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検索結果

検索 (著者・登録者: zavialov & a)の結果51件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-52587:
Csu pilus rod purified from Acinetobacter baumannii
手法: らせん対称 / : Malmi H, Zavialov AV, Pakharukova N

EMDB-52600:
Csu pilus rod antiparallel pair
手法: 単粒子 / : Malmi H, Pakharukova N, Zavialov AV

EMDB-52601:
Csu pilus rod type 1 stack
手法: 単粒子 / : Malmi H, Pakharukova N, Zavialov AV

EMDB-52602:
Csu pilus rod type 2 stack
手法: 単粒子 / : Malmi H, Pakharukova N, Zavialov AV

PDB-9i37:
Csu pilus rod purified from Acinetobacter baumannii
手法: らせん対称 / : Malmi H, Zavialov AV, Pakharukova N

PDB-9i3m:
Csu pilus rod antiparallel pair
手法: 単粒子 / : Malmi H, Pakharukova N, Zavialov AV

PDB-9i3n:
Csu pilus rod type 1 stack
手法: 単粒子 / : Malmi H, Pakharukova N, Zavialov AV

PDB-9i3o:
Csu pilus rod type 2 stack
手法: 単粒子 / : Malmi H, Pakharukova N, Zavialov AV

EMDB-14777:
Cryo-EM structure of archaic chaperone-usher Csu pilus of Acinetobacter baumannii
手法: らせん対称 / : Pakharukova N, Malmi H, Tuittila M, Paavilainen S, Ghosal D, Chang YW, Jensen GJ, Zavialov AV

PDB-7zl4:
Cryo-EM structure of archaic chaperone-usher Csu pilus of Acinetobacter baumannii
手法: らせん対称 / : Pakharukova N, Malmi H, Tuittila M, Paavilainen S, Ghosal D, Chang YW, Jensen GJ, Zavialov AV

PDB-2rdo:
50S subunit with EF-G(GDPNP) and RRF bound
手法: 単粒子 / : Gao N, Zavialov AV, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1430:
Specific interaction between EF-G and RRF and its implication for GTP-dependent ribosome splitting into subunits.
手法: 単粒子 / : Gao N, Zavialov A, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1395:
Incorporation of aminoacyl-tRNA into the ribosome as seen by cryo-electron microscopy.
手法: 単粒子 / : Valle M, Zavialov A, Li W, Stagg SM, Sengupta J, Nielsen RC, Nissen P, Harvey SC, Ehrenberg M, Frank J

PDB-2o0f:
Docking of the modified RF3 X-ray structure into cryo-EM map of E.coli 70S ribosome bound with RF3
手法: 単粒子 / : Gao H, Zhou Z, Rawat U, Huang C, Bouakaz L, Wang C, Liu Y, Zavialov A, Gursky R, Sanyal S, Ehrenberg M, Frank J, Song H

EMDB-1302:
RF3 induces ribosomal conformational changes responsible for dissociation of class I release factors.
手法: 単粒子 / : Gao H, Zhou Z, Rawat U, Huang C, Bouakaz L, Wang C, Liu Y, Zavialov A, Gursky R, Sanyal S, Ehrenberg M, Frank J, Song H

EMDB-1362:
Locking and unlocking of ribosomal motions.
手法: 単粒子 / : Mikel V, Andrey Z, Sengupta J, Rawat U, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1363:
Locking and unlocking of ribosomal motions.
手法: 単粒子 / : Mikel V, Andrey Z, Sengupta J, Rawat U, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1364:
Locking and unlocking of ribosomal motions.
手法: 単粒子 / : Mikel V, Andrey Z, Sengupta J, Rawat U, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1365:
Locking and unlocking of ribosomal motions.
手法: 単粒子 / : Mikel V, Andrey Z, Sengupta J, Rawat U, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1366:
Locking and unlocking of ribosomal motions.
手法: 単粒子 / : Mikel V, Andrey Z, Sengupta J, Rawat U, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1248:
The cryo-EM structure of a translation initiation complex from Escherichia coli.
手法: 単粒子 / : Allen GS, Zavialov A, Gursky R, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1249:
The cryo-EM structure of a translation initiation complex from Escherichia coli.
手法: 単粒子 / : Allen GS, Zavialov A, Gursky R, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1127:
Mechanism for the disassembly of the posttermination complex inferred from cryo-EM studies.
手法: 単粒子 / : Gao N, Zavialov AV, Li W, Sengupta J, Valle M, Gursky RP, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1128:
Mechanism for the disassembly of the posttermination complex inferred from cryo-EM studies.
手法: 単粒子 / : Gao N, Zavialov AV, Li W, Sengupta J, Valle M, Gursky RP, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1184:
Interactions of the release factor RF1 with the ribosome as revealed by cryo-EM.
手法: 単粒子 / : Rawat U, Gao H, Zavialov A, Gursky R, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1185:
Interactions of the release factor RF1 with the ribosome as revealed by cryo-EM.
手法: 単粒子 / : Rawat U, Gao H, Zavialov A, Gursky R, Ehrenberg M, Frank J

