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3A33	UbcH5b~Ubiquitin Conjugate 分子名称: GLYCEROL, Ubiquitin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2 著者 Sakata, E, Satoh, T, Yamamoto, S, Yamaguchi, Y, Yagi-Utsumi, M, Kurimoto, E, Wakatsuki, S, Kato, K. 登録日 2009-06-08 公開日 2009-11-24 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Crystal Structure of UbcH5b~Ubiquitin Intermediate: Insight into the Formation of the Self-Assembled E2~Ub Conjugates Structure, 18, 2010
5MNJ	Structure of MDM2-MDMX-UbcH5B-ubiquitin complex 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, Polyubiquitin-B, Protein Mdm4, ... 著者 Klejnot, M, Huang, D.T. 登録日 2016-12-13 公開日 2017-05-31 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.16 Å) 主引用文献 Structural analysis of MDM2 RING separates degradation from regulation of p53 transcription activity. Nat. Struct. Mol. Biol., 24, 2017
6IF1	Crystal structure of Ube2K and K48-linked di-ubiquitin complex 分子名称: Ubiquitin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K 著者 Lee, J.-G, Youn, H.-S, Lee, Y, An, J.Y, Park, K.R, Kang, J.Y, Lim, J.J, Eom, S.H. 登録日 2018-09-18 公開日 2018-11-21 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.466 Å) 主引用文献 Crystal structure of the Ube2K/E2-25K and K48-linked di-ubiquitin complex provides structural insight into the mechanism of K48-specific ubiquitin chain synthesis. Biochem. Biophys. Res. Commun., 506, 2018
5TUT	UbcH5a-Ub isopeptide conjugate 分子名称: Ubiquitin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1 著者 Sanchez, J.G, Wagner, J.M, Pornillos, O. 登録日 2016-11-07 公開日 2017-11-08 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.604 Å) 主引用文献 UbcH5a-Ub isopeptide conjugate To be Published
2YHO	The IDOL-UBE2D complex mediates sterol-dependent degradation of the LDL receptor 分子名称: ACETATE ION, E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE MYLIP, UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME E2 D1, ... 著者 Fairall, L, Goult, B.T, Millard, C.J, Tontonoz, P, Schwabe, J.W.R. 登録日 2011-05-04 公開日 2011-06-29 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 The Idol-Ube2D Complex Mediates Sterol-Dependent Degradation of the Ldl Receptor. Genes Dev., 25, 2011
6ZHS	Uba1 bound to two E2 (Ubc13) molecules 分子名称: GLYCEROL, SULFATE ION, Ubiquitin-activating enzyme E1 1, ... 著者 Misra, M, Schindelin, H. 登録日 2020-06-23 公開日 2022-01-12 最終更新日 2024-01-24 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.35 Å) 主引用文献 ATP induced conformational changes facilitate E1-E2 disulfide bridging in the ubiquitin system. To Be Published
5ULH	Structure of RNF165 in complex with a UbcH5b~Ub conjugate 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, GLYCEROL, THIOCYANATE ION, ... 著者 Middleton, A.J, Day, C.L, Wright, J.D. 登録日 2017-01-24 公開日 2017-06-07 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.95 Å) 主引用文献 Discovery of new non-covalent ubiquitin binding sites on UbcH5 To be published
6CP2	SidC in complex with UbcH7~Ub 分子名称: Polyubiquitin-B, SidC, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3 著者 Wasilko, D.J, Huang, Q, Mao, Y. 登録日 2018-03-13 公開日 2018-08-01 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å) 主引用文献 Insights into the ubiquitin transfer cascade catalyzed by theLegionellaeffector SidC. Elife, 7, 2018
6CP0	SdcA in complex with the E2, UbcH5C 分子名称: SdcA, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 著者 Wasilko, D.J, Huang, Q, Mao, Y. 登録日 2018-03-13 公開日 2018-08-01 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.01 Å) 主引用文献 Insights into the ubiquitin transfer cascade catalyzed by theLegionellaeffector SidC. Elife, 7, 2018
