登録情報 データベース : PDB / ID : 4z3c 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Zinc finger region of human TET3 in complex with CpG DNA 要素DNA (5'-D(*GP*CP*CP*AP*AP*CP*GP*TP*TP*GP*GP*C)-3')Methylcytosine dioxygenase 詳細キーワード DNA Binding protein/DNA / zinc finger / dna-binding / Structural Genomics / Structural Genomics Consortium / SGC / DNA Binding protein-DNA complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
epigenetic programing of male pronucleus / : / : / 5-methylcytosine catabolic process / 5-methylcytosine dioxygenase activity / TET1,2,3 and TDG demethylate DNA / : / oxidative demethylation / protein O-linked glycosylation / methyl-CpG binding ... epigenetic programing of male pronucleus / : / : / 5-methylcytosine catabolic process / 5-methylcytosine dioxygenase activity / TET1,2,3 and TDG demethylate DNA / : / oxidative demethylation / protein O-linked glycosylation / methyl-CpG binding / male pronucleus / female pronucleus / chromosome / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / zinc ion binding / nucleus / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 Methylcytosine dioxygenase TET1/2/3 / Oxygenase domain of the 2OGFeDO superfamily / 2OGFeDO, oxygenase domain / Oxygenase domain of the 2OGFeDO superfamily / CXXC zinc finger domain / Zinc finger, CXXC-type / Zinc finger CXXC-type profile. 類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / Methylcytosine dioxygenase TET3 / Methylcytosine dioxygenase TET3 類似検索 - 構成要素生物種 Homo sapiens (ヒト)synthetic construct (人工物) 手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.57 Å 詳細データ登録者 Liu, K. / Xu, C. / Tempel, W. / Dong, A. / Arrowsmith, C.H. / Bountra, C. / Edwards, A.M. / Min, J. / Structural Genomics Consortium (SGC) 引用ジャーナル : Structure / 年 : 2017タイトル : DNA Sequence Recognition of Human CXXC Domains and Their Structural Determinants.著者 : Xu, C. / Liu, K. / Lei, M. / Yang, A. / Li, Y. / Hughes, T.R. / Min, J. 履歴 登録 2015年3月31日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2015年4月29日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2017年11月22日 Group : Advisory / Derived calculations ... Advisory / Derived calculations / Refinement description / Source and taxonomy カテゴリ : entity_src_gen / pdbx_entity_src_syn ... entity_src_gen / pdbx_entity_src_syn / pdbx_struct_oper_list / pdbx_validate_close_contact / software Item : _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag ... _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _software.classification 改定 1.2 2018年1月3日 Group : Database references / Structure summary / カテゴリ : audit_author / citation / citation_authorItem : _citation.country / _citation.journal_abbrev ... _citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year 改定 1.3 2023年9月27日 Group : Data collection / Database references / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / diffrn_radiation_wavelength / pdbx_initial_refinement_model Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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