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5Y59	Crystal structure of Ku80 and Sir4 分子名称: ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, SULFATE ION, Sir4p 著者 Chen, H, Xue, J, Wu, J, Lei, M. 登録日 2017-08-08 公開日 2017-12-20 最終更新日 2024-03-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.402 Å) 主引用文献 Structural Insights into Yeast Telomerase Recruitment to Telomeres Cell, 172, 2018
6TYW	Structure of Ku80 von Willebrand domain S229A mutant complexed with APLF Ku Binding Motif 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, GLU-ARG-LYS-ARG-ILE-LEU-PRO-THR-TRP-MET-LEU-ALA-GLU, X-ray repair cross-complementing protein 5 著者 Min, J, Pedersen, L.C. 登録日 2019-08-09 公開日 2019-11-27 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.69965541 Å) 主引用文献 Ligand binding characteristics of the Ku80 von Willebrand domain. DNA Repair (Amst.), 85, 2019
6TYZ	Structure of Ku80 von Willebrand domain complexed with APLF Ku Binding Motif 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, GLU-ARG-LYS-ARG-ILE-LEU-PRO-THR-TRP-MET-LEU-ALA, X-ray repair cross-complementing protein 5 著者 Min, J, Pedersen, L.C. 登録日 2019-08-09 公開日 2019-11-27 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.51076627 Å) 主引用文献 Ligand binding characteristics of the Ku80 von Willebrand domain. DNA Repair (Amst.), 85, 2019
6TYV	Structure of Ku80 von Willebrand domain complexed with WRN Ku Binding Motif 分子名称: THR-THR-ALA-GLN-GLN-ARG-LYS-CYS-PRO-GLU-TRP-MET-ASN, X-ray repair cross-complementing protein 5 著者 Min, J, Pedersen, L.C. 登録日 2019-08-09 公開日 2019-11-27 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.926111 Å) 主引用文献 Ligand binding characteristics of the Ku80 von Willebrand domain. DNA Repair (Amst.), 85, 2019
6TYX	Structure of Ku80 von Willebrand domain S229A mutant complexed with XLF Ku Binding Motif 分子名称: LYS-GLY-LEU-PHE-MET, X-ray repair cross-complementing protein 5 著者 Min, J, Pedersen, L.C. 登録日 2019-08-09 公開日 2019-11-27 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.89944351 Å) 主引用文献 Ligand binding characteristics of the Ku80 von Willebrand domain. DNA Repair (Amst.), 85, 2019
6TYU	Structure of Ku80 von Willebrand domain complexed with MRI Ku Binding Motif 分子名称: LYS-THR-ARG-VAL-LEU-PRO-SER-TRP-LEU-THR-ALA, X-ray repair cross-complementing protein 5 著者 Min, J, Pedersen, L.C. 登録日 2019-08-09 公開日 2019-11-27 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.46862721 Å) 主引用文献 Ligand binding characteristics of the Ku80 von Willebrand domain. DNA Repair (Amst.), 85, 2019
6TYT	Structure of Ku80 von Willebrand domain S229A mutant complexed with APLF and XLF Ku Binding Motif 分子名称: ALA-LYS-GLY-LEU-PHE-MET, ARG-LYS-ARG-ILE-LEU-PRO-THR-TRP-MET-LEU-ALA, X-ray repair cross-complementing protein 5 著者 Min, J, Pedersen, L.C. 登録日 2019-08-09 公開日 2019-11-27 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.403488 Å) 主引用文献 Ligand binding characteristics of the Ku80 von Willebrand domain. DNA Repair (Amst.), 85, 2019
6ERF	Complex of APLF factor and Ku heterodimer bound to DNA 分子名称: Aprataxin and PNK-like factor, DNA (34-MER), DNA (5'-D(*GP*TP*TP*TP*TP*TP*AP*GP*TP*TP*TP*AP*TP*TP*GP*GP*GP*CP*GP*CP*G)-3'), ... 著者 Nemoz, C, Legrand, P, Ropars, V, Charbonnier, J.B. 登録日 2017-10-18 公開日 2018-10-17 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.01 Å) 主引用文献 XLF and APLF bind Ku80 at two remote sites to ensure DNA repair by non-homologous end joining. Nat.Struct.Mol.Biol., 25, 2018
