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万見検索

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検索結果

検索 (著者・登録者: starr & tn)の結果全44件を表示しています

EMDB-70353:
Clone 2.1 Fab in complex with chicken IgY CH2 domain (local refinement)

EMDB-47823:
Structure of the prefusion HKU5-19s Spike trimer (conformation 1)

EMDB-48048:
Structure of the prefusion HKU5-19s Spike trimer (conformation 2)

EMDB-46512:
Structure of the HKU5 RBD bound to the P. abramus ACE2 receptor

EMDB-47358:
Structure of the HKU5-19s RBD bound to the Bos taurus ACE2 receptor

EMDB-44103:
Structure of the Porcine deltacoronavirus (PDCoV) receptor-binding domain bound to the PD33 antibody Fab fragment and the Kappa light chain nanobody

EMDB-46804:
PDCoV S trimer bound by three copies of PD41 Fab

EMDB-46805:
PDCoV S RBD bound to PD41 Fab (local refinement)

EMDB-46806:
PDCoV S SD2018/300 Apo (Class I)

EMDB-46814:
PDCoV S SD2018/300 with one PD41 Fab bound (Class II)

EMDB-46815:
PDCoV S SD2018/300 with one PD41 Fab bound (Class III)

EMDB-46816:
PDCoV S SD2018/300 with two PD41 Fabs bound (Class IV)

PDB-9b2c:
Structure of the Porcine deltacoronavirus (PDCoV) receptor-binding domain bound to the PD33 antibody Fab fragment and the Kappa light chain nanobody

PDB-9dez:
PDCoV S trimer bound by three copies of PD41 Fab

PDB-9df0:
PDCoV S RBD bound to PD41 Fab (local refinement)

EMDB-43813:
VIR-7229 Fab fragment bound the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike trimer (local refinement of the BA 2.86 RBD/VIR-7229 VHVL)

EMDB-43842:
VIR-7229 Fab fragment bound the BA.2.86 spike trimer (global refinement)

EMDB-41784:
PRD-0038 RBD bound to Rhinolophus alcyone ACE2 (local refinement)

EMDB-41786:
PRD-0038 RBD bound to R. alcyone ACE2

EMDB-41842:
Prefusion structure of the PRD-0038 spike glycoprotein ectodomain trimer

EMDB-41843:
PRD-0038 Spike glycoprotein NTD

EMDB-33650:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7

EMDB-33651:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7 (focused refinement on Fab-RBD interface)

EMDB-29052:
SARS-CoV-2 Spike Hexapro - C68.59 Fab (Class 3 - disordered)

EMDB-29053:
SARS-CoV-2 Spike Hexapro - C59.68 Fab (Class 1 - No Fab bound)

EMDB-29054:
SARS-CoV-2 Spike Hexapro - C68.59 Fab (Class 2 - Fab bound)

EMDB-26507:
SARS-CoV-2 spike in complex with Multivalent miniprotein inhibitor FUS231-P24 (2RBDs open)

EMDB-26508:
SARS-CoV-2 spike in complex with multivalent miniprotein inhibitor FUS231-P24 (3RBDs open)

EMDB-26509:
SARS-CoV-2 spike in complex with multivalent miniprotein inhibitor FUS31-G10 (2RBDs open)

EMDB-26510:
SARS-CoV-2 spike in complex with multivalent miniprotein inhibitor FUS31-G10 (3RBDs open)

EMDB-26511:
SARS-CoV-2 spike in complex with AHB2-2GS-SB175 (local refinement of the RBD and AHB2)

EMDB-26512:
SARS-CoV-2 spike in complex with AHB2-2GS-SB175

EMDB-25785:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2K146 neutralizing antibody Fab fragment (three receptor-binding domains open)

EMDB-25783:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2K146 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and S2K146)

EMDB-25784:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2K146 neutralizing antibody Fab fragment (two receptor-binding domains open)

EMDB-24347:
SARS-CoV-2 S glycoprotein in complex with S2X259 Fab

EMDB-24365:
SARS-CoV-2 S bound to S2X259 Fab (local refinement of the RBD/S2X259 variable domains)

EMDB-24299:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2D106 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and S2D106)

EMDB-24300:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2D106 neutralizing antibody Fab fragment

EMDB-24301:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein ectodomain in complex with the S2H97 neutralizing antibody Fab fragment

EMDB-22627:
Negative stain EM map of SARS-COV-2 spike protein (trimer) with Fab COV2-2082

EMDB-22628:
Negative stain EM map of SARS-COV-2 spike protein (trimer) with Fab COV2-2479

EMDB-22148:
Negative stain EM map of SARS-COV-2 spike protein open RBD (trimer) with Fab COV2-2096

EMDB-22149:
Negative stain EM map of SARS-COV-2 spike protein (trimer) with Fab COV2-2832

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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