PDB: 129 件ウェブページステータス検索Chemie searchBIRD

---

5UDH	HHARI/ARIH1-UBCH7~Ubiquitin 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase ARIH1, Ubiquitin C variant, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, ... 著者 Miller, D.J, Schulman, B.A. 登録日 2016-12-27 公開日 2017-06-14 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.24 Å) 主引用文献 Structural Studies of HHARI/UbcH7Ub Reveal Unique E2Ub Conformational Restriction by RBR RING1. Structure, 25, 2017
5HKX	Crystal Structure of c-Cbl TKBD-RING domains (Y371E mutant) Refined to 1.85 A Resolution 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, E3 ubiquitin-protein ligase CBL, SODIUM ION, ... 著者 Lovell, S, Battaile, K.P, Mehzabeen, N, Zhang, N, Cooper, A, Gao, P, Perez, R.P. 登録日 2016-01-14 公開日 2017-01-18 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Crystal Structure of c-Cbl TKBD-RING domains (Y371E mutant) Refined to 1.85 A Resolution To be published
5TRB	Crystal structure of the RNF20 RING domain 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, ZINC ION 著者 Foglizzo, M, Middleton, A.J, Day, C.L. 登録日 2016-10-25 公開日 2016-11-02 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Structure and Function of the RING Domains of RNF20 and RNF40, Dimeric E3 Ligases that Monoubiquitylate Histone H2B. J.Mol.Biol., 428, 2016
5J3X	Structure of c-CBL Y371F 分子名称: CALCIUM ION, E3 ubiquitin-protein ligase CBL, ZINC ION 著者 Huang, D.T, Buetow, L, Dou, H. 登録日 2016-03-31 公開日 2016-09-21 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.822 Å) 主引用文献 Casitas B-lineage lymphoma linker helix mutations found in myeloproliferative neoplasms affect conformation. Bmc Biol., 14, 2016
3JBY	Cryo-electron microscopy structure of RAG Paired Complex (C2 symmetry) 分子名称: '-D(P*GP*AP*TP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*TP*GP*TP*CP*TP*TP*A)-3', 5'-D(P*CP*AP*CP*AP*GP*TP*GP*CP*TP*AP*CP*AP*GP*AP*C)-3', CALCIUM ION, ... 著者 Ru, H, Chambers, M.G, Fu, T.-M, Tong, A.B, Liao, M, Wu, H. 登録日 2015-10-22 公開日 2015-12-09 最終更新日 2024-02-21 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.7 Å) 主引用文献 Molecular Mechanism of V(D)J Recombination from Synaptic RAG1-RAG2 Complex Structures. Cell(Cambridge,Mass.), 163, 2015
3JBX	Cryo-electron microscopy structure of RAG Signal End Complex (C2 symmetry) 分子名称: 5'-D(*CP*AP*CP*AP*GP*TP*GP*CP*TP*AP*CP*AP*GP*AP*C)-3', 5'-D(*GP*CP*GP*AP*TP*GP*GP*TP*TP*AP*AP*CP*CP*A)-3', 5'-D(P*GP*TP*CP*TP*GP*TP*AP*GP*CP*AP*CP*TP*GP*TP*G)-3', ... 著者 Ru, H, Chambers, M.G, Fu, T.-M, Tong, A.B, Liao, M, Wu, H. 登録日 2015-10-22 公開日 2015-12-09 最終更新日 2024-02-21 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.4 Å) 主引用文献 Molecular Mechanism of V(D)J Recombination from Synaptic RAG1-RAG2 Complex Structures. Cell(Cambridge,Mass.), 163, 2015
3JBW	Cryo-electron microscopy structure of RAG Paired Complex (with NBD, no symmetry) 分子名称: 12-RSS signal end forward strand, 5'-D(P*GP*AP*TP*CP*TP*GP*GP*CP*CP*TP*GP*TP*CP*TP*TP*A)-3', Nicked 12-RSS intermediate reverse strand, ... 著者 Ru, H, Chambers, M.G, Fu, T.-M, Tong, A.B, Liao, M, Wu, H. 登録日 2015-10-21 公開日 2015-12-09 最終更新日 2024-02-21 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.6 Å) 主引用文献 Molecular Mechanism of V(D)J Recombination from Synaptic RAG1-RAG2 Complex Structures. Cell(Cambridge,Mass.), 163, 2015
4R7E	Structure of Bre1 RING domain 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1, ZINC ION 著者 Kumar, P, Wolberger, C. 登録日 2014-08-27 公開日 2015-05-13 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.251 Å) 主引用文献 Structure of the yeast Bre1 RING domain. Proteins, 83, 2015