2VRR	Structure of SUMO modified Ubc9 分子名称: FORMIC ACID, SMALL UBIQUITIN-RELATED MODIFIER 1, SODIUM ION, ... 著者 Knipscheer, P, Flotho, A, Klug, H, Olsen, J.V, van Dijk, W.J, Fish, A, Johnson, E.S, Mann, M, Sixma, T.K, Pichler, A. 登録日 2008-04-13 公開日 2008-08-19 最終更新日 2023-12-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.22 Å) 主引用文献 Ubc9 sumoylation regulates SUMO target discrimination. Mol. Cell, 31, 2008
5ULK	Crystal Structure of RNF165 in complex with a UbcH5b~Ub conjugate 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, Ubiquitin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, ... 著者 Middleton, A.J, Day, C.L, Wright, J.D. 登録日 2017-01-24 公開日 2017-06-07 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.38 Å) 主引用文献 Discovery of new non-covalent ubiquitin binding sites on UbcH5 To be published
6ZHT	Uba1-Ubc13 disulfide mediated complex 分子名称: CHLORIDE ION, GLYCEROL, Ubiquitin-activating enzyme E1 1, ... 著者 Schaefer, A, Misra, M, Schindelin, H. 登録日 2020-06-23 公開日 2022-01-12 最終更新日 2024-01-24 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 ATP induced conformational changes facilitate E1-E2 disulfide bridging in the ubiquitin system. To Be Published
6ZHU	Yeast Uba1 in complex with Ubc3 and ATP 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, MAGNESIUM ION, Ubiquitin-activating enzyme E1 1, ... 著者 Misra, M, Schindelin, H. 登録日 2020-06-23 公開日 2022-01-12 最終更新日 2024-01-24 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.18 Å) 主引用文献 ATP induced conformational changes facilitate E1-E2 disulfide bridging in the ubiquitin system To Be Published
5ULF	Crystal Structure of a UbcH5b~Ub conjugate 分子名称: GLYCEROL, Ubiquitin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2 著者 Middleton, A.J, Day, C.L, Wright, J.D. 登録日 2017-01-24 公開日 2017-06-07 最終更新日 2017-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Discovery of new non-covalent ubiquitin binding sites on UbcH5 To be published
7AI0	Crystal structure of human MDM2-G443T RING domain homodimer bound to UbcH5B-Ub (Crystal form 1) 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, CHLORIDE ION, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, ... 著者 Magnussen, H.M, Huang, D.T. 登録日 2020-09-25 公開日 2021-01-20 最終更新日 2024-05-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.559 Å) 主引用文献 Identification of a Catalytic Active but Non-Aggregating MDM2 RING Domain Variant. J.Mol.Biol., 433, 2021
7AI1	Crystal structure of human MDM2-G443T RING domain homodimer bound to UbcH5B-Ub (Crystal form 2) 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, CHLORIDE ION, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, ... 著者 Magnussen, H.M, Huang, D.T. 登録日 2020-09-25 公開日 2021-01-20 最終更新日 2024-05-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.07 Å) 主引用文献 Identification of a Catalytic Active but Non-Aggregating MDM2 RING Domain Variant. J.Mol.Biol., 433, 2021
7AHZ	Crystal structure of Western clawed frog MDM2 RING domain homodimer bound to UbcH5B-Ub 分子名称: CHLORIDE ION, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, Polyubiquitin-B, ... 著者 Magnussen, H.M, Huang, D.T. 登録日 2020-09-25 公開日 2021-01-20 最終更新日 2024-01-31 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.82 Å) 主引用文献 Identification of a Catalytic Active but Non-Aggregating MDM2 RING Domain Variant. J.Mol.Biol., 433, 2021