7SGL	DNA-PK complex of DNA end processing 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, Hairpin_1, ... 著者 Liu, L, Li, J, Chen, X, Yang, W, Gellert, M. 登録日 2021-10-06 公開日 2022-01-12 最終更新日 2022-01-19 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3 Å) 主引用文献 Autophosphorylation transforms DNA-PK from protecting to processing DNA ends. Mol.Cell, 82, 2022
7AXZ	Ku70/80 complex apo form 分子名称: X-ray repair cross-complementing protein 5, X-ray repair cross-complementing protein 6 著者 Hnizda, A, Tesina, P, Novak, P, Blundell, T.L. 登録日 2020-11-10 公開日 2021-02-10 最終更新日 2024-05-01 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.2 Å) 主引用文献 SAP domain forms a flexible part of DNA aperture in Ku70/80. Febs J., 288, 2021
7SU3	CryoEM structure of DNA-PK complex VII 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, DNA (5'-D(*AP*AP*GP*CP*AP*GP*TP*AP*GP*AP*G)-3'), DNA (5'-D(*GP*CP*AP*TP*GP*CP*TP*CP*TP*AP*CP*TP*GP*CP*TP*TP*CP*GP*AP*TP*AP*TP*CP*G)-3'), ... 著者 Chen, X, Liu, L, Gellert, M, Yang, W. 登録日 2021-11-16 公開日 2022-01-12 最終更新日 2024-06-05 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.3 Å) 主引用文献 Autophosphorylation transforms DNA-PK from protecting to processing DNA ends. Mol.Cell, 82, 2022
7SUD	CryoEM structure of DNA-PK complex VIII 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, MAGNESIUM ION, ... 著者 Chen, X, Liu, L, Gellert, M, Yang, W. 登録日 2021-11-16 公開日 2022-01-12 最終更新日 2022-01-19 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.6 Å) 主引用文献 Autophosphorylation transforms DNA-PK from protecting to processing DNA ends. Mol.Cell, 82, 2022
8EZB	NHEJ Long-range complex with ATP 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, DNA (30-MER), DNA (31-MER), ... 著者 Chen, S, He, Y. 登録日 2022-10-31 公開日 2023-06-14 最終更新日 2024-06-19 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (8.9 Å) 主引用文献 Cryo-EM visualization of DNA-PKcs structural intermediates in NHEJ. Sci Adv, 9, 2023
8EZA	NHEJ Long-range complex with PAXX 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, DNA (30-MER), DNA (31-MER), ... 著者 Chen, S, He, Y. 登録日 2022-10-31 公開日 2023-06-14 最終更新日 2024-06-19 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.39 Å) 主引用文献 Cryo-EM visualization of DNA-PKcs structural intermediates in NHEJ. Sci Adv, 9, 2023
6ZHE	Cryo-EM structure of DNA-PK dimer 分子名称: DNA (25-MER), DNA (26-MER), DNA (27-MER), ... 著者 Chaplin, A.K, Hardwick, S.W, Chirgadze, D.Y, Blundell, T.L. 登録日 2020-06-23 公開日 2020-10-21 最終更新日 2024-05-01 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (7.24 Å) 主引用文献 Dimers of DNA-PK create a stage for DNA double-strand break repair. Nat.Struct.Mol.Biol., 28, 2021
1JEY	Crystal Structure of the Ku heterodimer bound to DNA 分子名称: DNA (34-MER), DNA (5'-D(*GP*TP*TP*TP*TP*TP*AP*GP*TP*TP*TP*AP*TP*TP*GP*GP*GP*CP*GP*CP*G)-3'), Ku70, ... 著者 Walker, J.R, Corpina, R.A, Goldberg, J. 登録日 2001-06-19 公開日 2001-08-10 最終更新日 2023-08-16 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Structure of the Ku heterodimer bound to DNA and its implications for double-strand break repair. Nature, 412, 2001
