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検索結果

検索 (著者・登録者: tsuda & k)の結果74件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-49656:
Rabbit RB142 polyclonal Fab in complex with HIV-1 1086C NFL Env trimer
手法: 単粒子 / : Lin RN, Torres JL, Ozorowski G, Ward AB

EMDB-61095:
Structure of photosynthetic LH1-RC complex from the purple bacterium Blastochloris tepida
手法: 単粒子 / : Kimura Y, Kanno R, Mori K, Matsuda Y, Seto R, Takenaka S, Mino H, Ohkubo T, Honda M, Sasaki YC, Kishikawa J, Mitsuoka K, Mio K, Hall M, Purba ER, Mochizuki T, Mizoguchi A, Humbel BM, Madigan MT, Wang-Otomo ZY, Tani K

PDB-9j2f:
Structure of photosynthetic LH1-RC complex from the purple bacterium Blastochloris tepida
手法: 単粒子 / : Kimura Y, Kanno R, Mori K, Matsuda Y, Seto R, Takenaka S, Mino H, Ohkubo T, Honda M, Sasaki YC, Kishikawa J, Mitsuoka K, Mio K, Hall M, Purba ER, Mochizuki T, Mizoguchi A, Humbel BM, Madigan MT, Wang-Otomo ZY, Tani K

EMDB-37751:
Cryo-EM structure of T. pseudonana PyShell helical tube
手法: らせん対称 / : Kawamoto A, Tohda R, Gerle C, Kurisu G

PDB-8wqp:
Cryo-EM structure of T. pseudonana PyShell helical tube
手法: らせん対称 / : Kawamoto A, Tohda R, Gerle C, Kurisu G

EMDB-18709:
Subtomogram average of the T. pseudonana PyShell
手法: サブトモグラム平均 / : Demulder M, Righetto RD, Wietrzynski W, Lamm L, Engel BD

EMDB-18710:
Tomogram of P. tricornutum pyrenoid
手法: トモグラフィー / : Demulder M, Righetto RD, Wietrzynski W, Lamm L, Engel BD

EMDB-18711:
Tomogram of T. pseudonana pyrenoid
手法: トモグラフィー / : Demulder M, Righetto RD, Wietrzynski W, Lamm L, Engel BD

EMDB-18712:
Tomogram of PyShell mutant (M1) T. pseudonana
手法: トモグラフィー / : Demulder M, Righetto RD, Wietrzynski W, Lamm L, Engel BD

EMDB-18713:
Tomogram of PyShell mutant (M2) T. pseudonana
手法: トモグラフィー / : Demulder M, Righetto RD, Wietrzynski W, Lamm L, Engel BD

EMDB-18841:
Tomogram of T. pseudonana pyrenoid used for subtomogram avergaing
手法: トモグラフィー / : Demulder M, Righetto RD, Wietrzynski W, Lamm L, Engel BD

EMDB-35972:
CryoEM Structure of 40-Residue Arctic (E22G) Beta-Amyloid Fibril Derived by Co-Analysis with Solid-State NMR | E22G Abeta40
手法: らせん対称 / : Tehrani MJ, Matsuda I, Yamagata A, Matsunaga T, Sato M, Toyooka K, Shirouzu M, Ishii Y, Kodama Y, McElheny D, Kobayashi N

PDB-8j47:
CryoEM Structure of 40-Residue Arctic (E22G) Beta-Amyloid Fibril Derived by Co-Analysis with Solid-State NMR | E22G Abeta40
手法: らせん対称 / : Tehrani MJ, Matsuda I, Yamagata A, Matsunaga T, Sato M, Toyooka K, Shirouzu M, Ishii Y, Kodama Y, McElheny D, Kobayashi N

EMDB-39482:
mouse proteasome 20S subunit in complex with compound 1
手法: 単粒子 / : Kashima A, Arai Y

EMDB-39565:
canine immunoproteasome 20S subunit in complex with compound 2
手法: 単粒子 / : Kashima A, Arai Y

EMDB-39600:
canine immunoproteasome 20S subunit in complex with compound 1
手法: 単粒子 / : Kashima A, Arai Y

EMDB-39612:
canine immunoproteasome 20S subunit in complex with compound 1
手法: 単粒子 / : Kashima A, Arai Y

