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万見検索

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検索結果

検索 (著者・登録者: young & pr)の結果168件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-43813:
VIR-7229 Fab fragment bound the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike trimer (local refinement of the BA 2.86 RBD/VIR-7229 VHVL)

EMDB-43842:
VIR-7229 Fab fragment bound the BA.2.86 spike trimer (global refinement)

PDB-9asd:
VIR-7229 Fab fragment bound the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike trimer (local refinement of the BA 2.86 RBD/VIR-7229 VHVL)

PDB-9au2:
VIR-7229 Fab fragment bound the BA.2.86 spike trimer (global refinement)

EMDB-19653:
Structure of the E3 ubiquitin ligase RNF213, determined by cryoEM

EMDB-19654:
Human RNF213 (consensus refinement without accounting for flexibility)

EMDB-19655:
Human RNF213: focused refinement of ATPase domain

EMDB-19656:
Human RNF213: focused refinement of stalk domain

EMDB-19657:
Human RNF213: focused refinement of carbohydrate binding module (CBM) domain

EMDB-19658:
Human RNF213: focused refinement of E3 ligase domain

EMDB-19659:
Human RNF213: focused refinement of E3-RING domain

PDB-8s24:
Structure of the E3 ubiquitin ligase RNF213, determined by cryoEM

EMDB-36488:
Structure of Duffy Antigen Receptor for Chemokines (DARC)/ACKR1 in complex with the chemokine, CCL7 (Composite map)

EMDB-37212:
Structure of Duffy Antigen Receptor for Chemokines (DARC)/ACKR1 in complex with the chemokine, CCL7 (Receptor original map)

EMDB-37214:
Structure of Duffy Antigen Receptor for Chemokines (DARC)/ACKR1 in complex with the chemokine, CCL7 (Ligand/CCL7 focused map)

PDB-8jps:
Structure of Duffy Antigen Receptor for Chemokines (DARC)/ACKR1 in complex with the chemokine, CCL7 (Composite map)

EMDB-43435:
Prefusion stabilized structure of the SARS-CoV-2 fusion machinery

EMDB-43436:
Prefusion stabilized structure of the SARS-CoV-2 fusion machinery

EMDB-43437:
Prefusion stabilized structure of the SARS-CoV-2 fusion machinery

PDB-8vq9:
Prefusion stabilized structure of the SARS-CoV-2 fusion machinery

PDB-8vqa:
Prefusion stabilized structure of the SARS-CoV-2 fusion machinery

PDB-8vqb:
Prefusion stabilized structure of the SARS-CoV-2 fusion machinery

EMDB-41107:
CryoEM structure of TR-TRAP

PDB-8t9d:
CryoEM structure of TR-TRAP

EMDB-40968:
Atomic model of the mammalian Mediator complex with MED26 subunit

EMDB-40972:
CryoEM map of TR-TRAP

EMDB-40975:
CryoEM map of mouse mediator complex with alternate conformation CKM module

PDB-8t1i:
Atomic model of the mammalian Mediator complex with MED26 subunit

EMDB-43224:
Structure of the HKU1 RBD bound to the human TMPRSS2 receptor

PDB-8vgt:
Structure of the HKU1 RBD bound to the human TMPRSS2 receptor

EMDB-28752:
Cryo-electron tomography of wild type a-synuclein preformed fibrils

EMDB-28753:
Cryo-electron tomography of S42Y a-synuclein preformed fibrils

EMDB-29530:
SARS-CoV-2 XBB.1 spike RBD bound to the human ACE2 ectodomain and the S309 neutralizing antibody Fab fragment

EMDB-29531:
SARS-CoV-2 BQ.1.1 spike RBD bound to the human ACE2 ectodomain and the S309 neutralizing antibody Fab fragment

EMDB-40240:
SARS-CoV-2 BN.1 spike RBD bound to the human ACE2 ectodomain and the S309 neutralizing antibody Fab fragment

PDB-8fxb:
SARS-CoV-2 XBB.1 spike RBD bound to the human ACE2 ectodomain and the S309 neutralizing antibody Fab fragment

PDB-8fxc:
SARS-CoV-2 BQ.1.1 spike RBD bound to the human ACE2 ectodomain and the S309 neutralizing antibody Fab fragment

PDB-8s9g:
SARS-CoV-2 BN.1 spike RBD bound to the human ACE2 ectodomain and the S309 neutralizing antibody Fab fragment

EMDB-33650:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7

EMDB-33651:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7 (focused refinement on Fab-RBD interface)

PDB-7y71:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7

PDB-7y72:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer complexed with Fab fragment of anti-RBD antibody E7 (focused refinement on Fab-RBD interface)

EMDB-26157:
Cryo-EM structure of BG505 SOSIP HIV-1 Env trimer in complex with CD4 receptor (D1D2) and broadly neutralizing darpin bnD.9

EMDB-28538:
Structure of SARS-CoV-2 Orf3a in late endosome/lysosome-like membrane environment, MSP1D1 nanodisc

EMDB-28544:
Structure of SARS-CoV-1 Orf3a in late endosome/lysosome-like environment, MSP1D1 nanodisc

EMDB-28545:
Structure of SARS-CoV-2 Orf3a in plasma membrane-like environment, MSP1D1 nanodisc

EMDB-28546:
Structure of SARS-CoV-2 Orf3a in late endosome/lysosome-like environment, Saposin A nanodisc

EMDB-27779:
Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein S2 subunit

PDB-8dya:
Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein S2 subunit

EMDB-28558:
SARS-CoV-2 BA.1 spike ectodomain trimer in complex with the S2X324 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and S2X324)

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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