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6T7C	Structure of two copies of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 分子名称: DNA (147-MER), Histone H2A type 1-B/E, Histone H2B type 1-K, ... 著者 Dodonova, S.O, Zhu, F, Dienemann, C, Taipale, J, Cramer, P. 登録日 2019-10-21 公開日 2020-04-29 最終更新日 2024-05-22 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4 Å) 主引用文献 Nucleosome-bound SOX2 and SOX11 structures elucidate pioneer factor function. Nature, 580, 2020
6T7B	Structure of human Sox2 transcription factor in complex with a nucleosome 分子名称: DNA (147-MER), Histone H2A type 1-B/E, Histone H2B type 1-K, ... 著者 Dodonova, S.O, Zhu, F, Dienemann, C, Taipale, J, Cramer, P. 登録日 2019-10-21 公開日 2020-04-29 最終更新日 2024-05-22 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (5.1 Å) 主引用文献 Nucleosome-bound SOX2 and SOX11 structures elucidate pioneer factor function. Nature, 580, 2020
6T7A	Structure of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 分子名称: DNA (147-MER), Histone H2A type 1-B/E, Histone H2B type 1-K, ... 著者 Dodonova, S.O, Zhu, F, Dienemann, C, Taipale, J, Cramer, P. 登録日 2019-10-21 公開日 2020-04-29 最終更新日 2024-05-22 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.7 Å) 主引用文献 Nucleosome-bound SOX2 and SOX11 structures elucidate pioneer factor function. Nature, 580, 2020
6T78	Structure of human Sox11 transcription factor in complex with a short DNA fragment 分子名称: DNA (5'-D(*AP*AP*CP*AP*AP*AP*AP*TP*AP*AP*AP*CP*AP*AP*TP*A)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*TP*TP*GP*TP*TP*TP*AP*TP*TP*TP*TP*GP*TP*T)-3'), Transcription factor SOX-11 著者 Dodonova, S.O, Zhu, F, Dienemann, C, Taipale, J, Cramer, P. 登録日 2019-10-21 公開日 2020-04-29 最終更新日 2024-01-24 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.504 Å) 主引用文献 Nucleosome-bound SOX2 and SOX11 structures elucidate pioneer factor function. Nature, 580, 2020
6T90	OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 分子名称: DNA (146-MER), Green fluorescent protein,POU domain, class 5, ... 著者 Michael, A.K, Kempf, G, Cavadini, S, Bunker, R.D, Thoma, N.H. 登録日 2019-10-25 公開日 2020-05-06 最終更新日 2020-07-08 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.05 Å) 主引用文献 Mechanisms of OCT4-SOX2 motif readout on nucleosomes. Science, 368, 2020
6L6Y	Crystal Structure of Pluripotency Reprogramming Factor Sox17 mutant (Sox17EK) HMG Domain bound to DNA 分子名称: DNA (5'-D(*CP*CP*AP*GP*GP*AP*CP*AP*AP*TP*AP*GP*AP*GP*AP*C)-3'), DNA (5'-D(P*GP*GP*TP*CP*TP*CP*TP*AP*TP*TP*GP*TP*CP*CP*TP*G)-3'), SULFATE ION, ... 著者 Balasubramanian, M, Kolatkar, P.R. 登録日 2019-10-29 公開日 2020-11-04 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 Crystal Structure of Pluripotency Reprogramming Factor Sox17 mutant (Sox17EK) HMG Domain bound to DNA To Be Published
6LTJ	Structure of nucleosome-bound human BAF complex 分子名称: AT-rich interactive domain-containing protein 1A, Actin, cytoplasmic 1, ... 著者 He, S, Wu, Z, Tian, Y, Yu, Z, Yu, J, Wang, X, Li, J, Liu, B, Xu, Y. 登録日 2020-01-22 公開日 2020-02-12 最終更新日 2024-05-29 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.7 Å) 主引用文献 Structure of nucleosome-bound human BAF complex. Science, 367, 2020
6LTH	Structure of human BAF Base module 分子名称: AT-rich interactive domain-containing protein 1A, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, ... 著者 He, S, Wu, Z, Tian, Y, Yu, Z, Yu, J, Wang, X, Li, J, Liu, B, Xu, Y. 登録日 2020-01-22 公開日 2020-02-12 最終更新日 2024-05-29 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3 Å) 主引用文献 Structure of nucleosome-bound human BAF complex. Science, 367, 2020
