PDB-4pgn: CRYSTAL STRUCTURE OF A TRAP PERIPLASMIC SOLUTE BINDING PROTEIN FR...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4pgn

タイトル

CRYSTAL STRUCTURE OF A TRAP PERIPLASMIC SOLUTE BINDING PROTEIN FROM DESULFOVIBRIO ALASKENSIS G20 (Dde_0634, TARGET EFI-510120) WITH BOUND INDOLE PYRUVATE

要素

Extracellular solute-binding protein, family 7

キーワード

TRANSPORT PROTEIN / TRAP PERIPLASMIC SOLUTE BINDING FAMILY / ENZYME FUNCTION INITIATIVE / EFI / Structural Genomics

機能・相同性

機能・相同性情報

transmembrane transport / periplasmic space
類似検索 - 分子機能

生物種

Desulfovibrio desulfuricans (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

フーリエ合成 / 解像度: 1.8 Å

データ登録者

Vetting, M.W. / Al Obaidi, N.F. / Morisco, L.L. / Wasserman, S.R. / Stead, M. / Attonito, J.D. / Scott Glenn, A. / Chowdhury, S. / Evans, B. / Hillerich, B. ...

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Biochemistry / 年: 2015
タイトル: Experimental strategies for functional annotation and metabolism discovery: targeted screening of solute binding proteins and unbiased panning of metabolomes.
著者: Vetting, M.W. / Al-Obaidi, N. / Zhao, S. / San Francisco, B. / Kim, J. / Wichelecki, D.J. / Bouvier, J.T. / Solbiati, J.O. / Vu, H. / Zhang, X. / Rodionov, D.A. / Love, J.D. / Hillerich, B.S. ...

履歴

登録	2014年5月2日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2014年5月28日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2015年2月4日	Group: Derived calculations
改定 1.2	2015年2月25日	Group: Database references
改定 1.3	2015年10月14日	Group: Data collection
改定 1.4	2017年9月20日	Group: Author supporting evidence / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list / software Item: _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
改定 1.5	2019年12月25日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.6	2023年12月27日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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PDB形式	pdb4pgn.ent.gz	603.1 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4pgn_validation.pdf.gz	484.3 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4pgn_full_validation.pdf.gz	488.6 KB	表示
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CIF形式データ	4pgn_validation.cif.gz	85.5 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pg/4pgn ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pg/4pgn	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4ln5C 4mcoC 4mevC 4mhfC 4mijC 4mncC 4mniC 4mx6C 4n15C 4n17C 4n4uC 4n6dC 4n6kC 4n8gC 4n8yC 4n91C 4napC 4nf0C 4ng7C 4nguC 4nhbC 4nn3C 4nq8C 4nx1C 4o7mC 4o8mC 4o94C 4oa4C 4oanC 4ovpC 4ovqC 4ovrC 4ovsC 4ovtC 4p1eC 4p1lC 4p3lC 4p47C 4p56C 4p8bC 4p9kC 4pafC 4paiC 4pakC 4pbhC 4pbqC 4pc9C 4pcdC 4pddC 4pdhC 4pe3C 4petC 4pf6C 4pf8C 4pfbC 4pfiC 4pfrC 4pgpC 4uabC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	3npr-d 4nap-4 2zcq-d 4ea1-d 6n4l-d 3vjd-d 7ai1-3 3w7f-2 5hjq-d 5ycp-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: EFI-510102

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Extracellular solute-binding protein, family 7

B: Extracellular solute-binding protein, family 7

C: Extracellular solute-binding protein, family 7

D: Extracellular solute-binding protein, family 7

ヘテロ分子

149 kDa, 4 ポリマー
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1

A: Extracellular solute-binding protein, family 7

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
37.2 kDa, 1 ポリマー
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2

B: Extracellular solute-binding protein, family 7

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
37.1 kDa, 1 ポリマー
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3

C: Extracellular solute-binding protein, family 7

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
37.2 kDa, 1 ポリマー
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4

D: Extracellular solute-binding protein, family 7

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
37.1 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	50.122, 144.459, 95.466
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.330, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

