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6NOG	Poised-state Dot1L bound to the H2B-Ubiquitinated nucleosome 分子名称: 601 DNA Strand 1, 601 DNA Strand 2, Histone H2A type 1, ... 著者 Worden, E.J, Hoffmann, N.A, Wolberger, C. 登録日 2019-01-16 公開日 2019-02-20 最終更新日 2024-03-20 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.9 Å) 主引用文献 Mechanism of Cross-talk between H2B Ubiquitination and H3 Methylation by Dot1L. Cell, 176, 2019
6NN6	Structure of Dot1L-H2BK120ub nucleosome complex 分子名称: DNA (145-MER), Histone H2A type 1, Histone H2B 1.1, ... 著者 Anderson, C.J, Baird, M.R, Hsu, A, Barbour, E.H, Koyama, Y, Borgnia, M.J, McGinty, R.K. 登録日 2019-01-14 公開日 2019-02-13 最終更新日 2024-03-20 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.9 Å) 主引用文献 Structural Basis for Recognition of Ubiquitylated Nucleosome by Dot1L Methyltransferase. Cell Rep, 26, 2019
6J62	Crystal structure of mISG15/NS1B complex 分子名称: Non-structural protein 1, Ubiquitin-like protein ISG15 著者 Jiang, Y.N, Wang, X.Q. 登録日 2019-01-12 公開日 2019-12-25 最終更新日 2024-03-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.486 Å) 主引用文献 Crystal structure of mISG15/NS1B complex To Be Published
6QF8	Solution NMR ensemble for human ubiquitin at 298K compiled using the CoMAND method 分子名称: Polyubiquitin-B 著者 ElGamacy, M, Truffault, V, Zhu, H, Coles, M. 登録日 2019-01-09 公開日 2019-04-10 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Mapping Local Conformational Landscapes of Proteins in Solution. Structure, 27, 2019
6NJD	Crystal structure of RavD (residues 1-200) from Legionella pneumophila (strain Corby) complexed with Met-1 linked di-ubiquitin 分子名称: Di-ubiquitin, MAGNESIUM ION, RavD 著者 Wang, X, Zhou, Y, Zhu, Y. 登録日 2019-01-03 公開日 2019-05-22 最終更新日 2020-01-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.05 Å) 主引用文献 A bacterial effector deubiquitinase specifically hydrolyses linear ubiquitin chains to inhibit host inflammatory signalling. Nat Microbiol, 4, 2019
6NJG	Ubiquitin Variant in Complex with Ubiquitin Interacting Motif 分子名称: Polyubiquitin-B, Vacuolar protein sorting-associated protein 27 著者 Manczyk, N, Sicheri, F. 登録日 2019-01-03 公開日 2019-03-06 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.35 Å) 主引用文献 Dimerization of a ubiquitin variant leads to high affinity interactions with a ubiquitin interacting motif. Protein Sci., 28, 2019
6NJ9	Active state Dot1L bound to the H2B-Ubiquitinated nucleosome, 2-to-1 complex 分子名称: 601 DNA Strand 1, 601 DNA Strand 2, Histone H2A type 1, ... 著者 Worden, E.J, Hoffmann, N.A, Wolberger, C. 登録日 2019-01-02 公開日 2019-02-20 最終更新日 2021-06-16 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (2.96 Å) 主引用文献 Mechanism of Cross-talk between H2B Ubiquitination and H3 Methylation by Dot1L. Cell, 176, 2019
6N8O	Cryo-EM structure of Rpl10-inserted (RI) pre-60S ribosomal subunit 分子名称: 5.8S rRNA, 5S rRNA, 60S ribosomal export protein NMD3, ... 著者 Zhou, Y, Musalgaonkar, S, Johnson, A.W, Taylor, D.W. 登録日 2018-11-29 公開日 2019-03-13 最終更新日 2020-01-08 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.5 Å) 主引用文献 Tightly-orchestrated rearrangements govern catalytic center assembly of the ribosome. Nat Commun, 10, 2019
6N8N	Cryo-EM structure of Lsg1-engaged (LE) pre-60S ribosomal subunit 分子名称: 5.8S rRNA, 5S rRNA, 60S ribosomal export protein NMD3, ... 著者 Zhou, Y, Musalgaonkar, S, Johnson, A.W, Taylor, D.W. 登録日 2018-11-29 公開日 2019-03-13 最終更新日 2020-01-08 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.8 Å) 主引用文献 Tightly-orchestrated rearrangements govern catalytic center assembly of the ribosome. Nat Commun, 10, 2019
