[日本語] English
- 3次元電子顕微鏡データ検索 -

-
検索条件


キーワード
データベース /
Q: EM Navigatorの情報源は？
データエントリ / 週前
Q: データの更新はいつですか？
著者・登録者
解析手法
表示モード
並び順
エントリ数 / 1ページ
登録情報
文献
試料
実験
解析
データの最大数全データの場合は0
ファイル形式
  • CSV形式 (コンマ区切り, Excelなどに)
  • TSV形式 (タブ区切り)
  • JSON形式

万見検索

-
検索結果

検索 (著者・登録者: low & ys)の結果55件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-46976:
Arabinosyltransferase AftB in complex with Fab_B3
手法: 単粒子 / : Liu Y, Mancia F

EMDB-46978:
donor substrate analog-bound AftB
手法: 単粒子 / : Liu Y, Mancia F

EMDB-46998:
Product-Bound mannosyltransferase PimE
手法: 単粒子 / : Liu Y

EMDB-46999:
mannosyltransferase PimE in complex with Fab_E6
手法: 単粒子 / : Liu Y

EMDB-70353:
Clone 2.1 Fab in complex with chicken IgY CH2 domain (local refinement)
手法: 単粒子 / : Ozorowski G, Alkutkar T, Ward AB

EMDB-44380:
Prefusion F glycoprotein ectodomain of Nipah virus ectodomain in complex with DS90 nanobody
手法: 単粒子 / : Low YS, Isaacs A, Modhiran N, Watterson D

PDB-9n9d:
MicroED structure of papain co-crystallized with E-64C
手法: 電子線結晶学 / : Vlahakis N, Rodriguez JA

PDB-9nae:
MicroED structure of papain co-crystallized with E-64
手法: 電子線結晶学 / : Vlahakis N, Rodriguez JA

PDB-9nag:
MicroED structure of the apo-form of papain
手法: 電子線結晶学 / : Vlahakis N, Rodriguez JA

PDB-9nao:
MicroED structure of papain complexed with natural product E64-A65
手法: 電子線結晶学 / : Vlahakis NW, Rodriguez JA

PDB-9nar:
MicroED structure of papain microcrystals soaked with E-64 for 10 minutes
手法: 電子線結晶学 / : Vlahakis NW, Rodriguez JA

PDB-9nax:
MicroED structure of the papain-E-64 complex from microcrystals soaked with crude biosynthetic reaction mixture
手法: 電子線結晶学 / : Vlahakis NW, Rodriguez JA

PDB-9nay:
MicroED structure of papain complexed with natural product E-64-A65 from microcrystals soaked in crude biosynthetic reaction mixture
手法: 電子線結晶学 / : Vlahakis NW, Rodriguez JA

PDB-9nbp:
MicroED structure of the papain-E-64 complex from microcrystals mixed on-grid with microarrayed ligand
手法: 電子線結晶学 / : Vlahakis N, Rodriguez JA

PDB-9nbq:
MicroED structure of papain co-crystallized with E-64D
手法: 電子線結晶学 / : Vlahakis N, Rodriguez JA

PDB-9nc1:
MicroED structure of papain-E-64 complex from microcrystals soaked with protease inhibitor cocktail
手法: 電子線結晶学 / : Vlahakis N, Rodriguez JA

PDB-9nca:
MicroED structure of microcrystals soaked with a mixture of E-64, E-64C, and E-64D
手法: 電子線結晶学 / : Vlahakis N, Rodriguez JA

EMDB-45587:
SARS-CoV-2 nsp12 NiRAN domain bound to a covalent inhibitor SW090466-1
手法: 単粒子 / : Osinski A, Hernandez G, Tagliabracci VS

EMDB-50034:
SARS-CoV-2 M protein dimer (short form) in complex with Fab-B and CIM-834
手法: 単粒子 / : Debski-Antoniak OJ, Hurdiss DL

EMDB-50035:
SARS-CoV-2 M protein dimer (long form) in complex with Fab-E and incubated with CIM-834
手法: 単粒子 / : Debski-Antoniak O, Hurdiss DL

PDB-9exa:
SARS-CoV-2 M protein dimer (short form) in complex with Fab-B and CIM-834
手法: 単粒子 / : Debski-Antoniak OJ, Hurdiss DL

EMDB-42164:
The CryoEM structure of the high affinity Carbon monoxide dehydrogenase from Mycobacterium smegmatis
手法: 単粒子 / : Grinter R, Venugopal H, Greening C, Gillett D

PDB-8uem:
The CryoEM structure of the high affinity Carbon monoxide dehydrogenase from Mycobacterium smegmatis
手法: 単粒子 / : Grinter R, Venugopal H, Greening C, Gillett D

EMDB-38650:
Additional map for SARS-CoV-2 Spike D614G variant, one RBD-up conformation 1 (PDB ID: 7EAZ; EMD-31047). Map was generated from heterogeneous refinement with downsampling in CryoSPARC
手法: 単粒子 / : Yang TJ, Yu PY, Hsu STD

EMDB-33942:
Cryo-EM structure of MERS-CoV spike protein, Two RBD-up conformation 2
手法: 単粒子 / : Hsu STD, Chang NE, Weng ZW, Yang TJ, Draczkowski P