詳細

biological unit is a monomer

#1: タンパク質	Extracellular solute-binding protein, family 7 / TRAP PERIPLASMIC SOLUTE BINDING PROTEIN 分子量: 36869.078 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Desulfovibrio desulfuricans (バクテリア) 株: G20 / 遺伝子: Dde_0634 / プラスミド: pET / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q315G1
#2: 化合物	ChemComp-3IO / 3-(1H-INDOL-3-YL)-2-OXOPROPANOIC ACID / インド-ル-3-ピルビン酸分子量: 203.194 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₁H₉NO₃
#3: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1249 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.34 Å³/Da / 溶媒含有率: 47.51 %
結晶化	温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 5 詳細: Protein (68.0 mg/ml, 10 mM HEPES pH 7.5, 5 mM DTT), Reservoir (0.2 M di-Ammonium Hydrogen Citrate pH 5.0, 20 %(w/v) PEG 3350), Cryoprotection (80% Reservoir + 20% Ethylene Glycol

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 31-ID / 波長: 0.9793 Å

検出器

タイプ: RAYONIX MX225HE / 検出器: CCD / 日付: 2014年3月21日 / 詳細: MIRRORS

放射

モノクロメーター: GRAPHITE / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9793 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 1.8→33.9 Å / Num. obs: 124994 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 3.8 % / B_iso Wilson estimate: 18.15 Å² / R_merge(I) obs: 0.111 / R_pim(I) all: 0.066 / Net I/σ(I): 7.2 / Num. measured all: 470607 / Scaling rejects: 2

反射シェル

Diffraction-ID: 1 / Rejects: _

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured all	Num. unique all	R_pim(I) all	% possible all
1.8-1.83	3.7	0.8	1.7	22860	6132	0.48	99.9
9.86-33.9	3.4	0.035	15.7	2181	642	0.022	81.4

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
Aimless	0.1.27	データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.14	データ抽出
PHENIX	(phenix.refine: 1.8.1_1168)	精密化

精密化

構造決定の手法:

フーリエ合成 / 解像度: 1.8→29.301 Å / FOM work R set: 0.8502 / SU ML: 0.18 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 22.15 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.1959	6275	5.03 %	Random Selection
R_work	0.1568	118551	-	-
obs	0.1589	124826	99.71 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 104.44 Å² / B_iso mean: 27.28 Å² / B_iso min: 8.17 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.8→29.301 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	9509	0	134	1249	10892
B_iso mean	-	-	20.66	37.21	-
残基数	-	-	-	-	1237

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.011	9826
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.29	13356
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.075	1482
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.007	1737
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.63	3599

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
1.8-1.8205	0.3089	210	0.2621	3867	4077	100
1.8205-1.8419	0.2751	224	0.2476	3963	4187	100
1.8419-1.8643	0.261	240	0.233	3922	4162	100
1.8643-1.8879	0.2997	183	0.2311	3935	4118	100
1.8879-1.9128	0.2582	183	0.2194	3995	4178	100
1.9128-1.939	0.2449	217	0.2094	3930	4147	100
1.939-1.9667	0.2594	213	0.2065	3917	4130	100
1.9667-1.996	0.245	201	0.2053	3992	4193	100
1.996-2.0272	0.2577	188	0.1891	3976	4164	100
2.0272-2.0604	0.2273	223	0.1873	3895	4118	100
2.0604-2.0959	0.2462	218	0.1763	3998	4216	100
2.0959-2.134	0.2143	192	0.1663	3893	4085	100
2.134-2.1751	0.2189	212	0.1602	4009	4221	100
2.1751-2.2195	0.1851	193	0.1461	3974	4167	100
2.2195-2.2677	0.2091	201	0.1455	3961	4162	100
2.2677-2.3204	0.1889	210	0.1412	3937	4147	100
2.3204-2.3784	0.1817	199	0.1351	4001	4200	100
2.3784-2.4427	0.172	200	0.1335	3951	4151	100
2.4427-2.5145	0.198	200	0.1339	3991	4191	100
2.5145-2.5957	0.1912	233	0.1385	3895	4128	100
2.5957-2.6884	0.1982	247	0.1455	3935	4182	100
2.6884-2.7959	0.1893	180	0.1421	3998	4178	100
2.7959-2.9231	0.1933	208	0.1488	3976	4184	100
2.9231-3.077	0.2132	203	0.1526	3978	4181	100
3.077-3.2696	0.1954	222	0.1541	3948	4170	100
3.2696-3.5216	0.186	183	0.1405	3995	4178	100
3.5216-3.8753	0.1496	241	0.135	3964	4205	100
3.8753-4.4344	0.1536	222	0.1228	3942	4164	100
4.4344-5.5806	0.1487	217	0.1364	3995	4212	100
5.5806-29.3047	0.2016	212	0.1864	3818	4030	95

