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6MDH	X-ray crystal structure of ISG15 from Myotis davidii 分子名称: Ubiquitin-like protein ISG15 著者 Goodwin, O.Y, Langley, C.A, Dzimianski, J.V, Daczkowski, C.M, Pegan, S.D. 登録日 2018-09-04 公開日 2018-12-12 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.37 Å) 主引用文献 Structure of interferon-stimulated gene product 15 (ISG15) from the bat species Myotis davidii and the impact of interdomain ISG15 interactions on viral protein engagement. Acta Crystallogr D Struct Biol, 75, 2019
5OXI	C-terminally retracted ubiquitin L67S mutant 分子名称: SULFATE ION, Ubiquitin L67S mutant 著者 Gladkova, C.G, Schubert, A.F, Wagstaff, J.L, Pruneda, J.N, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2017-09-06 公開日 2017-11-22 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.63 Å) 主引用文献 An invisible ubiquitin conformation is required for efficient phosphorylation by PINK1. EMBO J., 36, 2017
5OXH	C-terminally retracted ubiquitin T66V/L67N mutant 分子名称: SULFATE ION, Ubiquitin T66V/L67N mutant 著者 Gladkova, C, Schubert, A.F, Wagstaff, J.L, Pruneda, J.P, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2017-09-06 公開日 2017-11-22 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.601 Å) 主引用文献 An invisible ubiquitin conformation is required for efficient phosphorylation by PINK1. EMBO J., 36, 2017
6NJD	Crystal structure of RavD (residues 1-200) from Legionella pneumophila (strain Corby) complexed with Met-1 linked di-ubiquitin 分子名称: Di-ubiquitin, MAGNESIUM ION, RavD 著者 Wang, X, Zhou, Y, Zhu, Y. 登録日 2019-01-03 公開日 2019-05-22 最終更新日 2020-01-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.05 Å) 主引用文献 A bacterial effector deubiquitinase specifically hydrolyses linear ubiquitin chains to inhibit host inflammatory signalling. Nat Microbiol, 4, 2019
5OHM	K33-specific affimer bound to K33 diUb 分子名称: K33-specific affimer, POLYETHYLENE GLYCOL (N=34), Polyubiquitin-C 著者 Michel, M.A, Komander, D. 登録日 2017-07-17 公開日 2017-10-04 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.8 Å) 主引用文献 Ubiquitin Linkage-Specific Affimers Reveal Insights into K6-Linked Ubiquitin Signaling. Mol. Cell, 68, 2017
3H7P	Crystal structure of K63-linked di-ubiquitin 分子名称: CADMIUM ION, Ubiquitin 著者 Weeks, S.D, Grasty, K.C, Hernandez-Cuebas, L, Loll, P.J. 登録日 2009-04-28 公開日 2009-09-22 最終更新日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Crystal structures of Lys-63-linked tri- and di-ubiquitin reveal a highly extended chain architecture. Proteins, 77, 2009
3H1U	Structure of ubiquitin in complex with Cd ions 分子名称: CADMIUM ION, Ubiquitin 著者 Qureshi, I.A, Ferron, F, Cheung, P, Lescar, J. 登録日 2009-04-14 公開日 2009-05-05 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 Crystallographic structure of ubiquitin in complex with cadmium ions BMC RES NOTES, 2, 2009
3H7S	Crystal structures of K63-linked di- and tri-ubiquitin reveal a highly extended chain architecture 分子名称: Ubiquitin, ZINC ION 著者 Weeks, S.D, Grasty, K.C, Hernandez-Cuebas, L, Loll, P.J. 登録日 2009-04-28 公開日 2009-09-22 最終更新日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Crystal structures of Lys-63-linked tri- and di-ubiquitin reveal a highly extended chain architecture. Proteins, 77, 2009
3HM3	The Structure and conformation of Lys-63 linked tetra-ubiquitin 分子名称: Ubiquitin, ZINC ION 著者 Datta, A.B, Hura, G.L, Wolberger, C. 登録日 2009-05-28 公開日 2009-08-25 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.96 Å) 主引用文献 The structure and conformation of Lys63-linked tetraubiquitin. J.Mol.Biol., 392, 2009
4ZPZ	Crystal Structure of Semi-synthetic Ubiquitin with Phospho-Ser65 and Ala46Cys 分子名称: Polyubiquitin-B 著者 Han, C, Virdee, S. 登録日 2015-05-08 公開日 2015-06-10 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.54 Å) 主引用文献 A Versatile Strategy for the Semisynthetic Production of Ser65 Phosphorylated Ubiquitin and Its Biochemical and Structural Characterisation. Chembiochem, 16, 2015
4ZQS	New compact conformation of linear Ub2 structure 分子名称: ubiquitin 著者 Thach, T.T, Shin, D, Han, S, Lee, S. 登録日 2015-05-11 公開日 2016-04-20 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.804 Å) 主引用文献 New conformations of linear polyubiquitin chains from crystallographic and solution-scattering studies expand the conformational space of polyubiquitin. Acta Crystallogr D Struct Biol, 72, 2016
4Z9S	Non-covalent assembly of monoubiquitin that mimics K11 poly-ubiquitin 分子名称: MALONIC ACID, THIOCYANATE ION, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a 著者 Levin-Kravets, O, Prag, G. 登録日 2015-04-11 公開日 2015-07-29 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Tetrameric Assembly of Monoubiquitin Accurately Mimics the Lys11 Polyubiquitin Chain Structure. Biochemistry, 54, 2015
6NXL	Ubiquitin binding variants 分子名称: Polyubiquitin-B 著者 Miller, D.J, Watson, E.R. 登録日 2019-02-08 公開日 2020-01-15 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.803 Å) 主引用文献 Protein engineering of a ubiquitin-variant inhibitor of APC/C identifies a cryptic K48 ubiquitin chain binding site. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 116, 2019
