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6P45	Crystal structure of the G-quadruplex formed by (TGGGT)4 in complex with N-methylmesoporphryin IX 分子名称: DNA (5'-D(P*TP*GP*GP*GP*TP*TP*GP*GP*GP*TP*TP*GP*GP*GP*TP*TP*GP*GP*GP*T)-3'), N-METHYLMESOPORPHYRIN, POTASSIUM ION 著者 Yatsunyk, L.A, Lin, L.Y. 登録日 2019-05-26 公開日 2020-05-27 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.339 Å) 主引用文献 Biophysical and X-ray structural studies of the (GGGTT)3GGG G-quadruplex in complex with N-methyl mesoporphyrin IX. Plos One, 15, 2020
7E5P	Aptamer enhancing peroxidase activity of myoglobin 分子名称: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*TP*GP*GP*GP*TP*TP*GP*GP*GP*AP*GP*GP*G)-3') 著者 Tsukakoshi, K, Matsugami, A, Khunathai, K, Kanazashi, M, Yamagishi, Y, Nakama, K, Oshikawa, D, Hayashi, F, Kuno, H, Ikebukuro, K. 登録日 2021-02-19 公開日 2021-06-16 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 G-quadruplex-forming aptamer enhances the peroxidase activity of myoglobin against luminol. Nucleic Acids Res., 49, 2021
1Q57	The Crystal Structure of the Bifunctional Primase-Helicase of Bacteriophage T7 分子名称: DNA primase/helicase 著者 Toth, E.A, Li, Y, Sawaya, M.R, Cheng, Y, Ellenberger, T. 登録日 2003-08-06 公開日 2003-11-25 最終更新日 2024-02-14 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.45 Å) 主引用文献 The Crystal Structure of the Bifunctional Primase-Helicase of Bacteriophage T7 Mol.Cell, 12, 2003
7UTT	Structure of Non-hydrolyzable ATP (ApCpp) binds to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mn coordination 分子名称: Cyclic GMP-AMP synthase, DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER, MANGANESE (II) ION, ... 著者 Wu, S, Gabelli, S.B, Sohn, J. 登録日 2022-04-27 公開日 2023-05-03 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.04 Å) 主引用文献 Structure of Non-hydrolyzable ATP (ApCpp) binds to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mn coordination To Be Published
7UUX	ATP binds to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mg coordination 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, Cyclic GMP-AMP synthase, MAGNESIUM ION, ... 著者 Wu, S, Gabelli, S.B, Sohn, J. 登録日 2022-04-29 公開日 2023-05-03 最終更新日 2024-05-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.26 Å) 主引用文献 The structural basis for 2'-5'/3'-5'-cGAMP synthesis by cGAS Nat Commun, 15, 2024
7UXW	Structure of ATP and GTP bind to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mg coordination 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, Cyclic GMP-AMP synthase, GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, ... 著者 Wu, S, Gabelli, S.B, Sohn, J. 登録日 2022-05-06 公開日 2023-05-10 最終更新日 2024-05-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.57 Å) 主引用文献 The structural basis for 2'-5'/3'-5'-cGAMP synthesis by cGAS Nat Commun, 15, 2024
7UYQ	Structure of GTP binds to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mg coordination 分子名称: Cyclic GMP-AMP synthase, GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, MAGNESIUM ION, ... 著者 Wu, S, Gabelli, S.B, Sohn, J. 登録日 2022-05-07 公開日 2023-05-10 最終更新日 2024-05-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.57 Å) 主引用文献 The structural basis for 2'-5'/3'-5'-cGAMP synthesis by cGAS Nat Commun, 15, 2024
4BJ5	Crystal structure of Rif2 in complex with the C-terminal domain of Rap1 (Rap1-RCT) 分子名称: DNA-BINDING PROTEIN RAP1, PROTEIN RIF2, SULFATE ION 著者 Shi, T, Bunker, R.D, Gut, H, Scrima, A, Thoma, N.H. 登録日 2013-04-16 公開日 2013-06-19 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.29 Å) 主引用文献 Rif1 and Rif2 Shape Telomere Funcation and Architecture Through Multivalent RAP1 Interactions Cell(Cambridge,Mass.), 153, 2013
