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8GBF	Crystal structure of human DNA polymerase eta incorporating syn-ITP across dT 分子名称: CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), DNA (5'-D(P*AP*TP*TP*CP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), ... 著者 Jung, H. 登録日 2023-02-25 公開日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.11 Å) 主引用文献 Crystal structure of human DNA polymerase eta incorporating syn-ITP across dT To Be Published
5L1I	Crystal Structure of Human DNA Polymerase Eta Inserting dCTP Opposite O6-Methyl-2'-deoxyguanosine 分子名称: 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*TP*C)-3'), ... 著者 Patra, A, Egli, M. 登録日 2016-07-29 公開日 2016-10-05 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.78 Å) 主引用文献 Mechanisms of Insertion of dCTP and dTTP Opposite the DNA Lesion O6-Methyl-2'-deoxyguanosine by Human DNA Polymerase eta. J.Biol.Chem., 291, 2016
5L1L	PostInsertion complex of Human DNA Polymerase Eta bypassing an O6-Methyl-2'-deoxyguanosine : dT site 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*GP*(6OG)P*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Patra, A, Egli, M. 登録日 2016-07-29 公開日 2016-10-05 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.62 Å) 主引用文献 Mechanisms of Insertion of dCTP and dTTP Opposite the DNA Lesion O6-Methyl-2'-deoxyguanosine by Human DNA Polymerase eta. J.Biol.Chem., 291, 2016
8EVF	HUMAN DNA POLYMERASE ETA EXTENSION COMPLEX WITH AN INCOMING DCTP 分子名称: 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*G)-3'), ... 著者 Pallan, P.S, Egli, M. 登録日 2022-10-20 公開日 2023-08-02 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.87 Å) 主引用文献 The peroxidation-derived DNA adduct, 6-oxo-M 1 dG, is a strong block to replication by human DNA polymerase eta. J.Biol.Chem., 299, 2023
8EVE	HUMAN DNA POLYMERASE ETA INSERTION COMPLEX 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, CALCIUM ION, DI(HYDROXYETHYL)ETHER, ... 著者 Pallan, P.S, Egli, M. 登録日 2022-10-20 公開日 2023-08-02 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.35 Å) 主引用文献 The peroxidation-derived DNA adduct, 6-oxo-M 1 dG, is a strong block to replication by human DNA polymerase eta. J.Biol.Chem., 299, 2023
5L1K	PostInsertion complex of Human DNA Polymerase Eta bypassing an O6-Methyl-2'-deoxyguanosine : dC site 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*C)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*GP*(6OG)P*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Patra, A, Egli, M. 登録日 2016-07-29 公開日 2016-10-05 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.82 Å) 主引用文献 Mechanisms of Insertion of dCTP and dTTP Opposite the DNA Lesion O6-Methyl-2'-deoxyguanosine by Human DNA Polymerase eta. J.Biol.Chem., 291, 2016
5L9X	Human DNA polymerase eta-DNA ternary complex: reaction with 10 mM Mn2+ for 60s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Gao, Y, Yang, W. 登録日 2016-06-12 公開日 2016-06-22 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Capture of a third Mg2+ is essential for catalyzing DNA synthesis. Science, 352, 2016
5L1J	Crystal Structure of Human DNA Polymerase Eta Inserting dTMPNPP Opposite O6-Methyl-2'-deoxyguanosine 分子名称: 5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]thymidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(6OG)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Patra, A, Egli, M. 登録日 2016-07-29 公開日 2016-10-05 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.94 Å) 主引用文献 Mechanisms of Insertion of dCTP and dTTP Opposite the DNA Lesion O6-Methyl-2'-deoxyguanosine by Human DNA Polymerase eta. J.Biol.Chem., 291, 2016
6UI2	Structure of human DNA polymerase eta complexed with N7MG in the template base paired with incoming non-hydrolyzable CTP 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(FMG)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Koag, M.C, Lee, S. 登録日 2019-09-30 公開日 2020-01-15 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.35 Å) 主引用文献 Bypass of the Major Alkylative DNA Lesion by Human DNA Polymerase eta. Molecules, 24, 2019
6UQI	Crystal structure of Q38A human DNA polymerase eta bound with 8-oxoadenine (oxoA) and non-hydrolyzable dGTP analog (dGTP*) 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(A38)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Jung, H, Lee, S. 登録日 2019-10-19 公開日 2020-10-28 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Crystal structure of Q38A human DNA polymerase eta bound with 8-oxoadenine (oxoA) and non-hydrolyzable dGTP analog (dGTP*) To Be Published
8FOG	Crystal structure of human DNA polymerase eta incorporating dITP across dT 分子名称: 2'-deoxyinosine 5'-triphosphate, CALCIUM ION, DNA polymerase eta, ... 著者 Jung, H. 登録日 2022-12-30 公開日 2023-05-03 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.29 Å) 主引用文献 Crystal structure of human DNA polymerase eta incorporating dITP across dT To Be Published
8FN3	Crystal structure of human DNA polymerase eta incorporating dITP across dC 分子名称: 2'-deoxyinosine 5'-triphosphate, CALCIUM ION, DNA polymerase eta, ... 著者 Jung, H. 登録日 2022-12-26 公開日 2023-05-03 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.17 Å) 主引用文献 Crystal structure of human DNA polymerase eta incorporating dITP across dC To Be Published
6PL8	Structure of human DNA polymerase eta complexed with 8OA in the template base paired with incoming non-hydrolyzable TTP 分子名称: 5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]thymidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(A38)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Koag, M.C, Lee, S. 登録日 2019-06-30 公開日 2020-07-01 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.17 Å) 主引用文献 Structure of human DNA polymerase eta complexed with 8OA in the template base paired with incoming non-hydrolyzable TTP To Be Published
