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4XOL	Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal - Cubic Ubiquitin crystals. 分子名称: Ubiquitin, ZINC ION 著者 Coquelle, N, Peixiang, M, Schanda, P, Colletier, J.P. 登録日 2015-01-16 公開日 2015-10-14 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.91 Å) 主引用文献 Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal. Nat Commun, 6, 2015
4XOF	Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal - Orthorhombic Ubiquitin crystals without Zinc. 分子名称: Ubiquitin 著者 Coquelle, N, Ma, P, Schanda, P, Colletier, J.P. 登録日 2015-01-16 公開日 2015-10-14 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.15 Å) 主引用文献 Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal. Nat Commun, 6, 2015
4ZPZ	Crystal Structure of Semi-synthetic Ubiquitin with Phospho-Ser65 and Ala46Cys 分子名称: Polyubiquitin-B 著者 Han, C, Virdee, S. 登録日 2015-05-08 公開日 2015-06-10 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.54 Å) 主引用文献 A Versatile Strategy for the Semisynthetic Production of Ser65 Phosphorylated Ubiquitin and Its Biochemical and Structural Characterisation. Chembiochem, 16, 2015
4ZQS	New compact conformation of linear Ub2 structure 分子名称: ubiquitin 著者 Thach, T.T, Shin, D, Han, S, Lee, S. 登録日 2015-05-11 公開日 2016-04-20 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.804 Å) 主引用文献 New conformations of linear polyubiquitin chains from crystallographic and solution-scattering studies expand the conformational space of polyubiquitin. Acta Crystallogr D Struct Biol, 72, 2016
4Z9S	Non-covalent assembly of monoubiquitin that mimics K11 poly-ubiquitin 分子名称: MALONIC ACID, THIOCYANATE ION, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a 著者 Levin-Kravets, O, Prag, G. 登録日 2015-04-11 公開日 2015-07-29 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Tetrameric Assembly of Monoubiquitin Accurately Mimics the Lys11 Polyubiquitin Chain Structure. Biochemistry, 54, 2015
4XKL	Crystal structure of NDP52 ZF2 in complex with mono-ubiquitin 分子名称: ACETATE ION, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, GLYCEROL, ... 著者 Xie, X, Li, F, Wang, Y, Lin, Z, Chen, X, Liu, J, Pan, L. 登録日 2015-01-12 公開日 2015-11-11 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Molecular basis of ubiquitin recognition by the autophagy receptor CALCOCO2 Autophagy, 11, 2015
4XOK	Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal. 分子名称: Ubiquitin, ZINC ION 著者 Coquelle, N, Ma, P, Schanda, P, Colletier, J.P. 登録日 2015-01-16 公開日 2015-10-14 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal. Nat Commun, 6, 2015
5AF5	Structure of Lys33-linked triUb S.G. P 212121 分子名称: POLYUBIQUITIN-C 著者 Michel, M.A, Elliott, P.R, Swatek, K.N, Simicek, M, Pruneda, J.N, Wagstaff, J.L, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2015-01-19 公開日 2015-03-25 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.68 Å) 主引用文献 Assembly and Specific Recognition of K29- and K33-Linked Polyubiquitin. Mol.Cell, 58, 2015
7M4O	Crystal structure of phosphorylated RBR E3 ligase RNF216 in complex with K63-linked di-ubiquitin 分子名称: 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL, E3 ubiquitin-protein ligase RNF216, GLYCEROL, ... 著者 Cotton, T.R, Lechtenberg, B.C. 登録日 2021-03-21 公開日 2022-01-05 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.21 Å) 主引用文献 Structural basis of K63-ubiquitin chain formation by the Gordon-Holmes syndrome RBR E3 ubiquitin ligase RNF216. Mol.Cell, 82, 2022
7M4M	Crystal structure of RBR E3 ligase RNF216 with ubiquitin 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF216, GLYCEROL, Ubiquitin, ... 著者 Cotton, T.R, Lechtenberg, B.C. 登録日 2021-03-21 公開日 2022-01-05 最終更新日 2024-04-03 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.39 Å) 主引用文献 Structural basis of K63-ubiquitin chain formation by the Gordon-Holmes syndrome RBR E3 ubiquitin ligase RNF216. Mol.Cell, 82, 2022
7M4N	Crystal structure of RBR E3 ligase RNF216 in complex with K63-linked di-ubiquitin 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF216, GLYCEROL, SULFATE ION, ... 著者 Cotton, T.R, Lechtenberg, B.C. 登録日 2021-03-21 公開日 2022-01-05 最終更新日 2024-04-03 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.52 Å) 主引用文献 Structural basis of K63-ubiquitin chain formation by the Gordon-Holmes syndrome RBR E3 ubiquitin ligase RNF216. Mol.Cell, 82, 2022
