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2DXS	Crystal structure of HCV NS5B RNA polymerase complexed with a tetracyclic inhibitor 分子名称: Genome polyprotein, N-[(13-CYCLOHEXYL-6,7-DIHYDROINDOLO[1,2-D][1,4]BENZOXAZEPIN-10-YL)CARBONYL]-2-METHYL-L-ALANINE 著者 Adachi, T, Tsuruha, J, Doi, S, Murase, K, Ikegashira, K, Watanabe, S, Uehara, K, Orita, T, Nomura, A, Kamada, M. 登録日 2006-08-30 公開日 2006-12-26 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Discovery of Conformationally Constrained Tetracyclic Compounds as Potent Hepatitis C Virus NS5B RNA Polymerase Inhibitors J.Med.Chem., 49, 2006
2IJD	Crystal Structure of the Poliovirus Precursor Protein 3CD 分子名称: Picornain 3C, RNA-directed RNA polymerase, SULFATE ION, ... 著者 Marcotte, L.L, Gohara, D.W, Filman, D.J, Hogle, J.M. 登録日 2006-09-29 公開日 2007-02-13 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.4 Å) 主引用文献 Crystal structure of poliovirus 3CD: virally-encoded protease and precursor to the RNA-dependent RNA polymerase. J.Virol., 81, 2007
2IJF	Crystal Structure of the Poliovirus RNA-Dependent RNA Polymerase Fidelity Mutant 3Dpol G64S 分子名称: RNA-directed RNA polymerase 著者 Marcotte, L.L, Gohara, D.G, Filman, D.J, Hogle, J.M. 登録日 2006-09-29 公開日 2007-02-13 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 Crystal structure of poliovirus 3CD: virally-encoded protease and precursor to the RNA-dependent RNA polymerase. J.Virol., 81, 2007
2IJN	Isothiazoles as active-site inhibitors of HCV NS5B polymerase 分子名称: (2R,3R)-3-{[3,5-BIS(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]AMINO}-2-CYANO-3-THIOXOPROPANAMIDE, RNA polymerase NS5B 著者 Yan, S, Yao, N. 登録日 2006-09-29 公開日 2006-11-28 最終更新日 2011-07-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Isothiazoles as active-site inhibitors of HCV NS5B polymerase Bioorg.Med.Chem.Lett., 17, 2007
2IM1	Crystal structure of poliovirus polymerase complexed with CTP and Mn2+ 分子名称: ACETIC ACID, CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE, MANGANESE (II) ION, ... 著者 Thompson, A.A, Peersen, O.B. 登録日 2006-10-03 公開日 2006-12-12 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Stabilization of Poliovirus Polymerase by NTP Binding and Fingers-Thumb Interactions. J.Mol.Biol., 366, 2007
2IM3	Crystal structure of poliovirus polymerase complexed with UTP and Mn2+ 分子名称: ACETIC ACID, MANGANESE (II) ION, SODIUM ION, ... 著者 Thompson, A.A, Peersen, O.B. 登録日 2006-10-03 公開日 2006-12-12 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Stabilization of Poliovirus Polymerase by NTP Binding and Fingers-Thumb Interactions. J.Mol.Biol., 366, 2007
2IM2	Crystal structure of poliovirus polymerase complexed with UTP and Mg2+ 分子名称: ACETIC ACID, SODIUM ION, URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE, ... 著者 Thompson, A.A, Peersen, O.B. 登録日 2006-10-03 公開日 2006-12-12 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.35 Å) 主引用文献 Stabilization of Poliovirus Polymerase by NTP Binding and Fingers-Thumb Interactions. J.Mol.Biol., 366, 2007
2ILZ	Crystal structure of poliovirus polymerase complexed with GTP and Mn2+ 分子名称: ACETIC ACID, GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, MANGANESE (II) ION, ... 著者 Thompson, A.A, Peersen, O.B. 登録日 2006-10-03 公開日 2006-12-12 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Stabilization of Poliovirus Polymerase by NTP Binding and Fingers-Thumb Interactions. J.Mol.Biol., 366, 2007
2IM0	Crystal structure of poliovirus polymerase complexed with CTP and Mg2+ 分子名称: ACETIC ACID, CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE, SODIUM ION, ... 著者 Thompson, A.A, Peersen, O.B. 登録日 2006-10-03 公開日 2006-12-12 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.25 Å) 主引用文献 Stabilization of Poliovirus Polymerase by NTP Binding and Fingers-Thumb Interactions. J.Mol.Biol., 366, 2007