EMDB-33943:
Cryo-EM structure of MERS-CoV spike protein, Two RBD-up conformation 1
手法: 単粒子 / : Hsu STD, Chang NE, Weng ZW, Yang TJ, Draczkowski P

EMDB-33944:
Cryo-EM structure of MERS-CoV spike protein, One RBD-up conformation 4
手法: 単粒子 / : Hsu STD, Chang NE, Weng ZW, Yang TJ, Draczkowski P

EMDB-33945:
Cryo-EM structure of MERS-CoV spike protein, One RBD-up conformation 3
手法: 単粒子 / : Hsu STD, Chang NE, Weng ZW, Yang TJ, Draczkowski P

EMDB-33946:
Cryo-EM structure of MERS-CoV spike protein, One RBD-up conformation 2
手法: 単粒子 / : Hsu STD, Chang NE, Weng ZW, Yang TJ, Draczkowski P

EMDB-33947:
Cryo-EM structure of MERS-CoV spike protein, One RBD-up conformation 1
手法: 単粒子 / : Hsu STD, Chang NE, Weng ZW, Yang TJ, Draczkowski P

EMDB-33948:
Cryo-EM structure of MERS-CoV spike protein, intermediate conformation
手法: 単粒子 / : Hsu STD, Chang NE, Weng ZW, Yang TJ, Draczkowski P

EMDB-33949:
Cryo-EM structure of MERS-CoV spike protein, all RBD-down conformation
手法: 単粒子 / : Hsu STD, Chang NE, Weng ZW, Yang TJ, Draczkowski P

EMDB-27630:
Structure of the PEAK3/14-3-3 complex
手法: 単粒子 / : Torosyan H, Paul M, Jura N, Verba KA

EMDB-27684:
Structure of the PEAK3 pseudokinase homodimer
手法: 単粒子 / : Torosyan H, Paul M, Jura N, Verba KA

EMDB-29299:
Langya virus F glycoprotein ectodomain in prefusion form
手法: 単粒子 / : Low YS, Isaacs A, Modhiran N, Watterson D

EMDB-29300:
Mojiang virus F ectodomain in prefusion form
手法: 単粒子 / : Low YS, Isaacs A, Modhiran N, Watterson D

EMDB-26767:
The 2.19-angstrom CryoEM structure of the [NiFe]-hydrogenase Huc from Mycobacterium smegmatis - Complex minus stalk
手法: 単粒子 / : Grinter R, Venugopal H, Kropp A, Greening C

EMDB-26801:
The 1.67 Angstrom CryoEM structure of the [NiFe]-hydrogenase Huc from Mycobacterium smegmatis - catalytic dimer (Huc2S2L)
手法: 単粒子 / : Grinter R, Venugopal H, Kropp A, Greening C

EMDB-26802:
The CryoEM structure of the [NiFe]-hydrogenase Huc from Mycobacterium smegmatis - Full complex focused refinement of stalk
手法: 単粒子 / : Grinter R, Venugopal H, Kropp A, Greening C

EMDB-27661:
The 1.52 angstrom CryoEM structure of the [NiFe]-hydrogenase Huc from Mycobacterium smegmatis - catalytic dimer (Huc2S2L)
手法: 単粒子 / : Grinter R, Venugopal H, Kropp A, Greening C

PDB-7utd:
The 2.19-angstrom CryoEM structure of the [NiFe]-hydrogenase Huc from Mycobacterium smegmatis - Complex minus stalk
手法: 単粒子 / : Grinter R, Venugopal H, Kropp A, Greening C

PDB-7uur:
The 1.67 Angstrom CryoEM structure of the [NiFe]-hydrogenase Huc from Mycobacterium smegmatis - catalytic dimer (Huc2S2L)
手法: 単粒子 / : Grinter R, Venugopal H, Kropp A, Greening C

PDB-7uus:
The CryoEM structure of the [NiFe]-hydrogenase Huc from Mycobacterium smegmatis - Full complex focused refinement of stalk
手法: 単粒子 / : Grinter R, Venugopal H, Kropp A, Greening C

PDB-8dqv:
The 1.52 angstrom CryoEM structure of the [NiFe]-hydrogenase Huc from Mycobacterium smegmatis - catalytic dimer (Huc2S2L)
手法: 単粒子 / : Grinter R, Venugopal H, Kropp A, Greening C

EMDB-25898:
SARS-CoV-2 nsp12/7/8 complex with a native N-terminus nsp9
手法: 単粒子 / : Osinski A, Tagliabracci VS

EMDB-23608:
DpK2 bacteriophage tail spike depolymerase
手法: 単粒子 / : Belousoff MJ, Bamert RS

PDB-7lzj:
DpK2 bacteriophage tail spike depolymerase
手法: 単粒子 / : Belousoff MJ, Bamert RS, Dunstan RA, Lithgow T

EMDB-23862:
Cryo-EM structure of SidJ-SdeA-CaM reaction intermediate complex
手法: 単粒子 / : Osinski A, Black MH

EMDB-23863:
Cryo-EM structure of SidJ-SdeC-CaM reaction intermediate complex
手法: 単粒子 / : Osinski A, Black MH

PDB-7mir:
Cryo-EM structure of SidJ-SdeA-CaM reaction intermediate complex
手法: 単粒子 / : Osinski A, Black MH, Pawlowski K, Chen Z, Li Y, Tagliabracci VS

ページ:

+
EMN検索について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

+
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

-
EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

他の情報も見る