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検索結果

検索 (著者・登録者: penczek & pa)の結果68件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-4405:
Helical MyD88 death domain filament
手法: らせん対称 / : Moncrieffe MC, Bollschweiler D

PDB-6i3n:
Helical MyD88 death domain filament
手法: らせん対称 / : Moncrieffe MC, Bollschweiler D, Penczek PAP, Gay NJ

EMDB-20475:
MicroED structure of proteinase K recorded on Falcon III
手法: 電子線結晶学 / : Hattne J, Martynowycz MW

EMDB-20476:
MicroED structure of proteinase K recorded on CetaD
手法: 電子線結晶学 / : Hattne J, Martynowycz MW

PDB-6pu4:
MicroED structure of proteinase K recorded on Falcon III
手法: 電子線結晶学 / : Hattne J, Martynowycz MW, Penzcek PA, Gonen T

PDB-6pu5:
MicroED structure of proteinase K recorded on CetaD
手法: 電子線結晶学 / : Hattne J, Martynowycz MW, Penzcek PA, Gonen T

EMDB-0088:
XaxAB pore complex from Xenorhabdus nematophila
手法: 単粒子 / : Schubert E, Vetter IR, Prumbaum D, Penczek PA, Raunser S

PDB-6gy6:
XaxAB pore complex from Xenorhabdus nematophila
手法: 単粒子 / : Schubert E, Raunser S

EMDB-7006:
Human ribonucleotide reductase large subunit (alpha) with dATP and CDP
手法: 単粒子 / : Brignole EJ, Drennan CL

PDB-6aui:
Human ribonucleotide reductase large subunit (alpha) with dATP and CDP
手法: 単粒子 / : Brignole EJ, Drennan CL, Asturias FJ, Tsai KL, Penczek PA

EMDB-3645:
CryoEM density of TcdA1 in prepore state (SPHIRE tutorial)
手法: 単粒子 / : Raunser S, Gatsogiannis S, Roderer S

PDB-5l08:
Cryo-EM structure of Casp-8 tDED filament
手法: らせん対称 / : Fu TM, Li Y, Lu A, Wu H

EMDB-8300:
Cryo-EM structure of Casp-8 tDED filament (CASP target)
手法: らせん対称 / : Fu TM, Li Y, Wu H

EMDB-6359:
Cryo-EM structure of the peroxisomal Pex1/Pex6 complex in ATP-gamma-S state
手法: 単粒子 / : Blok NB, Tan D, Wang RY, Penczek PA, Baker D, DiMaio F, Rapoport TA, Walz T

EMDB-6360:
Cryo-EM structure of the peroxisomal Pex1/Pex6 complex in ADP state
手法: 単粒子 / : Blok NB, Tan D, Wang RY, Penczek PA, Baker D, DiMaio F, Rapoport TA, Walz T

PDB-5aj0:
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (POST state).
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Loerke J, Budkevich TV, Yamamoto K, Schmidt A, Penczek PA, Vos MR, Burger J, Mielke T, Scheerer P, Spahn CMT

EMDB-2875:
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (POST state).
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Loerke J, Budkevich TV, Yamamoto K, Schmidt A, Penczek PA, Vos MR, Burger J, Mielke T, Scheerer P, Spahn CMT

EMDB-2902:
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (POST-i2 state).
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Loerke J, Budkevich TV, Yamamoto K, Schmidt A, Penczek PA, Vos MR, Burger J, Mielke T, Scheerer P, Spahn CMT

EMDB-2903:
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (POST-i3 state).
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Loerke J, Budkevich TV, Yamamoto K, Schmidt A, Penczek PA, Vos MR, Burger J, Mielke T, Scheerer P, Spahn CMT

EMDB-2904:
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (rotated-1 PRE state).
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Loerke J, Budkevich TV, Yamamoto K, Schmidt A, Penczek PA, Vos MR, Burger J, Mielke T, Scheerer P, Spahn CMT

