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検索結果

検索 (著者・登録者: takizawa & y)の結果187件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-64225:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome
手法: 単粒子 / : Ho CH, Nozawa K, Nishimura M, Oi M, Kujirai T, Ogasawara M, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-64226:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome)
手法: 単粒子 / : Ho CH, Nozawa K, Nishimura M, Oi M, Kujirai T, Ogasawara M, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9ujs:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome
手法: 単粒子 / : Ho CH, Nozawa K, Nishimura M, Oi M, Kujirai T, Ogasawara M, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9ujt:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome)
手法: 単粒子 / : Ho CH, Nozawa K, Nishimura M, Oi M, Kujirai T, Ogasawara M, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-64920:
Cryo-EM structure of CARD1 ectodomain
手法: 単粒子 / : Fukuda Y, Ishihama N, Laohavisit A

EMDB-64934:
Cryo-EM structure of a CARD1 ectodomain H197A/H199A/H222A mutant
手法: 単粒子 / : Fukuda Y, Ishihama N, Laohavisit A

EMDB-65715:
Cryo-EM map of the nucleosome reconstituted in E. coli cells
手法: 単粒子 / : Ho CH, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-65716:
Cryo-EM structure of the close-packed di-hexasome (CPDH)
手法: 単粒子 / : Ho CH, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9w74:
Cryo-EM structure of the close-packed di-hexasome (CPDH)
手法: 単粒子 / : Ho CH, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-61242:
Cryo-EM structure of native NCP-UV-DDB complex
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-61243:
Cryo-EM structure of NCP-UV-DDB complex containing CPD
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-61246:
Cryo-EM structure of UV-DDB bound to native NCP at SHL+/-2
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-61247:
Cryo-EM structure of UV-DDB bound to native NCP at SHL+/-3
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-61248:
Cryo-EM structure of UV-DDB bound to native NCP at SHL+/-6
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

PDB-9j8w:
Cryo-EM structure of NCP-UV-DDB complex containing CPD
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-60592:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome containing histone variant H2A.B
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Kujirai T, Hirano R, Ehara H, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

EMDB-60593:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Kujirai T, Rina H, Ehara H, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

PDB-9ii7:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Kujirai T, Rina H, Ehara H, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

EMDB-38604:
RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38607:
RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38624:
RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38717:
RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xrj:
RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xrm:
RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xso:
RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xvs:
RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-63078:
Cryo-EM structure of the native HeLa nucleosome
手法: 単粒子 / : Hatazawa S, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-63079:
Cryo-EM structure of the native HeLa nucleosome in poly-nucleosomes (class 1)
手法: 単粒子 / : Hatazawa S, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-63080:
Cryo-EM structure of the native HeLa nucleosome in poly-nucleosomes (class 2)
手法: 単粒子 / : Hatazawa S, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-63081:
Cryo-EM structure of the native HeLa nucleosome in poly-nucleosomes (class 3)
手法: 単粒子 / : Hatazawa S, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-63144:
Subtomogram average of the HeLa nucleosome
手法: サブトモグラム平均 / : Hatazawa S, Fukuda Y, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-63145:
Subtomogram average of the HeLa nucleosome for mapping back
手法: サブトモグラム平均 / : Hatazawa S, Fukuda Y, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-62193:
Cryo-EM structure of the human CENP-A-H4 octasome.
手法: 単粒子 / : Nozawa K, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9k9l:
Cryo-EM structure of the human CENP-A-H4 octasome.
手法: 単粒子 / : Nozawa K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-37121:
Structure of nucleosome complexed with one DEK molecule
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-37149:
Structure of H1.2 bound to the nucleosome
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8kd1:
Structure of nucleosome complexed with one DEK molecule
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8ke0:
Structure of H1.2 bound to the nucleosome
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-37115:
Structure of nucleosome complexed with two DEK molecules
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38443:
193 bp Widom601L nucleosome (closed)
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38444:
193 bp Widom601L nucleosome (middle)
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38445:
193 bp Widom601L nucleosome (open)
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8kcy:
Structure of nucleosome complexed with two DEK molecules
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Echigoya K, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-61231:
Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex)
手法: 単粒子 / : Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-61232:
Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex)
手法: 単粒子 / : Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-61233:
Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex
手法: 単粒子 / : Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9j8m:
Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex)
手法: 単粒子 / : Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9j8n:
Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex)
手法: 単粒子 / : Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9j8o:
Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex
手法: 単粒子 / : Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38877:
Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (closed form)
手法: 単粒子 / : Tanaka H, Nishimura M, Takizawa Y, Nozawa K, Ehara H, Sekine S, Kurumizaka H

ページ:

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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