[日本語] English
- 3次元電子顕微鏡データ検索 -

-
検索条件


キーワード
データベース /
Q: EM Navigatorの情報源は？
データエントリ / 週前
Q: データの更新はいつですか？
著者・登録者
解析手法
表示モード
並び順
エントリ数 / 1ページ
登録情報
文献
試料
実験
解析
データの最大数全データの場合は0
ファイル形式
  • CSV形式 (コンマ区切り, Excelなどに)
  • TSV形式 (タブ区切り)
  • JSON形式

万見検索

-
検索結果

検索 (著者・登録者: puglisi & j)の結果53件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-42457:
Methanosarcine mazei tRNAPyl in A-site of ribosome
手法: 単粒子 / : Krahn N, Zhang J, Melnikov SV, Tharp JM, Villa A, Patel A, Howard RJ, Gabir H, Patel TR, Stetefeld J, Puglisi J, Soll D

PDB-8upy:
Methanosarcine mazei tRNAPyl in A-site of ribosome
手法: 単粒子 / : Krahn N, Zhang J, Melnikov SV, Tharp JM, Villa A, Patel A, Howard RJ, Gabir H, Patel TR, Stetefeld J, Puglisi J, Soll D

EMDB-17329:
48S late-stage initiation complex with m6A mRNA
手法: 単粒子 / : Guca E, Lima LHF, Boissier F, Hashem Y

EMDB-17330:
48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA
手法: 単粒子 / : Guca E, Lima LHF, Boissier F, Hashem Y

PDB-8p03:
48S late-stage initiation complex with m6A mRNA
手法: 単粒子 / : Guca E, Lima LHF, Boissier F, Hashem Y

PDB-8p09:
48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA
手法: 単粒子 / : Guca E, Lima LHF, Boissier F, Hashem Y

EMDB-42455:
Candidatus Methanomethylophilus alvus tRNAPyl in A-site of ribosome
手法: 単粒子 / : Krahn N, Zhang J, Melnikov SV, Tharp JM, Villa A, Patel A, Howard RJ, Gabir H, Patel TR, Stetefeld J, Puglisi J, Soll D

PDB-8upt:
Candidatus Methanomethylophilus alvus tRNAPyl in A-site of ribosome
手法: 単粒子 / : Krahn N, Zhang J, Melnikov SV, Tharp JM, Villa A, Patel A, Howard RJ, Gabir H, Patel TR, Stetefeld J, Puglisi J, Soll D

EMDB-17804:
Bat-Hp-CoV Nsp1 and eIF1 bound to the human 40S small ribosomal subunit
手法: 単粒子 / : Schubert K, Karousis ED, Ban I, Lapointe CP, Leibundgut M, Baeumlin E, Kummerant E, Scaiola A, Schoenhut T, Ziegelmueller J, Puglisi JD, Muehlemann O, Ban N

EMDB-17805:
MERS-CoV Nsp1 bound to the human 43S pre-initiation complex
手法: 単粒子 / : Schubert K, Karousis ED, Ban I, Lapointe CP, Leibundgut M, Baeumlin E, Kummerant E, Scaiola A, Schoenhut T, Ziegelmueller J, Puglisi JD, Muehlemann O, Ban N

PDB-8ppk:
Bat-Hp-CoV Nsp1 and eIF1 bound to the human 40S small ribosomal subunit
手法: 単粒子 / : Schubert K, Karousis ED, Ban I, Lapointe CP, Leibundgut M, Baeumlin E, Kummerant E, Scaiola A, Schoenhut T, Ziegelmueller J, Puglisi JD, Muehlemann O, Ban N

PDB-8ppl:
MERS-CoV Nsp1 bound to the human 43S pre-initiation complex
手法: 単粒子 / : Schubert K, Karousis ED, Ban I, Lapointe CP, Leibundgut M, Baeumlin E, Kummerant E, Scaiola A, Schoenhut T, Ziegelmueller J, Puglisi JD, Muehlemann O, Ban N

EMDB-26705:
allo-tRNAUTu1 in the A, P, and E sites of the E. coli ribosome
手法: 単粒子 / : Zhang J, Krahn N, Prabhakar A, Vargas-Rodriguez O, Krupkin M, Fu Z, Acosta-Reyes FJ, Ge X, Choi J, Crnkovic A, Ehrenberg M, Viani Puglisi E, Soll D, Puglisi J

EMDB-26713:
allo-tRNAUTu1A in the A site of the E. coli ribosome
手法: 単粒子 / : Zhang J, Prabhakar A, Krahn N, Vargas-Rodriguez O, Krupkin M, Fu Z, Acosta-Reyes FJ, Ge X, Choi J, Crnkovic A, Ehrenberg M, Viani Puglisi E, Soll D, Puglisi J

EMDB-26714:
allo-tRNAUTu1A in the P site of the E. coli ribosome
手法: 単粒子 / : Zhang J, Prabhakar A, Krahn N, Vargas-Rodriguez O, Krupkin M, Fu Z, Acosta-Reyes FJ, Ge X, Choi J, Crnkovic A, Ehrenberg M, Viani Puglisi E, Soll D, Puglisi J

PDB-7ur5:
allo-tRNAUTu1 in the A, P, and E sites of the E. coli ribosome
手法: 単粒子 / : Zhang J, Krahn N, Prabhakar A, Vargas-Rodriguez O, Krupkin M, Fu Z, Acosta-Reyes FJ, Ge X, Choi J, Crnkovic A, Ehrenberg M, Viani Puglisi E, Soll D, Puglisi J

PDB-7uri:
allo-tRNAUTu1A in the A site of the E. coli ribosome
手法: 単粒子 / : Zhang J, Prabhakar A, Krahn N, Vargas-Rodriguez O, Krupkin M, Fu Z, Acosta-Reyes FJ, Ge X, Choi J, Crnkovic A, Ehrenberg M, Viani Puglisi E, Soll D, Puglisi J

