[日本語] English
- 3次元電子顕微鏡データ検索 -

-
検索条件


キーワード
データベース /
Q: EM Navigatorの情報源は？
データエントリ / 週前
Q: データの更新はいつですか？
著者・登録者
解析手法
表示モード
並び順
エントリ数 / 1ページ
登録情報
文献
試料
実験
解析
データの最大数全データの場合は0
ファイル形式
  • CSV形式 (コンマ区切り, Excelなどに)
  • TSV形式 (タブ区切り)
  • JSON形式

万見検索

-
検索結果

検索 (著者・登録者: van & den & berg & b)の結果240件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-54169:
Cryo-EM structure of LptDEM complex containing Shigella flexneri LptE and endogenous E. coli LptD and LptM
手法: 単粒子 / : Dunbar E, Basle A, van den Berg B

EMDB-54170:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE in complex with RTP45 superinfection exclusion protein from RTP bacteriophage and endogenous LptM
手法: 単粒子 / : Dunbar E, Basle A, van den Berg B

EMDB-54171:
Cryo-EM structure of the open state of Shigella flexneri LptDE bound by the RBP of Oekolampad phage
手法: 単粒子 / : Dunbar E, Basle A, van den Berg B

EMDB-54173:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE dimer: closed-state unbound and open-state bound by Oekolampad phage RBP
手法: 単粒子 / : Dunbar E, Basle A, van den Berg B

EMDB-54175:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by phage RBP reveals N-terminal strand insertion into lateral gate
手法: 単粒子 / : Dunbar E, Basle A, van den Berg B

PDB-9rpr:
Cryo-EM structure of LptDEM complex containing Shigella flexneri LptE and endogenous E. coli LptD and LptM
手法: 単粒子 / : Dunbar E, Basle A, van den Berg B

PDB-9rps:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE in complex with RTP45 superinfection exclusion protein from RTP bacteriophage and endogenous LptM
手法: 単粒子 / : Dunbar E, Basle A, van den Berg B

PDB-9rpt:
Cryo-EM structure of the open state of Shigella flexneri LptDE bound by the RBP of Oekolampad phage
手法: 単粒子 / : Dunbar E, Basle A, van den Berg B

PDB-9rpw:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE dimer: closed-state unbound and open-state bound by Oekolampad phage RBP
手法: 単粒子 / : Dunbar E, Basle A, van den Berg B

PDB-9rqi:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by phage RBP reveals N-terminal strand insertion into lateral gate
手法: 単粒子 / : Dunbar E, Basle A, van den Berg B

EMDB-52218:
Porphyromonas gingivalis BAM complex
手法: 単粒子 / : Madej M, Silale A, van den Berg B

PDB-9hjm:
Porphyromonas gingivalis BAM complex
手法: 単粒子 / : Madej M, Silale A, van den Berg B

EMDB-52749:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 1)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, van den Berg B, Hubbard J

EMDB-52750:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 2)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, van den Berg B, Hubbard J

EMDB-52751:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 3)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, van den Berg B, Hubbard J

EMDB-52752:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 4)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, van den Berg B, Hubbard J

EMDB-52753:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 5)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, van den Berg B, Hubbard J

EMDB-52754:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE in complex with a Bicyclic Peptide binder (Compound 12)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, Hubbard J, van den Berg B, Newman H

EMDB-52755:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 13)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, van den Berg B, Hubbard J

EMDB-52896:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 16)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Chirgadze DY, Hardwick SW, Hubbard J, van den Berg B, Dunbar E

PDB-9i92:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 1)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, van den Berg B, Hubbard J

PDB-9i93:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 2)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, van den Berg B, Hubbard J

PDB-9i94:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 3)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, van den Berg B, Hubbard J

PDB-9i95:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 4)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, van den Berg B, Hubbard J

PDB-9i96:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 5)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, van den Berg B, Hubbard J

PDB-9i97:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE in complex with a Bicyclic Peptide binder (Compound 12)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, Hubbard J, van den Berg B, Newman H

PDB-9i98:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 13)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Dunbar E, Hardwick SW, Chirgadze DY, van den Berg B, Hubbard J

PDB-9q8n:
Cryo-EM structure of Shigella flexneri LptDE bound by a Bicyclic peptide molecule (Compound 16)
手法: 単粒子 / : Allyjaun S, Newman H, Chirgadze DY, Hardwick SW, Hubbard J, van den Berg B, Dunbar E

EMDB-52200:
Extracellular components BamHIJK of the Bacteroides thetaiotaomicron BAM machinery
手法: 単粒子 / : Silale A, van den Berg B