EMDB-2905:
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (rotated-2 PRE state).
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Loerke J, Budkevich TV, Yamamoto K, Schmidt A, Penczek PA, Vos MR, Burger J, Mielke T, Scheerer P, Spahn CMT

EMDB-2906:
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (PRE* state).
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Loerke J, Budkevich TV, Yamamoto K, Schmidt A, Penczek PA, Vos MR, Burger J, Mielke T, Scheerer P, Spahn CMT

EMDB-2907:
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (classical iPRE state).
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Loerke J, Budkevich TV, Yamamoto K, Schmidt A, Penczek PA, Vos MR, Burger J, Mielke T, Scheerer P, Spahn CMT

EMDB-2908:
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (decoding/post-hydrolysis state).
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Loerke J, Budkevich TV, Yamamoto K, Schmidt A, Penczek PA, Vos MR, Burger J, Mielke T, Scheerer P, Spahn CMT

EMDB-2909:
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (classical-1 PRE state).
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Loerke J, Budkevich TV, Yamamoto K, Schmidt A, Penczek PA, Vos MR, Burger J, Mielke T, Scheerer P, Spahn CMT

EMDB-2910:
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (pre-recycling state).
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Loerke J, Budkevich TV, Yamamoto K, Schmidt A, Penczek PA, Vos MR, Burger J, Mielke T, Scheerer P, Spahn CMT

EMDB-2911:
Cryo electron microscopy of actively translating human polysomes (decoding/post-dissociation state).
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Loerke J, Budkevich TV, Yamamoto K, Schmidt A, Penczek PA, Vos MR, Burger J, Mielke T, Scheerer P, Spahn CMT

EMDB-5889:
Cryo-electron microscopy of human 80S ribosome
手法: 単粒子 / : Penczek PA, Fang J, Li X, Cheng Y, Loerke J, Spahn CMT

EMDB-6124:
Structure of the F-actin-tropomyosin complex
手法: らせん対称 / : von der Ecken J, Mueller M, Lehman W, Manstein DJ, Penczek PA, Raunser S

PDB-3j8a:
Structure of the F-actin-tropomyosin complex
手法: らせん対称 / : von der Ecken J, Mueller M, Lehman W, Manstein JM, Penczek AP, Raunser S

EMDB-5922:
3.6 Angstrom resolution MAVS filament generated from helical reconstruction
手法: らせん対称 / : Wu B, Peisley A, Li Z, Egelman E, Walz T, Penczek P, Hur S

EMDB-5925:
3.6 Angstrom resolution MAVS filament generated from helical reconstruction, truncated map
手法: らせん対称 / : Wu B, Peisley A, Li Z, Egelman E, Walz T, Penczek P, Hur S

PDB-3j6j:
3.6 Angstrom resolution MAVS filament generated from helical reconstruction
手法: らせん対称 / : Wu B, Peisley A, Li Z, Egelman E, Walz T, Penczek P, Hur S

PDB-4v5m:
tRNA tranlocation on the 70S ribosome: the pre-translocational translocation intermediate TI(PRE)
手法: 単粒子 / : Ratje AH, Loerke J, Mikolajka A, Bruenner M, Hildebrand PW, Starosta AL, Doenhoefer A, Connell SR, Fucini P, Mielke T, Whitford PC, Onuchic JN, Yu Y, Sanbonmatsu KY, Hartmann RK, Penczek PA, Wilson DN, Spahn CMT

PDB-4v5n:
tRNA translocation on the 70S ribosome: the post- translocational translocation intermediate TI(POST)
手法: 単粒子 / : Ratje AH, Loerke J, Mikolajka A, Bruenner M, Hildebrand PW, Starosta AL, Doenhoefer A, Connell SR, Fucini P, Mielke T, Whitford PC, Onuchic JN, Yu Y, Sanbonmatsu KY, Hartmann RK, Penczek PA, Wilson DN, Spahn CMT

PDB-4v68:
T. thermophilus 70S ribosome in complex with mRNA, tRNAs and EF-Tu.GDP.kirromycin ternary complex, fitted to a 6.4 A Cryo-EM map.
手法: 単粒子 / : Schuette JC, Spahn CMT