PDB-7urm:
allo-tRNAUTu1A in the P site of the E. coli ribosome
手法: 単粒子 / : Zhang J, Prabhakar A, Krahn N, Vargas-Rodriguez O, Krupkin M, Fu Z, Acosta-Reyes FJ, Ge X, Choi J, Crnkovic A, Ehrenberg M, Viani Puglisi E, Soll D, Puglisi J

EMDB-26067:
CryoEM structure of the human 40S small ribosomal subunit in complex with translation initiation factors eIF1A and eIF5B.
手法: 単粒子 / : Lapointe CP, Grosely R

PDB-7tql:
CryoEM structure of the human 40S small ribosomal subunit in complex with translation initiation factors eIF1A and eIF5B.
手法: 単粒子 / : Lapointe CP, Grosely R, Sokabe M, Alvarado C, Wang J, Montabana E, Villa N, Shin B, Dever T, Fraser C, Fernandez IS, Puglisi JD

EMDB-22899:
Structure of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core
手法: 単粒子 / : Ha B, Larsen KP

EMDB-22900:
Structure of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core with efavirenz
手法: 単粒子 / : Ha B, Larsen KP

EMDB-22901:
Structure of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core with nevirapine
手法: 単粒子 / : Ha B, Larsen KP

PDB-7kjv:
Structure of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core
手法: 単粒子 / : Ha B, Larsen KP, Zhang J, Fu Z, Montabana E, Jackson LN, Chen DH, Puglisi EV

PDB-7kjw:
Structure of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core with efavirenz
手法: 単粒子 / : Ha B, Larsen KP, Zhang J, Fu Z, Montabana E, Jackson LN, Chen DH, Puglisi EV

PDB-7kjx:
Structure of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core with nevirapine
手法: 単粒子 / : Ha B, Larsen KP, Zhang J, Fu Z, Montabana E, Jackson LN, Chen DH, Puglisi EV

EMDB-21859:
CryoEM structure of yeast 80S ribosome with Met-tRNAiMet, eIF5B, and GDP
手法: 単粒子 / : Wang J

PDB-6woo:
CryoEM structure of yeast 80S ribosome with Met-tRNAiMet, eIF5B, and GDP
手法: 単粒子 / : Wang J, Wang J, Puglisi J, Fernandez IS

EMDB-21582:
+1 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (pre-translocation state)
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Jackson LN

EMDB-21583:
+3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (pre-translocation state)
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Jackson LN

EMDB-21584:
+3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (intermediate state)
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Jackson LN

EMDB-21585:
+3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (displaced state)
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Jackson LN

EMDB-22002:
+1 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex (pre-translocation state, global map)
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Jackson LN, Zhang J, Puglisi EV

EMDB-22003:
+3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex (pre-translocation state, unmasked map)
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Jackson LN, Zhang J, Puglisi EV

EMDB-22004:
+3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex (intermediate state, unmasked map)
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Jackson LN, Zhang J, Puglisi EV

EMDB-22005:
+3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex (displaced state, unmasked map)
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Jackson LN, Zhang J, Puglisi EV

PDB-6waz:
+1 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (pre-translocation state)
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Jackson LN, Kappel K, Zhang J, Puglisi EV

PDB-6wb0:
+3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (pre-translocation state)
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Jackson LN, Kappel K, Zhang J, Puglisi EV

PDB-6wb1:
+3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (intermediate state)
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Jackson LN, Kappel K, Zhang J, Chen DH, Puglisi EV

PDB-6wb2:
+3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (displaced state)
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Jackson LN, Kappel K, Zhang J, Chen DH, Puglisi EV

EMDB-10181:
Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail
手法: 単粒子 / : Chandrasekaran V, Juszkiewicz S

PDB-6sgc:
Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail
手法: 単粒子 / : Chandrasekaran V, Juszkiewicz S, Choi J, Puglisi JD, Brown A, Shao S, Ramakrishnan V, Hegde RS

EMDB-20324:
Structure of a partial yeast post-scanning 48S preinitiation complex
手法: 単粒子 / : Wang J, Chen DH, Puglisi JD

EMDB-20325:
Cryo-EM structure of yeast eIF5B-bound 80S initiation complex (80S IC)
手法: 単粒子 / : Wang J, Chen DH, Puglisi JD

EMDB-20326:
Cryo-EM structure of yeast elongation-competent 80S complex (80S EC)
手法: 単粒子 / : Wang J, Chen DH, Puglisi JD

EMDB-7032:
Global architecture of the HIV-1 reverse transcriptase initiation complex
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Mathiharan YK, Chen DH, Puglisi JD, Skiniotis G, Puglisi EV

EMDB-7540:
Cryo-EM map of an HIV-1 reverse transcriptase initiation complex in magnesium chloride imaging buffer
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Chen DH, Puglisi JD, Puglisi EV

EMDB-7031:
Architecture of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Mathiharan YK, Chen DH, Puglisi JD, Skiniotis G, Puglisi EV

PDB-6b19:
Architecture of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core
手法: 単粒子 / : Larsen KP, Mathiharan YK, Chen DH, Puglisi JD, Skiniotis G, Puglisi EV

PDB-5a7u:
Single-particle cryo-EM of co-translational folded adr1 domain inside the E. coli ribosome exit tunnel.
手法: 単粒子 / : Nilsson OB, Hedman R, Marino J, Wickles S, Bischoff L, Johansson M, Muller-Lucks A, Trovato F, Puglisi JD, O'Brien E, Beckmann R, von Heijne G

ページ:

+
EMN検索について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

+
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

-
EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

他の情報も見る