6YOV	OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 分子名称: DNA (142-MER), Green fluorescent protein,POU domain, class 5, ... 著者 Michael, A.K, Kempf, G, Cavadini, S, Bunker, R.D, Thoma, N.H. 登録日 2020-04-15 公開日 2020-05-06 最終更新日 2020-07-08 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.42 Å) 主引用文献 Mechanisms of OCT4-SOX2 motif readout on nucleosomes. Science, 368, 2020
6WX7	SOX2 bound to Importin-alpha 2 分子名称: Importin subunit alpha-1, Transcription factor SOX-2 著者 Bikshapathi, J, Stewart, M, Forwood, J.K, Aragao, D, Roman, N. 登録日 2020-05-09 公開日 2020-10-28 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å) 主引用文献 Structural basis for nuclear import selectivity of pioneer transcription factor SOX2. Nat Commun, 12, 2021
6WX8	SOX2 bound to Importin-alpha 3 分子名称: Importin subunit alpha-3, SULFATE ION, Transcription factor SOX-2 著者 Bikshapathi, J, Stewart, M, Forwood, J.K, Aragao, D, Roman, N. 登録日 2020-05-10 公開日 2020-10-28 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Structural basis for nuclear import selectivity of pioneer transcription factor SOX2. Nat Commun, 12, 2021
6WX9	SOX2 bound to Importin-alpha 5 分子名称: Importin subunit alpha-5, Transcription factor SOX-2 著者 Bikshapathi, J, Stewart, M, Forwood, J.K, Aragao, D, Roman, N. 登録日 2020-05-10 公開日 2020-10-28 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Structural basis for nuclear import selectivity of pioneer transcription factor SOX2. Nat Commun, 12, 2021
7JJK	Crystal structure of SOX30 分子名称: Transcription factor SOX-30 著者 Ghafoori, S.M, Forwood, J.K. 登録日 2020-07-27 公開日 2020-08-19 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.4 Å) 主引用文献 Structure of SOX30 at 1.40 Angstroms resolution To Be Published
7CYU	Crystal structure of human BAF57 HMG domain 分子名称: SULFATE ION, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 著者 Heo, Y, Yun, J.H, Park, J.H, Lee, W. 登録日 2020-09-04 公開日 2020-10-14 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.55 Å) 主引用文献 Crystal structure of the HMG domain of human BAF57 and its interaction with four-way junction DNA. Biochem.Biophys.Res.Commun., 533, 2020
7LBW	Crystal structure of TFAM (mitochondrial transcription factor A) bridging two non-sequence specific DNA substrates 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, DI(HYDROXYETHYL)ETHER, DNA (5'-D(P*TP*AP*GP*CP*CP*TP*TP*TP*CP*TP*AP*TP*TP*AP*GP*CP*TP*CP*TP*TP*AP*G)-3'), ... 著者 Choi, W.S, Garcia-Diaz, M. 登録日 2021-01-09 公開日 2022-01-19 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.84 Å) 主引用文献 A minimal motif for sequence recognition by mitochondrial transcription factor A (TFAM). Nucleic Acids Res., 50, 2022
7LBX	Crystal structure of TFAM (mitochondrial transcription factor A) in complex with LSP 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, DNA (5'-D(P*TP*TP*AP*AP*CP*AP*GP*TP*CP*AP*CP*CP*CP*CP*CP*CP*AP*AP*CP*TP*AP*A)-3'), DNA (5'-D(P*TP*TP*AP*GP*TP*TP*GP*GP*GP*GP*GP*GP*TP*GP*AP*CP*TP*GP*TP*TP*AP*A)-3'), ... 著者 Choi, W.S, Garcia-Diaz, M. 登録日 2021-01-09 公開日 2022-01-19 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å) 主引用文献 A minimal motif for sequence recognition by mitochondrial transcription factor A (TFAM). Nucleic Acids Res., 50, 2022
