[日本語] English
- 3次元電子顕微鏡データ検索 -

-
検索条件


キーワード
データベース /
Q: EM Navigatorの情報源は?
データエントリ / 週前
Q: データの更新はいつですか?
著者・登録者
解析手法
表示モード
並び順
エントリ数 / 1ページ
登録情報
文献
試料
実験
解析
データの最大数全データの場合は0
ファイル形式
  • CSV形式 (コンマ区切り, Excelなどに)
  • TSV形式 (タブ区切り)
  • JSON形式

万見検索

-
検索結果

検索 (著者・登録者: shankar & s)の結果71件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-55720:
Cryo-EM reconstruction for n-Tr20U.
手法: 単粒子 / : Mehta R, Glatt S

EMDB-55721:
Cryo-EM structure of nTr20 tRNA
手法: 単粒子 / : Mehta R, Glatt S

EMDB-52860:
Ku70/80 bound to 147 bp nucleosome
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

EMDB-52861:
Ku70/80 bound to 153 bp nucleosome
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

EMDB-52879:
Ku70/80 with Ku70 linker and SAP domain bound to a 153 bp H2AX nucleosome
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

EMDB-52912:
Ku70/80 bound to a 153 bp H2AX nucleosome
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

EMDB-52958:
DNA-PK bound to a 153 bp H2AX nucleosome model 1
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

EMDB-53025:
DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome model 2
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin A

EMDB-53026:
Ku80 mediated DNA-PK dimer bound to 153 bp H2AX nucleosome
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

EMDB-53237:
DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome with ATPyS
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

PDB-9igw:
Ku70/80 bound to 147 bp nucleosome
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

PDB-9igx:
Ku70/80 bound to 153 bp nucleosome
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

PDB-9q80:
Ku70/80 with Ku70 linker and SAP domain bound to a 153 bp H2AX nucleosome
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

PDB-9q8x:
Ku70/80 bound to a 153 bp H2AX nucleosome
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

PDB-9q9f:
DNA-PK bound to a 153 bp H2AX nucleosome model 1
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

PDB-9qcr:
DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome model 2
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin A

PDB-9qcs:
Ku80 mediated DNA-PK dimer bound to 153 bp H2AX nucleosome
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

PDB-9qms:
DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome with ATPyS
手法: 単粒子 / : Hall C, Chaplin AK

EMDB-54112:
CryoEM structure of the microtubule-AKAP13 C1 domain complex
手法: 単粒子 / : Giono M, Choi SR, Filipcik P, Steinmetz MO

EMDB-51768:
Cryo-EM structure of taxol-microtubules in complex with the C1 domain of GEFH1
手法: 単粒子 / : Choi SR, Blum T, Steinmetz MO

PDB-9h1o:
Cryo-EM structure of taxol-microtubules in complex with the C1 domain of GEFH1
手法: 単粒子 / : Choi SR, Blum T, Steinmetz MO

EMDB-28663:
Herpes simplex virus 1 polymerase holoenzyme bound to DNA and foscarnet (pre-translocation state)
手法: 単粒子 / : Pan J, Abraham J, Coen DM, Shankar S, Yang P, Hogle J

EMDB-28664:
Herpes simplex virus 1 DNA polymerase holoenzyme bound to DNA template and primer, dNTP-free (editing mode)
手法: 単粒子 / : Pan J, Abraham J, Coen DM, Shankar S, Yang P, Hogle J

EMDB-42887:
Herpes simplex virus 1 polymerase holoenzyme bound to DNA in both open/closed conformations
手法: 単粒子 / : Pan J, Abraham J, Coen DM, Shankar S, Yang P, Hogle J

EMDB-42888:
Herpes simplex virus 1 polymerase holoenzyme bound to DNA and DTTP in closed conformation
手法: 単粒子 / : Pan J, Abraham J, Coen DM, Shankar S, Yang P, Hogle J

EMDB-42889:
Herpes simplex virus 1 polymerase holoenzyme bound to mismatched DNA in editing conformation
手法: 単粒子 / : Pan J, Abraham J, Coen DM, Shankar S, Yang P, Hogle J

EMDB-42890:
Herpes simplex virus 1 polymerase holoenzyme bound to DNA and acyclovir triphosphate in closed conformation
手法: 単粒子 / : Pan J, Abraham J, Coen DM, Shankar S, Yang P, Hogle J

EMDB-42891:
Herpes simplex virus 1 polymerase W781V mutant holoenzyme bound to DNA in editing conformation
手法: 単粒子 / : Pan J, Abraham J, Coen DM, Shankar S, Yang P, Hogle J

