[日本語] English
- 3次元電子顕微鏡データ検索 -

-
検索条件


キーワード
データベース /
Q: EM Navigatorの情報源は?
データエントリ / 週前
Q: データの更新はいつですか?
著者・登録者
解析手法
表示モード
並び順
エントリ数 / 1ページ
登録情報
文献
試料
実験
解析
データの最大数全データの場合は0
ファイル形式
  • CSV形式 (コンマ区切り, Excelなどに)
  • TSV形式 (タブ区切り)
  • JSON形式

万見検索

-
検索結果

検索 (著者・登録者: cheng & jd)の結果56件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-40825:
10E8-GT10.2 immunogen in complex with human Fab 10E8 and mouse Fab W6-10
手法: 単粒子 / : Huang J, Ozorowski G, Ward AB

EMDB-26583:
Cryo-EM structure of Antibody 12-16 in complex with prefusion SARS-CoV-2 Spike glycoprotein
手法: 単粒子 / : Casner RG, Shapiro L

EMDB-33650:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7
手法: 単粒子 / : Chia WN, Tan CW, Tan AWK, Young B, Starr TN, Lopez E, Fibriansah G, Barr J, Cheng S, Yeoh AYY, Yap WC, Lim BL, Ng TS, Sia WR, Zhu F, Chen S, Zhang J, Greaney AJ, Chen M, Au GG, Paradkar P, Peiris M, Chung AW, Bloom JD, Lye D, Lok SM, Wang LF

EMDB-33651:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7 (focused refinement on Fab-RBD interface)
手法: 単粒子 / : Chia WN, Tan CW, Tan AWK, Young B, Starr TN, Lopez E, Fibriansah G, Barr J, Cheng S, Yeoh AYY, Yap WC, Lim BL, Ng TS, Sia WR, Zhu F, Chen S, Zhang J, Greaney AJ, Chen M, Au GG, Paradkar P, Peiris M, Chung AW, Bloom JD, Lye D, Lok SM, Wang LF

EMDB-29044:
Structure of Zanidatamab bound to HER2
手法: 単粒子 / : Worrall LJ, Atkinson CE, Sanches M, Dixit S, Strynadka NCJ

EMDB-27032:
Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC monomeric complex
手法: 単粒子 / : Li Y, Langley C, Azumaya CM, Echeverria I, Chesarino NM, Emerman M, Cheng Y, Gross JD

EMDB-27033:
Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC dimeric complex in State 1
手法: 単粒子 / : Li Y, Langley C, Azumaya CM, Echeverria I, Chesarino NM, Emerman M, Cheng Y, Gross JD

EMDB-27034:
Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC dimeric complex in State 2
手法: 単粒子 / : Li Y, Langley C, Azumaya CM, Echeverria I, Chesarino NM, Emerman M, Cheng Y, Gross JD

EMDB-28667:
Cryo-EM map of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC dimeric complex in State 1-prime
手法: 単粒子 / : Li Y, Langley C, Azumaya CM, Echeverria I, Chesarino NM, Emerman M, Cheng Y, Gross JD

EMDB-32830:
GID subcomplex: Gid12 bound Substrate Receptor Scaffolding module
手法: 単粒子 / : Qiao S, Cheng JD, Schulman BA

EMDB-24227:
Porphyromonas gingivalis type IX secretion system
手法: サブトモグラム平均 / : Hu B

EMDB-24228:
T9SS cytoplasmic complex
手法: サブトモグラム平均 / : Hu B

EMDB-24229:
T9SS pores
手法: サブトモグラム平均 / : Hu B

EMDB-12990:
Cryo-EM structure of N. gonorhoeae LptDE in complex with ProMacrobodies
手法: 単粒子 / : Botte M, Ni D

EMDB-24896:
CryoEM structure of Gq-coupled MRGPRX2 with peptide agonist Cortistatin-14
手法: 単粒子 / : Cao C, Fay JF

EMDB-24897:
CryoEM structure of Gi-coupled MRGPRX2 with peptide agonist Cortistatin-14
手法: 単粒子 / : Cao C, Fay JF

EMDB-24898:
CryoEM structure of Gq-coupled MRGPRX2 with small molecule agonist (R)-Zinc-3573
手法: 単粒子 / : Cao C, Fay JF