6N8M	Cryo-EM structure of pre-Lsg1 (PL) pre-60S ribosomal subunit 分子名称: 5.8S RNA, 5S rRNA, 60S ribosomal export protein NMD3, ... 著者 Zhou, Y, Musalgaonkar, S, Johnson, A.W, Taylor, D.W. 登録日 2018-11-29 公開日 2019-03-13 最終更新日 2020-01-08 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.5 Å) 主引用文献 Tightly-orchestrated rearrangements govern catalytic center assembly of the ribosome. Nat Commun, 10, 2019
6N6R	Crystal structure of ABIN-1 UBAN in complex with two M1-linked di-ubiquitins 分子名称: TNFAIP3-interacting protein 1, Ubiquitin 著者 Rahighi, S, Dikic, I, Wakatsuki, S. 登録日 2018-11-27 公開日 2019-07-17 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.95 Å) 主引用文献 Molecular Recognition of M1-Linked Ubiquitin Chains by Native and Phosphorylated UBAN Domains. J.Mol.Biol., 431, 2019
6N5M	Crystal structure of ABIN-1 UBAN in complex with one M1-linked di-ubiquitin 分子名称: Polyubiquitin-C, TNFAIP3-interacting protein 1 著者 Rahighi, S, Dikic, I, Wakatsuki, S. 登録日 2018-11-22 公開日 2019-07-17 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.01 Å) 主引用文献 Molecular Recognition of M1-Linked Ubiquitin Chains by Native and Phosphorylated UBAN Domains. J.Mol.Biol., 431, 2019
6ISU	Crystal structure of Lys27-linked di-ubiquitin in complex with its selective interacting protein UCHL3 分子名称: Ubiquitin, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3 著者 Ding, S, Pan, M, Zheng, Q, Ren, Y, Hong, D. 登録日 2018-11-19 公開日 2019-02-06 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.866 Å) 主引用文献 Chemical Protein Synthesis Enabled Mechanistic Studies on the Molecular Recognition of K27-linked Ubiquitin Chains. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 58, 2019
6I7Q	Structure of pVHL-elongin B-elongin C (VCB) in complex with hydroxylated-HIF-2alpha (523-542) in the C2221 form 分子名称: Elongin-B, Elongin-C, Endothelial PAS domain-containing protein 1, ... 著者 Chowdhury, R, Aguilera, L.S, Schofield, C.J. 登録日 2018-11-17 公開日 2019-11-27 最終更新日 2024-01-24 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.798 Å) 主引用文献 HIF-2alpha-pVHL-elongin B-elongin C complex To Be Published
6I7R	Structure of pVHL-elongin B-elongin C (VCB) in complex with hydroxylated-HIF-2alpha (523-542) in the P43212 form 分子名称: Elongin-B, Elongin-C, Endothelial PAS domain-containing protein 1, ... 著者 Chowdhury, R, Aguilera, L.S, Schofield, C.J. 登録日 2018-11-17 公開日 2019-11-27 最終更新日 2024-01-24 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.949 Å) 主引用文献 HIF-2alpha-pVHL-elongin B-elongin C complex To Be Published
6I5N	Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 分子名称: COBALT (II) ION, Elongin-B, Elongin-C, ... 著者 Kung, W.W, Ramachandran, S, Makukhin, N, Bruno, E, Ciulli, A. 登録日 2018-11-14 公開日 2019-05-29 最終更新日 2019-06-19 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.98 Å) 主引用文献 Structural insights into substrate recognition by the SOCS2 E3 ubiquitin ligase. Nat Commun, 10, 2019
6I5J	Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 分子名称: COBALT (II) ION, Elongin-B, Elongin-C, ... 著者 Kung, W.W, Ramachandran, S, Makukhin, N, Bruno, E, Ciulli, A. 登録日 2018-11-13 公開日 2019-05-29 最終更新日 2019-11-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Structural insights into substrate recognition by the SOCS2 E3 ubiquitin ligase. Nat Commun, 10, 2019
