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検索結果

検索 (著者・登録者: makino & f)の結果130件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-63944:
Microtubule doublet from wild-type mouse tracheal epithelial cells
手法: サブトモグラム平均 / : Zhang Y, Ni T, He M, Park HJ, Choi MJ, Cheung HO

EMDB-63946:
microtubule doublet from Kif27-/- mouse tracheal epithelial cells
手法: サブトモグラム平均 / : Zhang Y, Ni T, He M, Park HJ, Choi MJ, Cheung HO

EMDB-62570:
Cryo-EM structure of the TIA-1 prion-like domain amyloid fibril, WT
手法: らせん対称 / : Inaoka D, Miyata T, Makino F, Ohtani Y, Ekari M, Kobayashi R, Imamura K, Sakamoto E, Kodama ST, Yoshida N, Kato T, Namba K, Tochio H, Sekiyama N

EMDB-62571:
Cryo-EM structure of the TIA-1 prion-like domain amyloid fibril, G355R
手法: らせん対称 / : Inaoka D, Miyata T, Makino F, Ohtani Y, Ekari M, Kobayashi R, Imamura K, Sakamoto E, Kodama ST, Yoshida N, Kato T, Namba K, Tochio H, Sekiyama N

PDB-9kty:
Cryo-EM structure of the TIA-1 prion-like domain amyloid fibril, WT
手法: らせん対称 / : Inaoka D, Miyata T, Makino F, Ohtani Y, Ekari M, Kobayashi R, Imamura K, Sakamoto E, Kodama ST, Yoshida N, Kato T, Namba K, Tochio H, Sekiyama N

PDB-9ktz:
Cryo-EM structure of the TIA-1 prion-like domain amyloid fibril, G355R
手法: らせん対称 / : Inaoka D, Miyata T, Makino F, Ohtani Y, Ekari M, Kobayashi R, Imamura K, Sakamoto E, Kodama ST, Yoshida N, Kato T, Namba K, Tochio H, Sekiyama N

EMDB-61993:
Structure of the Salmonella flagellar FliPQR complex reconstituted in the peptidisc
手法: 単粒子 / : Kinoshita M, Miyata T, Makino F, Imada K, Namba K, Minamino T

PDB-9k29:
Structure of the Salmonella flagellar FliPQR complex reconstituted in the peptidisc
手法: 単粒子 / : Kinoshita M, Miyata T, Makino F, Imada K, Namba K, Minamino T

EMDB-61725:
Cryo-EM Structure of Fructose Dehydrogenase Variant from Gluconobacter japonicus Truncating Heme 1c and C-Terminal Hydrophobic Regions
手法: 単粒子 / : Adachi T, Ichikawa K, Miyata T, Makino F, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Shirai O

PDB-9jqa:
Cryo-EM Structure of Fructose Dehydrogenase Variant from Gluconobacter japonicus Truncating Heme 1c and C-Terminal Hydrophobic Regions
手法: 単粒子 / : Adachi T, Ichikawa K, Miyata T, Makino F, Tanaka H, Namba K, Sowa K

EMDB-60747:
Cryo-EM structure of Escherichia coli hibernating ribosome with RNase I mutant
手法: 単粒子 / : Tanzawa T, Minami A, Yoshida H, Kato T, Ogawa T

EMDB-39676:
Cryo-EM structure of cylindrical fiber of MyD88 TIR
手法: 単粒子 / : Kasai K, Imamura K, Narita A, Makino F, Miyata T, Kato T, Namba K, Onishi H, Tochio H

PDB-8yym:
Cryo-EM structure of cylindrical fiber of MyD88 TIR
手法: 単粒子 / : Kasai K, Imamura K, Narita A, Makino F, Miyata T, Kato T, Namba K, Onishi H, Tochio H

EMDB-19402:
Single-particle cryo-EM of Mycoplasma pneumoniae adhesin P1 complexed with the anti-adhesive Fab fragment.
手法: 単粒子 / : Vizarraga D, Kawamoto A, Marcos-Silva M, Fita I, Miyata M, Pinyol J, Namba K, Kenri T

PDB-8ror:
Single-particle cryo-EM of Mycoplasma pneumoniae adhesin P1 complexed with the anti-adhesive Fab fragment.
手法: 単粒子 / : Vizarraga D, Kawamoto A, Marcos-Silva M, Fita I, Miyata M, Pinyol J, Namba K, Kenri T

