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Yorodumi- PDB-6qx2: 3.4A structure of benzoisoxazole 3 with S.aureus DNA gyrase and DNA -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6qx2 | ||||||
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Title | 3.4A structure of benzoisoxazole 3 with S.aureus DNA gyrase and DNA | ||||||
Components |
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Keywords | ISOMERASE / Inhibitor / DNA complex | ||||||
Function / homology | Function and homology information DNA negative supercoiling activity / DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) complex / DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity / DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing) / DNA topological change / DNA-templated DNA replication / chromosome / response to antibiotic / DNA binding / ATP binding ...DNA negative supercoiling activity / DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) complex / DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity / DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing) / DNA topological change / DNA-templated DNA replication / chromosome / response to antibiotic / DNA binding / ATP binding / metal ion binding / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Staphylococcus aureus (bacteria) synthetic construct (others) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 3.4 Å | ||||||
Authors | Bax, B.D. | ||||||
Funding support | 1items
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Citation | Journal: Bioorg.Med.Chem.Lett. / Year: 2019 Title: Structure-guided design of antibacterials that allosterically inhibit DNA gyrase. Authors: Thalji, R.K. / Raha, K. / Andreotti, D. / Checchia, A. / Cui, H. / Meneghelli, G. / Profeta, R. / Tonelli, F. / Tommasi, S. / Bakshi, T. / Donovan, B.T. / Howells, A. / Jain, S. / Nixon, C. ...Authors: Thalji, R.K. / Raha, K. / Andreotti, D. / Checchia, A. / Cui, H. / Meneghelli, G. / Profeta, R. / Tonelli, F. / Tommasi, S. / Bakshi, T. / Donovan, B.T. / Howells, A. / Jain, S. / Nixon, C. / Quinque, G. / McCloskey, L. / Bax, B.D. / Neu, M. / Chan, P.F. / Stavenger, R.A. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 6qx2.cif.gz | 1.7 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb6qx2.ent.gz | 1.3 MB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 6qx2.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qx/6qx2 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qx/6qx2 | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 6qx1C 2xcsS C: citing same article (ref.) S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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