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4K3M	E.coli sliding clamp in complex with AcALDLF peptide 分子名称: ALDLF, CALCIUM ION, DI(HYDROXYETHYL)ETHER, ... 著者 Yin, Z, Oakley, A.J. 登録日 2013-04-11 公開日 2013-05-01 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Structural and Thermodynamic Dissection of Linear Motif Recognition by the E. coli Sliding Clamp J.Med.Chem., 56, 2013
4JBA	Crystal Structure of the Oxidized Form of MarR from E.coli 分子名称: Multiple antibiotic resistance protein MarR 著者 Lou, H, Zhu, R, Hao, Z. 登録日 2013-02-19 公開日 2013-10-16 最終更新日 2014-04-09 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 The multiple antibiotic resistance regulator MarR is a copper sensor in Escherichia coli. Nat.Chem.Biol., 10, 2014
7S3L	Structure of Bacillus subtilis CcrZ (previously called YtmP) 分子名称: Aminoglycoside phosphotransferase family protein, PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER 著者 Nandakumar, J, Wozniak, K.J. 登録日 2021-09-07 公開日 2022-05-11 最終更新日 2022-06-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Structure and kinase activity of bacterial cell cycle regulator CcrZ. Plos Genet., 18, 2022
1HIO	HISTONE OCTAMER (CHICKEN), CHROMOSOMAL PROTEIN, ALPHA CARBONS ONLY 分子名称: HISTONE H2A, HISTONE H2B, HISTONE H3, ... 著者 Arents, G, Moudrianakis, E.N. 登録日 1991-09-19 公開日 1998-11-25 最終更新日 2024-02-07 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.1 Å) 主引用文献 The nucleosomal core histone octamer at 3.1 A resolution: a tripartite protein assembly and a left-handed superhelix. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 88, 1991
4G8X	G1 ORF67 / Staphyloccus aureus sigmaA domain 4 complex 分子名称: ORF067, RNA polymerase sigma factor rpoD 著者 Darst, S.A, Osmundson, J.S, Montero-Diaz, C.M, Hochschild, A. 登録日 2012-07-23 公開日 2013-08-07 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.001 Å) 主引用文献 Promoter-specific transcription inhibition in Staphylococcus aureus by a phage protein. Cell(Cambridge,Mass.), 151, 2012
4G6D	G1 ORF67 / Staphyloccus aureus sigmaA domain 4 complex 分子名称: ORF067, RNA polymerase sigma factor rpoD 著者 Darst, S.A, Osmundson, J.S. 登録日 2012-07-18 公開日 2013-01-23 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9971 Å) 主引用文献 Promoter-specific transcription inhibition in Staphylococcus aureus by a phage protein. Cell(Cambridge,Mass.), 151, 2012
2RGV	The crystal structure of PerR-Ox highlights 2-oxo-Histidine formation 分子名称: Peroxide operon regulator, ZINC ION 著者 Traore, D.A.K. 登録日 2007-10-05 公開日 2008-10-14 最終更新日 2011-07-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.05 Å) 主引用文献 Structural and functional characterization of 2-oxo-histidine in oxidized PerR protein. Nat.Chem.Biol., 5, 2009
4XR8	Crystal structure of the HPV16 E6/E6AP/p53 ternary complex at 2.25 A resolution 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, Cellular tumor antigen p53, DI(HYDROXYETHYL)ETHER, ... 著者 Martinez-Zapien, D, Ruiz, F.X, Mitschler, A, Podjarny, A, Trave, G, Zanier, K. 登録日 2015-01-20 公開日 2016-02-03 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.25 Å) 主引用文献 Structure of the E6/E6AP/p53 complex required for HPV-mediated degradation of p53. Nature, 529, 2016
1I9K	THE RNA I-MOTIF 分子名称: 5'-R(*UP*CP*CP*CP*CP*C)-3' 著者 Snoussi, K, Nonin-Lecomte, S, Lerou, J.L. 登録日 2001-03-20 公開日 2001-05-30 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 The RNA i-motif. J.Mol.Biol., 309, 2001