1AZO	DNA MISMATCH REPAIR PROTEIN MUTH FROM E. COLI 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, MUTH 著者 Yang, W. 登録日 1997-11-19 公開日 1998-05-20 最終更新日 2024-06-05 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) 主引用文献 Structural basis for MutH activation in E.coli mismatch repair and relationship of MutH to restriction endonucleases. EMBO J., 17, 1998
4BJ6	Crystal structure Rif2 in complex with the C-terminal domain of Rap1 (Rap1-RCT) 分子名称: DNA-BINDING PROTEIN RAP1, RAP1-INTERACTING FACTOR 2, SULFATE ION 著者 Shi, T, Bunker, R.D, Gut, H, Scrima, A, Thoma, N.H. 登録日 2013-04-16 公開日 2013-06-19 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.26 Å) 主引用文献 Rif1 and Rif2 Shape Telomere Funcation and Architecture Through Multivalent RAP1 Interactions Cell(Cambridge,Mass.), 153, 2013
1T4G	ATPase in complex with AMP-PNP 分子名称: DNA repair and recombination protein radA, MAGNESIUM ION, PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER 著者 Wu, Y, He, Y, Moya, I.A, Qian, X, Luo, Y. 登録日 2004-04-29 公開日 2004-08-17 最終更新日 2023-08-23 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 Crystal Structure of Archaeal Recombinase RadA; A Snapshot of Its Extended Conformation. Mol.Cell, 15, 2004
1MA8	A-DNA decamer GCGTA(UMS)ACGC with incorporated 2'-methylseleno-uridine 分子名称: 5'-D(*GP*CP*GP*TP*AP*UMSP*AP*CP*GP*C)-3' 著者 Teplova, M, Wilds, C.J, Wawrzak, Z, Tereshko, V, Du, Q, Carrasco, N, Huang, Z, Egli, M. 登録日 2002-08-01 公開日 2002-12-11 最終更新日 2024-02-14 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.3 Å) 主引用文献 Covalent incorporation of selenium into oligonucleotides for X-ray crystal structure determination via MAD: proof of principle BIOCHIMIE, 84, 2002
1SAA	ATF-2 RECOGNITION SITE, NMR, 10 STRUCTURES 分子名称: DNA (5'-D(*CP*AP*TP*GP*TP*GP*AP*CP*GP*TP*CP*AP*CP*AP*TP*G)-3') 著者 Conte, M.R, Lane, A.N, Bloomberg, G. 登録日 1997-08-19 公開日 1997-11-12 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of the ATF-2 recognition site and its interaction with the ATF-2 peptide. Nucleic Acids Res., 25, 1997
8JIC	human telomere two-quartet G-quadruplex at pH 7.0 分子名称: DNA (5'-D(*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*G)-3') 著者 Wang, B, Galer, P, Plavec, J. 登録日 2023-05-26 公開日 2024-04-03 最終更新日 2024-05-08 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Unveiling the structural mechanism of a G-quadruplex pH-Driven switch. Biochimie, 214, 2023
8JIH	human telomere two-quartet G-quadruplex at pH 5.0 分子名称: DNA (5'-D(*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*G)-3') 著者 Wang, B, Galer, P, Plavec, J. 登録日 2023-05-26 公開日 2024-04-03 最終更新日 2024-05-08 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Unveiling the structural mechanism of a G-quadruplex pH-Driven switch. Biochimie, 214, 2023
3JVE	Crystal Structure of the Sixth BRCT Domain of TopBP1 分子名称: DNA topoisomerase 2-binding protein 1 著者 Leung, C.C, Kellogg, E, Baker, D, Glover, J.N.M. 登録日 2009-09-16 公開日 2010-01-19 最終更新日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.34 Å) 主引用文献 Insights from the crystal structure of the sixth BRCT domain of topoisomerase IIbeta binding protein 1. Protein Sci., 19, 2010
8OFC	Structure of an i-motif domain with the cytosine analog 1,3-diaza-2-oxophenoxacione (tC) at neutral pH 分子名称: DNA (5'-D(*CP*(YCO)P*GP*TP*TP*CP*(DNR)P*GP*TP*TP*TP*TP*TP*CP*CP*GP*TP*TP*CP*(DNR)P*GP*T)-3') 著者 Mir, B, Serrano-Chacon, I, Terrazas, M, Gandioso, A, Garavis, M, Orozco, M, Escaja, N, Gonzalez, C. 登録日 2023-03-15 公開日 2024-02-07 最終更新日 2024-04-24 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Site-specific incorporation of a fluorescent nucleobase analog enhances i-motif stability and allows monitoring of i-motif folding inside cells. Nucleic Acids Res., 52, 2024