EMDB-24899:
CryoEM structure of Gi-coupled MRGPRX2 with small molecule agonist (R)-Zinc-3573
手法: 単粒子 / : Cao C, Fay JF

EMDB-24900:
CryoEM structure of Gq-coupled MRGPRX4 with small molecule agonist MS47134
手法: 単粒子 / : Cao C, Fay JF

EMDB-22829:
Human Tom70 in complex with SARS CoV2 Orf9b
手法: 単粒子 / : QCRG Structural Biology Consortium

PDB-7kdt:
Human Tom70 in complex with SARS CoV2 Orf9b
手法: 単粒子 / : QCRG Structural Biology Consortium

EMDB-20794:
Integrin alpha-v beta-8 in complex with latent TGF-beta (Primary map: sharpened. Additional map: unsharpened.)
手法: 単粒子 / : Campbell MG, Cormier A

EMDB-20795:
Integrin alpha-v beta-8 in complex with Fabs C6D4 and 11D12v2 (Primary map: sharpened, focused refinement. Five additional maps.)
手法: 単粒子 / : Campbell MG, Cormier A

EMDB-20796:
Integrin alpha-v beta-8 in complex with Fabs C6-RGD3 and 11D12v2 (Primary map: sharpened, focused refinement. Five additional maps.)
手法: 単粒子 / : Campbell MG, Cormier A

EMDB-20797:
Integrin alpha-v beta-8 in complex with latent TGF-beta, Conformation i (Primary map: sharpened. Additional map: unsharpened.)
手法: 単粒子 / : Campbell MG, Cormier A, Cheng Y, Nishimura SL

EMDB-20798:
Integrin alpha-v beta-8 in complex with latent TGF-beta, Conformation ii (Primary map: sharpened. Additional map: unsharpened.)
手法: 単粒子 / : Campbell MG, Cormier A, Cheng Y, Nishimura SL

EMDB-20799:
Integrin alpha-v beta-8 in complex with latent TGF-beta, Conformation iii (Primary map: sharpened. Additional map: unsharpened.)
手法: 単粒子 / : Campbell MG, Cormier A, Cheng Y, Nishimura SL

EMDB-20800:
Integrin alpha-v beta-8 in complex with latent TGF-beta, Conformation v (Primary map: sharpened. Additional map: unsharpened.)
手法: 単粒子 / : Campbell MG, Cormier A, Cheng Y, Nishimura SL

EMDB-20801:
Integrin alpha-v beta-8 in complex with latent TGF-beta, Conformation vi (Primary map: sharpened. Additional map: unsharpened.)
手法: 単粒子 / : Campbell MG, Cormier A, Cheng Y, Nishimura SL

EMDB-20802:
Integrin alpha-v beta-8 in complex with latent TGF-beta, Conformation vii (Primary map: sharpened. Additional map: unsharpened.)
手法: 単粒子 / : Campbell MG, Cormier A, Cheng Y, Nishimura SL

EMDB-21125:
Integrin alpha-v beta-8 in complex with pro-TGF-beta1
手法: 単粒子 / : Campbell MG, Cormier A, Nishimura SL, Cheng Y

EMDB-8977:
Cryo-EM structure at 3.2 A resolution of HIV-1 fusion peptide-directed antibody, A12V163-b.01, elicited by vaccination of Rhesus macaques, in complex with stabilized HIV-1 Env BG505 DS-SOSIP, which was also bound to antibodies VRC03 and PGT122
手法: 単粒子 / : Acharya P, Eng ET, Kwong PD

EMDB-20191:
Cryo-EM structure of vaccine-elicited antibody 0PV-b.01 in complex with HIV-1 Env BG505 DS-SOSIP and antibodies VRC03 and PGT122
手法: 単粒子 / : Gorman J, Kwong PD

EMDB-20189:
Cryo-EM structure of vaccine-elicited antibody 0PV-a.01 in complex with HIV-1 Env BG505 DS-SOSIP and antibodies VRC03 and PGT122
手法: 単粒子 / : Gorman J, Kwong PD

