 2019-11-20 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.09 Å) 主引用文献 Structural insights into mutagenicity of anticancer nucleoside analog cytarabine during replication by DNA polymerase eta. Sci Rep, 9, 2019
6PZ3	Polymerase Eta-catalyzed insertion of correct G opposite template cytarabine (AraC) residue 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA Primer strand, DNA polymerase eta, ... 著者 Rechkoblit, O, Aggarwal, A.K. 登録日 2019-07-31 公開日 2019-11-20 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.395 Å) 主引用文献 Structural insights into mutagenicity of anticancer nucleoside analog cytarabine during replication by DNA polymerase eta. Sci Rep, 9, 2019
3SI8	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex with the 5'T of a CPD in the active site (TT2) 分子名称: (2R,3S,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-tetrahydro-2-(hydroxymethyl)furan-3-ol, 1,2-ETHANEDIOL, 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, ... 著者 Biertumpfel, C, Zhao, Y, Kondo, Y, Ramon-Maiques, S, Gregory, M, Lee, J.Y, Masutani, C, Lehmann, A.R, Hanaoka, F, Yang, W. 登録日 2011-06-17 公開日 2011-08-03 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.15 Å) 主引用文献 Structure and mechanism of human DNA polymerase eta. Nature, 465, 2010
6UQI	Crystal structure of Q38A human DNA polymerase eta bound with 8-oxoadenine (oxoA) and non-hydrolyzable dGTP analog (dGTP*) 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(A38)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Jung, H, Lee, S. 登録日 2019-10-19 公開日 2020-10-28 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Crystal structure of Q38A human DNA polymerase eta bound with 8-oxoadenine (oxoA) and non-hydrolyzable dGTP analog (dGTP*) To Be Published
6WK6	Crystal structure of human polymerase eta complexed with Xanthine containing DNA 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(3ZO)P*CP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), ... 著者 Jung, H, Lee, S. 登録日 2020-04-15 公開日 2021-01-06 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.35 Å) 主引用文献 Structural insights into the bypass of the major deaminated purines by translesion synthesis DNA polymerase. Biochem.J., 477, 2020
6UI2	Structure of human DNA polymerase eta complexed with N7MG in the template base paired with incoming non-hydrolyzable CTP 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(FMG)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Koag, M.C, Lee, S. 登録日 2019-09-30 公開日 2020-01-15 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.35 Å) 主引用文献 Bypass of the Major Alkylative DNA Lesion by Human DNA Polymerase eta. Molecules, 24, 2019
6V5K	Crystal structure of human DNA polymerase eta complexed with N7-nitrogen half-mustard guanine (NHMG) and dCTP* 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*T*(QRV)P*CP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), ... 著者 Jung, H, Lee, S. 登録日 2019-12-04 公開日 2020-12-09 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.69 Å) 主引用文献 Crystal structure of human DNA polymerase eta complexed with N7-nitrogen half-mustard guanine (NHMG) and dCTP* To Be Published
3TQ1	Human DNA Polymerase eta in binary complex with DNA 分子名称: DNA (5'-D(*TP*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*CP*AP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA polymerase eta 著者 Ummat, A, Silverstein, T.D, Jain, R, Buku, A, Johnson, R.E, Prakash, L, Prakash, S, Aggarwal, A.K. 登録日 2011-09-08 公開日 2012-02-08 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.556 Å) 主引用文献 Human DNA Polymerase Eta Is Pre-Aligned for dNTP Binding and Catalysis. J.Mol.Biol., 415, 2012
3WUP	Crystal Structure of the Ubiquitin-Binding Zinc Finger (UBZ) Domain of the Human DNA Polymerase Eta 分子名称: CHLORIDE ION, DNA polymerase eta, GLYCEROL, ... 著者 Suzuki, N, Wakatsuki, S, Kawasaki, S. 登録日 2014-05-01 公開日 2015-06-17 最終更新日 2024-05-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.6 Å) 主引用文献 A novel mode of ubiquitin recognition by the ubiquitin-binding zinc finger domain of WRNIP1. Febs J., 283, 2016
5VTP	X-ray diffraction data of DNA Polymerase Eta (RAD30) of Saccharomyces cerevisiae with a single magnesium bound in absence of DNA and incoming dNTP 分子名称: DNA polymerase eta, MAGNESIUM ION 著者 Powers, K.T, Washington, M.T. 登録日 2017-05-17 公開日 2018-01-24 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 The C-terminal region of translesion synthesis DNA polymerase eta is partially unstructured and has high conformational flexibility. Nucleic Acids Res., 46, 2018
2LSK	C-terminal domain of human REV1 in complex with DNA-polymerase H (eta) 分子名称: DNA polymerase eta, DNA repair protein REV1 著者 Pozhidaeva, A, Pustovalova, Y, Bezsonova, I, Korzhnev, D. 登録日 2012-05-01 公開日 2012-06-27 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 NMR structure and dynamics of the C-terminal domain from human Rev1 and its complex with Rev1 interacting region of DNA polymerase eta. Biochemistry, 51, 2012

 

123456789101112>