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検索結果

検索 (著者・登録者: yamamoto & j)の結果175件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-63852:
Cryo-EM Structure of Human ACE2 Complexed with RacCS20637 RBD
手法: 単粒子 / : Matsumoto K, Akasaka H, Shihoya W, Nureki O

PDB-9u4o:
Cryo-EM Structure of Human ACE2 Complexed with RacCS20637 RBD
手法: 単粒子 / : Matsumoto K, Akasaka H, Shihoya W, Nureki O

EMDB-64974:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT WT Consensus map
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

EMDB-64975:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT WT_TM_Local Refinment
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

EMDB-64976:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT WT_SD_Local refinement
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

EMDB-61242:
Cryo-EM structure of native NCP-UV-DDB complex
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-61243:
Cryo-EM structure of NCP-UV-DDB complex containing CPD
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-61246:
Cryo-EM structure of UV-DDB bound to native NCP at SHL+/-2
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-61247:
Cryo-EM structure of UV-DDB bound to native NCP at SHL+/-3
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-61248:
Cryo-EM structure of UV-DDB bound to native NCP at SHL+/-6
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

PDB-9j8w:
Cryo-EM structure of NCP-UV-DDB complex containing CPD
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-62028:
Cryo-EM structure of TMPRSS2 in complex with Fab fragments of 752 mAb and 2228 mAb
手法: 単粒子 / : Katsura K, Hisano T, Matsumoto T, Shirouzu M

PDB-9k3t:
Cryo-EM structure of TMPRSS2 in complex with Fab fragments of 752 mAb and 2228 mAb
手法: 単粒子 / : Katsura K, Hisano T, Matsumoto T, Shirouzu M

EMDB-63950:
Cryo-EM structure of Leminorella grimontii GatC in the presence of D-xylose
手法: 単粒子 / : Takahashi YS, Kohga H, Shigematsu H, Miyazaki R, Tsukazaki T

EMDB-63951:
Cryo-EM structure of Leminorella grimontii GatC in the absence of D-xylose
手法: 単粒子 / : Takahashi YS, Kohaga H, Shigematsu H, Miyazaki R, Tsukazaki T

PDB-9u82:
Cryo-EM structure of Leminorella grimontii GatC in the presence of D-xylose
手法: 単粒子 / : Takahashi YS, Kohga H, Shigematsu H, Miyazaki R, Tsukazaki T

PDB-9u84:
Cryo-EM structure of Leminorella grimontii GatC in the absence of D-xylose
手法: 単粒子 / : Takahashi YS, Kohaga H, Shigematsu H, Miyazaki R, Tsukazaki T

EMDB-47967:
Cryo-EM structure of Drosophila melanogaster insulin receptor (dmIR) bound with one DILP1, asymmetric conformation
手法: 単粒子 / : Bai XC

EMDB-47969:
Cryo-EM structure of Drosophila melanogaster insulin receptor (dmIR) bound with two DILP1, symmetric conformation
手法: 単粒子 / : Bai XC

EMDB-47970:
Cryo-EM structure of Drosophila melanogaster insulin receptor (dmIR) bound with one DILP2, asymmetric conformation
手法: 単粒子 / : Bai XC

EMDB-47971:
Cryo-EM structure of Drosophila melanogaster insulin receptor (dmIR) bound with three DILP5, asymmetric conformation
手法: 単粒子 / : Bai XC

PDB-9ef1:
Cryo-EM structure of Drosophila melanogaster insulin receptor (dmIR) bound with one DILP1, asymmetric conformation
手法: 単粒子 / : Bai XC

PDB-9ef4:
Cryo-EM structure of Drosophila melanogaster insulin receptor (dmIR) bound with two DILP1, symmetric conformation
手法: 単粒子 / : Bai XC

PDB-9ef5:
Cryo-EM structure of Drosophila melanogaster insulin receptor (dmIR) bound with one DILP2, asymmetric conformation
手法: 単粒子 / : Bai XC

PDB-9ef9:
Cryo-EM structure of Drosophila melanogaster insulin receptor (dmIR) bound with three DILP5, asymmetric conformation
手法: 単粒子 / : Bai XC

EMDB-64982:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT WT
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

EMDB-64996:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT mutant L60C
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

PDB-9vdc:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT WT
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

PDB-9veb:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT mutant L60C
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

EMDB-38604:
RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38607:
RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38624:
RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38717:
RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xrj:
RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xrm:
RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xso:
RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xvs:
RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38849:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT WT
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

PDB-8y1x:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT WT
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

EMDB-38731:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT mutant L60C
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

PDB-8xw5:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT mutant L60C
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

EMDB-19181:
Beta-galactosidase (LacZ) purified from E. coli.
手法: 単粒子 / : Hardenbrook NJ, Sheng Y, Zhang P

EMDB-19182:
Beta-galactosidase (LacZ) in complex with glycosyrin from Pseudomonas syringae.
手法: 単粒子 / : Hardenbrook NJ, Sheng Y, Zhang P

EMDB-19183:
Beta-galactosidase (LacZ) in complex with synthetic glycosyrin.
手法: 単粒子 / : Hardenbrook NJ, Sheng Y, Zhang P

PDB-8ri6:
Beta-galactosidase (LacZ) purified from E. coli.
手法: 単粒子 / : Hardenbrook NJ, Sheng Y, Zhang P

PDB-8ri7:
Beta-galactosidase (LacZ) in complex with glycosyrin from Pseudomonas syringae.
手法: 単粒子 / : Hardenbrook NJ, Sheng Y, Zhang P

PDB-8ri8:
Beta-galactosidase (LacZ) in complex with synthetic glycosyrin.
手法: 単粒子 / : Hardenbrook NJ, Sheng Y, Zhang P

EMDB-38240:
Macaca fascicularis NTCP in complex with YN69083 Fab
手法: 単粒子 / : Park JH, Ishimoto N, Park SY

PDB-8xcd:
Macaca fascicularis NTCP in complex with YN69083 Fab
手法: 単粒子 / : Park JH, Ishimoto N, Park SY

EMDB-44293:
Cryo-EM structure of MraY in complex with analogue 2
手法: 単粒子 / : Hao A, Lee SY

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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