EMDB-19403:
Single-particle cryo-EM of the P1-P40P90 heterodimer from Mycoplasma pneumoniae below 10 Angstrom resolution.
手法: 単粒子 / : Kawamoto A, Vizarraga D, Marcos-Silva M, Fita I, Miyata M, Pinyol J, Namba K, Kenri T

EMDB-60007:
Structure of the Salmonella flagellar MS-ring with C11 symmetry applied
手法: 単粒子 / : Kinoshita M, Makino F, Miyata T, Imada K, Minamino T, Namba K

EMDB-60008:
Structure of the RBM3 ring of Salmonella flagellar MS-ring protein FliF with C33 symmetry applied
手法: 単粒子 / : Kinoshita M, Makino F, Miyata T, Imada K, Minamino T, Namba K

EMDB-60009:
Structure of the RBM3 ring of Salmonella flagellar MS-ring protein FliF with C34 symmetry applied
手法: 単粒子 / : Kinoshita M, Makino F, Miyata T, Imada K, Minamino T, Namba K

EMDB-62210:
Structure of the 34-mer RBM3 ring of Salmonella flagellar MS-ring protein FliF with C1 symmetry applied
手法: 単粒子 / : Kinoshita M, Makino F, Miyata T, Imada K, Minamino T, Namba K

EMDB-62211:
Structure of the 33-mer RBM3 ring of Salmonella flagellar MS-ring protein FliF with C1 symmetry applied
手法: 単粒子 / : Kinoshita M, Makino F, Miyata T, Imada K, Minamino T, Namba K

PDB-8zds:
Structure of the Salmonella flagellar MS-ring with C11 symmetry applied
手法: 単粒子 / : Kinoshita M, Makino F, Miyata T, Imada K, Minamino T, Namba K

PDB-8zdt:
Structure of the RBM3 ring of Salmonella flagellar MS-ring protein FliF with C33 symmetry applied
手法: 単粒子 / : Kinoshita M, Makino F, Miyata T, Imada K, Minamino T, Namba K

PDB-8zdu:
Structure of the RBM3 ring of Salmonella flagellar MS-ring protein FliF with C34 symmetry applied
手法: 単粒子 / : Kinoshita M, Makino F, Miyata T, Imada K, Minamino T, Namba K

EMDB-37355:
Cryo-EM structure of helical filament of MyD88 TIR
手法: 単粒子 / : Kasai K, Imamura K, Narita A, Makino F, Miyata T, Kato T, Namba K, Onishi H, Tochio H

PDB-8w8m:
Cryo-EM structure of helical filament of MyD88 TIR
手法: 単粒子 / : Kasai K, Imamura K, Narita A, Makino F, Miyata T, Kato T, Namba K, Onishi H, Tochio H

EMDB-60959:
Salmonella enterica serovar Typhimurium FliC(G426A)delta(204-292) forming the L-type straight filament
手法: らせん対称 / : Waraich K, Makino F, Miyata T, Kinoshita M, Minamino T, Namba K

PDB-9iwq:
Salmonella enterica serovar Typhimurium FliC(G426A)delta(204-292) forming the L-type straight filament
手法: らせん対称 / : Waraich K, Makino F, Miyata T, Kinoshita M, Minamino T, Namba K

EMDB-36920:
Cryo-EM Structure of Membrane-bound Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter japonicus variant-H1147A
手法: 単粒子 / : Fukawa E, Miyata T, Makino F, Adachi T, Suzuki Y, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

EMDB-36921:
Cryo-EM Structure of Membrane-bound Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter japonicus variant-N1146A
手法: 単粒子 / : Fukawa E, Miyata T, Makino F, Adachi T, Suzuki Y, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

EMDB-38247:
Cryo-EM Structure of Membrane-bound Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter japonicus variant-N1146Q
手法: 単粒子 / : Fukawa E, Miyata T, Makino F, Adachi T, Suzuki Y, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

EMDB-38248:
Cryo-EM Structure of Membrane-bound Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter japonicus variant-N1190A
手法: 単粒子 / : Fukawa E, Miyata T, Makino F, Adachi T, Suzuki Y, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