5B24	The crystal structure of the nucleosome containing cyclobutane pyrimidine dimer 分子名称: DNA (145-MER), Histone H2A type 1-B/E, Histone H2B type 1-J, ... 著者 Horikoshi, N, Tachiwana, H, Kagawa, W, Osakabe, A, Kurumizaka, H. 登録日 2015-12-31 公開日 2016-03-02 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.6 Å) 主引用文献 Crystal structure of the nucleosome containing ultraviolet light-induced cyclobutane pyrimidine dimer Biochem.Biophys.Res.Commun., 471, 2016
7UV9	KDM2A-nucleosome structure stabilized by H3K36C-UNC8015 covalent conjugate 分子名称: DNA (185-MER), FE (III) ION, Histone H2A type 1, ... 著者 Spangler, C.J, Skrajna, A, Foley, C.A, Budziszewski, G.R, Azzam, D.N, James, L.I, Frye, S.V, McGinty, R.K. 登録日 2022-04-29 公開日 2023-02-22 最終更新日 2024-06-12 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.2 Å) 主引用文献 Structural basis of paralog-specific KDM2A/B nucleosome recognition. Nat.Chem.Biol., 19, 2023
3NTU	RADA RECOMBINASE D302K MUTANT IN COMPLEX with AMP-PNP 分子名称: DNA repair and recombination protein radA, MAGNESIUM ION, PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER, ... 著者 Luo, Y. 登録日 2010-07-05 公開日 2011-07-27 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 RAD51 protein ATP cap regulates nucleoprotein filament stability. J.Biol.Chem., 287, 2012
1VT7	Structures of the mismatched duplex D(GGGTGCCC) 分子名称: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*TP*GP*CP*CP*C)-3') 著者 Rabinovich, D, Haran, T, Eisenstein, M, Shakked, Z. 登録日 1996-12-02 公開日 2011-07-13 最終更新日 2023-12-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Structures of the mismatched duplex d(GGGTGCCC) and one of its Watson-Crick analogues d(GGGCGCCC). J.Mol.Biol., 200, 1988
4Z9E	Alba from Thermoplasma volcanium 分子名称: DNA/RNA-binding protein Alba 著者 Ma, C, Lee, S.J, Pathak, C, Lee, B.J. 登録日 2015-04-10 公開日 2016-02-24 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.49 Å) 主引用文献 Alba from Thermoplasma volcanium belongs to alpha-NAT's: An insight into the structural aspects of Tv Alba and its acetylation by Tv Ard1. Arch.Biochem.Biophys., 590, 2016
5I2V	NMR structure of a new G-quadruplex forming sequence within the KRAS proto-oncogene promoter region 分子名称: DNA (5'-D(*AP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*TP*GP*TP*GP*GP*GP*AP*AP*TP*AP*GP*GP*GP*AP*A)-3'), POTASSIUM ION 著者 Salgado, G.F, Kerkour, A, Mergny, J.-L. 登録日 2016-02-09 公開日 2016-03-16 最終更新日 2024-06-19 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 High-resolution three-dimensional NMR structure of the KRAS proto-oncogene promoter reveals key features of a G-quadruplex involved in transcriptional regulation. J. Biol. Chem., 292, 2017
6SEG	Class1: CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 分子名称: DNA (145-MER), Histone H2A type 2-A, Histone H2B type 1-C/E/F/G/I, ... 著者 Ali-Ahmad, A, Bilokapic, S, Schafer, I.B, Halic, M, Sekulic, N. 登録日 2019-07-30 公開日 2019-08-14 最終更新日 2024-05-22 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.1 Å) 主引用文献 CENP-C unwraps the human CENP-A nucleosome through the H2A C-terminal tail. Embo Rep., 20, 2019
6SE0	Class 1 : CENP-A nucleosome 分子名称: DNA (145-MER), Histone H2A type 2-A, Histone H2B type 1-C/E/F/G/I, ... 著者 Ali-Ahmad, A, Bilokapic, S, Schafer, I.B, Halic, M, Sekulic, N. 登録日 2019-07-29 公開日 2019-08-14 最終更新日 2024-05-22 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.8 Å) 主引用文献 CENP-C unwraps the human CENP-A nucleosome through the H2A C-terminal tail. Embo Rep., 20, 2019

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