6ZHA	Cryo-EM structure of DNA-PK monomer 分子名称: DNA, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit,DNA-dependent protein kinase catalytic subunit,DNA-dependent protein kinase catalytic subunit,DNA-PKcs, X-ray repair cross-complementing protein 5, ... 著者 Chaplin, A.K, Hardwick, S.W, Chirgadze, D.Y, Blundell, T.L. 登録日 2020-06-21 公開日 2020-10-21 最終更新日 2024-05-01 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.91 Å) 主引用文献 Dimers of DNA-PK create a stage for DNA double-strand break repair. Nat.Struct.Mol.Biol., 28, 2021
1JEQ	Crystal Structure of the Ku Heterodimer 分子名称: KU70, KU80 著者 Walker, J.R, Corpina, R.A, Goldberg, J. 登録日 2001-06-18 公開日 2001-08-15 最終更新日 2024-02-07 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å) 主引用文献 Structure of the Ku heterodimer bound to DNA and its implications for double-strand break repair. Nature, 412, 2001
6ERG	Complex of XLF and heterodimer Ku bound to DNA 分子名称: DNA (21-MER), DNA (34-MER), Non-homologous end-joining factor 1, ... 著者 Nemoz, C, Legrand, P, Ropars, V, Charbonnier, J.B. 登録日 2017-10-18 公開日 2018-10-17 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å) 主引用文献 XLF and APLF bind Ku80 at two remote sites to ensure DNA repair by non-homologous end joining. Nat. Struct. Mol. Biol., 25, 2018
6ERH	Complex of XLF and heterodimer Ku bound to DNA 分子名称: DNA (21-MER), DNA (34-MER), Non-homologous end-joining factor 1, ... 著者 Nemoz, C, Legrand, P, Ropars, V, Charbonnier, J.B. 登録日 2017-10-18 公開日 2018-10-17 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 XLF and APLF bind Ku80 at two remote sites to ensure DNA repair by non-homologous end joining. Nat. Struct. Mol. Biol., 25, 2018
8BH3	DNA-PK Ku80 mediated dimer bound to PAXX 分子名称: DNA (25-MER), DNA (26-MER), DNA (27-MER), ... 著者 Hardwick, S.W, Chaplin, A.K. 登録日 2022-10-28 公開日 2023-06-07 最終更新日 2024-07-24 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.55 Å) 主引用文献 PAXX binding to the NHEJ machinery explains functional redundancy with XLF. Sci Adv, 9, 2023
8BHV	DNA-PK XLF mediated dimer bound to PAXX 分子名称: DNA (24-MER), DNA (26-MER), DNA (27-MER), ... 著者 Hardwick, S.W, Chaplin, A.K. 登録日 2022-11-01 公開日 2023-06-07 最終更新日 2024-07-24 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.51 Å) 主引用文献 PAXX binding to the NHEJ machinery explains functional redundancy with XLF. Sci Adv, 9, 2023
8BHY	DNA-PK Ku80 mediated dimer bound to PAXX and XLF 分子名称: DNA (25-MER), DNA (26-MER), DNA (27-MER), ... 著者 Hardwick, S.W, Chaplin, A.K. 登録日 2022-11-01 公開日 2023-06-07 最終更新日 2024-07-24 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (5.33 Å) 主引用文献 PAXX binding to the NHEJ machinery explains functional redundancy with XLF. Sci Adv, 9, 2023
5Y3R	Cryo-EM structure of Human DNA-PK Holoenzyme 分子名称: DNA (34-MER), DNA (36-MER), DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, ... 著者 Yin, X, Liu, M, Tian, Y, Wang, J, Xu, Y. 登録日 2017-07-29 公開日 2017-09-06 最終更新日 2024-03-27 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (6.6 Å) 主引用文献 Cryo-EM structure of human DNA-PK holoenzyme Cell Res., 27, 2017
5Y58	Crystal structure of Ku70/80 and TLC1 分子名称: ATP-dependent DNA helicase II subunit 1, ATP-dependent DNA helicase II subunit 2, TLC1 著者 Chen, H, Xue, J, Wu, J, Lei, M. 登録日 2017-08-08 公開日 2017-12-20 最終更新日 2024-03-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Structural Insights into Yeast Telomerase Recruitment to Telomeres Cell, 172, 2018

 

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