5AF4	Structure of Lys33-linked diUb 分子名称: GLYCEROL, SULFATE ION, UBIQUITIN 著者 Michel, M.A, Elliott, P.R, Swatek, K.N, Simicek, M, Pruneda, J.N, Wagstaff, J.L, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2015-01-19 公開日 2015-03-25 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Assembly and Specific Recognition of K29- and K33-Linked Polyubiquitin. Mol.Cell, 58, 2015
7NPO	Branched K48-K63-Ub3 分子名称: GLYCEROL, Polyubiquitin-B 著者 Lange, S.M, Kwasna, D, Kulathu, Y. 登録日 2021-02-27 公開日 2022-08-10 最終更新日 2024-07-31 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.19 Å) 主引用文献 VCP/p97-associated proteins are binders and debranching enzymes of K48-K63-branched ubiquitin chains. Nat.Struct.Mol.Biol., 2024
7NBB	Branched Lys48- and Lys63-linked tri-ubiquitin (K48-K63-Ub3) in complex with synthetic nanobody NbSL3 分子名称: CHLORIDE ION, GLYCEROL, MAGNESIUM ION, ... 著者 Lange, S.M, Kulathu, Y. 登録日 2021-01-26 公開日 2022-08-10 最終更新日 2024-07-31 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.55 Å) 主引用文献 VCP/p97-associated proteins are binders and debranching enzymes of K48-K63-branched ubiquitin chains. Nat.Struct.Mol.Biol., 2024
5GOG	Lys29-linked di-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y. 登録日 2016-07-27 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.977 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOK	K11/K63-branched tri-Ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y, Liu, L. 登録日 2016-07-27 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.84 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
4I6N	Crystal structure of Trichinella spiralis UCH37 catalytic domain bound to Ubiquitin vinyl methyl ester 分子名称: 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE, METHYL 4-AMINOBUTANOATE, SODIUM ION, ... 著者 Morrow, M.E, Ronau, J.A, White, R.R, Artavanis-Tsakonas, K, Das, C. 登録日 2012-11-29 公開日 2013-05-29 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.701 Å) 主引用文献 Stabilization of an Unusual Salt Bridge in Ubiquitin by the Extra C-Terminal Domain of the Proteasome-Associated Deubiquitinase UCH37 as a Mechanism of Its Exo Specificity. Biochemistry, 52, 2013
5GOH	Lys33-linked di-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y, Liu, L. 登録日 2016-07-27 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.946 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GO8	Linear tetra-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y. 登録日 2016-07-26 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.21 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOD	Lys27-linked di-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, MAGNESIUM ION, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y. 登録日 2016-07-26 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.15 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
5GOJ	Lys63-linked di-ubiquitin 分子名称: D-ubiquitin, Ubiquitin 著者 Gao, S, Pan, M, Zheng, Y, Liu, L. 登録日 2016-07-27 公開日 2016-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.549 Å) 主引用文献 Monomer/Oligomer Quasi-Racemic Protein Crystallography J.Am.Chem.Soc., 138, 2016
4IG7	Crystal structure of Trichinella spiralis UCH37 bound to Ubiquitin vinyl methyl ester 分子名称: METHYL 4-AMINOBUTANOATE, Ubiquitin, Ubiquitin C-terminal hydrolase 37 著者 Das, C, Kim, M.I, Morrow, M.E. 登録日 2012-12-16 公開日 2013-05-29 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.996 Å) 主引用文献 Stabilization of an Unusual Salt Bridge in Ubiquitin by the Extra C‑Terminal Domain of the Proteasome-Associated Deubiquitinase UCH37 as a Mechanism of Its Exo Specificity. Biochemistry, 52, 2013
5GO0	Solution structure of nedd8 from Trypanosoma brucei 分子名称: Ubiquitin, putative 著者 Wang, R, Liao, S, Zhang, J, Tu, X. 登録日 2016-07-25 公開日 2017-07-26 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of nedd8 from Trypanosoma brucei To Be Published
5H07	TNIP2-Ub complex, C2 form 分子名称: Polyubiquitin-C, TNFAIP3-interacting protein 2 著者 Lo, Y.C, Lin, S.C. 登録日 2016-10-04 公開日 2017-03-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.586 Å) 主引用文献 Structural Insights into Linear Tri-ubiquitin Recognition by A20-Binding Inhibitor of NF-kappa B, ABIN-2 Structure, 25, 2017
5GVI	Zebrafish USP30 in complex with Lys6-linked diubiquitin 分子名称: Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, ZINC ION, ubiquitin 著者 Sato, Y, Fukai, S. 登録日 2016-09-05 公開日 2017-09-13 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.87 Å) 主引用文献 Structural basis for specific cleavage of Lys6-linked polyubiquitin chains by USP30 Nat. Struct. Mol. Biol., 24, 2017

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