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4ZBX	Family 4 uracil-DNA glycosylase from Sulfolobus tokodaii (free form, X-ray wavelength=0.9000) 分子名称: 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID, IRON/SULFUR CLUSTER, Uracil-DNA glycosylase 著者 Kawai, A, Miyamoto, S. 登録日 2015-04-15 公開日 2015-09-09 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) 主引用文献 Crystal structure of family 4 uracil-DNA glycosylase from Sulfolobus tokodaii and a function of tyrosine 170 in DNA binding Febs Lett., 589, 2015
4ZBY	Family 4 uracil-DNA glycosylase from Sulfolobus tokodaii (uracil complex form) 分子名称: 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID, IRON/SULFUR CLUSTER, URACIL, ... 著者 Kawai, A, Miyamoto, S. 登録日 2015-04-15 公開日 2015-09-09 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) 主引用文献 Crystal structure of family 4 uracil-DNA glycosylase from Sulfolobus tokodaii and a function of tyrosine 170 in DNA binding Febs Lett., 589, 2015
4ZBZ	Family 4 uracil-DNA glycosylase from Sulfolobus tokodaii (free form, X-ray wavelength=1.5418) 分子名称: 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID, GLYCEROL, IRON/SULFUR CLUSTER, ... 著者 Kawai, A, Miyamoto, S. 登録日 2015-04-15 公開日 2015-09-09 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Crystal structure of family 4 uracil-DNA glycosylase from Sulfolobus tokodaii and a function of tyrosine 170 in DNA binding Febs Lett., 589, 2015
5AYR	The crystal structure of SAUGI/human UDG complex 分子名称: MAGNESIUM ION, Uncharacterized protein, Uracil-DNA glycosylase 著者 Wang, H.C, Ko, T.P, Huang, M.F, Wang, A.H.J. 登録日 2015-09-02 公開日 2016-06-08 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å) 主引用文献 Using structural-based protein engineering to modulate the differential inhibition effects of SAUGI on human and HSV uracil DNA glycosylase. Nucleic Acids Res., 44, 2016
5AYS	Crystal structure of SAUGI/HSV UDG complex 分子名称: Uncharacterized protein, Uracil-DNA glycosylase 著者 Wang, H.C, Ko, T.P, Huang, M.F, Wang, A.H.J. 登録日 2015-09-02 公開日 2016-06-08 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.09 Å) 主引用文献 Using structural-based protein engineering to modulate the differential inhibition effects of SAUGI on human and HSV uracil DNA glycosylase. Nucleic Acids Res., 44, 2016
5CYS	Structure of the enzyme-product complex resulting from TDG action on a GcaC mismatch 分子名称: ACETIC ACID, DNA (28-MER), G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase 著者 Pozharski, E, Malik, S.S, Drohat, A.C. 登録日 2015-07-30 公開日 2015-09-16 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.45 Å) 主引用文献 Characterizing the enzyme-product complexes of thymine DNA glycosylase using crystallography and NMR Nucleic Acids Res., 2015
5EUG	CRYSTALLOGRAPHIC AND ENZYMATIC STUDIES OF AN ACTIVE SITE VARIANT H187Q OF ESCHERICHIA COLI URACIL DNA GLYCOSYLASE: CRYSTAL STRUCTURES OF MUTANT H187Q AND ITS URACIL COMPLEX 分子名称: PROTEIN (GLYCOSYLASE), URACIL 著者 Xiao, G, Tordova, M, Drohat, A.C, Jagadeesh, J, Stivers, J.T, Gilliland, G.L. 登録日 1998-12-27 公開日 1999-07-23 最終更新日 2023-12-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.6 Å) 主引用文献 Crystal structure of Escherichia coli uracil DNA glycosylase and its complexes with uracil and glycerol: structure and glycosylase mechanism revisited. Proteins, 35, 1999