PDB-2fvo:
Docking of the modified RF1 X-ray structure into the Low Resolution Cryo-EM map of E.coli 70S Ribosome bound with RF1
手法: 単粒子 / : Rawat U, Gao H, Zavialov A, Gursky R, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1zn0:
Coordinates of RRF and EF-G fitted into Cryo-EM map of the 50S subunit bound with both EF-G (GDPNP) and RRF
手法: 単粒子 / : Gao N, Zavialov AV, Li W, Sengupta J, Valle M, Gursky RP, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1zn1:
Coordinates of RRF fitted into Cryo-EM map of the 70S post-termination complex
手法: 単粒子 / : Gao N, Zavialov AV, Li W, Sengupta J, Valle M, Gursky RP, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1zo1:
IF2, IF1, and tRNA fitted to cryo-EM data OF E. COLI 70S initiation complex
手法: 単粒子 / : Allen GS, Zavialov A, Gursky R, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1zo3:
The P-site and P/E-site tRNA structures fitted to P/I site codon.
手法: 単粒子 / : Allen GS, Zavialov A, Gursky R, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1055:
Locking and unlocking of ribosomal motions.
手法: 単粒子 / : Valle M, Zavialov A, Li W, Stagg SM, Sengupta J, Nielsen RC, Nissen P, Hervey SC, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1056:
Incorporation of aminoacyl-tRNA into the ribosome as seen by cryo-electron microscopy.
手法: 単粒子 / : Valle M, Zavialov A, Li W, Stagg SM, Sengupta J, Nielsen RC, Nissen P, Harvey SC, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1qza:
Coordinates of the A/T site tRNA model fitted into the cryo-EM map of EF-Tu ternary complex (GDP.Kirromycin) bound 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Valle M, Zavialov A, Li W, Stagg SM, Sengupta J, Nielsen RC, Nissen P, Harvey SC, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1qzb:
Coordinates of the A-site tRNA model fitted into the cryo-EM map of 70S ribosome in the pre-translocational state
手法: 単粒子 / : Valle M, Zavialov A, Li W, Stagg SM, Sengupta J, Nielsen RC, Nissen P, Harvey SC, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1qzc:
Coordinates of S12, SH44, LH69 and SRL separately fitted into the cryo-EM map of EF-Tu ternary complex (GDP.Kirromycin) bound 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Valle M, Zavialov A, Li W, Stagg SM, Sengupta J, Nielsen RC, Nissen P, Harvey SC, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1qzd:
EF-Tu.kirromycin coordinates fitted into the cryo-EM map of EF-Tu ternary complex (GDP.Kirromycin) bound 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Valle M, Zavialov A, Li W, Stagg SM, Sengupta J, Nielsen RC, Nissen P, Harvey SC, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1r2w:
Coordinates of L11 with 58nts of 23S rRNA fitted into the cryo-EM map of the 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Valle M, Zavialov A, Li W, Stagg SM, Sengupta J, Nielsen RC, Nissen P, Harvey SC, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1r2x:
Coordinates of L11 with 58nts of 23S rRNA fitted into the cryo-EM map of EF-Tu ternary complex (GDP.Kirromycin) bound 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Valle M, Zavialov A, Li W, Stagg SM, Sengupta J, Nielsen RC, Nissen P, Harvey SC, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1006:
A cryo-electron microscopic study of ribosome-bound termination factor RF2.
手法: 単粒子 / : Rawat U, Gao H, Zavialov A, Gursky R, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1007:
A cryo-electron microscopic study of ribosome-bound termination factor RF2.
手法: 単粒子 / : Rawat UB, Zavialov AV, Sengupta J, Valle M, Grassucci RA, Linde J, Vestergaard B, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1008:
A cryo-electron microscopic study of ribosome-bound termination factor RF2.
手法: 単粒子 / : Rawat UB, Zavialov AV, Sengupta J, Valle M, Grassucci RA, Linde J, Vestergaard B, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1009:
A cryo-electron microscopic study of ribosome-bound termination factor RF2.
手法: 単粒子 / : Rawat UB, Zavialov AV, Sengupta J, Valle M, Grassucci RA, Linde J, Vestergaard B, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1010:
A cryo-electron microscopic study of ribosome-bound termination factor RF2.
手法: 単粒子 / : Rawat UB, Zavialov AV, Sengupta J, Valle M, Grassucci RA, Linde J, Vestergaard B, Ehrenberg M, Frank J

EMDB-1005:
Structure of the Escherichia coli ribosomal termination complex with release factor 2.
手法: 単粒子 / : Klaholz BP, Pape T, Zavialov AV, Myasnikov AG, Orlova EV, Vestergaard B, Ehrenberg M, van Heel M

PDB-1pn6:
Domain-wise fitting of the crystal structure of T.thermophilus EF-G into the low resolution map of the release complex.Puromycin.EFG.GDPNP of E.coli 70S ribosome.
手法: 単粒子 / : Valle M, Zavialov A, Sengupta J, Rawat U, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1pn7:
Coordinates of S12, L11 proteins and P-tRNA, from the 70S X-ray structure aligned to the 70S Cryo-EM map of E.coli ribosome
手法: 単粒子 / : Valle M, Zavialov A, Sengupta J, Rawat U, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1pn8:
Coordinates of S12, L11 proteins and E-site tRNA from 70S crystal structure separately fitted into the Cryo-EM map of E.coli 70S.EF-G.GDPNP complex. The atomic coordinates originally from the E-site tRNA were fitted in the position of the hybrid P/E-site tRNA.
手法: 単粒子 / : Valle M, Zavialov A, Sengupta J, Rawat U, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1mvr:
Decoding Center & Peptidyl transferase center from the X-ray structure of the Thermus thermophilus 70S ribosome, aligned to the low resolution Cryo-EM map of E.coli 70S Ribosome
手法: 単粒子 / : Rawat UB, Zavialov AV, Sengupta J, Valle M, Grassucci RA, Linde J, Vestergaard B, Ehrenberg M, Frank J

PDB-1ml5:
Structure of the E. coli ribosomal termination complex with release factor 2
手法: 単粒子 / : Klaholz BP, Pape T, Zavialov AV, Myasnikov AG, Orlova EV, Vestergaard B, Ehrenberg M, van Heel M

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

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関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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