6Y6X	Tetracenomycin X bound to the human ribosome 分子名称: 28S ribosomal RNA, 5.8S ribosomal RNA, 5S ribosomal RNA, ... 著者 Buschauer, R, Cheng, J, Berninghausen, O, Beckmann, R, Wilson, D.N. 登録日 2020-02-27 公開日 2020-07-08 最終更新日 2023-11-08 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (2.8 Å) 主引用文献 Tetracenomycin X inhibits translation by binding within the ribosomal exit tunnel. Nat.Chem.Biol., 16, 2020
4BY7	elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex 分子名称: , 5'-D(*DAP*AP*AP*GP*TP*AP*CP*TP*TP*GP*AP*GP*CP*DTP)-3', 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID, ... 著者 Kinkelin, K, Wozniak, G.G, Rothbart, S.B, Lidschreiber, M, Strahl, B.D, Cramer, P. 登録日 2013-07-18 公開日 2013-09-11 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.15 Å) 主引用文献 Structures of RNA polymerase II complexes with Bye1, a chromatin-binding PHF3/DIDO homologue. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 110, 2013
6YVV	Condensin complex from S.cerevisiae ATP-free apo bridged state 分子名称: Condensin complex subunit 1,Ycs4, Condensin complex subunit 2,Brn1, Structural maintenance of chromosomes protein 2,Structural maintenance of chromosomes protein 2, ... 著者 Lee, B.-G, Cawood, C, Gutierrez-Escribano, P, Nakane, T, Merkel, F, Hassler, M, Haering, C.H, Aragon, L, Lowe, J. 登録日 2020-04-28 公開日 2020-07-15 最終更新日 2024-05-22 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (7.5 Å) 主引用文献 Cryo-EM structures of holo condensin reveal a subunit flip-flop mechanism. Nat.Struct.Mol.Biol., 27, 2020
6YVU	Condensin complex from S.cerevisiae ATP-free apo non-engaged state 分子名称: Condensin complex subunit 1,Condensin complex subunit 1,Ycs4, Condensin complex subunit 2,Condensin complex subunit 2,Brn1, Structural maintenance of chromosomes protein 2,Structural maintenance of chromosomes protein 2,Smc2, ... 著者 Lee, B.-G, Cawood, C, Gutierrez-Escribano, P, Nakane, T, Merkel, F, Hassler, M, Aragon, L, Haering, C.H, Lowe, J. 登録日 2020-04-28 公開日 2020-07-15 最終更新日 2024-05-22 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (7.5 Å) 主引用文献 Cryo-EM structures of holo condensin reveal a subunit flip-flop mechanism. Nat.Struct.Mol.Biol., 27, 2020
2K86	Solution Structure of FOXO3a Forkhead domain 分子名称: Forkhead box protein O3 著者 Wang, F, Marshall, C.B, Li, G, Plevin, M.J, Ikura, M. 登録日 2008-09-02 公開日 2008-10-14 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Biochemical and structural characterization of an intramolecular interaction in FOXO3a and its binding with p53. J.Mol.Biol., 384, 2008
5IY4	Crystal structure of human PCNA in complex with the PIP box of DVC1 分子名称: DVC1 PIP box, Proliferating cell nuclear antigen 著者 Jiang, T, Xu, M, Wang, Y. 登録日 2016-03-24 公開日 2016-06-08 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.945 Å) 主引用文献 Crystal structure of human PCNA in complex with the PIP box of DVC1 Biochem.Biophys.Res.Commun., 474, 2016
4BY1	elongating RNA Polymerase II-Bye1 TLD complex soaked with AMPCPP 分子名称: 5'-D(*AP*AP*AP*GP*TP*AP*CP*TP*TP*GP*AP*GP*CP*TP)-3', 5'-D(*AP*GP*CP*TP*CP*AP*AP*GP*TP*AP*CP*TP*TP*AP *TP*TP*CP*CP*BRUP*GP*GP*TP*CP*AP*AP*T)-3', 5'-R(*UP*UP*CP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*AP)-3', ... 著者 Kinkelin, K, Wozniak, G.G, Rothbart, S.B, Lidschreiber, M, Strahl, B.D, Cramer, P. 登録日 2013-07-17 公開日 2013-09-11 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.6 Å) 主引用文献 Structures of RNA Polymerase II Complexes with Bye1, a Chromatin-Binding Phf3/Dido1 Homologue Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
4G94	G1 ORF67 / Staphyloccus aureus sigmaA domain 4 complex 分子名称: ORF067, RNA polymerase sigma factor rpoD 著者 Darst, S.A, Osmundson, J.S, Montero-Diaz, C.M, Hochschild, A. 登録日 2012-07-23 公開日 2013-01-23 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9971 Å) 主引用文献 Promoter-specific transcription inhibition in Staphylococcus aureus by a phage protein. Cell(Cambridge,Mass.), 151, 2012