PDB-8exx:
Herpes simplex virus 1 polymerase holoenzyme bound to DNA and foscarnet (pre-translocation state)
手法: 単粒子 / : Pan J, Abraham J, Coen DM, Shankar S, Yang P, Hogle J

PDB-8v1q:
Herpes simplex virus 1 polymerase holoenzyme bound to DNA in both open/closed conformations
手法: 単粒子 / : Pan J, Abraham J, Coen DM, Shankar S, Yang P, Hogle J

PDB-8v1r:
Herpes simplex virus 1 polymerase holoenzyme bound to DNA and DTTP in closed conformation
手法: 単粒子 / : Pan J, Abraham J, Coen DM, Shankar S, Yang P, Hogle J

PDB-8v1s:
Herpes simplex virus 1 polymerase holoenzyme bound to mismatched DNA in editing conformation
手法: 単粒子 / : Pan J, Abraham J, Coen DM, Shankar S, Yang P, Hogle J

PDB-8v1t:
Herpes simplex virus 1 polymerase holoenzyme bound to DNA and acyclovir triphosphate in closed conformation
手法: 単粒子 / : Pan J, Abraham J, Coen DM, Shankar S, Yang P, Hogle J

EMDB-44765:
Human DNA polymerase theta helicase domain in complex with inhibitor AB25583, dimer form
手法: 単粒子 / : Ito F, Li Z, Chen XS

EMDB-44766:
Human DNA polymerase theta helicase domain in complex with inhibitor AB25583, tetramer form
手法: 単粒子 / : Ito F, Li Z, Chen XS

PDB-9bp9:
Human DNA polymerase theta helicase domain in complex with inhibitor AB25583, dimer form
手法: 単粒子 / : Ito F, Li Z, Chen XS

PDB-9bpa:
Human DNA polymerase theta helicase domain in complex with inhibitor AB25583, tetramer form
手法: 単粒子 / : Ito F, Li Z, Chen XS

EMDB-17948:
Cryo-EM map of Giardia intestinalis deoxyadenosine kinase
手法: 単粒子 / : Ranjbarian F, Rafie K, Shankar K, Krakovka S, Svaerd S, Carlson LA, Hofer A

EMDB-36854:
Cryo-EM structure of 30S ribosome with cleaved AP-mRNA bound complex I
手法: 単粒子 / : Afsar M, Shukla A, Ramachandran R

EMDB-36860:
Cryo-EM structure of 30S ribosome with cleaved AP-mRNA bound complex (Body 1)
手法: 単粒子 / : Ramachandran R, Afsar M, Shukla A

EMDB-36868:
Cryo-EM structure of 30S ribosome with cleaved AP-mRNA bound complex (Body 2)
手法: 単粒子 / : Ramachandran R, Afsar M, Shukla A

EMDB-36883:
Cryo-EM structure of 30S ribosome with cleaved AP-mRNA bound complex-II
手法: 単粒子 / : Ramachandran R, Afsar M, Shukla A

EMDB-36885:
Cryo-EM structure of 30S ribosome with cleaved AP-mRNA bound complex-II (Body 1)
手法: 単粒子 / : Ramachandran R, Afsar M, Shukla A

EMDB-36886:
Cryo-EM structure of 30S ribosome with cleaved AP-mRNA bound complex-II (Body 2)
手法: 単粒子 / : Ramachandran R, Afsar M, Shukla A

PDB-8k3o:
Cryo-EM structure of 30S ribosome with cleaved AP-mRNA bound complex I
手法: 単粒子 / : Afsar M, Shukla A, Ramachandran R

PDB-8k4e:
Cryo-EM structure of 30S ribosome with cleaved AP-mRNA bound complex-II
手法: 単粒子 / : Ramachandran R, Afsar M, Shukla A

EMDB-18615:
Cryo-electron tomogram of small unilamellar vesicles decorated with poliovirus protein 2C
手法: トモグラフィー / : Shankar K, Dahmane S, Carlson LA

EMDB-28198:
Cryo-EM map of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike in complex with LLNL-199
手法: 単粒子 / : Binshtein E, Crowe JE

EMDB-28199:
Cryo-EM map of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike in complex with 2130-1-0114-112
手法: 単粒子 / : Binshtein E, Crowe JE

PDB-8ekd:
Cryo-EM map of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 spike in complex with 2130-1-0114-112
手法: 単粒子 / : Binshtein E, Crowe JE

ページ:

+
EMN検索について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

+
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

-
EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は? / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

他の情報も見る