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5H07	TNIP2-Ub complex, C2 form 分子名称: Polyubiquitin-C, TNFAIP3-interacting protein 2 著者 Lo, Y.C, Lin, S.C. 登録日 2016-10-04 公開日 2017-03-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.586 Å) 主引用文献 Structural Insights into Linear Tri-ubiquitin Recognition by A20-Binding Inhibitor of NF-kappa B, ABIN-2 Structure, 25, 2017
5GVI	Zebrafish USP30 in complex with Lys6-linked diubiquitin 分子名称: Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, ZINC ION, ubiquitin 著者 Sato, Y, Fukai, S. 登録日 2016-09-05 公開日 2017-09-13 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.87 Å) 主引用文献 Structural basis for specific cleavage of Lys6-linked polyubiquitin chains by USP30 Nat. Struct. Mol. Biol., 24, 2017
5GO0	Solution structure of nedd8 from Trypanosoma brucei 分子名称: Ubiquitin, putative 著者 Wang, R, Liao, S, Zhang, J, Tu, X. 登録日 2016-07-25 公開日 2017-07-26 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of nedd8 from Trypanosoma brucei To Be Published
5GO7	Linear tri-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y. 登録日 2016-07-26 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.801 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOC	Lys11-linked diubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, SODIUM ION, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y. 登録日 2016-07-26 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.733 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOI	Lys48-linked di-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y, Liu, L. 登録日 2016-07-27 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.594 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
2ZCC	Ubiquitin crystallized under high pressure 分子名称: Ubiquitin, ZINC ION 著者 Kitahara, R, Tanaka, T, Yamashita, M, Araya, K, Yokoyama, S, Akasaka, K, Taniguchi, Y, Kato, M. 登録日 2007-11-08 公開日 2007-11-20 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.4 Å) 主引用文献 Structure of Ubiquitin crystallized under high pressure to be published
2ZEQ	Crystal structure of ubiquitin-like domain of murine Parkin 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase parkin 著者 Tomoo, K. 登録日 2007-12-14 公開日 2008-08-19 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.65 Å) 主引用文献 Crystal structure and molecular dynamics simulation of ubiquitin-like domain of murine parkin Biochim.Biophys.Acta, 1784, 2008
3A9J	Crystal structure of the mouse TAB2-NZF in complex with Lys63-linked di-ubiquitin 分子名称: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7-interacting protein 2, Ubiquitin, ZINC ION 著者 Sato, Y, Yoshikawa, A, Yamashita, M, Yamagata, A, Fukai, S. 登録日 2009-10-29 公開日 2009-12-08 最終更新日 2021-11-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.18 Å) 主引用文献 Structural basis for specific recognition of Lys 63-linked polyubiquitin chains by NZF domains of TAB2 and TAB3 Embo J., 28, 2009
2XK5	Crystal structure of K6-linked diubiquitin 分子名称: UBIQUITIN, ZINC ION 著者 Virdee, S, Chin, J.W, Komander, D. 登録日 2010-07-07 公開日 2010-08-25 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 Engineered Diubiquitin Synthesis Reveals K29-Isopeptide Specificity of an Otu Deubiquitinase Nat.Chem.Biol., 6, 2010
2XEW	Crystal structure of K11-linked diubiquitin 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, CHLORIDE ION, CITRATE ANION, ... 著者 Bremm, A, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2010-05-18 公開日 2010-07-14 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Lys11-Linked Ubiquitin Chains Adopt Compact Conformations and are Preferentially Hydrolyzed by the Deubiquitinase Cezanne Nat.Struct.Mol.Biol., 17, 2010
7UYH	Structure of the first OTU domain from Legionella pneumophila effector protein LotA bound to K6-linked diUb 分子名称: LotA, Ubiquitin 著者 Warren, G.D, Pruneda, J.N. 登録日 2022-05-06 公開日 2022-12-21 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Mechanism of Lys6 poly-ubiquitin specificity by the L. pneumophila deubiquitinase LotA. Mol.Cell, 83, 2023
2ZCB	Crystal Structure of ubiquitin P37A/P38A 分子名称: Ubiquitin, ZINC ION 著者 Kitahara, R, Tanaka, T, Sakata, E, Yamaguchi, Y, Kato, K, Yokoyama, S. 登録日 2007-11-08 公開日 2007-11-20 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.6 Å) 主引用文献 Crystal Structure of ubiquitin P37A/P38A To be published
3AUL	Crystal structure of wild-type Lys48-linked diubiquitin in an open conformation 分子名称: Polyubiquitin-C 著者 Hirano, T, Olivier, S, Yagi, M, Takemoto, E, Hiromoto, T, Satoh, T, Mizushima, T, Kato, K. 登録日 2011-02-09 公開日 2011-09-07 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.39 Å) 主引用文献 Conformational dynamics of wild-type Lys48-linked diubiquitin in solution J.Biol.Chem., 286, 2011
