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- PDB-7mvs: DNA gyrase complexed with uncleaved DNA and Compound 7 to 2.6A re... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 7mvs
タイトルDNA gyrase complexed with uncleaved DNA and Compound 7 to 2.6A resolution
要素
  • DNA (5'-D(P*AP*GP*CP*CP*GP*TP*AP*GP*GP*GP*CP*CP*CP*TP*AP*CP*GP*GP*CP*T)-3')
  • DNA gyrase subunit B,DNA gyrase subunit A
キーワードISOMERASE/DNA/ANTIBIOTIC / Inhibitor / Complex / DNA / Gyrase / ANTIBIOTIC / ISOMERASE-DNA-ANTIBIOTIC complex
機能・相同性
機能・相同性情報


DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) complex / DNA negative supercoiling activity / DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing) / DNA topological change / DNA-templated DNA replication / chromosome / response to antibiotic / DNA binding / ATP binding / metal ion binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Gyrase A; domain 2 - #40 / DNA gyrase, subunit A / DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A, C-terminal repeat / DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A, C-terminal / : / DNA gyrase C-terminal domain, beta-propeller / DNA gyrase subunit B, TOPRIM domain / DNA gyrase, subunit B / DNA topoisomerase, type IIA, subunit B / DNA gyrase B subunit, C-terminal ...Gyrase A; domain 2 - #40 / DNA gyrase, subunit A / DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A, C-terminal repeat / DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A, C-terminal / : / DNA gyrase C-terminal domain, beta-propeller / DNA gyrase subunit B, TOPRIM domain / DNA gyrase, subunit B / DNA topoisomerase, type IIA, subunit B / DNA gyrase B subunit, C-terminal / DNA gyrase B subunit, carboxyl terminus / Topoisomerase (Topo) IIA-type catalytic domain profile. / DNA topoisomerase, type IIA, alpha-helical domain superfamily / DNA topoisomerase, type IIA, domain A / DNA topoisomerase, type IIA, domain A, alpha-beta / DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A / DNA Topoisomerase IV / DNA topoisomerase, type IIA, subunit B, domain 2 / DNA gyrase B / DNA topoisomerase, type IIA / DNA topoisomerase, type IIA, conserved site / DNA topoisomerase II signature. / TopoisomeraseII / DNA topoisomerase, type IIA, subunit B, C-terminal / Toprim domain / DNA topoisomerase, type IIA-like domain superfamily / Toprim domain profile. / TOPRIM domain / Gyrase A; domain 2 / Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase / Histidine kinase-like ATPases / Histidine kinase/HSP90-like ATPase superfamily / Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup / Ribosomal protein S5 domain 2-type fold / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
: / Chem-Y1W / DNA / DNA (> 10) / DNA gyrase subunit B / DNA gyrase subunit A
類似検索 - 構成要素
生物種Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
synthetic construct (人工物)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.60137142659 Å
データ登録者Ratigan, S.C. / McElroy, C.A.
資金援助 米国, 1件
組織認可番号国
Other private 米国
引用ジャーナル: J.Med.Chem. / 年: 2021
タイトル: Optimization of TopoIV Potency, ADMET Properties, and hERG Inhibition of 5-Amino-1,3-dioxane-Linked Novel Bacterial Topoisomerase Inhibitors: Identification of a Lead with In Vivo Efficacy against MRSA.
著者: Lu, Y. / Vibhute, S. / Li, L. / Okumu, A. / Ratigan, S.C. / Nolan, S. / Papa, J.L. / Mann, C.A. / English, A. / Chen, A. / Seffernick, J.T. / Koci, B. / Duncan, L.R. / Roth, B. / Cummings, J. ...著者: Lu, Y. / Vibhute, S. / Li, L. / Okumu, A. / Ratigan, S.C. / Nolan, S. / Papa, J.L. / Mann, C.A. / English, A. / Chen, A. / Seffernick, J.T. / Koci, B. / Duncan, L.R. / Roth, B. / Cummings, J.E. / Slayden, R.A. / Lindert, S. / McElroy, C.A. / Wozniak, D.J. / Yalowich, J. / Mitton-Fry, M.J.
履歴
登録2021年5月15日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02021年10月20日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12021年11月10日Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author
Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID
改定 1.22023年10月18日Group: Data collection / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim
Item: _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id ..._struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