PDB-8ypk:
mouse proteasome 20S subunit in complex with compound 1
手法: 単粒子 / : Kashima A, Arai Y

PDB-8ysx:
canine immunoproteasome 20S subunit in complex with compound 2
手法: 単粒子 / : Kashima A, Arai Y

PDB-8yvg:
canine immunoproteasome 20S subunit in complex with compound 1
手法: 単粒子 / : Kashima A, Arai Y

PDB-8yvp:
canine immunoproteasome 20S subunit in complex with compound 1
手法: 単粒子 / : Kashima A, Arai Y

EMDB-38453:
Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1-up state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

EMDB-38454:
Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike RBD in complex with ACE2
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

PDB-8xlm:
Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1-up state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

PDB-8xln:
Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike RBD in complex with ACE2
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

EMDB-37648:
SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (1-up state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

EMDB-37650:
SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (closed-2 state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

EMDB-37651:
SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (closed-1 state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

PDB-8wmd:
Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (closed-2 state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

PDB-8wmf:
Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (closed-1 state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

EMDB-35634:
Wheat 80S ribosome stalled on AUG-Stop boron dependently
手法: 単粒子 / : Yokoyama T, Tanaka M, Saito H, Nishimoto M, Tsuda K, Sotta N, Shigematsu H, Shirouzu M, Iwasaki S, Ito T, Fujiwara T

EMDB-35635:
Wheat 40S ribosome in complex with a tRNAi
手法: 単粒子 / : Yokoyama T, Tanaka M, Saito H, Nishimoto M, Tsuda K, Sotta N, Shigematsu H, Shirouzu M, Iwasaki S, Ito T, Fujiwara T

EMDB-35636:
Wheat 40S ribosome in complex with a tRNAi and eIF2
手法: 単粒子 / : Yokoyama T, Tanaka M, Saito H, Nishimoto M, Tsuda K, Sotta N, Shigematsu H, Shirouzu M, Iwasaki S, Ito T, Fujiwara T

EMDB-35637:
Wheat 80S ribosome stalled on AUG-Stop boron dependently with cycloheximide
手法: 単粒子 / : Yokoyama T, Tanaka M, Saito H, Nishimoto M, Tsuda K, Sotta N, Shigematsu H, Shirouzu M, Iwasaki S, Ito T, Fujiwara T

EMDB-35638:
Wheat 80S ribosome pausing on AUG-Stop with cycloheximide
手法: 単粒子 / : Yokoyama T, Tanaka M, Saito H, Nishimoto M, Tsuda K, Sotta N, Shigematsu H, Shirouzu M, Iwasaki S, Ito T, Fujiwara T

PDB-8ip8:
Wheat 80S ribosome stalled on AUG-Stop boron dependently
手法: 単粒子 / : Yokoyama T, Tanaka M, Saito H, Nishimoto M, Tsuda K, Sotta N, Shigematsu H, Shirouzu M, Iwasaki S, Ito T, Fujiwara T

PDB-8ip9:
Wheat 40S ribosome in complex with a tRNAi
手法: 単粒子 / : Yokoyama T, Tanaka M, Saito H, Nishimoto M, Tsuda K, Sotta N, Shigematsu H, Shirouzu M, Iwasaki S, Ito T, Fujiwara T

PDB-8ipa:
Wheat 80S ribosome stalled on AUG-Stop boron dependently with cycloheximide
手法: 単粒子 / : Yokoyama T, Tanaka M, Saito H, Nishimoto M, Tsuda K, Sotta N, Shigematsu H, Shirouzu M, Iwasaki S, Ito T, Fujiwara T

PDB-8ipb:
Wheat 80S ribosome pausing on AUG-Stop with cycloheximide
手法: 単粒子 / : Yokoyama T, Tanaka M, Saito H, Nishimoto M, Tsuda K, Sotta N, Shigematsu H, Shirouzu M, Iwasaki S, Ito T, Fujiwara T

EMDB-36724:
Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 1)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-36726:
Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 2)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-36727:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-36728:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-36729:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike RBD in complex with ACE2
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8jyk:
Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 1)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8jym:
Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 2)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8jyn:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8jyo:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8jyp:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike RBD in complex with ACE2
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-35622:
SARS-CoV-2 XBB.1 spike glycoprotein (closed-1 state)
手法: 単粒子 / : Anraku Y, Kita S, Yajima H, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

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