4V5E

Insights into translational termination from the structure of RF2 bound to the ribosome

これは巨大構造です。

4V5E の概要

関連するPDBエントリー1HR0 2V48 1IBK 2B64 1XMQ 1IBL 2B9M 2UUC 2WDK 1PN8 2WDG 1XNR 1DV4 1HNZ 1RSS 2WDH 2J02 1J5E 1JGQ 2J00 2B9O 1I94 1HNX 1I96 2UU9 1PN7 2UUB 1VOV 1EG0 1IBM 1EMI 2UXB 2VQE 1G1X 1PNX 2V46 2UUA 1I95 1XNQ 1QD7 2VQF 1GIX 1JGO 1JGP 1N32 2F4V 1N34 1N33 1TWT 1PNS 1QZC 2UXD 1FKA 1YL4 2WDM 2UXC 1N36 1FJG 1XMO 1HNW 1I97 1L1U
統合されたエントリ2WH1 2WH2 2WH3 2WH4
分子名称16S ribosomal RNA, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2, 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3, ... (61 entities in total)
機能のキーワードribosomal protein, ribonucleoprotein, termination, rrna-binding, trna-binding, metal-binding, rf2, trna, mrna, ribosome, protein biosynthesis, zinc-finger, rna-binding, translation
由来する生物種Escherichia coli K-12
詳細
細胞内の位置Cytoplasm  Q5SM01
ポリマー鎖数118
分子量合計4640998.44
構造登録者
Weixlbaumer, A.,Jin, H.,Neubauer, C.,Voorhees, R.M.,Petry, S.,Kelley, A.C.,Ramakrishnan, V. (登録日: 2009-04-30, 公開日: 2014-07-09, 最終更新日: 2018-03-14)
主引用文献
Weixlbaumer, A.,Jin, H.,Neubauer, C.,Voorhees, R.M.,Petry, S.,Kelley, A.C.,Ramakrishnan, V.
Insights Into Translational Termination from the Structure of Rf2 Bound to the Ribosome.
Science, 322:953-956, 2008
PubMed: 18988853 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1126/science.1164840
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (3.45 Å)
?

構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliersRNA backbone0.2573912.6%11.2%7.4%0.55MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

Molmil generated image of 4v5e
回転なし
Molmil generated image of 4v5e
x軸(左右方向)周りに90°回転
Molmil generated image of 4v5e
y軸(上下方向)周りに90°回転

他の静止画像(生物学的単位)

Molmil generated image of 4v5e
回転なし
Molmil generated image of 4v5e
x軸(左右方向)周りに90°回転
Molmil generated image of 4v5e
y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (4v5e-assembly1.cif.gz [3.55 MB])
生物学的単位の座標ファイル (4v5e-assembly2.cif.gz [3.56 MB])