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検索結果

検索 (著者・登録者: fujita & r)の結果128件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-62399:
CryoEM structure of Pleurocybella porrigens lectin (PPL) in complex with GalNAc
手法: 単粒子 / : Ishimoto N, Adachi D, Kawabata H, Park SY, Tame JRH, Kamata K

PDB-9kl3:
CryoEM structure of Pleurocybella porrigens lectin (PPL) in complex with GalNAc
手法: 単粒子 / : Ishimoto N, Adachi D, Kawabata H, Park SY, Tame JRH, Kamata K

EMDB-63603:
Cryo-EM structure of Rc-o319 RBD/R. cornutus ACE2 complex
手法: 単粒子 / : Matsumoto K, Shihoya W, Nureki O

EMDB-65045:
Cryo-EM Structure of Rc-o319 Ectodomain trimer
手法: 単粒子 / : Matsumoto K, Shihoya W, Nureki O

PDB-9m3f:
Cryo-EM structure of Rc-o319 RBD/R. cornutus ACE2 complex
手法: 単粒子 / : Matsumoto K, Shihoya W, Nureki O

PDB-9vg7:
Cryo-EM Structure of Rc-o319 Ectodomain trimer
手法: 単粒子 / : Matsumoto K, Shihoya W, Nureki O

EMDB-60854:
Cryo-EM structure of urease from Ureaplasma parvum
手法: 単粒子 / : Fujita J, Namba K, Wu HN, Yanagihara I

PDB-9it2:
Cryo-EM structure of urease from Ureaplasma parvum
手法: 単粒子 / : Fujita J, Namba K, Wu HN, Yanagihara I

EMDB-63050:
Cryo-EM structure of linker-extended biparatopic antibody BA1-GP4 in complex with TNFR2
手法: 単粒子 / : Otsuki T, Matsumoto S, Fujita J, Miyata T, Namba K, Kanada R, Okuno Y, Kamada H, Ohno H, Akiba H

PDB-9lfl:
Cryo-EM structure of linker-extended biparatopic antibody BA1-GP4 in complex with TNFR2
手法: 単粒子 / : Otsuki T, Matsumoto S, Fujita J, Miyata T, Namba K, Kanada R, Okuno Y, Kamada H, Ohno H, Akiba H

EMDB-64005:
Iota toxin Ib pore serine-clamp mutant(C1)
手法: 単粒子 / : Ninomiya Y, Yoshida T, Yamada T, Kishikawa J, Tsuge H

EMDB-60837:
Cryo-EM structure of KpFtsZ-ZapA complex
手法: らせん対称 / : Fujita J, Hibino K, Kagoshima G, Kamimura N, Kato Y, Uehara R, Namba K, Uchihashi T, Matsumura H

PDB-9isk:
Cryo-EM structure of KpFtsZ-ZapA complex
手法: らせん対称 / : Fujita J, Hibino K, Kagoshima G, Kamimura N, Kato Y, Uehara R, Namba K, Uchihashi T, Matsumura H

EMDB-39544:
Iota toxin Ib pore serine-clamp mutant
手法: 単粒子 / : Ninomiya Y, Yoshida T, Yamada T, Kishikawa J, Tsuge H

PDB-8yrm:
Iota toxin Ib pore serine-clamp mutant
手法: 単粒子 / : Ninomiya Y, Yoshida T, Yamada T, Kishikawa J, Tsuge H

EMDB-60718:
Cryo-EM structure of G1-ATPase dimer from Mycoplasma mobile gliding machinery
手法: 単粒子 / : Toyonaga T, Kato T, Kawamoto A, Miyata T, Kawakami K, Fujita J, Hamaguchi T, Namba K, Miyata M

PDB-9io5:
Cryo-EM structure of G1-ATPase dimer from Mycoplasma mobile gliding machinery
手法: 単粒子 / : Toyonaga T, Kato T, Kawamoto A, Miyata T, Kawakami K, Fujita J, Hamaguchi T, Namba K, Miyata M

EMDB-39081:
Structure of the Ebola virus nucleocapsid subunit
手法: 単粒子 / : Fujita-Fujiharu Y, Hu S, Hirabayashi A, Takamatsu Y, Ng Y, Houri K, Muramoto Y, Nakano M, Sugita Y, Noda T

PDB-8y9j:
Structure of the Ebola virus nucleocapsid subunit
手法: 単粒子 / : Fujita-Fujiharu Y, Hu S, Hirabayashi A, Takamatsu Y, Ng Y, Houri K, Muramoto Y, Nakano M, Sugita Y, Noda T