5FF8	TDG enzyme-product complex 分子名称: DNA, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase 著者 Pozharski, E, Malik, S.S, Drohat, A.C. 登録日 2015-12-18 公開日 2016-09-28 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) 主引用文献 Structural basis of damage recognition by thymine DNA glycosylase: Key roles for N-terminal residues. Nucleic Acids Res., 44, 2016
5H0J	The crystal structure of WT Pedobacter heparinus SMUG2 分子名称: Uncharacterized protein 著者 Xie, W, Cao, W, Pang, P. 登録日 2016-10-04 公開日 2017-01-18 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.801 Å) 主引用文献 SMUG2 DNA glycosylase from Pedobacter heparinus as a new subfamily of the UDG superfamily Biochem. J., 474, 2017
5H0K	The crystal structure of WT Pedobacter heparinus SMUG2 分子名称: Uncharacterized protein 著者 Xie, W, Cao, W, Pang, P. 登録日 2016-10-04 公開日 2017-01-18 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.25 Å) 主引用文献 SMUG2 DNA glycosylase from Pedobacter heparinus as a new subfamily of the UDG superfamily Biochem. J., 474, 2017
5H93	Crystal structure of Geobacter metallireducens SMUG1 分子名称: Geobacter metallireducens SMUG1 著者 Xie, W, Cao, W, Zhang, Z, Shen, J. 登録日 2015-12-25 公開日 2016-04-27 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.176 Å) 主引用文献 Structural Basis of Substrate Specificity in Geobacter metallireducens SMUG1 Acs Chem.Biol., 11, 2016
5H98	Crystal structure of Geobacter metallireducens SMUG1 分子名称: Geobacter metallireducens SMUG1 著者 Xie, W, Cao, W, Zhang, Z, Shen, J. 登録日 2015-12-26 公開日 2016-04-27 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.04 Å) 主引用文献 Structural Basis of Substrate Specificity in Geobacter metallireducens SMUG1 Acs Chem.Biol., 11, 2016
5H99	Crystal structure of Geobacter metallireducens SMUG1 mutant N58D 分子名称: Geobacter metallireducens SMUG1 著者 Xie, W, Cao, W, Zhang, Z, Shen, J. 登録日 2015-12-26 公開日 2016-04-27 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Structural Basis of Substrate Specificity in Geobacter metallireducens SMUG1 Acs Chem.Biol., 11, 2016
5H9I	Crystal structure of Geobacter metallireducens SMUG1 with xanthine 分子名称: BETA-MERCAPTOETHANOL, GLYCEROL, Geobacter metallireducens SMUG1, ... 著者 Xie, W, Cao, W, Zhang, Z, Shen, J. 登録日 2015-12-28 公開日 2016-04-27 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.501 Å) 主引用文献 Structural Basis of Substrate Specificity in Geobacter metallireducens SMUG1 Acs Chem.Biol., 11, 2016
5HF7	TDG enzyme-substrate complex 分子名称: DNA (28-MER), G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase 著者 Pozharski, E, Malik, S.S, Drohat, A.C. 登録日 2016-01-06 公開日 2016-09-28 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.54 Å) 主引用文献 Structural basis of damage recognition by thymine DNA glycosylase: Key roles for N-terminal residues. Nucleic Acids Res., 44, 2016
5JK7	The X-ray structure of the DDB1-DCAF1-Vpr-UNG2 complex 分子名称: DNA damage-binding protein 1, Protein VPRBP, Protein Vpr, ... 著者 Calero, G, Ahn, J, Wu, Y. 登録日 2016-04-26 公開日 2016-10-05 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.49 Å) 主引用文献 The DDB1-DCAF1-Vpr-UNG2 crystal structure reveals how HIV-1 Vpr steers human UNG2 toward destruction. Nat.Struct.Mol.Biol., 23, 2016
5JXY	Enzyme-substrate complex of TDG catalytic domain bound to a G/U analog 分子名称: DNA (28-MER), G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase 著者 Pidugu, L.S, Pozharski, E, Malik, S.S, Drohat, A.C. 登録日 2016-05-13 公開日 2016-09-28 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.71 Å) 主引用文献 Structural basis of damage recognition by thymine DNA glycosylase: Key roles for N-terminal residues. Nucleic Acids Res., 44, 2016