2MWX	The RING Domain of human Promyelocytic Leukemia Protein (PML) 分子名称: Protein PML, ZINC ION 著者 Huang, S.Y, Chang, C.F, Fan, P.J, Guntert, P, Shih, H.M, Huang, T.H. 登録日 2014-12-02 公開日 2015-02-11 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 The RING domain of human promyelocytic leukemia protein (PML). J.Biomol.Nmr, 61, 2015
4GB0	Crystal Structure of the RING domain of RNF168 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF168, MALONATE ION, ZINC ION 著者 Zhang, X.Q, Wang, C.L, Zang, J.Y. 登録日 2012-07-26 公開日 2013-07-10 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Structural basis for role of ring finger protein RNF168 RING domain Cell Cycle, 12, 2013
3ZNI	Structure of phosphoTyr363-Cbl-b - UbcH5B-Ub - ZAP-70 peptide complex 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, CALCIUM ION, E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE CBL-B, ... 著者 Dou, H, Buetow, L, Sibbet, G.J, Cameron, K, Huang, D.T. 登録日 2013-02-14 公開日 2013-07-10 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.21 Å) 主引用文献 Essentiality of a Non-Ring Element in Priming Donor Ubiquitin for Catalysis by a Monomeric E3. Nat.Struct.Mol.Biol., 20, 2013
4KBL	Structure of HHARI, a RING-IBR-RING ubiquitin ligase: autoinhibition of an Ariadne-family E3 and insights into ligation mechanism 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase ARIH1, ZINC ION 著者 Duda, D.M, Olszewski, J.L, Schulman, B.A. 登録日 2013-04-23 公開日 2013-05-29 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.3 Å) 主引用文献 Structure of HHARI, a RING-IBR-RING Ubiquitin Ligase: Autoinhibition of an Ariadne-Family E3 and Insights into Ligation Mechanism. Structure, 21, 2013
4KC9	Structure of HHARI, a RING-IBR-RING ubiquitin ligase: autoinhibition of an Ariadne-family E3 and insights into ligation mechanism 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase ARIH1, ZINC ION 著者 Duda, D.M, Olszewski, J.L, Schulman, B.A. 登録日 2013-04-24 公開日 2013-05-29 最終更新日 2013-07-03 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.603 Å) 主引用文献 Structure of HHARI, a RING-IBR-RING Ubiquitin Ligase: Autoinhibition of an Ariadne-Family E3 and Insights into Ligation Mechanism. Structure, 21, 2013
4A4B	Structure of modified phosphoTyr371-c-Cbl-UbcH5B-ZAP-70 complex 分子名称: CALCIUM ION, E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE CBL, TYROSINE-PROTEIN KINASE ZAP-70, ... 著者 Dou, H, Buetow, L, Hock, A, Sibbet, G.J, Vousden, K.H, Huang, D.T. 登録日 2011-10-08 公開日 2012-01-25 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.789 Å) 主引用文献 Structural Basis for Autoinhibition and Phosphorylation-Dependent Activation of C-Cbl Nat.Struct.Mol.Biol., 19, 2012
4A4C	Structure of phosphoTyr371-c-Cbl-UbcH5B-ZAP-70 complex 分子名称: CALCIUM ION, E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE CBL, TYROSINE-PROTEIN KINASE ZAP-70, ... 著者 Dou, H, Buetow, L, Hock, A, Sibbet, G.J, Vousden, K.H, Huang, D.T. 登録日 2011-10-08 公開日 2012-01-25 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.704 Å) 主引用文献 Structural Basis for Autoinhibition and Phosphorylation-Dependent Activation of C-Cbl Nat.Struct.Mol.Biol., 19, 2012
4A49	Structure of phosphoTyr371-c-Cbl-UbcH5B complex 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase CBL, POTASSIUM ION, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, ... 著者 Dou, H, Buetow, L, Hock, A, Sibbet, G.J, Vousden, K.H, Huang, D.T. 登録日 2011-10-07 公開日 2012-01-25 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.214 Å) 主引用文献 Structural basis for autoinhibition and phosphorylation-dependent activation of c-Cbl. Nat. Struct. Mol. Biol., 19, 2012
2Y1N	Structure of c-Cbl-ZAP-70 peptide complex 分子名称: CALCIUM ION, E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE, TYROSINE-PROTEIN KINASE ZAP-70 ZAP-70,70 KDA ZETA-ASSOCIATED PROTEIN, ... 著者 Dou, H, Sibbet, G.J, Huang, D.T. 登録日 2010-12-08 公開日 2012-01-18 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.999 Å) 主引用文献 Structural Basis for Autoinhibition and Phosphorylation-Dependent Activation of C-Cbl. Nat.Struct.Mol.Biol., 19, 2012