EMDB-39119:
Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence
手法: 単粒子 / : Kimura T, Hirai S, Kujirai T, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-39120:
Cryo-EM structure of the human nucleosome containing the H3.1 E97K mutant
手法: 単粒子 / : Kimura T, Hirai S, Kujirai T, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8ybj:
Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence
手法: 単粒子 / : Kimura T, Hirai S, Kujirai T, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

PDB-8ybk:
Cryo-EM structure of the human nucleosome containing the H3.1 E97K mutant
手法: 単粒子 / : Kimura T, Hirai S, Kujirai T, Ogasawara M, Takizawa Y, Kurumizaka H

EMDB-36251:
RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

EMDB-36252:
RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

EMDB-36253:
RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

EMDB-37848:
RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(0) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

PDB-8jh2:
RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

PDB-8jh3:
RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

PDB-8jh4:
RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome
手法: 単粒子 / : Akatsu M, Fujita R, Ogasawara M, Ehara H, Kujirai T, Takizawa Y, Sekine S, Kurumizaka H

EMDB-33785:
Cryo-EM structure of the histamine-bound histamine H4 receptor and Gq complex
手法: 単粒子 / : Im D, Iwata S, Asada H

EMDB-33786:
Cryo-EM structure of the imetit-bound histamine H4 receptor and Gq complex
手法: 単粒子 / : Im D, Iwata S, Asada H

PDB-7yfc:
Cryo-EM structure of the histamine-bound histamine H4 receptor and Gq complex
手法: 単粒子 / : Im D, Iwata S, Asada H

PDB-7yfd:
Cryo-EM structure of the imetit-bound histamine H4 receptor and Gq complex
手法: 単粒子 / : Im D, Iwata S, Asada H

EMDB-34871:
Cryo-EM structure of biparatopic antibody Bp109-92 in complex with TNFR2
手法: 単粒子 / : Akiba H, Fujita J, Ise T, Nishiyama K, Miyata T, Kato T, Namba K, Ohno H, Kamada H, Nagata S, Tsumoto K

PDB-8hlb:
Cryo-EM structure of biparatopic antibody Bp109-92 in complex with TNFR2
手法: 単粒子 / : Akiba H, Fujita J, Ise T, Nishiyama K, Miyata T, Kato T, Namba K, Ohno H, Kamada H, Nagata S, Tsumoto K

EMDB-36048:
Cryo-EM structure of hZnT7-Fab complex in zinc-unbound state, determined in outward-facing conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

EMDB-36049:
Cryo-EM structure of hZnT7-Fab complex in zinc-bound state, determined in outward-facing conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

EMDB-36050:
Cryo-EM structure of hZnT7-Fab complex in zinc-unbound state, determined in heterogeneous conformations- one subunit in an inward-facing and the other in an outward-facing conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

EMDB-36051:
Cryo-EM structure of hZnT7-Fab complex in zinc state 2, determined in heterogeneous conformations- one subunit in an inward-facing zinc-bound and the other in an outward-facing zinc-bound conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

EMDB-36052:
Cryo-EM structure of hZnT7DeltaHis-loop-Fab complex in zinc-unbound state, determined in outward-facing conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

EMDB-36053:
Cryo-EM structure of hZnT7DeltaHis-loop-Fab complex in zinc-bound state, determined in outward-facing conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

EMDB-36055:
Cryo-EM structure of hZnT7-Fab complex in zinc state 1, determined in heterogeneous conformations- one subunit in an inward-facing zinc-bound and the other in an outward-facing zinc-unbound conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

PDB-8j7t:
Cryo-EM structure of hZnT7-Fab complex in zinc-unbound state, determined in outward-facing conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

PDB-8j7u:
Cryo-EM structure of hZnT7-Fab complex in zinc-bound state, determined in outward-facing conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

PDB-8j7v:
Cryo-EM structure of hZnT7-Fab complex in zinc-unbound state, determined in heterogeneous conformations- one subunit in an inward-facing and the other in an outward-facing conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

PDB-8j7w:
Cryo-EM structure of hZnT7-Fab complex in zinc state 2, determined in heterogeneous conformations- one subunit in an inward-facing zinc-bound and the other in an outward-facing zinc-bound conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

PDB-8j7x:
Cryo-EM structure of hZnT7DeltaHis-loop-Fab complex in zinc-unbound state, determined in outward-facing conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

PDB-8j7y:
Cryo-EM structure of hZnT7DeltaHis-loop-Fab complex in zinc-bound state, determined in outward-facing conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

PDB-8j80:
Cryo-EM structure of hZnT7-Fab complex in zinc state 1, determined in heterogeneous conformations- one subunit in an inward-facing zinc-bound and the other in an outward-facing zinc-unbound conformation
手法: 単粒子 / : Han BB, Inaba K, Watanabe S

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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