5ZZ5	Redox-sensing transcriptional repressor Rex 分子名称: GLYCEROL, Redox-sensing transcriptional repressor Rex 著者 Park, Y.W, Jang, Y.Y, Joo, H.K, Lee, J.Y. 登録日 2018-05-30 公開日 2018-11-07 最終更新日 2024-03-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 Structural Analysis of Redox-sensing Transcriptional Repressor Rex from Thermotoga maritima Sci Rep, 8, 2018
1A6I	TET REPRESSOR, CLASS D VARIANT 分子名称: TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN CLASS D 著者 Orth, P, Cordes, F, Schnappinger, D, Hillen, W, Saenger, W, Hinrichs, W. 登録日 1998-02-25 公開日 1999-03-02 最終更新日 2024-05-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å) 主引用文献 Conformational changes of the Tet repressor induced by tetracycline trapping. J.Mol.Biol., 279, 1998
4LD5	Crystal structure of MepR Q18P mutant from multidrug resistant S. aureus clinical isolate 分子名称: MepR, SULFATE ION 著者 Birukou, I, Brennan, R.G. 登録日 2013-06-24 公開日 2013-09-11 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å) 主引用文献 The molecular mechanisms of allosteric mutations impairing MepR repressor function in multidrug-resistant strains of Staphylococcus aureus. MBio, 4, 2013
4L9T	Crystal structure of MepR F27L mutant from multidrug resistant S. aureus clinical isolate 分子名称: MepR, SULFATE ION 著者 Birukou, I, Brennan, R.G. 登録日 2013-06-18 公開日 2013-09-11 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.794 Å) 主引用文献 The molecular mechanisms of allosteric mutations impairing MepR repressor function in multidrug-resistant strains of Staphylococcus aureus. MBio, 4, 2013
3R0J	Structure of PhoP from Mycobacterium tuberculosis 分子名称: POSSIBLE TWO COMPONENT SYSTEM RESPONSE TRANSCRIPTIONAL POSITIVE REGULATOR PHOP, R-1,2-PROPANEDIOL, SULFATE ION 著者 Menon, S, Wang, S. 登録日 2011-03-08 公開日 2011-07-13 最終更新日 2014-10-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Structure of the Response Regulator PhoP from Mycobacterium tuberculosis Reveals a Dimer through the Receiver Domain. Biochemistry, 50, 2011
7ZWC	Structure of SNAPc:TBP-TFIIA-TFIIB sub-complex bound to U5 snRNA promoter 分子名称: Non-template strand, TATA-box-binding protein, Template strand, ... 著者 Rengachari, S, Schilbach, S, Kaliyappan, T, Gouge, J, Zumer, K, Schwarz, J, Urlaub, H, Dienemann, C, Vannini, A, Cramer, P. 登録日 2022-05-19 公開日 2022-11-30 最終更新日 2024-07-24 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.2 Å) 主引用文献 Structural basis of SNAPc-dependent snRNA transcription initiation by RNA polymerase II. Nat.Struct.Mol.Biol., 29, 2022
4L9N	Crystal structure of MepR A103V mutant from multidrug resistant S. aureus clinical isolate 分子名称: MepR, SULFATE ION 著者 Birukou, I, Brennan, R.G. 登録日 2013-06-18 公開日 2013-09-11 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.6 Å) 主引用文献 The molecular mechanisms of allosteric mutations impairing MepR repressor function in multidrug-resistant strains of Staphylococcus aureus. MBio, 4, 2013
7PT0	SCO3201 with putative ligand 分子名称: SPERMIDINE, TetR family transcriptional regulator 著者 Werten, S, Palm, G.J, Hinrichs, W. 登録日 2021-09-25 公開日 2021-10-20 最終更新日 2024-02-07 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.89 Å) 主引用文献 Crystal structures of free and ligand-bound forms of the TetR/AcrR-like regulator SCO3201 from Streptomyces coelicolor suggest a novel allosteric mechanism. Febs J., 290, 2023

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