PDB-4v4b:
Structure of the ribosomal 80S-eEF2-sordarin complex from yeast obtained by docking atomic models for RNA and protein components into a 11.7 A cryo-EM map.
手法: 単粒子 / : Spahn CM, Gomez-Lorenzo MG, Grassucci RA, Jorgensen R, Andersen GR, Beckmann R, Penczek PA, Ballesta JPG, Frank J

PDB-3j1n:
Cryo-EM map of a yeast minimal preinitiation complex interacting with the Mediator Head module
手法: 単粒子 / : Asturias FJ, Imasaki T

PDB-3j1o:
Cryo-EM map of a yeast minimal preinitiation complex interacting with the Mediator Head module
手法: 単粒子 / : Asturias FJ, Imasaki T

EMDB-5450:
Inward-Facing Conformation of the Zinc Transporter YiiP revealed by Cryo-electron Microscopy
手法: らせん対称 / : Coudray N, Valvo S, Hu M, Lasala R, Kim C, Vink M, Zhou M, Provasi D, Filizola M, Tao J, Fang J, Penczek PA, Ubarretxena-Belandia I, Stokes DL

PDB-3j1z:
Inward-Facing Conformation of the Zinc Transporter YiiP revealed by Cryo-electron Microscopy
手法: らせん対称 / : Coudray N, Valvo S, Hu M, Lasala R, Kim C, Vink M, Zhou M, Provasi D, Filizola M, Tao J, Fang J, Penczek PA, Ubarretxena-Belandia I, Stokes DL, Transcontinental EM Initiative for Membrane Protein Structure (TEMIMPS)

EMDB-1987:
Structure of the Actin-Tropomyosin-Myosin Complex (rigor ATM 3)
手法: らせん対称 / : Behrmann E, Mueller M, Penczek PA, Mannherz HG, Manstein DJ, Raunser S

EMDB-1988:
Structure of the Actin-Tropomyosin-Myosin Complex (rigor ATM 2)
手法: らせん対称 / : Behrmann E, Mueller M, Penczek PA, Mannherz HG, Manstein DJ, Raunser S

EMDB-1989:
Structure of the Actin-Tropomyosin-Myosin Complex (rigor ATM 1)
手法: らせん対称 / : Behrmann E, Mueller M, Penczek PA, Mannherz HG, Manstein DJ, Raunser S

EMDB-1990:
Structure of bare F-actin filaments obtained from the same sample as the Actin-Tropomyosin-Myosin Complex
手法: らせん対称 / : Behrmann E, Mueller M, Penczek PA, Mannherz HG, Manstein DJ, Raunser S

PDB-4a7f:
Structure of the Actin-Tropomyosin-Myosin Complex (rigor ATM 3)
手法: らせん対称 / : Behrmann E, Mueller M, Penczek PA, Mannherz HG, Manstein DJ, Raunser S

PDB-4a7h:
Structure of the Actin-Tropomyosin-Myosin Complex (rigor ATM 2)
手法: らせん対称 / : Behrmann E, Mueller M, Penczek PA, Mannherz HG, Manstein DJ, Raunser S

PDB-4a7l:
Structure of the Actin-Tropomyosin-Myosin Complex (rigor ATM 1)
手法: らせん対称 / : Behrmann E, Mueller M, Penczek PA, Mannherz HG, Manstein DJ, Raunser S

PDB-4a7n:
Structure of bare F-actin filaments obtained from the same sample as the Actin-Tropomyosin-Myosin Complex
手法: 単粒子 / : Behrmann E, Mueller M, Penczek PA, Mannherz HG, Manstein DJ, Raunser S

EMDB-5407:
Cryo-EM map of a yeast minimal preinitiation complex interacting with the Mediator Head module
手法: 単粒子 / : Cai G, Chaban Y, Imasaki T, Kovacs JA, Calero G, Penczek PA, Takagi Y, Asturias FJ

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

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関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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