-
構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
A: DNA gyrase subunit B,DNA gyrase subunit A
B: DNA gyrase subunit B,DNA gyrase subunit A
C: DNA (5'-D(P*AP*GP*CP*CP*GP*TP*AP*GP*GP*GP*CP*CP*CP*TP*AP*CP*GP*GP*CP*T)-3')
D: DNA (5'-D(P*AP*GP*CP*CP*GP*TP*AP*GP*GP*GP*CP*CP*CP*TP*AP*CP*GP*GP*CP*T)-3')
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)169,38711
ポリマ－168,6044
非ポリマー7837
水2,612145
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
  • 根拠: gel filtration, Gel filtration provides evidence that Chain A is dimerized with Chain B., There's density in the crystal structure revealing that dsDNA is bound to gyrase dimer.
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area16150 Å2
ΔGint-118 kcal/mol
Surface area57100 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)93.017, 93.017, 406.663
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number169
Space group name H-MP61
Space group name HallP61
Symmetry operation#1: x,y,z
#2: x-y,x,z+1/6
#3: y,-x+y,z+5/6
#4: -y,x-y,z+1/3
#5: -x+y,-x,z+2/3
#6: -x,-y,z+1/2
非結晶学的対称性 (NCS)NCSドメイン:
IDEns-ID
11
21
12
22

NCSドメイン領域:
Dom-IDComponent-IDEns-IDBeg auth comp-IDBeg label comp-IDEnd auth comp-IDEnd label comp-IDSelection detailsAuth asym-IDLabel asym-IDAuth seq-IDLabel seq-ID
111DADADCDC(chain 'C' and ((resid 1 and (name C5' or name...CC1 - 191 - 19
211DADADCDCchain 'D'DD1 - 191 - 19
112LYSLYSTHRTHR(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA10 - 3610 - 36
122SERSERSERSER(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA38 - 4238 - 42
132THRTHRASNASN(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA44 - 6844 - 68
142GLUGLUTYRTYR(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA70 - 11870 - 118
152PHEPHEMETMET(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA120 - 121120 - 121
162PROPROILEILE(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA123 - 125123 - 125
172ALAALAALAALA(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA127 - 173127 - 173
182GLNGLNTYRTYR(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA175 - 198175 - 198
192ARGARGMETMET(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA209 - 219210 - 220
1102GLUGLULEULEU(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA221 - 224222 - 225
1112TYRTYRLYSLYS(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA226 - 263227 - 264
1122TYRTYRVALVAL(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA265 - 272266 - 273
1132VALVALASPASP(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA275 - 284276 - 285
1142SERSERTYRTYR(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA286 - 288287 - 289
1152ALAALAVALVAL(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA290 - 292291 - 293
1162METMETALAALA(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA294 - 321295 - 322
1172ARGARGLEULEU(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA323 - 337324 - 338
1182ASPASPILEILE(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA339 - 340340 - 341
1192LYSLYSALAALA(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA342 - 373343 - 374
1202GLYGLYGLYGLY(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA375 - 427376 - 428
1212GLYGLYILEILE(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA430 - 431431 - 432
1222ALAALATYRTYR(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA434 - 435435 - 436
1232THRTHRTHRTHR(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA437438
1242GLYGLYASPASP(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA440 - 492441 - 493
1252ARGARGLEULEU(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA494 - 499495 - 500
1262THRTHRVALVAL(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA501 - 509502 - 510
1272LYSLYSLEULEU(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA511 - 557512 - 558
1282HISHISALAALA(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA559 - 579560 - 580
1292ILEILEASPASP(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA581 - 593582 - 594
1302ILEILESERSER(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA595 - 619596 - 620
1312LYSLYSLEULEU(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA621 - 650622 - 651
1322TYRTYRGLUGLU(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA652 - 664653 - 665
1332LEULEULEULEU(chain 'A' and (resid 10 through 19 or (resid 20...AA666 - 691667 - 692
212LYSLYSTHRTHR(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB10 - 3610 - 36
222SERSERSERSER(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB38 - 4238 - 42
232THRTHRASNASN(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB44 - 6844 - 68
242GLUGLUTYRTYR(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB70 - 11870 - 118
252PHEPHEMETMET(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB120 - 121120 - 121
262PROPROILEILE(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB123 - 125123 - 125
272ALAALAALAALA(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB127 - 173127 - 173
282GLNGLNTYRTYR(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB175 - 198175 - 198
292ARGARGMETMET(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB209 - 219210 - 220
2102GLUGLULEULEU(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB221 - 224222 - 225
2112TYRTYRLYSLYS(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB226 - 263227 - 264
2122TYRTYRVALVAL(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB265 - 272266 - 273
2132VALVALASPASP(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB275 - 284276 - 285
2142SERSERTYRTYR(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB286 - 288287 - 289
2152ALAALAVALVAL(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB290 - 292291 - 293
2162METMETALAALA(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB294 - 321295 - 322
2172ARGARGLEULEU(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB323 - 337324 - 338
2182ASPASPILEILE(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB339 - 340340 - 341
2192LYSLYSALAALA(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB342 - 373343 - 374
2202GLYGLYGLYGLY(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB375 - 427376 - 428
2212GLYGLYILEILE(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB430 - 431431 - 432
2222ALAALATYRTYR(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB434 - 435435 - 436
2232THRTHRTHRTHR(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB437438
2242GLYGLYASPASP(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB440 - 492441 - 493
2252ARGARGLEULEU(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB494 - 499495 - 500
2262THRTHRVALVAL(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB501 - 509502 - 510
2272LYSLYSLEULEU(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB511 - 557512 - 558
2282HISHISALAALA(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB559 - 579560 - 580
2292ILEILEASPASP(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB581 - 593582 - 594
2302ILEILESERSER(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB595 - 619596 - 620
2312LYSLYSLEULEU(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB621 - 650622 - 651
2322TYRTYRGLUGLU(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB652 - 664653 - 665
2332LEULEULEULEU(chain 'B' and (resid 10 through 36 or resid 38...BB666 - 691667 - 692