EMDB-52202:
BamADG components of the Bacteroides thetaiotaomicron BAM machinery
手法: 単粒子 / : Silale A, van den Berg B

EMDB-52209:
Bacteroides thetaiotaomicron BAM complex
手法: 単粒子 / : Silale A, van den Berg B

EMDB-52219:
Porphyromonas gingivalis BAM complex with periplasmic density
手法: 単粒子 / : Madej M, Silale A, van den Berg B

PDB-9his:
Extracellular components BamHIJK of the Bacteroides thetaiotaomicron BAM machinery
手法: 単粒子 / : Silale A, van den Berg B

PDB-9hiv:
BamADG components of the Bacteroides thetaiotaomicron BAM machinery
手法: 単粒子 / : Silale A, van den Berg B

PDB-9hj3:
Bacteroides thetaiotaomicron BAM complex
手法: 単粒子 / : Silale A, van den Berg B

EMDB-51210:
Bacteroides thetaiotaomicron siderophore transporter XusA in complex with surface-exposed lipoprotein XusB
手法: 単粒子 / : Silale A, van den Berg B

PDB-9gbc:
Bacteroides thetaiotaomicron siderophore transporter XusA in complex with surface-exposed lipoprotein XusB
手法: 単粒子 / : Silale A, van den Berg B

EMDB-54402:
Structure of in-vivo formed alpha-synuclein fibrils purified from a M83+/- mouse brain injected with recombinant 1B fibrils
手法: らせん対称 / : van den Heuvel L, Burger D, Kashyrina M, de La Seigliere H, Lewis AJ, De Nuccio F, Mohammed I, Verchere J, Feuillie C, Berbon M, Arotcarena M, Retailleau A, Bezard E, Canron M, Meissner WG, Loquet A, Bousset L, Poujol C, Nilsson KPR, Laferriere F, Baron T, Lofrumento DD, De Giorgi F, Stahlberg H, Ichas F

PDB-9rzf:
Structure of in-vivo formed alpha-synuclein fibrils purified from a M83+/- mouse brain injected with recombinant 1B fibrils
手法: らせん対称 / : van den Heuvel L, Burger D, Kashyrina M, de La Seigliere H, Lewis AJ, De Nuccio F, Mohammed I, Verchere J, Feuillie C, Berbon M, Arotcarena M, Retailleau A, Bezard E, Canron M, Meissner WG, Loquet A, Bousset L, Poujol C, Nilsson KPR, Laferriere F, Baron T, Lofrumento DD, De Giorgi F, Stahlberg H, Ichas F

EMDB-51308:
Cryo-EM Structure of Pentameric Outer Membrane Protein A from Bdellovibrio bacteriovorus
手法: 単粒子 / : Parr RJ, Ratkeviciute G, Lovering AL

PDB-9gf0:
Cryo-EM Structure of Pentameric Outer Membrane Protein A from Bdellovibrio bacteriovorus
手法: 単粒子 / : Parr RJ, Ratkeviciute G, Lovering AL

EMDB-54139:
Structure of Avast type 5 activator (Gp316, JADA jumbophage protein)
手法: 単粒子 / : Pacesa M, Muralidharan A, Brouns SJJ

EMDB-49523:
Cryo-EM structure of hexameric SenDRT9 RT-ncRNA complex
手法: 単粒子 / : Burman N, Pandey S, Wiedenheft B, Sternberg SH

EMDB-49525:
Cryo-EM structure of the trimeric SenDRT9 RT-ncRNA complex (GST fusion)
手法: 単粒子 / : Burman N, Pandey S, Wiedenheft B, Sternberg SH

PDB-9nlv:
Cryo-EM structure of hexameric SenDRT9 RT-ncRNA complex
手法: 単粒子 / : Burman N, Pandey S, Wiedenheft B, Sternberg SH

PDB-9nlx:
Cryo-EM structure of the trimeric SenDRT9 RT-ncRNA complex (GST fusion)
手法: 単粒子 / : Burman N, Pandey S, Wiedenheft B, Sternberg SH

EMDB-50707:
Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with nanobody 7F
手法: 単粒子 / : Debski-Antoniak O, Drulyte I, Hurdiss DL

EMDB-50708:
Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with nanobody 7F (local refinement)
手法: 単粒子 / : Debski-Antoniak O, Drulyte I, Hurdiss DL

PDB-9fr3:
Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with nanobody 7F
手法: 単粒子 / : Debski-Antoniak O, Hurdiss DL

PDB-9fr4:
Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with nanobody 7F (local refinement)
手法: 単粒子 / : Debski-Antoniak O, Hurdiss DL

ページ:

+
EMN検索について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

+
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

-
EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

他の情報も見る