7M5W	Crystal structure of the HMG-C1 domain of human capicua bound to DNA 分子名称: CALCIUM ION, DNA (5'-D(*GP*CP*TP*TP*TP*TP*TP*CP*AP*TP*TP*CP*AP*TP*AP*AP*CP*C)-3'), DNA (5'-D(*GP*GP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*AP*TP*GP*AP*AP*AP*AP*AP*GP*C)-3'), ... 著者 Webb, J.P, Liew, J.J.M, Gnann, A.D, Dowling, D.P. 登録日 2021-03-25 公開日 2022-04-06 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.95 Å) 主引用文献 Molecular basis of DNA recognition by the HMG-box-C1 module of Capicua Biorxiv, 2022
7VDV	The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 分子名称: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE, AT-rich interactive domain-containing protein 2,AT-rich interactive domain-containing protein 2, Actin, ... 著者 Chen, Z.C, Chen, K.J, Yuan, J.J. 登録日 2021-09-07 公開日 2022-05-18 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.4 Å) 主引用文献 Structure of human chromatin-remodelling PBAF complex bound to a nucleosome. Nature, 605, 2022
7Y8R	The nucleosome-bound human PBAF complex 分子名称: ACTB protein (Fragment), ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE, AT-rich interactive domain-containing protein 2, ... 著者 Wang, L, Yu, J, Yu, Z, Wang, Q, He, S, Xu, Y. 登録日 2022-06-24 公開日 2022-12-07 最終更新日 2022-12-21 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.4 Å) 主引用文献 Structure of nucleosome-bound human PBAF complex. Nat Commun, 13, 2022
7YHP	CryoEM structure of Arabidopsis ROS1 in complex with 5mC-dsDNA at 3.1 Angstroms resolution 分子名称: DNA (40-MER), IRON/SULFUR CLUSTER, Sex-determining region Y protein,REPRESSOR OF SILENCING 1,DNA glycosylase/AP lyase ROS1 著者 Du, X, Du, J. 登録日 2022-07-14 公開日 2022-11-30 最終更新日 2023-03-08 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.1 Å) 主引用文献 Molecular basis of the plant ROS1-mediated active DNA demethylation. Nat.Plants, 9, 2023
7YHO	CryoEM structure of Arabidopsis ROS1 in complex with TG mismatch dsDNA at 3.3 Angstroms resolution 分子名称: DNA (40-MER), IRON/SULFUR CLUSTER, Sex-determining region Y protein,DNA glycosylase/AP lyase ROS1 著者 Du, X, Du, J. 登録日 2022-07-14 公開日 2022-11-30 最終更新日 2023-03-08 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.3 Å) 主引用文献 Molecular basis of the plant ROS1-mediated active DNA demethylation. Nat.Plants, 9, 2023
7YHQ	CryoEM structure of Arabidopsis ROS1 in complex with a covalent-linked reaction intermediate at 3.9 Angstroms resolution 分子名称: DNA (40-MER), IRON/SULFUR CLUSTER, Sex-determining region Y protein,DNA glycosylase/AP lyase ROS1 著者 Du, X, Du, J. 登録日 2022-07-14 公開日 2022-11-30 最終更新日 2023-03-08 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.9 Å) 主引用文献 Molecular basis of the plant ROS1-mediated active DNA demethylation. Nat.Plants, 9, 2023
8BX1	Oct4/Sox2 protein:DNA complex 分子名称: HOXB1_f, HOXB1_r, POU domain, ... 著者 Chojnowski, G, Wilmanns, M, Round, E. 登録日 2022-12-07 公開日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Crystal structure of Oct4-Soc2-HoxB1 complex To Be Published
8BX2	Oct4/Sox2 protein:DNA complex 分子名称: POU domain, class 5, transcription factor 1, ... 著者 Chojnowski, G, Wilmanns, M, Round, E. 登録日 2022-12-07 公開日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.14 Å) 主引用文献 Crystal structure of Oct4-Soc2-UTF1 complex To Be Published
8I9M	The RAGE and HMGB1 complex 分子名称: Advanced glycosylation end product-specific receptor, High mobility group protein B1 著者 Han, C.W, Kim, H.J. 登録日 2023-02-07 公開日 2024-02-14 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (5.19 Å) 主引用文献 The RAGE and HMGB1 complex To Be Published

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