2ILY	Crystal structure of poliovirus polymerase complexed with ATP and Mg2+ 分子名称: ACETIC ACID, ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, Poliovirus polymerase, ... 著者 Thompson, A.A, Peersen, O.B. 登録日 2006-10-03 公開日 2006-12-12 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Stabilization of Poliovirus Polymerase by NTP Binding and Fingers-Thumb Interactions. J.Mol.Biol., 366, 2007
2J7N	Structure of the RNAi polymerase from Neurospora crassa 分子名称: GLYCEROL, MAGNESIUM ION, RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE 著者 Salgado, P.S, Koivunen, M.R.L, Makeyev, E.V, Bamford, D.H, Stuart, D.I, Grimes, J.M. 登録日 2006-10-13 公開日 2006-12-13 最終更新日 2024-05-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 The Structure of an Rnai Polymerase Links RNA Silencing and Transcription. Plos Biol., 4, 2006
2J7O	STRUCTURE OF THE RNAI POLYMERASE FROM NEUROSPORA CRASSA 分子名称: MAGNESIUM ION, RNA DEPENDENT RNA POLYMERASE 著者 Salgado, P.S, Koivunen, M.R.L, Makeyev, E.V, Bamford, D.H, Stuart, D.I, Grimes, J.M. 登録日 2006-10-13 公開日 2006-12-13 最終更新日 2024-05-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.5 Å) 主引用文献 The Structure of an Rnai Polymerase Links RNA Silencing and Transcription. Plos Biol., 4, 2006
2J7W	Dengue virus NS5 RNA dependent RNA polymerase domain complexed with 3' dGTP 分子名称: DI(HYDROXYETHYL)ETHER, GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, POLYPROTEIN, ... 著者 Yap, T.L, Xu, T, Chen, Y.L, Malet, H, Egloff, M.P, Canard, B, Vasudevan, S.G, Lescar, J. 登録日 2006-10-17 公開日 2007-03-13 最終更新日 2023-12-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Crystal Structure of the Dengue Virus RNA- Dependent RNA Polymerase Catalytic Domain at 1.85 Angstrom Resolution. J.Virol., 81, 2007
2J7U	Dengue virus NS5 RNA dependent RNA polymerase domain 分子名称: CHLORIDE ION, MAGNESIUM ION, RNA DEPENDENT RNA POLYMERASE, ... 著者 Yap, T.L, Xu, T, Chen, Y.L, Malet, H, Egloff, M.P, Canard, B, Vasudevan, S.G, Lescar, J. 登録日 2006-10-17 公開日 2007-03-13 最終更新日 2023-12-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Crystal Structure of the Dengue Virus RNA- Dependent RNA Polymerase Catalytic Domain at 1.85 Angstrom Resolution. J.Virol., 81, 2007
2NVQ	RNA Polymerase II Elongation Complex in 150 mM Mg+2 with 2'dUTP 分子名称: 28-MER DNA template strand, 5'-D(*CP*TP*GP*CP*TP*TP*AP*TP*CP*GP*GP*TP*AP*G)-3', 5'-R(*AP*UP*CP*GP*AP*GP*AP*GP*GP*A)-3', ... 著者 Wang, D, Bushnell, D.A, Westover, K.D, Kaplan, C.D, Kornberg, R.D. 登録日 2006-11-13 公開日 2006-12-12 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å) 主引用文献 Structural basis of transcription: role of the trigger loop in substrate specificity and catalysis Cell(Cambridge,Mass.), 127, 2006
2NVT	RNA Polymerase II Elongation Complex in 150 mM Mg+2 with GMPCPP 分子名称: 5'-D(*GP*TP*AP*CP*TP*TP*G)-3', 5'-D(P*CP*AP*AP*GP*TP*AP*CP*TP*TP*AP*CP*GP*CP*CP*TP*GP*GP*TP*CP*TP*T)-3', 5'-R(*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3', ... 著者 Wang, D, Bushnell, D.A, Westover, K.D, Kaplan, C.D, Kornberg, R.D. 登録日 2006-11-13 公開日 2006-12-12 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.36 Å) 主引用文献 Structural basis of transcription: role of the trigger loop in substrate specificity and catalysis Cell(Cambridge,Mass.), 127, 2006
2NVY	RNA Polymerase II form II in 150 mM Mn+2 分子名称: DNA-directed RNA polymerase II 13.6 kDa polypeptide, DNA-directed RNA polymerase II 140 kDa polypeptide, DNA-directed RNA polymerase II 45 kDa polypeptide, ... 著者 Wang, D, Bushnell, D.A, Westover, K.D, Kaplan, C.D, Kornberg, R.D. 登録日 2006-11-13 公開日 2006-12-26 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.4 Å) 主引用文献 Structural basis of transcription: role of the trigger loop in substrate specificity and catalysis Cell(Cambridge,Mass.), 127, 2006