6I4X	Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with erythropoietin receptor peptide 分子名称: DI(HYDROXYETHYL)ETHER, Elongin-B, Elongin-C, ... 著者 Kung, W.W, Ramachandran, S, Makukhin, N, Bruno, E, Ciulli, A. 登録日 2018-11-12 公開日 2019-05-29 最終更新日 2019-06-19 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.69 Å) 主引用文献 Structural insights into substrate recognition by the SOCS2 E3 ubiquitin ligase. Nat Commun, 10, 2019
6N13	UbcH7-Ub Complex with R0RBR Parkin and phosphoubiquitin 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase parkin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, ZINC ION, ... 著者 Condos, T.E.C, Dunkerley, K.M, Freeman, E.A, Barber, K.R, Aguirre, J.D, Chaugule, V.K, Xiao, Y, Konermann, L, Walden, H, Shaw, G.S. 登録日 2018-11-08 公開日 2018-11-28 最終更新日 2020-01-08 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Synergistic recruitment of UbcH7~Ub and phosphorylated Ubl domain triggers parkin activation. EMBO J., 37, 2018
6IP6	Cryo-EM structure of the CMV-stalled human 80S ribosome with HCV IRES (Structure iii) 分子名称: 18S ribosomal RNA, 28S ribosomal RNA, 40S ribosomal protein S10, ... 著者 Yokoyama, T, Shigematsu, H, Shirouzu, M, Imataka, H, Ito, T. 登録日 2018-11-02 公開日 2019-05-29 最終更新日 2019-11-06 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.5 Å) 主引用文献 HCV IRES Captures an Actively Translating 80S Ribosome. Mol.Cell, 74, 2019
6IP8	Cryo-EM structure of the HCV IRES dependently initiated CMV-stalled 80S ribosome (Structure iv) 分子名称: 18S ribosomal RNA, 28S ribosomal RNA, 40S ribosomal protein S10, ... 著者 Yokoyama, T, Shigematsu, H, Shirouzu, M, Imataka, H, Ito, T. 登録日 2018-11-02 公開日 2019-05-29 最終更新日 2019-11-06 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.9 Å) 主引用文献 HCV IRES Captures an Actively Translating 80S Ribosome. Mol.Cell, 74, 2019
6IP5	Cryo-EM structure of the CMV-stalled human 80S ribosome (Structure ii) 分子名称: 18S ribosomal RNA, 28S ribosomal RNA, 40S ribosomal protein S10, ... 著者 Yokoyama, T, Shigematsu, H, Shirouzu, M, Imataka, H, Ito, T. 登録日 2018-11-02 公開日 2019-05-29 最終更新日 2019-11-06 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.9 Å) 主引用文献 HCV IRES Captures an Actively Translating 80S Ribosome. Mol.Cell, 74, 2019
6MUN	Structure of hRpn10 bound to UBQLN2 UBL 分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, Ubiquilin-2 著者 Chen, X, Walters, K.J. 登録日 2018-10-23 公開日 2019-09-04 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure of hRpn10 Bound to UBQLN2 UBL Illustrates Basis for Complementarity between Shuttle Factors and Substrates at the Proteasome. J.Mol.Biol., 431, 2019
6MTB	Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 分子名称: 18S rRNA, 28S rRNA, 40S ribosomal protein S10, ... 著者 Brown, A, Baird, M.R, Yip, M.C.J, Murray, J, Shao, S. 登録日 2018-10-19 公開日 2018-11-21 最終更新日 2019-05-15 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.6 Å) 主引用文献 Structures of translationally inactive mammalian ribosomes. Elife, 7, 2018
6MTD	Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 分子名称: 18S rRNA, 28S rRNA, 5.8S rRNA, ... 著者 Brown, A, Baird, M.R, Yip, M.C.J, Murray, J, Shao, S. 登録日 2018-10-19 公開日 2018-11-21 最終更新日 2019-05-15 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.3 Å) 主引用文献 Structures of translationally inactive mammalian ribosomes. Elife, 7, 2018

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