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検索結果

検索 (著者・登録者: yamada & k)の結果103件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-82471:
Iota toxin Ib D452A pore
手法: 単粒子 / : Yamada T, Nakanishi R, Sugita Y, Ninomiya Y, Yoshida T, Noda T, Tsuge H

PDB-44bv:
Iota toxin Ib D452A pore
手法: 単粒子 / : Yamada T, Nakanishi R, Sugita Y, Ninomiya Y, Yoshida T, Noda T, Tsuge H

EMDB-62001:
Cryo-EM structure of the HfmIscB-omega RNA-target DNA complex
手法: 単粒子 / : Nagahata N, Yamada S, Yamashita K, Nishimasu H

EMDB-62002:
Cryo-EM structure of the TbaIscB-omega RNA-target DNA complex
手法: 単粒子 / : Nagahata N, Yamada S, Yamashita K, Nishimasu H

EMDB-62003:
Cryo-EM structure of the YnpsCas9-guide RNA-target DNA complex
手法: 単粒子 / : Nagahata N, Yamada S, Yamashita K, Nishimasu H

EMDB-62004:
Cryo-EM structure of the NbaCas9-guide RNA-target DNA complex
手法: 単粒子 / : Nagahata N, Yamada S, Yamashita K, Nishimasu H

PDB-9k2z:
Cryo-EM structure of the HfmIscB-omega RNA-target DNA complex
手法: 単粒子 / : Nagahata N, Yamada S, Yamashita K, Nishimasu H

PDB-9k30:
Cryo-EM structure of the TbaIscB-omega RNA-target DNA complex
手法: 単粒子 / : Nagahata N, Yamada S, Yamashita K, Nishimasu H

PDB-9k31:
Cryo-EM structure of the YnpsCas9-guide RNA-target DNA complex
手法: 単粒子 / : Nagahata N, Yamada S, Yamashita K, Nishimasu H

PDB-9k32:
Cryo-EM structure of the NbaCas9-guide RNA-target DNA complex
手法: 単粒子 / : Nagahata N, Yamada S, Yamashita K, Nishimasu H

EMDB-71751:
Cryo-ET reconstruction of a regenerating axon after axotomy showing branching microtubules (primary mouse thalamus neuronal explant, control)
手法: トモグラフィー / : Bodakuntla S, Taira K, Yamada Y, Alvarez-Brecht P, Cada AK, Basnet N, Zhang R, Martinez-Sanchez A, Biertumpfel C, Mizuno N

EMDB-71752:
Cryo-ET reconstruction of a regenerating axon after axotomy showing branching microtubules (primary mouse thalamus neuronal explant)
手法: トモグラフィー / : Taira K, Bodakuntla S, Yamada Y, Alvarez-Brecht P, Cada AK, Basnet N, Zhang R, Martinez-Sanchez A, Biertumpfel C, Mizuno N

EMDB-71753:
Cryo-ET reconstruction of a regenerating axon after axotomy showing polymerizing microtubules (primary mouse thalamus neuronal explant)
手法: トモグラフィー / : Bodakuntla S, Taira K, Yamada Y, Alvarez-Brecht P, Cada AK, Basnet N, Zhang R, Martinez-Sanchez A, Biertumpfel C, Mizuno N

EMDB-71754:
Cryo-ET reconstruction of a regenerating axon 24 h after axotomy (primary mouse thalamus neuronal explant)
手法: トモグラフィー / : Bodakuntla S, Taira K, Yamada Y, Alvarez-Brecht P, Cada AK, Basnet N, Zhang R, Martinez-Sanchez A, Biertumpfel C, Mizuno N

EMDB-71755:
Cryo-ET reconstruction of a regenerating axon 24 h after axotomy (primary mouse thalamus neuronal explant)
手法: トモグラフィー / : Bodakuntla S, Taira K, Yamada Y, Alvarez-Brecht P, Cada AK, Basnet N, Zhang R, Martinez-Sanchez A, Biertumpfel C, Mizuno N

EMDB-71840:
Cryo-ET subtomogram averaging of a stress fiber from a regenerating axon
手法: サブトモグラム平均 / : Bodakuntla S, Taira K, Yamada Y, Alvarez-Brecht P, Cada AK, Basnet N, Zhang R, Martinez-Sanchez A, Biertumpfel C, Mizuno N

EMDB-62568:
Cryo-EM structure of wild type RIG-I with 5'p-RNA
手法: 単粒子 / : Tan YB, Luo D

EMDB-62574:
Cryo-EM structure of E373A mutant RIG-I with 5'p-RNA
手法: 単粒子 / : Tan YB, Luo D

PDB-9ktw:
Cryo-EM structure of wild type RIG-I with 5'p-RNA
手法: 単粒子 / : Tan YB, Luo D

PDB-9ku4:
Cryo-EM structure of E373A mutant RIG-I with 5'p-RNA
手法: 単粒子 / : Tan YB, Luo D

EMDB-62399:
CryoEM structure of Pleurocybella porrigens lectin (PPL) in complex with GalNAc
手法: 単粒子 / : Ishimoto N, Adachi D, Kawabata H, Park SY, Tame JRH, Kamata K

PDB-9kl3:
CryoEM structure of Pleurocybella porrigens lectin (PPL) in complex with GalNAc
手法: 単粒子 / : Ishimoto N, Adachi D, Kawabata H, Park SY, Tame JRH, Kamata K

EMDB-71750:
In situ microtubule of EpoB-induced regenerating axons
手法: らせん対称 / : Bodakuntla S, Taira K, Yamada Y, Alvarez-Brecht P, Cada AK, Basnet N, Zhang R, Martinez-Sanchez A, Biertumpfel C, Mizuno N