NCSアンサンブル:
ID
1
2

-
要素

-
タンパク質 / DNA鎖 , 2種, 4分子 ABCD

#1: タンパク質 DNA gyrase subunit B,DNA gyrase subunit A


分子量: 78166.055 Da / 分子数: 2 / 変異: Y324F / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
遺伝子: gyrB, gyrA, SA0006 / プラスミド: pDB.His.MBP / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌)
参照: UniProt: P0A0K8, UniProt: Q99XG5, DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
#2: DNA鎖 DNA (5'-D(P*AP*GP*CP*CP*GP*TP*AP*GP*GP*GP*CP*CP*CP*TP*AP*CP*GP*GP*CP*T)-3')


分子量: 6135.955 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)

-
非ポリマー , 5種, 152分子

#3: 化合物 ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド


分子量: 35.453 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#4: 化合物 ChemComp-MN / MANGANESE (II) ION


分子量: 54.938 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mn
#5: 化合物 ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン


分子量: 96.063 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO4
#6: 化合物 ChemComp-Y1W / (1S)-2-[(2r,5S)-5-{[(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)methyl]amino}-1,3-dioxan-2-yl]-1-(3-fluoro-6-methoxyquinolin-4-yl)ethan-1-ol


分子量: 470.490 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C25H27FN2O6 / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#7: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 145 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるかY

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 3.01 Å3/Da / 溶媒含有率: 59.16 % / 解説: 40umx150um hexagonal rods, clear
結晶化温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.2
詳細: motherliquor: 80mM Bis-Tris, pH=6.2, 15.33% PEG 5000MME protein: 50mM HEPES, pH=7.5 1.2uL motherliquor : 0.8uL protein streaked with existing seed stock
Temp details: +/- 4K

-
データ収集

回折平均測定温度: 77 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 19-ID / 波長: 1.54 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2020年11月30日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1.54 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.601→23.7427486328 Å / Num. obs: 60022 / % possible obs: 98.87 % / 冗長度: 6.1 % / Biso Wilson estimate: 61.3801855894 Å2 / CC1/2: 0.997 / Rmerge(I) obs: 0.22 / Rpim(I) all: 0.093 / Rrim(I) all: 0.239 / Net I/σ(I): 9.2
反射 シェル解像度: 2.601→2.694 Å / Num. unique obs: 5472 / CC1/2: 0.389 / Rpim(I) all: 0.66 / % possible all: 90.81

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
SBC-Collectデータ収集
PHENIX1.11.1_2575精密化
HKL-2000データ削減
HKL-2000データスケーリング
PHENIX1.11.1_2575位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 2XCS

2xcs


解像度: 2.60137142659→23.7427486328 Å / SU ML: 0.459867161797 / 交差検証法: NONE / σ(F): 1.33788961277 / 位相誤差: 29.4972337594
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
Rfactor反射数%反射
Rfree0.251722343658 3878 3.30506668939 %
Rwork0.195513593603 113457 -
obs0.19732038353 60022 97.216123286 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL
原子変位パラメータBiso mean: 77.4825563237 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 2.60137142659→23.7427486328 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数10627 800 44 145 11616
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0032970553182112147
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d0.50740740559816605
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.04010037139261849
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.003005588907092069
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d17.13741821967354
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
2.6014-2.63310.413692904439990.3408981582092668X-RAY DIFFRACTION64.5891690009
2.6331-2.66630.3285688998421230.3488150189823645X-RAY DIFFRACTION85.9881332725
2.6663-2.70140.3976294485941290.3566511895243706X-RAY DIFFRACTION90.1716435457
2.7014-2.73830.4185377903381320.3408945935214002X-RAY DIFFRACTION94.4482522276
2.7383-2.77740.3800307969021320.330739388043932X-RAY DIFFRACTION96.1665877899
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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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