EMDB-9189:
Cryo-EM structure at 3.8 A resolution of HIV-1 fusion peptide-directed antibody, DF1W-a.01, elicited by vaccination of Rhesus macaques, in complex with stabilized HIV-1Env BG505 DS-SOSIP, which was also bound to antibodies VRC03 and PGT122
手法: 単粒子 / : Acharya P, Xu K

EMDB-9319:
Cryo-EM structure at 4.0 A resolution of vaccine-elicited antibody 17D4 in complex with HIV-1 Env BG505 DS-SOSIP, and antibodies VRC03 and PGT122
手法: 単粒子 / : Acharya P, Kwong PD

EMDB-9320:
Cryo-EM structure at 4.2 A resolution of vaccine-elicited antibody DFPH-a.15 in complex with HIV-1 Env BG505 DS-SOSIP, and antibodies VRC03 and PGT122
手法: 単粒子 / : Acharya P, Kwong PD

EMDB-9359:
Cryo-EM structure of vaccine-elicited antibody 0PV-c.01 in complex with HIV-1 Env BG505 DS-SOSIP and antibodies VRC03 and PGT122
手法: 単粒子 / : Gorman J, Kwong PD

EMDB-9351:
Cryo-EM structure of singly-bound SNF2h-nucleosome complex, with SNF2h bound at SHL+2
手法: 単粒子 / : Armache JP, Gamarra N, Johnson SL, Wu S, Leonard JD, Narlikar GJ, Cheng Y

EMDB-9352:
Cryo-EM structure of singly-bound SNF2h-nucleosome complex at 3.4 A
手法: 単粒子 / : Armache JP, Gamarra N, Johnson SL, Wu S, Leonard JD, Narlikar GJ, Cheng Y

EMDB-9353:
Cryo-EM structure of SNF2h doubly-bound to the nucleosome
手法: 単粒子 / : Armache JP, Gamarra N, Johnson SL, Wu S, Leonard JD, Narlikar GJ, Cheng Y

EMDB-9354:
Cryo-EM structure of singly-bound SNF2h-nucleosome complex at 3.9A with SNF2h bound at SHL-2
手法: 単粒子 / : Armache JP, Gamarra N, Johnson SL, Wu S, Leonard JD, Narlikar GJ, Cheng Y

EMDB-9355:
Cryo-EM structure of singly-bound SNF2h-nucleosome complex at 6.9A with SNF2h bound at SHL+2
手法: 単粒子 / : Armache JP, Gamarra N, Johnson SL, Wu S, Leonard JD, Narlikar GJ, Cheng Y

EMDB-9356:
Cryo-EM structure of singly-bound SNF2h-nucleosome complex with SNF2h bound at the flanking DNA proximal side
手法: 単粒子 / : Armache JP, Gamarra N, Johnson SL, Leonard JD, Wu S, Narlikar GN

EMDB-7043:
BbRAG1L-3'TIR synaptic complex with intact DNA refined with C1 symmetry
手法: 単粒子 / : Zhang Y, Cheng TC, Xiong Y, Schatz DG

EMDB-7044:
BbRAG1L- 3'TIR synaptic complex with intact DNA refined with C2 symmetry
手法: 単粒子 / : Zhang Y, Cheng TC, Xiong Y, Schatz DG

EMDB-7045:
BbRAGL-3'TIR synaptic complex with nicked DNA refined with c1 symmetry
手法: 単粒子 / : Zhang Y, Cheng TC, Xiong Y, Schatz DG

EMDB-7046:
BbRAGL-3'TIR synaptic complex with nicked DNA refined with C2 symmetry
手法: 単粒子 / : Zhang Y, Cheng TC

EMDB-8707:
Negative stain reconstruction of Endoplasmic Reticulum HSP40 co-chaperone native ERdj3 tetramer.
手法: 単粒子 / : Chowdhury S, Lander GC, Chen KC, Qu S, Noxon IC, Schonhoft JD, Plate L, Powers ET, Kelly JW, Wiseman RL

EMDB-6299:
S. cerevisiae SAGA complex in the arched conformation
手法: 単粒子 / : Setiaputra D, Ross JD, Lu S, Cheng DT, Dong MQ, Yip CK

ページ:

+
EMN検索について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

+
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

-
EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は? / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

他の情報も見る