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検索結果

検索 (著者・登録者: wiedenheft & b)の結果全40件を表示しています

EMDB-71091:
Cas1-Cas2/3 integrase, heterohexameric assembly
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-71097:
Cas1-Cas2/3 integrase bound to foreign dsDNA fragment
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-71101:
Cas1-2/3 integration complex, 34 bp foreign DNA with PAM, first transesterification
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-71112:
Cas1-2/3 integration complex, 34 bp foreign DNA with PAM, CRISPR leader association
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-71114:
Cas1-2/3 integration complex, 32 bp foreign DNA without PAM, CRISPR leader association
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-71115:
Cas1-2/3 integration complex, 32 bp foreign DNA without PAM, first transesterification
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-71116:
Cas1-2/3 integration complex, 32 bp foreign DNA without PAM, full repeat
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

PDB-9p11:
Cas1-Cas2/3 integrase, heterohexameric assembly
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

PDB-9p1d:
Cas1-Cas2/3 integrase bound to foreign dsDNA fragment
手法: 単粒子 / : Henriques WS, Bowman J, Hall LN, Gauvin CG, Wei H, Kuang H, Zimanyi CM, Eng ET, Santiago-Frangos A, Wiedenheft B

EMDB-43796:
Structure of the guideless DtCmr Type III CRISPR complex
手法: 単粒子 / : Burman N, Henriques WH, Pandey S, Wiedenheft B

PDB-9arw:
Structure of the guideless DtCmr Type III CRISPR complex
手法: 単粒子 / : Burman N, Henriques WH, Pandey S, Wiedenheft B

EMDB-49523:
Cryo-EM structure of hexameric SenDRT9 RT-ncRNA complex
手法: 単粒子 / : Burman N, Pandey S, Wiedenheft B, Sternberg SH

EMDB-49525:
Cryo-EM structure of the trimeric SenDRT9 RT-ncRNA complex (GST fusion)
手法: 単粒子 / : Burman N, Pandey S, Wiedenheft B, Sternberg SH

PDB-9nlv:
Cryo-EM structure of hexameric SenDRT9 RT-ncRNA complex
手法: 単粒子 / : Burman N, Pandey S, Wiedenheft B, Sternberg SH

PDB-9nlx:
Cryo-EM structure of the trimeric SenDRT9 RT-ncRNA complex (GST fusion)
手法: 単粒子 / : Burman N, Pandey S, Wiedenheft B, Sternberg SH

EMDB-49053:
Structure of the retron IA complex with HNH nuclease in the "down" orientation
手法: 単粒子 / : Burman N, Thomas-George J, Wilkinson R, Wiedenheft B

EMDB-49055:
Structure of the retron IA complex with HNH nuclease in the "up" orientation
手法: 単粒子 / : Burman N, Thomas-George J, Wilkinson R, Wiedenheft B

EMDB-49056:
Structure of the Retron IA Complex without the HNH Nuclease
手法: 単粒子 / : Burman N, Thomas-George J, Wilkinson R, Wiedenheft B

PDB-9n69:
Structure of the retron IA complex with HNH nuclease in the "down" orientation
手法: 単粒子 / : Burman N, Thomas-George J, Wilkinson R, Wiedenheft B

PDB-9n6b:
Structure of the retron IA complex with HNH nuclease in the "up" orientation
手法: 単粒子 / : Burman N, Thomas-George J, Wilkinson R, Wiedenheft B

PDB-9n6c:
Structure of the Retron IA Complex without the HNH Nuclease
手法: 単粒子 / : Burman N, Thomas-George J, Wilkinson R, Wiedenheft B

EMDB-43103:
Structure of the PARIS immune complex with AriB subunits in C3 arrangement.
手法: 単粒子 / : Burman NB, Henriques W, Wilkinson R, Graham A, Wiedenheft B

EMDB-43104:
PARIS immune complex with AriB subunits in the trans arrangement.
手法: 単粒子 / : Burman NB, Henriques W, Wilkinson R, Graham A, Wiedenheft B

EMDB-43105:
Map of the AriA homohexamer following release of the AriB effector during PARIS-mediated defense.
手法: 単粒子 / : Burman NB, Santiago-Frangos A, Henriques W, Wilkinson R, Graham A, Wiedenheft B

EMDB-42719:
Asymmetric unit of the PARIS Immune Complex at 3.2 Angstrom Resolution
手法: 単粒子 / : Burman NB, Henriques W, Wilkinson R, Graham A, Wiedenheft B