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.7471	0.4904	0.1178	1.6254	-0.4951	0.9313	-0.0762	0.1191	0.2383	0.0678	0.1336	0.2719	-0.2034	-0.061	-0.0404	0.16	0.0038	0.0143	0.1417	0.0521	0.1904	18.5868	15.2474	52.4146
2	1.9593	-0.4727	-0.2038	1.3876	-0.0791	0.8085	-0.063	0.1193	0.0263	0.1835	0.1714	0.64	-0.1347	-0.1686	-0.0729	0.1455	0.0274	0.0666	0.1674	0.0851	0.2948	13.5315	9.7975	54.9455
3	1.7152	-0.191	-0.3435	1.1277	-0.4236	1.4512	0.0278	-0.1139	-0.0873	0.236	-0.012	-0.1968	-0.1041	0.1025	-0.018	0.1494	-0.0126	-0.0378	0.1532	-0.0063	0.1412	33.2439	-0.2933	65.2516
4	2.2185	-0.4865	0.1376	1.0289	-0.4077	0.799	-0.0049	0.1289	-0.0588	-0.0256	-0.0341	-0.1982	-0.0105	0.1231	0.0329	0.1072	-0.0059	0.0022	0.1767	-0.0079	0.1263	34.4031	1.8717	54.9639
5	1.2292	0.1004	0.4512	1.8913	-0.7588	1.4749	-0.0493	0.4079	0.2406	-0.2209	0.1086	0.2805	-0.1112	-0.0552	0.0043	0.1446	-0.0376	-0.0241	0.19	0.0903	0.1735	20.8745	12.7695	46.2523
6	2.9935	0.7922	-1.3548	0.5234	-0.8596	1.3627	0.0346	0.4333	-0.6007	-0.0317	0.05	-0.2455	0.2969	-0.1284	-0.1387	0.2265	-0.0202	0.0041	0.1878	-0.0423	0.3386	31.1051	-13.2908	58.2894
7	2.4589	-0.1397	0.1342	1.7767	-0.2918	1.1574	0.0267	-0.0912	-0.0711	0.0799	0.1086	0.2338	-0.04	-0.0907	-0.1176	0.1343	-0.038	0.0316	0.1785	0.0062	0.1558	8.1991	-3.8562	59.3791
8	1.0514	0.3205	0.0868	1.4429	0.3926	1.5202	-0.0358	-0.1327	0.136	-0.0075	0.0283	-0.1041	-0.1812	0.0132	0.0023	0.1468	0.0303	0.001	0.1237	-0.0433	0.1499	28.1154	40.1082	96.6689
9	0.8973	0.0524	0.0454	1.4704	0.4628	0.5353	-0.055	0.0508	0.0057	-0.1701	0.0788	-0.2579	-0.0721	0.0445	-0.0258	0.1396	-0.0131	0.0383	0.1178	-0.029	0.1162	33.1149	27.5224	86.1452
10	1.9167	0.4885	-0.0857	1.4679	0.3202	0.7681	-0.0824	0.1338	0.0429	-0.1495	0.194	-0.3359	-0.0946	0.0869	-0.0712	0.1225	-0.0274	0.0426	0.1361	-0.031	0.1819	35.7878	27.2694	88.2313
11	1.957	0.6036	0.1692	1.3074	0.3492	1.5068	-0.0604	0.047	-0.213	-0.2575	0.0158	0.1938	-0.0577	-0.1305	0.0351	0.134	-0.0053	-0.0078	0.1178	-0.0162	0.1659	15.8961	17.0849	78.4321
12	1.8383	0.6238	0.0539	1.0737	0.3194	0.7771	-0.0946	-0.1424	-0.0405	-0.0146	0.0898	0.2734	-0.0156	-0.1361	-0.002	0.1058	-0.0025	0.0148	0.1635	0.018	0.1686	14.8581	19.6101	88.6386
13	1.609	0.3949	0.4203	1.8472	0.3434	1.3919	-0.0446	-0.1864	0.0556	0.176	0.0533	-0.1441	-0.1252	-0.0924	0.0236	0.1114	0.0264	0.0095	0.1223	-0.0372	0.1105	29.3628	30.8891	96.8522
14	1.447	0.0238	-0.5059	0.0667	-0.1593	1.3221	-0.0401	-0.2535	-0.1977	-0.1823	0.2322	0.4558	0.4924	-0.107	0.3645	0.0961	-0.0767	0.0576	0.1897	0.0808	0.4416	16.962	5.4997	85.732
15	0.9748	0.4081	0.3869	1.4154	0.5185	1.2249	0.0034	0.0066	-0.1434	-0.0863	0.2135	-0.3429	-0.088	0.2027	-0.1576	0.134	-0.0088	0.0519	0.1515	-0.0357	0.2021	41.0283	13.391	84.345
16	1.9691	0.2327	0.4179	1.1941	-0.1067	1.2453	-0.0683	0.1593	-0.0235	-0.1152	0.149	0.1791	0.0855	-0.028	-0.0898	0.2308	-0.0174	-0.013	0.1846	0.1124	0.266	29.1136	31.3985	41.3527