2XWU	CRYSTAL STRUCTURE OF IMPORTIN 13 - UBC9 COMPLEX 分子名称: IMPORTIN13, SUMO-CONJUGATING ENZYME UBC9 著者 Gruenwald, M, Bono, F. 登録日 2010-11-05 公開日 2010-12-29 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Structure of Importin13-Ubc9 Complex: Nuclear Import and Release of a Key Regulator of Sumoylation. Embo J., 30, 2011
5L9T	Model of human Anaphase-promoting complex/Cyclosome (APC/C-CDH1) with E2 UBE2S poised for polyubiquitination where UBE2S, APC2, and APC11 are modeled into low resolution density 分子名称: Anaphase-promoting complex subunit 1, Anaphase-promoting complex subunit 10, Anaphase-promoting complex subunit 11, ... 著者 Brown, N.G, VanderLinden, R, Dube, P, Haselbach, D, Peters, J.M, Stark, H, Schulman, B.A. 登録日 2016-06-11 公開日 2016-10-26 最終更新日 2024-05-08 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (6.4 Å) 主引用文献 Dual RING E3 Architectures Regulate Multiubiquitination and Ubiquitin Chain Elongation by APC/C. Cell, 165, 2016
5NKZ	Crystal structure of H. polymorpha ubiquitin conjugating enzyme Pex4p in complex with soluble domain of Pex22p 分子名称: Peroxin 22, Ubiquitin-conjugating enzyme E2-21 kDa 著者 Danda, N, Lunev, S, Ali, A, Groves, M.R, Williams, C. 登録日 2017-04-03 公開日 2018-01-24 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.85 Å) 主引用文献 Structural insights into K48-linked ubiquitin chain formation by the Pex4p-Pex22p complex. Biochem. Biophys. Res. Commun., 496, 2018
2Y9P	Pex4p-Pex22p mutant II structure 分子名称: PEROXISOME ASSEMBLY PROTEIN 22, UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME E2-21 KDA 著者 Williams, C, van den Berg, M, Panjikar, S, Distel, B, Wilmanns, M. 登録日 2011-02-16 公開日 2012-02-29 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.25 Å) 主引用文献 Pex4P-Pex22P Structure To be Published
6JKY	Crystal structure of MvcA-UBE2N-Ub complex from Legionella pneumophila 分子名称: MvcA, Ub, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N 著者 Ouyang, S.Y, Guan, H. 登録日 2019-03-03 公開日 2019-12-18 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.454 Å) 主引用文献 Legionella pneumophila regulates the activity of UBE2N by deamidase-mediated deubiquitination. Embo J., 39, 2020
6D4P	Ube2D1 in complex with ubiquitin variant Ubv.D1.1 分子名称: Ubiquitin Variant Ubv.D1.1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1 著者 Ceccarelli, D.F, Garg, P, Sidhu, S, Sicheri, F. 登録日 2018-04-18 公開日 2019-07-17 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.11 Å) 主引用文献 Structural and Functional Analysis of Ubiquitin-based Inhibitors That Target the Backsides of E2 Enzymes. J.Mol.Biol., 432, 2020
6JB6	Crystal structure of Ub-conjugated Ube2K C92K&K97A mutant (isopeptide linkage), 2.7 A resolution 分子名称: Ubiquitin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K 著者 Lee, J.-G, Youn, H.-S, Lee, Y, An, J.Y, Park, K.R, Kang, J.Y, Mun, S.A, Park, J, Park, T, Jin, M.W, Yang, J, Eom, S.H. 登録日 2019-01-25 公開日 2019-03-20 最終更新日 2024-03-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å) 主引用文献 Crystal structure of Ub-conjugated Ube2K C92K&K97A mutant (isopeptide linkage), 2.7 A resolution To Be Published
6D68	Ube2G1 in complex with ubiquitin variant Ubv.G1.1 分子名称: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 G1, Ubv.G1.1 著者 Ceccarelli, D.F, Garg, P, Sidhu, S, Sicheri, F. 登録日 2018-04-20 公開日 2019-07-17 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.36 Å) 主引用文献 Structural and Functional Analysis of Ubiquitin-based Inhibitors That Target the Backsides of E2 Enzymes. J.Mol.Biol., 432, 2020

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