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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-4172 | |||||||||
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タイトル | Roadblock-1 region of the dynein tail/dynactin/BICDR1 complex | |||||||||
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![]() | Cryo-EM / Complex / MOTOR PROTEIN | |||||||||
機能・相同性 | ![]() transport along microtubule / visual behavior / dynein light chain binding / dynein heavy chain binding / ciliary tip / Intraflagellar transport / dynein complex / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / cytoplasmic dynein complex / microtubule motor activity ...transport along microtubule / visual behavior / dynein light chain binding / dynein heavy chain binding / ciliary tip / Intraflagellar transport / dynein complex / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / cytoplasmic dynein complex / microtubule motor activity / dynein intermediate chain binding / microtubule-based movement / Amplification of signal from unattached kinetochores via a MAD2 inhibitory signal / COPI-mediated anterograde transport / Mitotic Prometaphase / EML4 and NUDC in mitotic spindle formation / Loss of Nlp from mitotic centrosomes / Loss of proteins required for interphase microtubule organization from the centrosome / Recruitment of mitotic centrosome proteins and complexes / Recruitment of NuMA to mitotic centrosomes / Resolution of Sister Chromatid Cohesion / Anchoring of the basal body to the plasma membrane / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / MHC class II antigen presentation / AURKA Activation by TPX2 / RHO GTPases Activate Formins / cilium / Aggrephagy / HCMV Early Events / Separation of Sister Chromatids / Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition / microtubule / vesicle / centrosome / membrane / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.4 Å | |||||||||
![]() | Urnavicius L / Lau CK | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM shows how dynactin recruits two dyneins for faster movement. 著者: Linas Urnavicius / Clinton K Lau / Mohamed M Elshenawy / Edgar Morales-Rios / Carina Motz / Ahmet Yildiz / Andrew P Carter / ![]() ![]() ![]() 要旨: Dynein and its cofactor dynactin form a highly processive microtubule motor in the presence of an activating adaptor, such as BICD2. Different adaptors link dynein and dynactin to distinct cargoes. ...Dynein and its cofactor dynactin form a highly processive microtubule motor in the presence of an activating adaptor, such as BICD2. Different adaptors link dynein and dynactin to distinct cargoes. Here we use electron microscopy and single-molecule studies to show that adaptors can recruit a second dynein to dynactin. Whereas BICD2 is biased towards recruiting a single dynein, the adaptors BICDR1 and HOOK3 predominantly recruit two dyneins. We find that the shift towards a double dynein complex increases both the force and speed of the microtubule motor. Our 3.5 Å resolution cryo-electron microscopy reconstruction of a dynein tail-dynactin-BICDR1 complex reveals how dynactin can act as a scaffold to coordinate two dyneins side-by-side. Our work provides a structural basis for understanding how diverse adaptors recruit different numbers of dyneins and regulate the motile properties of the dynein-dynactin transport machine. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 295.2 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 13.7 KB 13.7 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 108.7 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.8 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 217 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 216.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 6f1zMC ![]() 4168C ![]() 4169C ![]() 4170C ![]() 4171C ![]() 4177C ![]() 5owoC ![]() 6f1tC ![]() 6f1uC ![]() 6f1vC ![]() 6f1yC ![]() 6f38C ![]() 6f3aC C: 同じ文献を引用 ( M: このマップから作成された原子モデル |
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類似構造データ |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.34 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Two dynein tail domains, dynactin and BICDR1
全体 | 名称: Two dynein tail domains, dynactin and BICDR1 |
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要素 |
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-超分子 #1: Two dynein tail domains, dynactin and BICDR1
超分子 | 名称: Two dynein tail domains, dynactin and BICDR1 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2
分子 | 名称: Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 68.442141 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MSDKSELKAE LERKKQRLAQ IREEKKRKEE ERKKKETDQK KEAVAPVQEE SDLEKKRREA EALLQSMGLT PESPIVPPPM SPSSKSVST PSEAGSQDSG DGAVGSRRGP IKLGMAKITQ VDFPPREIVT YTKETQTPVM AQPKEDEEED DDVVAPKPPI E PEEEKTLK ...文字列: MSDKSELKAE LERKKQRLAQ IREEKKRKEE ERKKKETDQK KEAVAPVQEE SDLEKKRREA EALLQSMGLT PESPIVPPPM SPSSKSVST PSEAGSQDSG DGAVGSRRGP IKLGMAKITQ VDFPPREIVT YTKETQTPVM AQPKEDEEED DDVVAPKPPI E PEEEKTLK KDEENDSKAP PHELTEEEKQ QILHSEEFLS FFDHSTRIVE RALSEQINIF FDYSGRDLED KEGEIQAGAK LS LNRQFFD ERWSKHRVVS CLDWSSQYPE LLVASYNNNE DAPHEPDGVA LVWNMKYKKT TPEYVFHCQS AVMSATFAKF HPN LVVGGT YSGQIVLWDN RSNKRTPVQR TPLSAAAHTH PVYCVNVVGT QNAHNLISIS TDGKICSWSL DMLSHPQDSM ELVH KQSKA VAVTSMSFPV GDVNNFVVGS EEGSVYTACR HGSKAGISEM FEGHQGPITG IHCHAAVGAV DFSHLFVTSS FDWTV KLWS TKNNKPLYSF EDNAGYVYDV MWSPTHPALF ACVDGMGRLD LWNLNNDTEV PTASISVEGN PALNRVRWTH SGREIA VGD SEGQIVIYDV GEQIAVPRND EWARFGRTLA EINANRADAE EEAATRIPA UniProtKB: Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 |
-分子 #2: Dynein light chain roadblock-type 1
分子 | 名称: Dynein light chain roadblock-type 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 10.934576 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MAEVEETLKR LQSQKGVQGI IVVNTEGIPI KSTMDNPTTT QYASLMHSFI LKARSTVRDI DPQNDLTFLR IRSKKNEIMV APDKDYFLI VIQNPTE UniProtKB: Dynein light chain roadblock-type 1 |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE / 装置: FEI VITROBOT MARK III |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k) 平均電子線量: 52.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
-原子モデル構築 1
精密化 | 空間: REAL / プロトコル: FLEXIBLE FIT 当てはまり具合の基準: Cross-correlation coefficient |
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得られたモデル | ![]() PDB-6f1z: |