17	0.7168	0.3725	0.6846	1.329	-0.2241	2.6001	-0.0154	0.2796	-0.5854	-0.2193	0.2	-0.3466	0.2342	0.385	-0.083	0.2541	0.027	0.0106	0.2601	0.0173	0.2798	43.4404	28.1915	37.9939
18	1.3276	0.366	0.4372	1.4428	-0.2962	0.9813	-0.2627	0.3479	0.4757	-0.1237	0.1709	0.1111	-0.0769	0.3736	0.1185	0.1982	-0.0548	-0.066	0.2725	0.1646	0.2982	41.7661	46.0539	39.4307
19	1.4576	0.1122	0.3656	1.0418	-0.0493	1.307	-0.0246	-0.3652	0.0236	0.516	-0.0385	-0.0776	0.1189	0.1892	0.038	0.3521	0.0175	-0.0695	0.3744	0.0713	0.2138	48.707	43.2141	59.3345
20	2.0875	0.6746	0.2454	1.711	0.0871	1.7159	-0.144	0.0803	0.2738	-0.0647	0.1323	0.4466	0.0687	0.0256	-0.0083	0.2005	-0.018	-0.0244	0.1846	0.1397	0.2957	31.3212	39.7824	43.0772
21	0.9494	-0.2106	-0.3759	1.0864	-0.5301	2.4842	-0.2781	0.0835	0.4961	0.4021	0.0032	-0.1571	-0.2569	0.047	0.1792	0.355	-0.1127	-0.1204	0.392	0.0694	0.3878	51.4952	56.2588	52.6724
22	2.5864	-0.3695	-0.4876	1.3557	0.2435	1.3863	-0.358	0.0352	0.1657	0.0276	0.066	-0.0075	-0.128	0.2696	0.0255	0.2393	-0.0803	-0.1044	0.3503	0.1986	0.4525	42.5248	58.2755	36.5778
23	1.6069	0.1929	0.1577	1.3631	-0.1839	0.9726	0.0073	0.0599	-0.0692	-0.0409	0.0636	0.1145	0.0648	0.0235	-0.0547	0.1383	0.0123	0.002	0.0872	0.0578	0.1191	28.5118	-23.1415	89.5902
24	0.7342	0.1432	1.1448	1.5182	-0.128	2.8469	0.1291	0.0517	-0.2908	-0.1633	0.0369	-0.4047	0.3093	0.2507	-0.086	0.1706	0.0297	0.0348	0.1428	0.018	0.2186	42.9351	-26.2967	86.0892
25	0.6803	0.483	0.1759	1.2906	-0.165	0.9277	-0.0354	0.0367	0.0997	0.061	-0.028	-0.0721	-0.0535	0.169	0.0503	0.1305	-0.0057	0.0042	0.1473	0.0406	0.1324	41.8126	-7.1509	88.9442
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27	1	0.1239	-0.1364	0.3839	-0.2017	1.9194	-0.0554	-0.196	0.1876	0.438	-0.0597	-0.3105	-0.2662	0.2741	0.0508	0.3751	-0.0328	-0.1355	0.326	0.0165	0.1902	52.4158	-7.2289	108.8038
28	1.8638	-0.1439	0.2832	0.5653	-0.0746	1.6385	0.0537	-0.0323	-0.1083	0.2108	-0.1204	-0.1647	0.2007	0.3665	0.0216	0.3026	0.0273	-0.0906	0.2941	0.0622	0.1867	50.3358	-16.8586	106.282
29	1.0198	0.2182	0.1583	0.4633	-0.157	1.7312	-0.0302	-0.2056	-0.0203	0.395	0.093	-0.1075	-0.0304	0.1006	0.0147	0.308	0.0301	-0.0277	0.2092	0.0547	0.1067	40.9382	-11.6704	108.2359
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31	1.1279	0.1112	0.3954	1.2757	-0.2068	2.0807	0.0504	-0.2225	0.1835	0.1427	0.0697	0.2552	0.0866	-0.3124	-0.0841	0.1525	0.0108	0.0383	0.1424	0.07	0.1348	28.7748	-12.1125	97.3202
32	1.3541	-0.2213	-0.2181	0.519	-0.0917	0.0883	-0.1895	-0.0678	0.4256	0.3519	0.2908	-0.4799	-0.2938	-0.0417	-0.0169	0.6569	-0.1127	-0.0524	0.352	-0.0771	0.3426	48.0416	1.8797	110.4467
33	2.8623	0.6402	0.5377	1.0559	-0.3057	5.0678	-0.0729	0.02	-0.2125	0.2762	-0.2451	-0.6137	-0.093	0.3678	0.0975	0.1497	-0.0775	-0.0365	0.2099	0.0538	0.3201	55.1597	-0.8337	87.3462