2NVX	RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with 2'-dUTP 分子名称: 28-MER DNA template strand, 5'-D(*CP*TP*GP*CP*TP*TP*AP*TP*CP*GP*GP*TP*AP*G)-3', 5'-R(*AP*UP*CP*GP*AP*GP*AP*GP*GP*A)-3', ... 著者 Wang, D, Bushnell, D.A, Westover, K.D, Kaplan, C.D, Kornberg, R.D. 登録日 2006-11-13 公開日 2006-12-19 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.6 Å) 主引用文献 Structural basis of transcription: role of the trigger loop in substrate specificity and catalysis Cell(Cambridge,Mass.), 127, 2006
2NVZ	RNA Polymerase II elongation complex with UTP, updated 11/2006 分子名称: 28-MER DNA template strand, 5'-D(*CP*TP*GP*CP*TP*TP*AP*TP*CP*GP*GP*TP*AP*G)-3', 5'-R(*AP*UP*CP*GP*AP*GP*AP*GP*GP*A)-3', ... 著者 Wang, D, Bushnell, D.A, Westover, K.D, Kaplan, C.D, Kornberg, R.D. 登録日 2006-11-14 公開日 2006-12-19 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (4.3 Å) 主引用文献 Structural basis of transcription: role of the trigger loop in substrate specificity and catalysis Cell(Cambridge,Mass.), 127, 2006
2E2J	RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with GMPCPP 分子名称: 27-MER DNA template strand, 5'-D(P*CP*TP*GP*CP*TP*TP*AP*TP*CP*GP*GP*TP*A)-3', 5'-R(P*AP*UP*CP*GP*AP*GP*AP*GP*G)-3', ... 著者 Wang, D, Bushnell, D.A, Westover, K.D, Kaplan, C.D, Kornberg, R.D. 登録日 2006-11-14 公開日 2006-12-12 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.5 Å) 主引用文献 Structural basis of transcription: role of the trigger loop in substrate specificity and catalysis Cell(Cambridge,Mass.), 127, 2006
2E2H	RNA polymerase II elongation complex at 5 mM Mg2+ with GTP 分子名称: 28-MER DNA template strand, 5'-D(*CP*TP*GP*CP*TP*TP*AP*TP*CP*GP*GP*TP*AP*G)-3', 5'-R(*AP*UP*CP*GP*AP*GP*AP*GP*GP*A)-3', ... 著者 Wang, D, Bushnell, D.A, Westover, K.D, Kaplan, C.D, Kornberg, R.D. 登録日 2006-11-14 公開日 2006-12-12 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.95 Å) 主引用文献 Structural basis of transcription: role of the trigger loop in substrate specificity and catalysis Cell(Cambridge,Mass.), 127, 2006
2E2I	RNA polymerase II elongation complex in 5 mM Mg+2 with 2'-dGTP 分子名称: 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, 28-MER DNA template strand, 5'-D(*CP*TP*GP*CP*TP*TP*AP*TP*CP*GP*GP*TP*AP*G)-3', ... 著者 Wang, D, Bushnell, D.A, Westover, K.D, Kaplan, C.D, Kornberg, R.D. 登録日 2006-11-14 公開日 2006-12-19 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.41 Å) 主引用文献 Structural basis of transcription: role of the trigger loop in substrate specificity and catalysis Cell(Cambridge,Mass.), 127, 2006
2JA5	CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex A 分子名称: 5'-D(*AP*GP*CP*TP*CP*AP*AP*GP*TP*AP *CP*TP*TTP*TP*TP*CP*CP*BRUP*GP*GP*TP*CP*AP*TP*T)-3', 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*AP)-3', DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, ... 著者 Brueckner, F, Hennecke, U, Carell, T, Cramer, P. 登録日 2006-11-23 公開日 2007-02-20 最終更新日 2023-12-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.8 Å) 主引用文献 Cpd Damage Recognition by Transcribing RNA Polymerase II Science, 315, 2007
2JA8	CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex D 分子名称: 5'-D(*AP*GP*CP*TP*CP*AP*AP*GP*TP*AP *CP*TP*TP*TP*TP*TTP*CP*BRUP*GP*GP*TP*CP*AP*TP*T)-3', 5'-D(*TP*AP*AP*GP*TP*AP*CP*TP*TP*GP *AP*GP*CP*T)-3', 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*AP*UP)-3', ... 著者 Brueckner, F, Hennecke, U, Carell, T, Cramer, P. 登録日 2006-11-23 公開日 2007-02-20 最終更新日 2023-12-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.8 Å) 主引用文献 Cpd Damage Recognition by Transcribing RNA Polymerase II. Science, 315, 2007
2JA6	CPD lesion containing RNA Polymerase II elongation complex B 分子名称: 5'-D(*AP*GP*CP*TP*CP*AP*AP*GP*TP*AP *CP*TP*TP*TTP*TP*CP*CP*BRUP*GP*GP*TP*CP*AP*TP*T)-3', 5'-D(*TP*AP*AP*GP*TP*AP*CP*TP*TP*GP *AP*GP*CP*T)-3', 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*AP)-3', ... 著者 Brueckner, F, Hennecke, U, Carell, T, Cramer, P. 登録日 2006-11-23 公開日 2007-02-20 最終更新日 2023-12-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (4 Å) 主引用文献 CPD damage recognition by transcribing RNA polymerase II. Science, 315, 2007

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