PDB-9pnd:
In situ microtubule of EpoB-induced regenerating axons
手法: らせん対称 / : Bodakuntla S, Taira K, Yamada Y, Alvarez-Brecht P, Cada AK, Basnet N, Zhang R, Martinez-Sanchez A, Biertumpfel C, Mizuno N

EMDB-64005:
Iota toxin Ib pore serine-clamp mutant(C1)
手法: 単粒子 / : Ninomiya Y, Yoshida T, Yamada T, Kishikawa J, Tsuge H

EMDB-39676:
Cryo-EM structure of cylindrical fiber of MyD88 TIR
手法: 単粒子 / : Kasai K, Imamura K, Narita A, Makino F, Miyata T, Kato T, Namba K, Onishi H, Tochio H

PDB-8yym:
Cryo-EM structure of cylindrical fiber of MyD88 TIR
手法: 単粒子 / : Kasai K, Imamura K, Narita A, Makino F, Miyata T, Kato T, Namba K, Onishi H, Tochio H

EMDB-39544:
Iota toxin Ib pore serine-clamp mutant
手法: 単粒子 / : Ninomiya Y, Yoshida T, Yamada T, Kishikawa J, Tsuge H

PDB-8yrm:
Iota toxin Ib pore serine-clamp mutant
手法: 単粒子 / : Ninomiya Y, Yoshida T, Yamada T, Kishikawa J, Tsuge H

EMDB-39104:
Cryo-EM structure of cellodextrin phosphorylase from Clostridium thermocellum with cellodextrin ligands
手法: 単粒子 / : Kuga T, Sunagawa N, Igarashi K

PDB-8yaq:
Cryo-EM structure of cellodextrin phosphorylase from Clostridium thermocellum with cellodextrin ligands
手法: 単粒子 / : Kuga T, Sunagawa N, Igarashi K

EMDB-44013:
F-actin-Talin(R13-DD) complex
手法: らせん対称 / : Biertumpfel C, Yamada Y, Mizuno N

EMDB-48238:
F-actin-Talin(R13-DD) complex, half-decorated
手法: らせん対称 / : Biertumpfel C, Yamada Y, Mizuno N

EMDB-48243:
F-actin-Talin(R13-DD) complex, single-decorated
手法: らせん対称 / : Biertumpfel C, Yamada Y, Mizuno N

PDB-9az6:
F-actin-Talin(R13-DD) complex
手法: らせん対称 / : Biertumpfel C, Yamada Y, Mizuno N

EMDB-37355:
Cryo-EM structure of helical filament of MyD88 TIR
手法: 単粒子 / : Kasai K, Imamura K, Narita A, Makino F, Miyata T, Kato T, Namba K, Onishi H, Tochio H

PDB-8w8m:
Cryo-EM structure of helical filament of MyD88 TIR
手法: 単粒子 / : Kasai K, Imamura K, Narita A, Makino F, Miyata T, Kato T, Namba K, Onishi H, Tochio H

EMDB-27770:
Structure of LRRC8C-LRRC8A(IL125) Chimera, Class 1
手法: 単粒子 / : Takahashi H, Yamada T, Denton JS, Strange K, Karakas E

EMDB-27771:
Structure of LRRC8C-LRRC8A(IL125) Chimera, Class 2
手法: 単粒子 / : Takahashi H, Yamada T, Denton JS, Strange K, Karakas E

EMDB-27772:
Structure of LRRC8C-LRRC8A(IL125) Chimera, Class 3
手法: 単粒子 / : Takahashi H, Yamada T, Denton JS, Strange K, Karakas E

EMDB-27773:
Structure of LRRC8C-LRRC8A(IL125) Chimera, Class 4
手法: 単粒子 / : Takahashi H, Yamada T, Denton JS, Strange K, Karakas E

EMDB-27774:
Structure of LRRC8C-LRRC8A(IL125) Chimera, Class 5
手法: 単粒子 / : Takahashi H, Yamada T, Denton JS, Strange K, Karakas E

PDB-8dxn:
Structure of LRRC8C-LRRC8A(IL125) Chimera, Class 1
手法: 単粒子 / : Takahashi H, Yamada T, Denton JS, Strange K, Karakas E

PDB-8dxo:
Structure of LRRC8C-LRRC8A(IL125) Chimera, Class 2
手法: 単粒子 / : Takahashi H, Yamada T, Denton JS, Strange K, Karakas E

PDB-8dxp:
Structure of LRRC8C-LRRC8A(IL125) Chimera, Class 3
手法: 単粒子 / : Takahashi H, Yamada T, Denton JS, Strange K, Karakas E

PDB-8dxq:
Structure of LRRC8C-LRRC8A(IL125) Chimera, Class 4
手法: 単粒子 / : Takahashi H, Yamada T, Denton JS, Strange K, Karakas E

PDB-8dxr:
Structure of LRRC8C-LRRC8A(IL125) Chimera, Class 5
手法: 単粒子 / : Takahashi H, Yamada T, Denton JS, Strange K, Karakas E

EMDB-32041:
Complex structure of Clostridioides difficile enzymatic component (CDTa) and binding component (CDTb) pore with short stem
手法: 単粒子 / : Yamada T, Kawamoto A, Yoshida T, Sato Y, Kato T, Tsuge H

EMDB-32043:
Complex structure of Clostridioides difficile enzymatic component (CDTa) and binding component (CDTb) pore with long stem
手法: 単粒子 / : Yamada T, Kawamoto A, Yoshida T, Sato Y, Kato T, Tsuge H

EMDB-33188:
Complex map of Clostridioides difficile enzymatic component (CDTa) and binding component (CDTb) di-heptamer
手法: 単粒子 / : Yamada T, Kawamoto A, Yoshida T, Sato Y, Kato T, Tsuge H

ページ:

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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