34	3.3069	-0.5024	-0.6494	1.2869	0.1933	0.9	0.1332	0.0475	0.2319	0.0092	0.0128	0.037	-0.1029	-0.0248	-0.0598	0.1363	-0.0024	0.0227	0.1654	0.0104	0.2268	41.294	4.1576	85.3113

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 32 through 134 )	A
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 135 through 154 )	A
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 155 through 212 )	A
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 213 through 237 )	A
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 238 through 288 )	A
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 289 through 307 )	A
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 308 through 339 )	A
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 31 through 74 )	B
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 75 through 134 )	B
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 135 through 154 )	B
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 155 through 212 )	B
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 213 through 237 )	B
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 238 through 287 )	B
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 288 through 307 )	B
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 308 through 339 )	B
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 32 through 74 )	C
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 75 through 93 )	C
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 94 through 154 )	C
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 155 through 237 )	C
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 238 through 288 )	C
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 289 through 320 )	C
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 321 through 341 )	C
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 32 through 74 )	D
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 75 through 93 )	D
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 94 through 134 )	D
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 135 through 154 )	D
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resid 155 through 184 )	D
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 185 through 212 )	D
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 213 through 237 )	D
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'D' and (resid 238 through 251 )	D
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'D' and (resid 252 through 288 )	D
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'D' and (resid 289 through 307 )	D
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'D' and (resid 308 through 321 )	D
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'D' and (resid 322 through 341 )	D

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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