PDB-8k6j:
Cryo-EM Structure of Membrane-bound Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter japonicus variant-H1147A
手法: 単粒子 / : Fukawa E, Miyata T, Makino F, Adachi T, Suzuki Y, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

PDB-8k6k:
Cryo-EM Structure of Membrane-bound Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter japonicus variant-N1146A
手法: 単粒子 / : Fukawa E, Miyata T, Makino F, Adachi T, Suzuki Y, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

PDB-8xcm:
Cryo-EM Structure of Membrane-bound Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter japonicus variant-N1146Q
手法: 単粒子 / : Fukawa E, Miyata T, Makino F, Adachi T, Suzuki Y, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

PDB-8xcn:
Cryo-EM Structure of Membrane-bound Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter japonicus variant-N1190A
手法: 単粒子 / : Fukawa E, Miyata T, Makino F, Adachi T, Suzuki Y, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

EMDB-36190:
Cryo-EM Structure of Na-dithionite Reduced Membrane-bound Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter japonicus
手法: 単粒子 / : Suzuki Y, Miyata T, Makino F, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

EMDB-36191:
Cryo-EM Structure of K-ferricyanide Oxidized Membrane-bound Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter japonicus
手法: 単粒子 / : Suzuki Y, Miyata T, Makino F, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

PDB-8jej:
Cryo-EM Structure of Na-dithionite Reduced Membrane-bound Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter japonicus
手法: 単粒子 / : Suzuki Y, Miyata T, Makino F, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

PDB-8jek:
Cryo-EM Structure of K-ferricyanide Oxidized Membrane-bound Fructose Dehydrogenase from Gluconobacter japonicus
手法: 単粒子 / : Suzuki Y, Miyata T, Makino F, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

EMDB-33972:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (3-up RBD) bound to neutralizing antibody CSW1-1805
手法: 単粒子 / : Anzai I, Fujita J, Ono C, Kosaka Y, Miyamoto Y, Shichinohe S, Takada K, Torii S, Taguwa S, Suzuki K, Makino F, Kajita T, Inoue T, Namba K, Watanabe T, Matsuura Y

EMDB-33973:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (1-up RBD) bound to neutralizing antibody CSW2-1353
手法: 単粒子 / : Anzai I, Fujita J, Ono C, Kosaka Y, Miyamoto Y, Shichinohe S, Takada K, Torii S, Taguwa S, Suzuki K, Makino F, Kajita T, Inoue T, Namba K, Watanabe T, Matsuura Y

EMDB-33974:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing antibody CSW2-1353
手法: 単粒子 / : Anzai I, Fujita J, Ono C, Kosaka Y, Miyamoto Y, Shichinohe S, Takada K, Torii S, Taguwa S, Suzuki K, Makino F, Kajita T, Inoue T, Namba K, Watanabe T, Matsuura Y

EMDB-33975:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) with C480A mutation
手法: 単粒子 / : Anzai I, Fujita J, Ono C, Kosaka Y, Miyamoto Y, Shichinohe S, Takada K, Torii S, Taguwa S, Suzuki K, Makino F, Kajita T, Inoue T, Namba K, Watanabe T, Matsuura Y

EMDB-34368:
Cryo-EM Structure of Membrane-Bound Alcohol Dehydrogenase from Gluconobacter oxydans
手法: 単粒子 / : Adachi T, Miyata T, Makino F, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

EMDB-34369:
Cryo-EM Structure of Membrane-Bound Aldehyde Dehydrogenase from Gluconobacter oxydans
手法: 単粒子 / : Adachi T, Miyata T, Makino F, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

PDB-8gy2:
Cryo-EM Structure of Membrane-Bound Alcohol Dehydrogenase from Gluconobacter oxydans
手法: 単粒子 / : Adachi T, Miyata T, Makino F, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

PDB-8gy3:
Cryo-EM Structure of Membrane-Bound Aldehyde Dehydrogenase from Gluconobacter oxydans
手法: 単粒子 / : Adachi T, Miyata T, Makino F, Tanaka H, Namba K, Sowa K, Kitazumi Y, Shirai O

EMDB-33643:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab816
手法: 単粒子 / : Uchikubo T, Shirouzu M

EMDB-33644:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab803
手法: 単粒子 / : Uchikubo T, Shirouzu M

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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