3A9K	Crystal structure of the mouse TAB3-NZF in complex with Lys63-linked di-ubiquitin 分子名称: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7-interacting protein 3, Ubiquitin, ZINC ION 著者 Sato, Y, Yoshikawa, A, Yamashita, M, Yamagata, A, Fukai, S. 登録日 2009-10-29 公開日 2009-12-08 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.4 Å) 主引用文献 Structural basis for specific recognition of Lys 63-linked polyubiquitin chains by NZF domains of TAB2 and TAB3 Embo J., 28, 2009
3B1L	Crystal Structure of parkin ubiquitin-like domain R33Q mutant 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase parkin 著者 Tomoo, K, Ikemiya, A, Amami, Y, In, Y, Ishida, T. 登録日 2011-07-04 公開日 2012-07-04 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Crystal Structure of parkin ubiquitin-like domain R33Q mutant to be published
3AXC	Crystal structure of linear diubiquitin 分子名称: GLYCEROL, Ubiquitin 著者 Rohaim, A, Kawasaki, M, Kato, R, Dikic, I, Wakatsuki, S. 登録日 2011-04-01 公開日 2012-01-25 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.19 Å) 主引用文献 Structure of a compact conformation of linear diubiquitin Acta Crystallogr.,Sect.D, 68, 2012
3B0A	Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 分子名称: Polyubiquitin-C, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE, ... 著者 Sato, Y, Fujita, H, Yoshikawa, A, Yamashita, M, Yamagata, A, Kaiser, S.E, Iwai, K, Fukai, S. 登録日 2011-06-07 公開日 2011-12-14 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Specific recognition of linear ubiquitin chains by the Npl4 zinc finger (NZF) domain of the HOIL-1L subunit of the linear ubiquitin chain assembly complex Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 108, 2011
3B08	Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 分子名称: Polyubiquitin-C, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, ZINC ION, ... 著者 Sato, Y, Fujita, H, Yoshikawa, A, Yamashita, M, Yamagata, A, Kaiser, S.E, Iwai, K, Fukai, S. 登録日 2011-06-07 公開日 2011-12-14 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.701 Å) 主引用文献 Specific recognition of linear ubiquitin chains by the Npl4 zinc finger (NZF) domain of the HOIL-1L subunit of the linear ubiquitin chain assembly complex Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 108, 2011
3ALB	Cyclic Lys48-linked tetraubiquitin 分子名称: SULFATE ION, ubiquitin 著者 Satoh, T, Sakata, E, Yamamoto, S, Yamaguchi, Y, Sumiyoshi, A, Wakatsuki, S, Kato, K. 登録日 2010-07-29 公開日 2010-08-25 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Crystal structure of cyclic Lys48-linked tetraubiquitin Biochem.Biophys.Res.Commun., 2010
6V5D	EROS3 RDC and NOE Derived Ubiquitin Ensemble 分子名称: Ubiquitin 著者 Lange, O.F, Lakomek, N.A, Smith, C.A, Griesinger, C, de Groot, B.L. 登録日 2019-12-04 公開日 2020-01-01 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Enhancing NMR derived ensembles with kinetics on multiple timescales. J.Biomol.Nmr, 74, 2020
6W9S	Crystal structure of an OTU deubiquitinase from Escherichia albertii bound to ubiquitin 分子名称: FORMIC ACID, OTU domain-containing protein EschOTU, Ubiquitin 著者 Schubert, A.F, Pruneda, J.N, Komander, D. 登録日 2020-03-23 公開日 2020-07-01 最終更新日 2020-08-12 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Identification and characterization of diverse OTU deubiquitinases in bacteria. Embo J., 39, 2020
6W9R	Crystal structure of an OTU deubiquitinase from Wolbachia pipientis wMel bound to ubiquitin 分子名称: CITRATE ANION, OTU domain-containing protein wMelOTU, Ubiquitin 著者 Schubert, A.F, Pruneda, J.N, Komander, D. 登録日 2020-03-23 公開日 2020-07-01 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.82 Å) 主引用文献 Identification and characterization of diverse OTU deubiquitinases in bacteria. Embo J., 39, 2020
7P08	Solution structure of the human SF3A1 ubiquitin-like domain 分子名称: Isoform 1 of Splicing factor 3A subunit 1 著者 de Vries, T, Campagne, S, Allain, F.H.T. 登録日 2021-06-29 公開日 2022-02-09 最終更新日 2022-02-16 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Sequence-specific RNA recognition by an RGG motif connects U1 and U2 snRNP for spliceosome assembly. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 119, 2022
7P0V	Crystal structure of human SF3A1 ubiquitin-like domain in complex with U1 snRNA stem-loop 4 分子名称: Isoform 2 of Splicing factor 3A subunit 1, PENTAETHYLENE GLYCOL, RNA (5'-R(P*GP*GP*GP*GP*AP*CP*UP*GP*CP*GP*UP*UP*CP*GP*CP*GP*CP*UP*UP*UP*CP*CP*CP*C)-3'), ... 著者 Sabath, K, de Vries, T, Jonas, S. 登録日 2021-06-30 公開日 2022-04-20 最終更新日 2024-01-31 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.56 Å) 主引用文献 Sequence-specific RNA recognition by an RGG motif connects U1 and U2 snRNP for spliceosome assembly. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 119, 2022

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