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万見検索

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検索結果

検索 (著者・登録者: sofos & n)の結果全43件を表示しています

EMDB-19075:
Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K composite map

EMDB-19282:
Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K Cas12k domain local-refinement map

EMDB-19283:
Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K TnsC domain local-refinement map

EMDB-19284:
Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K TnsB domain local-refinement map

EMDB-19286:
consensus map of the V-K CRISPR-associated Transposon Integration Assembly

PDB-8rdu:
Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K composite map

PDB-8rkt:
Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K Cas12k domain local-refinement map

PDB-8rku:
Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K TnsC domain local-refinement map

PDB-8rkv:
Conformational Landscape of the Type V-K CRISPR-associated TransposonIntegration Assembly CAST V-K TnsB domain local-refinement map

EMDB-15697:
Cryo-EM structure of shCas12k-sgRNA-dsDNA ternary complex (type V-K CRISPR-associated transposon)

EMDB-15698:
Cryo-EM structure of Cas12k-sgRNA binary complex (type V-K CRISPR-associated transposon)

PDB-8axa:
Cryo-EM structure of shCas12k-sgRNA-dsDNA ternary complex (type V-K CRISPR-associated transposon)

PDB-8axb:
Cryo-EM structure of Cas12k-sgRNA binary complex (type V-K CRISPR-associated transposon)

EMDB-15294:
Cryo-EM structure of the strand transfer complex of the TnsB transposase (type V-K CRISPR-associated transposon)

EMDB-15344:
Type V-K CAST TnsB bound to LTR-SR

PDB-8aa5:
Cryo-EM structure of the strand transfer complex of the TnsB transposase (type V-K CRISPR-associated transposon)

EMDB-14441:
E. coli C-P lyase bound to a PhnK/PhnL dual ABC dimer and ADP + Pi

EMDB-14442:
E. coli C-P lyase bound to PhnK/PhnL dual ABC dimer with AMPPNP and PhnK E171Q mutation

PDB-7z15:
E. coli C-P lyase bound to a PhnK/PhnL dual ABC dimer and ADP + Pi

PDB-7z16:
E. coli C-P lyase bound to PhnK/PhnL dual ABC dimer with AMPPNP and PhnK E171Q mutation

EMDB-14443:
E. coli C-P lyase bound to a PhnK ABC dimer in an open conformation

EMDB-14444:
E. coli C-P lyase bound to a PhnK ABC dimer and ATP

EMDB-14445:
E. coli C-P lyase bound to a single PhnK ABC domain

PDB-7z17:
E. coli C-P lyase bound to a PhnK ABC dimer in an open conformation

PDB-7z18:
E. coli C-P lyase bound to a PhnK ABC dimer and ATP

PDB-7z19:
E. coli C-P lyase bound to a single PhnK ABC domain

EMDB-12827:
Structure of the mini-RNA-guided endonuclease CRISPR-Cas_phi3

PDB-7odf:
Structure of the mini-RNA-guided endonuclease CRISPR-Cas_phi3

EMDB-10102:
Type III-B Cmr-beta Cryo-EM structure of the Apo state

EMDB-10117:
Cryo-EM structure of the Type III-B Cmr-beta bound to cognate target RNA and AMPPnP, state 1

EMDB-10119:
Cryo-EM structure of the type III-B Cmr-beta complex bound to non-cognate target RNA

EMDB-10126:
Cryo-EM structure of the Type III-B Cmr-beta bound to cognate target RNA and AMPPnP, state 2

EMDB-10196:
Cryo-EM structure of the Type III-B Cmr-beta bound to cognate target RNA and AMPPnP, state 2, in the presence of ssDNA

EMDB-10197:
Cryo-EM structure of the Type III-B Cmr-beta bound to cognate target RNA and AMPPnP, state 1, in the presence of ssDNA

EMDB-10209:
Cryo-EM structure of the Type III-B Cmr-beta bound to cognate target RNA

PDB-6s6b:
Type III-B Cmr-beta Cryo-EM structure of the Apo state

PDB-6s8b:
Cryo-EM structure of the Type III-B Cmr-beta bound to cognate target RNA and AMPPnP, state 1

PDB-6s8e:
Cryo-EM structure of the type III-B Cmr-beta complex bound to non-cognate target RNA

PDB-6s91:
Cryo-EM structure of the Type III-B Cmr-beta bound to cognate target RNA and AMPPnP, state 2

PDB-6sh8:
Cryo-EM structure of the Type III-B Cmr-beta bound to cognate target RNA and AMPPnP, state 2, in the presence of ssDNA

PDB-6shb:
Cryo-EM structure of the Type III-B Cmr-beta bound to cognate target RNA and AMPPnP, state 1, in the presence of ssDNA

PDB-6sic:
Cryo-EM structure of the Type III-B Cmr-beta bound to cognate target RNA

EMDB-4691:
Reconstruction of the CRISPR-associated hexameric RNase Csx1 from Sulfolobus islandicus

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は? / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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