5NN7	KSHV uracil-DNA glycosylase, apo form 分子名称: Uracil-DNA glycosylase 著者 Earl, C, Bagneris, C, Cole, A.R, Barrett, T, Savva, R. 登録日 2017-04-08 公開日 2018-03-21 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 A structurally conserved motif in gamma-herpesvirus uracil-DNA glycosylases elicits duplex nucleotide-flipping. Nucleic Acids Res., 46, 2018
5NNH	KSHV uracil-DNA glycosylase, apo form 分子名称: SULFATE ION, Uracil-DNA glycosylase 著者 Earl, C, Bagneris, C, Cole, A.R, Barrett, T, Savva, R. 登録日 2017-04-09 公開日 2018-03-21 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 A structurally conserved motif in gamma-herpesvirus uracil-DNA glycosylases elicits duplex nucleotide-flipping. Nucleic Acids Res., 46, 2018
5NNU	KSHV uracil-DNA glycosylase, product complex with dsDNA exhibiting duplex nucleotide flipping 分子名称: DNA, DNA containing an abasic site, Uracil-DNA glycosylase 著者 Earl, C, Bagneris, C, Barrett, T, Savva, R. 登録日 2017-04-10 公開日 2018-03-21 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.97 Å) 主引用文献 A structurally conserved motif in gamma-herpesvirus uracil-DNA glycosylases elicits duplex nucleotide-flipping. Nucleic Acids Res., 46, 2018
5T2W	Structure of thymine DNA glycosylase bound to substrate analog 2'-F-5-formyl-dC 分子名称: DNA (27-MER), DNA (28-MER), G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase 著者 Pidugu, L.S, Pozharski, E, Drohat, A.C. 登録日 2016-08-24 公開日 2016-11-09 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Structural Basis for Excision of 5-Formylcytosine by Thymine DNA Glycosylase. Biochemistry, 55, 2016
5X55	Crystal structure of mimivirus uracil-DNA glycosylase 分子名称: Probable uracil-DNA glycosylase 著者 Kwon, E, Pathak, D, Kim, D.Y. 登録日 2017-02-14 公開日 2017-08-09 最終更新日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.302 Å) 主引用文献 Crystal structure of mimivirus uracil-DNA glycosylase PLoS ONE, 12, 2017
6AIL	CRYSTAL STRUCTURE AT 1.3 ANGSTROMS RESOLUTION OF A NOVEL UDG, UdgX, FROM Mycobacterium smegmatis 分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER, Uracil DNA glycosylase X 著者 Ahn, W.C, Aroli, S, Varshney, V, Woo, E.J. 登録日 2018-08-24 公開日 2019-05-29 最終更新日 2024-03-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.335 Å) 主引用文献 Covalent binding of uracil DNA glycosylase UdgX to abasic DNA upon uracil excision. Nat.Chem.Biol., 15, 2019
6AJO	Complex form of Uracil DNA glycosylase X and uracil-DNA. 分子名称: DNA (5'-D(P*(ORP)P*TP*T)-3'), IRON/SULFUR CLUSTER, PHOSPHATE ION, ... 著者 Ahn, W.C, Aroli, S, Varshney, U, Woo, E.J. 登録日 2018-08-28 公開日 2019-05-29 最終更新日 2024-03-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.269 Å) 主引用文献 Covalent binding of uracil DNA glycosylase UdgX to abasic DNA upon uracil excision. Nat.Chem.Biol., 15, 2019
6AJP	Complex form of Uracil DNA glycosylase X and deoxyuridine monophosphate. 分子名称: 2'-DEOXYURIDINE-5'-MONOPHOSPHATE, IRON/SULFUR CLUSTER, Uracil DNA glycosylase superfamily protein 著者 Ahn, W.C, Aroli, S, Varshney, U, Woo, E.J. 登録日 2018-08-28 公開日 2019-05-29 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.334 Å) 主引用文献 Covalent binding of uracil DNA glycosylase UdgX to abasic DNA upon uracil excision. Nat.Chem.Biol., 15, 2019

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