2Y1M	Structure of native c-Cbl 分子名称: CALCIUM ION, E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE, ZINC ION 著者 Dou, H, Sibbet, G.J, Huang, D.T. 登録日 2010-12-08 公開日 2012-01-18 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.67 Å) 主引用文献 Structural Basis for Autoinhibition and Phosphorylation-Dependent Activation of C-Cbl. Nat.Struct.Mol.Biol., 19, 2012
2LDR	Solution structure of Helix-RING domain of Cbl-b in the Tyr363 phosphorylated form 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase CBL-B, ZINC ION 著者 Kumeta, H, Kobashigawa, Y, Inagaki, F. 登録日 2011-06-01 公開日 2011-12-14 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Autoinhibition and phosphorylation-induced activation mechanisms of human cancer and autoimmune disease-related E3 protein Cbl-b Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 108, 2011
3VGO	Crystal structure of the N-terminal fragment of Cbl-b 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase CBL-B 著者 Kobashigawa, Y, Noda, N.N, Inagaki, F. 登録日 2011-08-18 公開日 2011-12-14 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.1 Å) 主引用文献 Autoinhibition and phosphorylation-induced activation mechanisms of human cancer and autoimmune disease-related E3 protein Cbl-b Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 108, 2011
3L11	Crystal Structure of the Ring Domain of RNF168 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF168, MALONATE ION, ZINC ION 著者 Neculai, D, Yermekbayeva, L, Crombet, L, Weigelt, J, Bountra, C, Edwards, A.M, Arrowsmith, C.H, Bochkarev, A, Dhe-Paganon, S, Structural Genomics Consortium (SGC) 登録日 2009-12-10 公開日 2010-01-19 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.12 Å) 主引用文献 Molecular insights into the function of RING finger (RNF)-containing proteins hRNF8 and hRNF168 in Ubc13/Mms2-dependent ubiquitylation. J.Biol.Chem., 287, 2012
3KNV	Crystal structure of the RING and first zinc finger domains of TRAF2 分子名称: TNF receptor-associated factor 2, ZINC ION 著者 Yin, Q, Wu, H. 登録日 2009-11-12 公開日 2009-11-24 最終更新日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Structural basis for the lack of E2 interaction in the RING domain of TRAF2. Biochemistry, 48, 2009
2K4D	E2-c-Cbl recognition is necessary but not sufficient for ubiquitination activity 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase CBL, ZINC ION 著者 Huang, A, De Jong, R.N, Wienk, H, Winkler, S.G, Timmers, H.T.M, Boelens, R. 登録日 2008-06-06 公開日 2009-01-20 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 E2-c-Cbl recognition is necessary but not sufficient for ubiquitination activity J.Mol.Biol., 385, 2009
2ECW	Solution structure of the Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) domain Tripartite motif protein 30 分子名称: Tripartite motif-containing protein 30, ZINC ION 著者 Abe, H, Miyamoto, K, Tochio, N, Yoneyama, M, Kigawa, T, Yokoyama, S, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) 登録日 2007-02-14 公開日 2008-02-26 最終更新日 2024-05-29 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of the Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) domain Tripartite motif protein 30 To be Published
1JM7	Solution structure of the BRCA1/BARD1 RING-domain heterodimer 分子名称: BRCA1-ASSOCIATED RING DOMAIN PROTEIN 1, BREAST CANCER TYPE 1 SUSCEPTIBILITY PROTEIN, ZINC ION 著者 Brzovic, P.S, Rajagopal, P, Hoyt, D.W, King, M.-C, Klevit, R.E. 登録日 2001-07-17 公開日 2001-10-03 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure of a BRCA1-BARD1 heterodimeric RING-RING complex. Nat.Struct.Biol., 8, 2001

<123456>