6OQ1	Crystal Structure of Branched K11/K48-Linked Tri-Ubiquitin 分子名称: Ubiquitin 著者 Boughton, A.J, Fushman, D. 登録日 2019-04-25 公開日 2019-10-23 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Branching via K11 and K48 Bestows Ubiquitin Chains with a Unique Interdomain Interface and Enhanced Affinity for Proteasomal Subunit Rpn1. Structure, 28, 2020
5AF5	Structure of Lys33-linked triUb S.G. P 212121 分子名称: POLYUBIQUITIN-C 著者 Michel, M.A, Elliott, P.R, Swatek, K.N, Simicek, M, Pruneda, J.N, Wagstaff, J.L, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2015-01-19 公開日 2015-03-25 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.68 Å) 主引用文献 Assembly and Specific Recognition of K29- and K33-Linked Polyubiquitin. Mol.Cell, 58, 2015
5AF4	Structure of Lys33-linked diUb 分子名称: GLYCEROL, SULFATE ION, UBIQUITIN 著者 Michel, M.A, Elliott, P.R, Swatek, K.N, Simicek, M, Pruneda, J.N, Wagstaff, J.L, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2015-01-19 公開日 2015-03-25 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Assembly and Specific Recognition of K29- and K33-Linked Polyubiquitin. Mol.Cell, 58, 2015
6FJ7	Caldiarchaeum Subterraneum Ubiquitin 分子名称: SULFATE ION, Ubiquitin-like protein 著者 Wojtynek, M, Martin, J, Hartmann, M.D. 登録日 2018-01-21 公開日 2018-07-25 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.05 Å) 主引用文献 Rpn11-mediated ubiquitin processing in an ancestral archaeal ubiquitination system. Nat Commun, 9, 2018
6OQ2	NMR Structure of Branched K11/K48-Linked Tri-Ubiquitin 分子名称: Ubiquitin 著者 Boughton, A.J, Fushman, D. 登録日 2019-04-25 公開日 2019-10-23 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Branching via K11 and K48 Bestows Ubiquitin Chains with a Unique Interdomain Interface and Enhanced Affinity for Proteasomal Subunit Rpn1. Structure, 28, 2020
5CHW	Structure of ISG15 in space group P212121 分子名称: GLYCEROL, SULFATE ION, Ubiquitin-like protein ISG15 著者 Fritz, G, Basters, A. 登録日 2015-07-10 公開日 2016-09-28 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Structure of ISG15 in space group P212121 To Be Published
5CHF	Crystal structure of murine ISG15 in space group P21212 分子名称: GLYCEROL, SULFATE ION, Ubiquitin-like protein ISG15 著者 Fritz, G, Basters, A. 登録日 2015-07-10 公開日 2016-09-28 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Crystal structure of murine ISG15 in space group P21212 To Be Published
6P81	Structure of DNA polymerase III, beta subunit/ beta sliding clamp from Klebsiella pneumoniae, expressed with an N-terminal His-Smt3 fusion tag, in complex with Griselimycin 分子名称: 1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE, ACETATE ION, CALCIUM ION, ... 著者 Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID) 登録日 2019-06-06 公開日 2019-07-10 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.75 Å) 主引用文献 Structure of DNA polymerase III, beta subunit/ beta sliding clamp from Klebsiella pneumoniae, expressed with an N-terminal His-Smt3 fusion tag, in complex with Griselimycin to be published
6E2B	Ubiquitin in complex with Pt(2-phenilpyridine)(PPh3) 分子名称: GLYCEROL, SULFATE ION, Ubiquitin, ... 著者 Zhemkov, V.A, Kim, M. 登録日 2018-07-11 公開日 2018-11-14 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.45 Å) 主引用文献 Reactions of Cyclometalated Platinum(II) [Pt(N∧C)(PR3)Cl] Complexes with Imidazole and Imidazole-Containing Biomolecules: Fine-Tuning of Reactivity and Photophysical Properties via Ligand Design. Inorg Chem, 58, 2019
8DMQ	Crystal structure of Legionella pneumophila macrodomain MavL in complex with ubiquitin vinyl methyl ester 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, CITRATE ANION, METHYL 4-AMINOBUTANOATE, ... 著者 Zhang, Z, Das, C. 登録日 2022-07-08 公開日 2023-07-12 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.195 Å) 主引用文献 Structure of Legionella pneumophila macrodomain effector MavL in complex with ubiquitin vinyl methyl ester To Be Published
8E7O	CRYSTAL STRUCTURE OF LYS48-LINKED TETRAUBIQUITIN 分子名称: SULFATE ION, Ubiquitin 著者 Lemma, B.E, Fushman, D. 登録日 2022-08-24 公開日 2022-11-02 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) 主引用文献 Mechanism of selective recognition of Lys48-linked polyubiquitin by macrocyclic peptide inhibitors of proteasomal degradation. Nat Commun, 14, 2023
7RMA	Structure of the fourth UIM (Ubiquitin Interacting Motif) of ANKRD13D in complex with a high affinity UbV (Ubiquitin Variant) 分子名称: Ankyrin repeat domain-containing protein 13D, SODIUM ION, SULFATE ION, ... 著者 Singer, A.U, Manczyk, N, Veggiani, G, Sicheri, F, Sidhu, S.S. 登録日 2021-07-27 公開日 2022-05-11 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 Panel of Engineered Ubiquitin Variants Targeting the Family of Human Ubiquitin Interacting Motifs. Acs Chem.Biol., 17, 2022

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