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検索結果

検索 (著者・登録者: ogasawara & s)の結果149件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-64225:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome
手法: 単粒子 / : Ho CH, Nozawa K, Nishimura M, Oi M, Kujirai T, Ogasawara M, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-64226:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome)
手法: 単粒子 / : Ho CH, Nozawa K, Nishimura M, Oi M, Kujirai T, Ogasawara M, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9ujs:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome
手法: 単粒子 / : Ho CH, Nozawa K, Nishimura M, Oi M, Kujirai T, Ogasawara M, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9ujt:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome)
手法: 単粒子 / : Ho CH, Nozawa K, Nishimura M, Oi M, Kujirai T, Ogasawara M, Ehara H, Sekine S, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-66042:
Open State of Apo-P-Glycoprotein
手法: 単粒子 / : Hamaguchi-Suzuki N, Kanaoka Y, Ogasawara S, Murata T, Uchihashi T

EMDB-66043:
Closed State of Apo-P-Glycoprotein.
手法: 単粒子 / : Hamaguchi-Suzuki N, Kanaoka Y, Ogasawara S, Murata T, Uchihashi T

EMDB-67107:
Cryo-EM structure of the human A2A adenosine receptor in complex with a Fab antibody fragment
手法: 単粒子 / : Miyashita Y, Konno R, Ogasawara S, Okuda Y, Takamuku Y, Moriya T, Saito T, Murata T, Ohara O, Kawashima Y

PDB-9xqb:
Cryo-EM structure of the human A2A adenosine receptor in complex with a Fab antibody fragment
手法: 単粒子 / : Miyashita Y, Konno R, Ogasawara S, Okuda Y, Takamuku Y, Moriya T, Saito T, Murata T, Ohara O, Kawashima Y

EMDB-65715:
Cryo-EM map of the nucleosome reconstituted in E. coli cells
手法: 単粒子 / : Ho CH, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-65716:
Cryo-EM structure of the close-packed di-hexasome (CPDH)
手法: 単粒子 / : Ho CH, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9w74:
Cryo-EM structure of the close-packed di-hexasome (CPDH)
手法: 単粒子 / : Ho CH, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-61242:
Cryo-EM structure of native NCP-UV-DDB complex
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-61243:
Cryo-EM structure of NCP-UV-DDB complex containing CPD
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-61246:
Cryo-EM structure of UV-DDB bound to native NCP at SHL+/-2
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-61247:
Cryo-EM structure of UV-DDB bound to native NCP at SHL+/-3
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-61248:
Cryo-EM structure of UV-DDB bound to native NCP at SHL+/-6
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

PDB-9j8w:
Cryo-EM structure of NCP-UV-DDB complex containing CPD
手法: 単粒子 / : Matsumoto S, Takizawa Y, Ogasawara M, Hashimoto K, Negishi L, Xu W, Tachibana H, Yamamoto J, Iwai S, Sugasawa K, Kurumizaka H

EMDB-64982:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT WT
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

EMDB-64996:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT mutant L60C
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

PDB-9vdc:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT WT
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

PDB-9veb:
Cryo-EM structure of the aspartate:alanine antiporter AspT mutant L60C
手法: 単粒子 / : Nanatani K, Kanno R, Kawabata T, Watanabe S, Hidaka M, Yamanaka T, Toda K, Fujiki T, Kunii K, Miyamoto A, Chiba F, Ogasawara S, Murata T, Humbel BM, Inaba K, Mitsuoka K, Guan L, Abe K, Yamamoto M, Koshiba S

EMDB-60592:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome containing histone variant H2A.B
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Kujirai T, Hirano R, Ehara H, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

EMDB-60593:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Kujirai T, Rina H, Ehara H, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

PDB-9ii7:
RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Kujirai T, Rina H, Ehara H, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

EMDB-38604:
RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38607:
RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38624:
RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-38717:
RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xrj:
RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xrm:
RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xso:
RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8xvs:
RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei
手法: 単粒子 / : Kujirai T, Kato J, Yamamoto K, Hirai S, Negishi L, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-61231:
Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex)
手法: 単粒子 / : Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-61232:
Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex)
手法: 単粒子 / : Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-61233:
Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex
手法: 単粒子 / : Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9j8m:
Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex)
手法: 単粒子 / : Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9j8n:
Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex)
手法: 単粒子 / : Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-9j8o:
Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex
手法: 単粒子 / : Horikoshi N, Miyake R, Sogawa-Fujiwara C, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-37132:
Structure of LAT1-CD98hc-Fab170 in complex with JPH203, consensus map
手法: 単粒子 / : Lee Y

EMDB-37134:
Structure of LAT1-CD98hc in complex with JPH203, focused on TMD
手法: 単粒子 / : Lee Y

EMDB-37135:
Structure of LAT1-CD98hc-Fab170 in complex with BCH, consensus map
手法: 単粒子 / : Lee Y

EMDB-37136:
Structure of LAT1-CD98hc in complex with BCH, focused on TMD
手法: 単粒子 / : Lee Y

EMDB-37137:
Structure of apo inward-open LAT1-CD98hc-Fab170 in nanodisc, consensus map
手法: 単粒子 / : Lee Y

EMDB-37138:
Structure of apo inward-open LAT1-CD98h in nanodisc, focused on TMD
手法: 単粒子 / : Lee Y

EMDB-37140:
Structure of LAT1-CD98hc in complex with L-Phe, focused on TMD
手法: 単粒子 / : Lee Y

EMDB-37141:
Structure of LAT1-CD98hc in complex with melphalan, focused on TMD
手法: 単粒子 / : Lee Y

EMDB-37142:
Structure of apo outward-open LAT1-CD98h in nanodisc, focused on TMD
手法: 単粒子 / : Lee Y

PDB-8kdd:
Structure of LAT1-CD98hc-Fab170 in complex with JPH203, consensus map
手法: 単粒子 / : Lee Y

PDB-8kdf:
Structure of LAT1-CD98hc in complex with JPH203, focused on TMD
手法: 単粒子 / : Lee Y

PDB-8kdg:
Structure of LAT1-CD98hc-Fab170 in complex with BCH, consensus map
手法: 単粒子 / : Lee Y

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
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関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

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