6V5K	Crystal structure of human DNA polymerase eta complexed with N7-nitrogen half-mustard guanine (NHMG) and dCTP* 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*T*(QRV)P*CP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), ... 著者 Jung, H, Lee, S. 登録日 2019-12-04 公開日 2020-12-09 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.69 Å) 主引用文献 Crystal structure of human DNA polymerase eta complexed with N7-nitrogen half-mustard guanine (NHMG) and dCTP* To Be Published
8G8H	Crystal structure of human DNA polymerase eta incorporating ITP across dC 分子名称: CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), DNA (5'-D(P*AP*TP*CP*CP*TP*CP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Jung, H. 登録日 2023-02-17 公開日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.64 Å) 主引用文献 Crystal structure of human DNA polymerase eta incorporating ITP across dC To Be Published
6PLC	Structure of human DNA polymerase eta complexed with 8OA in the template base paired with incoming non-hydrolyzable GTP 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(A38)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Koag, M.C, Lee, S. 登録日 2019-06-30 公開日 2020-04-22 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Mutagenesis mechanism of the major oxidative adenine lesion 7,8-dihydro-8-oxoadenine. Nucleic Acids Res., 48, 2020
6PL7	Structure of human DNA polymerase eta complexed with A in the template base paired with incoming non-hydrolyzable TTP 分子名称: 5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]thymidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*AP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... 著者 Koag, M.C, Lee, S. 登録日 2019-06-30 公開日 2020-07-01 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Structure of human DNA polymerase eta complexed with A in the template base paired with incoming non-hydrolyzable TTP To Be Published
6Q02	Polymerase Eta-catalyzed insertion of the mismatched A opposite template cytarabine (AraC) residue 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA Primer Strand, DNA polymerase eta, ... 著者 Rechkoblit, O, Aggarwal, A.K. 登録日 2019-08-01 公開日 2019-11-20 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.09 Å) 主引用文献 Structural insights into mutagenicity of anticancer nucleoside analog cytarabine during replication by DNA polymerase eta. Sci Rep, 9, 2019
6PZ3	Polymerase Eta-catalyzed insertion of correct G opposite template cytarabine (AraC) residue 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA Primer strand, DNA polymerase eta, ... 著者 Rechkoblit, O, Aggarwal, A.K. 登録日 2019-07-31 公開日 2019-11-20 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.395 Å) 主引用文献 Structural insights into mutagenicity of anticancer nucleoside analog cytarabine during replication by DNA polymerase eta. Sci Rep, 9, 2019
6W5X	Crystal structure of human polymerase eta complexed with N7-benzylguanine and dCTP* 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(DRG)P*CP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), ... 著者 Jung, H, Lee, S. 登録日 2020-03-14 公開日 2021-03-17 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.59 Å) 主引用文献 Crystal structure of human polymerase eta complexed with N7-benzylguanine and dCTP* To Be Published
6WK6	Crystal structure of human polymerase eta complexed with Xanthine containing DNA 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(3ZO)P*CP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), ... 著者 Jung, H, Lee, S. 登録日 2020-04-15 公開日 2021-01-06 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.35 Å) 主引用文献 Structural insights into the bypass of the major deaminated purines by translesion synthesis DNA polymerase. Biochem.J., 477, 2020
4J9R	Human DNA polymerase eta-DNA translocated binary complex with TG mispair 分子名称: DNA (5'-D(*T*AP*CP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*T)-3'), DNA (5'-D(P*TP*AP*CP*GP*TP*CP*AP*TP*G)-3'), DNA polymerase eta, ... 著者 Zhao, Y, Gregory, M, Biertumpfel, C, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. 登録日 2013-02-16 公開日 2013-05-01 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.35 Å) 主引用文献 Mechanism of somatic hypermutation at the WA motif by human DNA polymerase eta. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
4J9S	Human DNA polymerase eta-DNA translocated binary complex: with TA base pair 分子名称: DNA (5'-D(*T*AP*TP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*CP*GP*TP*CP*AP*TP*A)-3'), DNA polymerase eta, ... 著者 Zhao, Y, Gregory, M, Biertumpfel, C, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. 登録日 2013-02-16 公開日 2013-05-01 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.95 Å) 主引用文献 Mechanism of somatic hypermutation at the WA motif by human DNA polymerase eta. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
4RNN	Crystal structure of human polymerase eta inserting dGMPnPP opposite DNA template containing an abasic site 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA polymerase eta, GLYCEROL, ... 著者 Patra, A, Egli, M. 登録日 2014-10-24 公開日 2015-02-18 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.808 Å) 主引用文献 Structural and Kinetic Analysis of Nucleoside Triphosphate Incorporation Opposite an Abasic Site by Human Translesion DNA Polymerase eta. J.Biol.Chem., 290, 2015
4RU9	Crystal structure of human DNA polymerase eta inserting dCMPNPP opposite a MeFapy-dG adducted DNA template 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA polymerase eta, MAGNESIUM ION, ... 著者 Patra, A, Egli, M. 登録日 2014-11-18 公開日 2015-08-05 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.65 Å) 主引用文献 Structural Basis for Error-Free Bypass of the 5-N-Methylformamidopyrimidine-dG Lesion by Human DNA Polymerase eta and Sulfolobus solfataricus P2 Polymerase IV. J.Am.Chem.Soc., 137, 2015

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