PDB-8ux9:
Asymmetric unit of the PARIS Immune Complex at 3.2 Angstrom Resolution
手法: 単粒子 / : Burman NB, Henriques W, Wilkinson R, Graham A, Wiedenheft B

EMDB-29280:
Cas1-Cas2/3 integrase and IHF bound to CRISPR leader, repeat and foreign DNA
手法: 単粒子 / : Santiago-Frangos A, Henriques WS, Wiegand T, Gauvin C, Buyukyoruk M, Neselu K, Eng ET, Lander GC, Wiedenheft B

PDB-8flj:
Cas1-Cas2/3 integrase and IHF bound to CRISPR leader, repeat and foreign DNA
手法: 単粒子 / : Santiago-Frangos A, Henriques WS, Wiegand T, Gauvin C, Buyukyoruk M, Neselu K, Eng ET, Lander GC, Wiedenheft B

EMDB-25437:
Structure of DPSL (DNA Protection in Starved Cells - Like) from Pyrococcus furiosus
手法: 単粒子 / : Gauvin CC, Waghwani HK

EMDB-21516:
Cryo-EM structure of anti-CRISPR AcrIF9, bound to the type I-F crRNA-guided CRISPR surveillance complex
手法: 単粒子 / : Hirschi M, Santiago-Frangos A

EMDB-21517:
Cryo-EM structure of anti-CRISPR AcrIF9 and dsDNA, bound to the type I-F crRNA-guided CRISPR surveillance complex
手法: 単粒子 / : Hirschi M, Santiago-Frangos A, Wilkinson R, Golden SM, Wiedenheft B, Lander GC

PDB-6w1x:
Cryo-EM structure of anti-CRISPR AcrIF9, bound to the type I-F crRNA-guided CRISPR surveillance complex
手法: 単粒子 / : Hirschi M, Santiago-Frangos A, Wilkinson R, Golden SM, Wiedenheft B, Lander G

PDB-6whi:
Cryo-electron microscopy structure of the type I-F CRISPR RNA-guided surveillance complex bound to the anti-CRISPR AcrIF9
手法: 単粒子 / : Hirschi M, Santiago-Frangos A, Wilkinson R, Golden SM, Wiedenheft B, Lander G

PDB-6ne0:
Structure of double-stranded target DNA engaged Csy complex from Pseudomonas aeruginosa (PA-14)
手法: 単粒子 / : Chowdhury S, Rollins MF, Carter J, Golden SM, Miettinen HM, Santiago-Frangos A, Faith D, Lawrence MC, Wiedenheft B, Lander GC

EMDB-9191:
Structure of double-stranded target DNA engaged Csy complex from Pseudomonas aeruginosa (PA-14)
手法: 単粒子 / : Chowdhury S, Rollins MF, Carter J, Golden SM, Miettinen HM, Santiago-Frangos A, Faith D, Lawrence MC, Wiedenheft B, Lander GC

EMDB-8558:
Negative stain reconstruction of Cas1-Cas2/3 complex of type I-F CRISPR system from Pseudomonas aeruginosa (PA14)
手法: 単粒子 / : Chowdhury S, Lander GC, Rollins MF, Carter J, Golden MS, Wilkinson RA, Bondy-Denomy J, Wiedenheft B

EMDB-8624:
Cryo EM structure of anti-CRISPRs, AcrF1 and AcrF2, bound to type I-F crRNA-guided CRISPR surveillance complex
手法: 単粒子 / : Chowdhury S, Carter J

PDB-5uz9:
Cryo EM structure of anti-CRISPRs, AcrF1 and AcrF2, bound to type I-F crRNA-guided CRISPR surveillance complex
手法: 単粒子 / : Chowdhury S, Carter J, Rollins MF, Jackson RN, Hoffmann C, Nosaka L, Bondy-Denomy J, Maxwell KL, Davidson AR, Fischer ER, Lander GC, Wiedenheft B

EMDB-5314:
Structures of the RNA-guided surveillance complex from a bacterial immune system
手法: 単粒子 / : Wiedenheft B, Lander GC, Zhou K, Jore MM, Brouns SJJ, van der Oost J, Doudna JA, Nogales E

EMDB-5315:
Structures of the RNA-guided surveillance complex from a bacterial immune system
手法: 単粒子 / : Wiedenheft B, Lander GC, Zhou K, Jore MM, Brouns SJJ, van der Oost J, Doudna JA, Nogales E

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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